MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9301 chromosome

Total Repeats: 20333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017432	AAT	2	6	261977	261982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242521
5002	NC_017432	TTA	2	6	261989	261994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242521
5003	NC_017432	TAA	2	6	262009	262014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242521
5004	NC_017432	TTG	2	6	262050	262055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242521
5005	NC_017432	ACT	2	6	262081	262086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242521
5006	NC_017432	TAT	2	6	262120	262125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242521
5007	NC_017432	CCG	2	6	262131	262136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385242521
5008	NC_017432	CACT	2	8	262165	262172	25 %	25 %	0 %	50 %	385242521
5009	NC_017432	TC	4	8	262195	262202	0 %	50 %	0 %	50 %	385242521
5010	NC_017432	ATGA	2	8	262250	262257	50 %	25 %	25 %	0 %	385242521
5011	NC_017432	A	6	6	262300	262305	100 %	0 %	0 %	0 %	385242521
5012	NC_017432	TTG	2	6	262343	262348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242521
5013	NC_017432	A	6	6	262354	262359	100 %	0 %	0 %	0 %	385242521
5014	NC_017432	CTT	2	6	262382	262387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242521
5015	NC_017432	A	6	6	262438	262443	100 %	0 %	0 %	0 %	385242521
5016	NC_017432	ACT	2	6	262477	262482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242521
5017	NC_017432	AGC	2	6	262493	262498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242521
5018	NC_017432	AGC	3	9	262519	262527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242521
5019	NC_017432	TGA	2	6	262579	262584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242521
5020	NC_017432	TC	3	6	262681	262686	0 %	50 %	0 %	50 %	385242521
5021	NC_017432	TAA	2	6	262716	262721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242521
5022	NC_017432	AAG	2	6	262750	262755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242521
5023	NC_017432	TAT	2	6	262771	262776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242521
5024	NC_017432	CTT	2	6	262783	262788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242521
5025	NC_017432	AC	3	6	262905	262910	50 %	0 %	0 %	50 %	385242521
5026	NC_017432	GTTC	2	8	262972	262979	0 %	50 %	25 %	25 %	385242521
5027	NC_017432	CT	3	6	263035	263040	0 %	50 %	0 %	50 %	385242521
5028	NC_017432	GCA	2	6	263114	263119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242521
5029	NC_017432	ATAG	2	8	263135	263142	50 %	25 %	25 %	0 %	385242521
5030	NC_017432	GCT	2	6	263186	263191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242521
5031	NC_017432	TCG	2	6	263325	263330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242521
5032	NC_017432	TCA	2	6	263333	263338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242521
5033	NC_017432	CGA	2	6	263482	263487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242521
5034	NC_017432	A	6	6	263501	263506	100 %	0 %	0 %	0 %	385242521
5035	NC_017432	GAA	2	6	263528	263533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242521
5036	NC_017432	CCTTT	2	10	263558	263567	0 %	60 %	0 %	40 %	385242521
5037	NC_017432	AGA	2	6	263596	263601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242521
5038	NC_017432	TCT	2	6	263627	263632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242521
5039	NC_017432	A	6	6	263658	263663	100 %	0 %	0 %	0 %	385242521
5040	NC_017432	TAT	2	6	263670	263675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242521
5041	NC_017432	A	7	7	263760	263766	100 %	0 %	0 %	0 %	385242522
5042	NC_017432	TG	3	6	263904	263909	0 %	50 %	50 %	0 %	385242522
5043	NC_017432	GAA	2	6	263970	263975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242522
5044	NC_017432	AAT	2	6	263985	263990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242522
5045	NC_017432	CAG	2	6	264007	264012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242522
5046	NC_017432	A	7	7	264142	264148	100 %	0 %	0 %	0 %	385242522
5047	NC_017432	CAT	2	6	264263	264268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242523
5048	NC_017432	TCT	2	6	264295	264300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242523
5049	NC_017432	TCT	2	6	264346	264351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242523
5050	NC_017432	AGA	2	6	264357	264362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242523
5051	NC_017432	CAT	2	6	264419	264424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242523
5052	NC_017432	ACT	2	6	264801	264806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242524
5053	NC_017432	TTC	2	6	264893	264898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242524
