MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 20277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_017431	AGA	2	6	311369	311374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241645
6003	NC_017431	CAAC	2	8	311385	311392	50 %	0 %	0 %	50 %	385241645
6004	NC_017431	TTC	2	6	311512	311517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241645
6005	NC_017431	CTAT	2	8	311545	311552	25 %	50 %	0 %	25 %	385241645
6006	NC_017431	CTT	2	6	311596	311601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241645
6007	NC_017431	A	7	7	311659	311665	100 %	0 %	0 %	0 %	385241645
6008	NC_017431	A	6	6	311676	311681	100 %	0 %	0 %	0 %	385241645
6009	NC_017431	GCA	2	6	311763	311768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241645
6010	NC_017431	GCT	2	6	311787	311792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241645
6011	NC_017431	TC	3	6	311851	311856	0 %	50 %	0 %	50 %	385241645
6012	NC_017431	TTG	2	6	311880	311885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241645
6013	NC_017431	TTC	2	6	311889	311894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241645
6014	NC_017431	TAA	2	6	311931	311936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241645
6015	NC_017431	CAA	2	6	311973	311978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241646
6016	NC_017431	GCT	2	6	312080	312085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241646
6017	NC_017431	TGT	2	6	312093	312098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241646
6018	NC_017431	GAT	2	6	312135	312140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241646
6019	NC_017431	T	6	6	312198	312203	0 %	100 %	0 %	0 %	385241646
6020	NC_017431	TTG	2	6	312233	312238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241646
6021	NC_017431	TGGG	2	8	312345	312352	0 %	25 %	75 %	0 %	385241646
6022	NC_017431	AG	3	6	312376	312381	50 %	0 %	50 %	0 %	385241646
6023	NC_017431	CAG	2	6	312440	312445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241646
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6027	NC_017431	TGGT	2	8	312759	312766	0 %	50 %	50 %	0 %	385241647
6028	NC_017431	ATT	2	6	312769	312774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241647
6029	NC_017431	CTTGG	2	10	312794	312803	0 %	40 %	40 %	20 %	385241647
6030	NC_017431	TTG	2	6	312859	312864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241647
6031	NC_017431	GCA	2	6	312870	312875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241647
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6033	NC_017431	CTC	2	6	312897	312902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241647
6034	NC_017431	TTC	2	6	312943	312948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241647
6035	NC_017431	TAT	2	6	312985	312990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241647
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6038	NC_017431	ATGGCT	2	12	313164	313175	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385241647
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6041	NC_017431	GAA	2	6	313420	313425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241648
6042	NC_017431	ATC	2	6	313427	313432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241648
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6044	NC_017431	TAA	2	6	313534	313539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241648
6045	NC_017431	AAG	2	6	313549	313554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241648
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6050	NC_017431	ATA	2	6	313680	313685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241648
6051	NC_017431	A	8	8	313716	313723	100 %	0 %	0 %	0 %	385241649
6052	NC_017431	CTT	2	6	313724	313729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241649
6053	NC_017431	ATA	2	6	313775	313780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241649
6054	NC_017431	CAA	2	6	313807	313812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241649
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6056	NC_017431	A	6	6	313967	313972	100 %	0 %	0 %	0 %	385241649
6057	NC_017431	CTAA	2	8	314017	314024	50 %	25 %	0 %	25 %	385241649
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6061	NC_017431	CTT	2	6	314153	314158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241649
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6069	NC_017431	TCT	2	6	314731	314736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241649
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6104	NC_017431	AT	3	6	316457	316462	50 %	50 %	0 %	0 %	385241650
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6108	NC_017431	TCCGG	2	10	316563	316572	0 %	20 %	40 %	40 %	385241650
6109	NC_017431	GATT	2	8	316669	316676	25 %	50 %	25 %	0 %	385241650
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6494	NC_017431	ATAG	2	8	335077	335084	50 %	25 %	25 %	0 %	385241667
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6498	NC_017431	GGAA	2	8	335429	335436	50 %	0 %	50 %	0 %	385241667
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