MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 20277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017431	GGAA	2	8	55060	55067	50 %	0 %	50 %	0 %	385241410
1002	NC_017431	GATCTG	2	12	55095	55106	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385241410
1003	NC_017431	GTGTAA	2	12	55143	55154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241410
1004	NC_017431	GCA	2	6	55157	55162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241410
1005	NC_017431	GGTTCA	2	12	55232	55243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385241410
1006	NC_017431	TTATC	2	10	55333	55342	20 %	60 %	0 %	20 %	385241410
1007	NC_017431	GGA	2	6	55433	55438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241410
1008	NC_017431	TGC	2	6	55468	55473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241410
1009	NC_017431	GTA	2	6	55511	55516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241410
1010	NC_017431	GAGT	2	8	55629	55636	25 %	25 %	50 %	0 %	385241410
1011	NC_017431	AT	3	6	55678	55683	50 %	50 %	0 %	0 %	385241410
1012	NC_017431	TTA	2	6	55693	55698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241410
1013	NC_017431	CTGG	3	12	55971	55982	0 %	25 %	50 %	25 %	385241411
1014	NC_017431	ATT	2	6	55986	55991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241411
1015	NC_017431	GAT	2	6	55999	56004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241411
1016	NC_017431	TCT	2	6	56017	56022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241411
1017	NC_017431	TCC	2	6	56052	56057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241411
1018	NC_017431	TTA	2	6	56065	56070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241411
1019	NC_017431	TTGC	2	8	56108	56115	0 %	50 %	25 %	25 %	385241411
1020	NC_017431	CGAG	2	8	56150	56157	25 %	0 %	50 %	25 %	385241411
1021	NC_017431	T	6	6	56160	56165	0 %	100 %	0 %	0 %	385241411
1022	NC_017431	GTA	2	6	56191	56196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241411
1023	NC_017431	GTT	2	6	56302	56307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241411
1024	NC_017431	AG	3	6	56314	56319	50 %	0 %	50 %	0 %	385241411
1025	NC_017431	TGG	2	6	56322	56327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241411
1026	NC_017431	GTTGT	2	10	56401	56410	0 %	60 %	40 %	0 %	385241411
1027	NC_017431	T	6	6	56456	56461	0 %	100 %	0 %	0 %	385241411
1028	NC_017431	AGA	2	6	57844	57849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241412
1029	NC_017431	CAT	2	6	57942	57947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241412
1030	NC_017431	CTG	2	6	58035	58040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241412
1031	NC_017431	TGT	2	6	58102	58107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241412
1032	NC_017431	TTG	2	6	58140	58145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241412
1033	NC_017431	GAAA	2	8	58175	58182	75 %	0 %	25 %	0 %	385241412
1034	NC_017431	CT	3	6	58185	58190	0 %	50 %	0 %	50 %	385241412
1035	NC_017431	AGGT	2	8	58214	58221	25 %	25 %	50 %	0 %	385241412
1036	NC_017431	AGA	2	6	59173	59178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241413
1037	NC_017431	TCT	2	6	59189	59194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241413
1038	NC_017431	T	6	6	59221	59226	0 %	100 %	0 %	0 %	385241413
1039	NC_017431	CGTT	2	8	59372	59379	0 %	50 %	25 %	25 %	385241413
1040	NC_017431	GGAG	2	8	59381	59388	25 %	0 %	75 %	0 %	385241413
1041	NC_017431	GTAA	2	8	59433	59440	50 %	25 %	25 %	0 %	385241413
1042	NC_017431	TCCTAA	2	12	59500	59511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241413
1043	NC_017431	AGT	2	6	59529	59534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241413
1044	NC_017431	T	6	6	59561	59566	0 %	100 %	0 %	0 %	385241413
1045	NC_017431	TAG	2	6	59608	59613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241413
1046	NC_017431	GCT	2	6	59621	59626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241413
1047	NC_017431	GTC	2	6	59647	59652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241413
1048	NC_017431	ATGG	2	8	59660	59667	25 %	25 %	50 %	0 %	385241413
1049	NC_017431	AGG	2	6	59694	59699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241413
1050	NC_017431	GA	3	6	59746	59751	50 %	0 %	50 %	0 %	385241413
1051	NC_017431	CAA	2	6	59769	59774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241413
1052	NC_017431	ATAA	2	8	59806	59813	75 %	25 %	0 %	0 %	385241413
1053	NC_017431	GAGCA	2	10	59846	59855	40 %	0 %	40 %	20 %	385241413
1054	NC_017431	GT	3	6	59884	59889	0 %	50 %	50 %	0 %	385241413
1055	NC_017431	TAG	2	6	59896	59901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241413
1056	NC_017431	AAG	2	6	60081	60086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241413
1057	NC_017431	CTC	2	6	60093	60098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241413
1058	NC_017431	AAC	2	6	60126	60131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241413
1059	NC_017431	T	7	7	60145	60151	0 %	100 %	0 %	0 %	385241413
1060	NC_017431	CTT	2	6	60195	60200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241413
1061	NC_017431	AAT	2	6	60225	60230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241413
1062	NC_017431	TTC	2	6	60236	60241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241413