5054	NC_017432	CTT	2	6	265030	265035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242524
5055	NC_017432	AAT	2	6	265058	265063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242524
5056	NC_017432	GCT	2	6	265074	265079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242524
5057	NC_017432	TAA	2	6	265132	265137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242524
5058	NC_017432	CTG	2	6	265174	265179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242524
5059	NC_017432	TA	3	6	265191	265196	50 %	50 %	0 %	0 %	385242524
5060	NC_017432	TTC	3	9	265229	265237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242524
5061	NC_017432	AAG	2	6	265250	265255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242524
5062	NC_017432	CAA	2	6	265360	265365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242524
5063	NC_017432	AG	4	8	265397	265404	50 %	0 %	50 %	0 %	385242524
5064	NC_017432	AGC	2	6	265409	265414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242524
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5069	NC_017432	AGC	2	6	266104	266109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242525
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5072	NC_017432	TCT	2	6	266150	266155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242525
5073	NC_017432	GT	3	6	266236	266241	0 %	50 %	50 %	0 %	385242525
5074	NC_017432	CTT	2	6	266313	266318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242525
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5080	NC_017432	ACA	2	6	266548	266553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242526
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5082	NC_017432	GCT	2	6	266619	266624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242526
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5088	NC_017432	TGA	2	6	266844	266849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242526
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5091	NC_017432	AC	3	6	267010	267015	50 %	0 %	0 %	50 %	385242526
5092	NC_017432	CA	3	6	267074	267079	50 %	0 %	0 %	50 %	385242526
5093	NC_017432	GCA	2	6	267201	267206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242526
5094	NC_017432	ATACA	2	10	267244	267253	60 %	20 %	0 %	20 %	385242526
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5098	NC_017432	TCATT	2	10	267644	267653	20 %	60 %	0 %	20 %	385242527
5099	NC_017432	A	6	6	267657	267662	100 %	0 %	0 %	0 %	385242527
5100	NC_017432	CAG	2	6	267686	267691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242527
5101	NC_017432	A	6	6	267692	267697	100 %	0 %	0 %	0 %	385242527
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5103	NC_017432	TC	3	6	267809	267814	0 %	50 %	0 %	50 %	385242527
5104	NC_017432	TTC	3	9	267852	267860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242527
5105	NC_017432	TTG	2	6	267869	267874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242527
5106	NC_017432	ACTT	2	8	267944	267951	25 %	50 %	0 %	25 %	385242527
5107	NC_017432	AGC	2	6	268001	268006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242527
5108	NC_017432	TC	3	6	268149	268154	0 %	50 %	0 %	50 %	385242527
5109	NC_017432	TTG	2	6	268163	268168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242527
5110	NC_017432	GAA	2	6	268199	268204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242527
5111	NC_017432	TAA	2	6	268585	268590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242528
5112	NC_017432	A	7	7	268605	268611	100 %	0 %	0 %	0 %	385242528
5113	NC_017432	TTCT	2	8	268658	268665	0 %	75 %	0 %	25 %	385242528
5114	NC_017432	GA	3	6	268720	268725	50 %	0 %	50 %	0 %	385242528
5115	NC_017432	TAAAA	2	10	268751	268760	80 %	20 %	0 %	0 %	385242528
5116	NC_017432	GTT	2	6	268775	268780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242528
5117	NC_017432	TGA	2	6	268796	268801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242528
5118	NC_017432	TC	3	6	268876	268881	0 %	50 %	0 %	50 %	385242528
5119	NC_017432	AG	3	6	268908	268913	50 %	0 %	50 %	0 %	385242528
5120	NC_017432	ATT	2	6	269000	269005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242528
5121	NC_017432	TAC	2	6	269052	269057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242528
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5123	NC_017432	AAG	2	6	269128	269133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242528
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5247	NC_017432	CAC	2	6	274791	274796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385242532
5248	NC_017432	CAA	2	6	274800	274805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242532
5249	NC_017432	TAT	2	6	274817	274822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242532
