MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 20277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017431	T	6	6	82520	82525	0 %	100 %	0 %	0 %	385241432
1502	NC_017431	GAA	2	6	82559	82564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241432
1503	NC_017431	GAA	2	6	82588	82593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241432
1504	NC_017431	GA	3	6	82650	82655	50 %	0 %	50 %	0 %	385241432
1505	NC_017431	GTTC	2	8	82660	82667	0 %	50 %	25 %	25 %	385241432
1506	NC_017431	GCT	2	6	82795	82800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241432
1507	NC_017431	GTGC	2	8	82807	82814	0 %	25 %	50 %	25 %	385241432
1508	NC_017431	TAA	2	6	82857	82862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241432
1509	NC_017431	CAT	2	6	82873	82878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241432
1510	NC_017431	GAA	2	6	82885	82890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241432
1511	NC_017431	GA	3	6	82970	82975	50 %	0 %	50 %	0 %	385241432
1512	NC_017431	TAC	2	6	83021	83026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241433
1513	NC_017431	T	6	6	83045	83050	0 %	100 %	0 %	0 %	385241433
1514	NC_017431	T	7	7	83057	83063	0 %	100 %	0 %	0 %	385241433
1515	NC_017431	T	6	6	83070	83075	0 %	100 %	0 %	0 %	385241433
1516	NC_017431	GTA	2	6	83156	83161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241433
1517	NC_017431	T	6	6	83167	83172	0 %	100 %	0 %	0 %	385241433
1518	NC_017431	TATG	2	8	83191	83198	25 %	50 %	25 %	0 %	385241433
1519	NC_017431	TAT	2	6	83220	83225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241433
1520	NC_017431	GTCTGT	2	12	83234	83245	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385241433
1521	NC_017431	TCA	2	6	83254	83259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241433
1522	NC_017431	TCAT	2	8	83262	83269	25 %	50 %	0 %	25 %	385241433
1523	NC_017431	CAA	2	6	83304	83309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241433
1524	NC_017431	ACTG	2	8	83314	83321	25 %	25 %	25 %	25 %	385241433
1525	NC_017431	CATT	2	8	83329	83336	25 %	50 %	0 %	25 %	385241433
1526	NC_017431	AGA	2	6	83362	83367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241433
1527	NC_017431	AGCA	2	8	83368	83375	50 %	0 %	25 %	25 %	385241433
1528	NC_017431	TC	3	6	83390	83395	0 %	50 %	0 %	50 %	385241433
1529	NC_017431	ATTA	2	8	83521	83528	50 %	50 %	0 %	0 %	385241433
1530	NC_017431	TTTG	2	8	83561	83568	0 %	75 %	25 %	0 %	385241433
1531	NC_017431	TTG	2	6	83658	83663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241433
1532	NC_017431	GAT	2	6	83755	83760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241433
1533	NC_017431	TCTA	2	8	83845	83852	25 %	50 %	0 %	25 %	385241433
1534	NC_017431	CTA	2	6	83873	83878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241433
1535	NC_017431	TAT	2	6	83926	83931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241433
1536	NC_017431	TAAG	2	8	83950	83957	50 %	25 %	25 %	0 %	385241433
1537	NC_017431	AGT	2	6	84039	84044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241434
1538	NC_017431	TAT	2	6	84066	84071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241434
1539	NC_017431	TGC	2	6	84081	84086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241434
1540	NC_017431	AAG	2	6	84101	84106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241434
1541	NC_017431	TC	3	6	84113	84118	0 %	50 %	0 %	50 %	385241434
1542	NC_017431	AG	3	6	84124	84129	50 %	0 %	50 %	0 %	385241434
1543	NC_017431	GAA	2	6	84157	84162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241434
1544	NC_017431	CAG	2	6	84296	84301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241434
1545	NC_017431	TAA	2	6	84342	84347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241434
1546	NC_017431	AG	3	6	84391	84396	50 %	0 %	50 %	0 %	385241434
1547	NC_017431	TTC	2	6	84410	84415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241434
1548	NC_017431	GAAG	2	8	84454	84461	50 %	0 %	50 %	0 %	385241434
1549	NC_017431	A	6	6	84478	84483	100 %	0 %	0 %	0 %	385241434
1550	NC_017431	AGA	2	6	84528	84533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241434
1551	NC_017431	TTC	2	6	84606	84611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241434
1552	NC_017431	TAAA	2	8	84620	84627	75 %	25 %	0 %	0 %	385241434
1553	NC_017431	ATCC	2	8	84691	84698	25 %	25 %	0 %	50 %	385241434
1554	NC_017431	TGG	2	6	84719	84724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241434
1555	NC_017431	TGA	2	6	84752	84757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241434
1556	NC_017431	TCC	2	6	84759	84764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241434
1557	NC_017431	ACA	2	6	84783	84788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241434
1558	NC_017431	TTTC	2	8	84838	84845	0 %	75 %	0 %	25 %	385241434
1559	NC_017431	AGAT	2	8	84879	84886	50 %	25 %	25 %	0 %	385241434
1560	NC_017431	AGCGA	2	10	84903	84912	40 %	0 %	40 %	20 %	385241434
1561	NC_017431	CTT	2	6	84916	84921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241434
1562	NC_017431	T	6	6	84942	84947	0 %	100 %	0 %	0 %	385241434
1563	NC_017431	GAA	2	6	85069	85074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241434
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1565	NC_017431	AT	3	6	85327	85332	50 %	50 %	0 %	0 %	385241435
1566	NC_017431	AGC	2	6	85395	85400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241435
1567	NC_017431	AG	3	6	85422	85427	50 %	0 %	50 %	0 %	385241435
1568	NC_017431	GAAA	2	8	85460	85467	75 %	0 %	25 %	0 %	385241435
1569	NC_017431	T	6	6	85597	85602	0 %	100 %	0 %	0 %	385241435
1570	NC_017431	TGG	2	6	85698	85703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241435
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1573	NC_017431	CAA	2	6	85765	85770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241435
1574	NC_017431	TCT	2	6	85843	85848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241435
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1577	NC_017431	GCA	2	6	85878	85883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241435
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1593	NC_017431	TA	3	6	87028	87033	50 %	50 %	0 %	0 %	385241435
1594	NC_017431	T	6	6	87127	87132	0 %	100 %	0 %	0 %	385241435
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1597	NC_017431	AGAGC	2	10	87323	87332	40 %	0 %	40 %	20 %	385241436
1598	NC_017431	ATG	2	6	87389	87394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241436
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1600	NC_017431	ATG	2	6	87413	87418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241436
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1610	NC_017431	CAT	2	6	87891	87896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241436
1611	NC_017431	ACA	2	6	87968	87973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241436
1612	NC_017431	TTC	2	6	87982	87987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241436
1613	NC_017431	TAA	2	6	88084	88089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241436
1614	NC_017431	A	6	6	88088	88093	100 %	0 %	0 %	0 %	385241436
1615	NC_017431	TTC	2	6	88094	88099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241436
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1623	NC_017431	GTA	2	6	88646	88651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241437
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1625	NC_017431	TAT	2	6	88735	88740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241437
1626	NC_017431	CATT	2	8	88779	88786	25 %	50 %	0 %	25 %	385241437
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