1063	NC_017431	ATGT	2	8	60256	60263	25 %	50 %	25 %	0 %	385241413
1064	NC_017431	CATT	2	8	60285	60292	25 %	50 %	0 %	25 %	385241413
1065	NC_017431	ATG	2	6	60306	60311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241414
1066	NC_017431	CCT	2	6	60312	60317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241414
1067	NC_017431	AGT	2	6	60367	60372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241414
1068	NC_017431	TCT	2	6	60390	60395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241414
1069	NC_017431	TCA	2	6	60402	60407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241414
1070	NC_017431	TTC	2	6	60523	60528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241414
1071	NC_017431	CTTT	2	8	60558	60565	0 %	75 %	0 %	25 %	385241414
1072	NC_017431	TTCT	2	8	60581	60588	0 %	75 %	0 %	25 %	385241414
1073	NC_017431	TTC	2	6	60620	60625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241414
1074	NC_017431	TC	3	6	60632	60637	0 %	50 %	0 %	50 %	385241414
1075	NC_017431	T	6	6	60644	60649	0 %	100 %	0 %	0 %	385241414
1076	NC_017431	T	7	7	60704	60710	0 %	100 %	0 %	0 %	385241414
1077	NC_017431	TCA	2	6	61089	61094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241415
1078	NC_017431	TTC	2	6	61151	61156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241415
1079	NC_017431	TCT	2	6	61215	61220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241415
1080	NC_017431	A	6	6	61251	61256	100 %	0 %	0 %	0 %	385241415
1081	NC_017431	CA	3	6	61258	61263	50 %	0 %	0 %	50 %	385241415
1082	NC_017431	TGA	2	6	61270	61275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241415
1083	NC_017431	TTA	2	6	61283	61288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241415
1084	NC_017431	TCA	2	6	61323	61328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241415
1085	NC_017431	GAA	2	6	61329	61334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241415
1086	NC_017431	TCT	2	6	61335	61340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241415
1087	NC_017431	AAG	2	6	61375	61380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241415
1088	NC_017431	CTT	2	6	61387	61392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241415
1089	NC_017431	ATT	2	6	61397	61402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241415
1090	NC_017431	AT	3	6	61508	61513	50 %	50 %	0 %	0 %	385241415
1091	NC_017431	GA	3	6	61531	61536	50 %	0 %	50 %	0 %	385241415
1092	NC_017431	TTC	2	6	61558	61563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241415
1093	NC_017431	GAA	2	6	61602	61607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241415
1094	NC_017431	GA	3	6	61657	61662	50 %	0 %	50 %	0 %	385241415
1095	NC_017431	ATG	2	6	61899	61904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241415
1096	NC_017431	TGT	2	6	61946	61951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241415
1097	NC_017431	AGC	2	6	61964	61969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241415
1098	NC_017431	AAT	2	6	62127	62132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241415
1099	NC_017431	ATG	2	6	62199	62204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241415
1100	NC_017431	TGTGA	2	10	62295	62304	20 %	40 %	40 %	0 %	385241415
1101	NC_017431	TGT	2	6	62316	62321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241415
1102	NC_017431	A	6	6	62397	62402	100 %	0 %	0 %	0 %	385241415
1103	NC_017431	ATT	2	6	62414	62419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241415
1104	NC_017431	CGA	2	6	62462	62467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241415
1105	NC_017431	GA	3	6	62472	62477	50 %	0 %	50 %	0 %	385241415
1106	NC_017431	CTT	2	6	62589	62594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241415
1107	NC_017431	AAG	2	6	62623	62628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241415
1108	NC_017431	TTA	2	6	62700	62705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241415
1109	NC_017431	GA	3	6	62731	62736	50 %	0 %	50 %	0 %	385241415
1110	NC_017431	TTA	2	6	62781	62786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241415
1111	NC_017431	AAG	2	6	62788	62793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241415
1112	NC_017431	TC	3	6	62887	62892	0 %	50 %	0 %	50 %	385241415
1113	NC_017431	CAA	2	6	62988	62993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241415
1114	NC_017431	AT	3	6	63068	63073	50 %	50 %	0 %	0 %	385241415
1115	NC_017431	TTC	2	6	63074	63079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241415
1116	NC_017431	GTT	2	6	63213	63218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241415
1117	NC_017431	CTTC	2	8	63219	63226	0 %	50 %	0 %	50 %	385241415
1118	NC_017431	AG	3	6	63268	63273	50 %	0 %	50 %	0 %	385241415
1119	NC_017431	CT	4	8	63276	63283	0 %	50 %	0 %	50 %	385241415
1120	NC_017431	T	6	6	63295	63300	0 %	100 %	0 %	0 %	385241415
1121	NC_017431	GTTCTT	2	12	63414	63425	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385241415
1122	NC_017431	TTA	2	6	63440	63445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241415
1123	NC_017431	AG	3	6	63503	63508	50 %	0 %	50 %	0 %	385241415
1124	NC_017431	AGA	2	6	63527	63532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241415
1125	NC_017431	TATG	2	8	63573	63580	25 %	50 %	25 %	0 %	385241415
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