5250	NC_017432	TCT	2	6	274904	274909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242532
5251	NC_017432	ATCCT	2	10	274918	274927	20 %	40 %	0 %	40 %	385242532
5252	NC_017432	GAT	2	6	274971	274976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242532
5253	NC_017432	AGA	2	6	275066	275071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242532
5254	NC_017432	TGA	2	6	275130	275135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242533
5255	NC_017432	AGGAG	2	10	275169	275178	40 %	0 %	60 %	0 %	385242533
5256	NC_017432	GCT	2	6	275269	275274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242533
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5261	NC_017432	TGC	2	6	275355	275360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242533
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5283	NC_017432	A	6	6	276140	276145	100 %	0 %	0 %	0 %	385242534
5284	NC_017432	TGGT	2	8	276229	276236	0 %	50 %	50 %	0 %	385242534
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5317	NC_017432	CTC	2	6	277325	277330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242534
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5362	NC_017432	CCAT	2	8	279684	279691	25 %	25 %	0 %	50 %	385242535
5363	NC_017432	GAG	2	6	279744	279749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385242535
5364	NC_017432	GCTT	2	8	279785	279792	0 %	50 %	25 %	25 %	385242535
5365	NC_017432	GCA	2	6	280061	280066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242536
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5368	NC_017432	TTA	2	6	280234	280239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242536
5369	NC_017432	AGC	2	6	280250	280255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242536
5370	NC_017432	ACG	2	6	280300	280305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242536
5371	NC_017432	GTA	2	6	280334	280339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242536
5372	NC_017432	TCT	2	6	280395	280400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242537
5373	NC_017432	TGA	2	6	280424	280429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242537
5374	NC_017432	CT	3	6	280472	280477	0 %	50 %	0 %	50 %	385242537
5375	NC_017432	ATC	2	6	280478	280483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242537
5376	NC_017432	TTC	2	6	280484	280489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242537
5377	NC_017432	GAA	2	6	280515	280520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242537
5378	NC_017432	GA	3	6	280540	280545	50 %	0 %	50 %	0 %	385242537
5379	NC_017432	AAAG	2	8	280572	280579	75 %	0 %	25 %	0 %	385242537
5380	NC_017432	ATA	2	6	280670	280675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242537
5381	NC_017432	CAT	2	6	280738	280743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242537
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5383	NC_017432	GTT	2	6	280818	280823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242537
5384	NC_017432	GAT	2	6	280851	280856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242537
5385	NC_017432	TTC	2	6	280915	280920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242537
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5387	NC_017432	TTA	2	6	280948	280953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242537
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5389	NC_017432	TTC	2	6	281003	281008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242537
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5392	NC_017432	CTT	2	6	281098	281103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242537
5393	NC_017432	TCC	2	6	281273	281278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242537
5394	NC_017432	CAG	2	6	281281	281286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242537
5395	NC_017432	GAA	2	6	281386	281391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242537
5396	NC_017432	CACGCG	2	12	281540	281551	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385242537
5397	NC_017432	ATT	3	9	281564	281572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242537
5398	NC_017432	TTTCTT	2	12	281719	281730	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385242537
5399	NC_017432	TCT	2	6	281843	281848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242538
5400	NC_017432	TGC	2	6	281866	281871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242538
5401	NC_017432	TGTT	2	8	281894	281901	0 %	75 %	25 %	0 %	385242538
5402	NC_017432	TTG	2	6	281907	281912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242538
5403	NC_017432	AGA	2	6	281931	281936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242538
5404	NC_017432	AAC	2	6	281989	281994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385242538
5405	NC_017432	CAT	2	6	281997	282002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242538
5406	NC_017432	CTT	2	6	282014	282019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242538
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5408	NC_017432	CAG	2	6	282059	282064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242538
5409	NC_017432	CTG	2	6	282072	282077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242538
5410	NC_017432	GAA	2	6	282107	282112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385242538
5411	NC_017432	TATC	2	8	282182	282189	25 %	50 %	0 %	25 %	385242538
5412	NC_017432	AGCT	2	8	282203	282210	25 %	25 %	25 %	25 %	385242538
5413	NC_017432	CTG	2	6	282369	282374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242538
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5433	NC_017432	ATA	2	6	283302	283307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385242538
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5435	NC_017432	TCT	2	6	283438	283443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242538
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5438	NC_017432	TCT	2	6	283615	283620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242538
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5442	NC_017432	CAG	2	6	283953	283958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385242538
5443	NC_017432	CTC	2	6	284007	284012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242538
5444	NC_017432	TAC	2	6	284031	284036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242538
5445	NC_017432	GCT	2	6	284081	284086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242538
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5449	NC_017432	ATTC	2	8	284190	284197	25 %	50 %	0 %	25 %	385242538
5450	NC_017432	CAT	2	6	284509	284514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242539
5451	NC_017432	T	9	9	284514	284522	0 %	100 %	0 %	0 %	385242539
5452	NC_017432	ATC	2	6	284557	284562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242539
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5454	NC_017432	GT	3	6	284622	284627	0 %	50 %	50 %	0 %	385242539
5455	NC_017432	CTG	2	6	284678	284683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242539
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5459	NC_017432	CTCC	2	8	285076	285083	0 %	25 %	0 %	75 %	385242539
5460	NC_017432	AAGC	2	8	285098	285105	50 %	0 %	25 %	25 %	385242539
5461	NC_017432	ATG	2	6	285115	285120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385242539
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5463	NC_017432	CTC	2	6	285177	285182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385242539
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5466	NC_017432	AG	3	6	285299	285304	50 %	0 %	50 %	0 %	385242539
5467	NC_017432	CTT	2	6	285602	285607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385242540
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5470	NC_017432	GTC	2	6	285712	285717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385242540
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5472	NC_017432	ACT	2	6	285759	285764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242540
5473	NC_017432	ACT	2	6	285828	285833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242540
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5475	NC_017432	T	7	7	285874	285880	0 %	100 %	0 %	0 %	385242540
5476	NC_017432	CTCCTA	2	12	285881	285892	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385242540
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5478	NC_017432	TC	3	6	286081	286086	0 %	50 %	0 %	50 %	385242540
5479	NC_017432	ATC	2	6	286106	286111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242540
5480	NC_017432	TGGC	2	8	286116	286123	0 %	25 %	50 %	25 %	385242540
5481	NC_017432	TTCGA	2	10	286135	286144	20 %	40 %	20 %	20 %	385242540
5482	NC_017432	ATT	2	6	286170	286175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385242540
5483	NC_017432	AG	3	6	286177	286182	50 %	0 %	50 %	0 %	385242540
5484	NC_017432	TTG	2	6	286184	286189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242540
5485	NC_017432	ACT	2	6	286217	286222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385242540
5486	NC_017432	AT	3	6	286227	286232	50 %	50 %	0 %	0 %	385242540
5487	NC_017432	TTG	2	6	286259	286264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385242541
5488	NC_017432	T	6	6	286291	286296	0 %	100 %	0 %	0 %	385242541
5489	NC_017432	CTTT	2	8	286449	286456	0 %	75 %	0 %	25 %	385242541
5490	NC_017432	T	7	7	286454	286460	0 %	100 %	0 %	0 %	385242541
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