MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/11023 chromosome

Total Repeats: 20277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017431	ATT	2	6	286503	286508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241619
5502	NC_017431	AAC	2	6	286538	286543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241619
5503	NC_017431	GAA	2	6	286567	286572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241619
5504	NC_017431	GAA	2	6	286645	286650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241619
5505	NC_017431	T	6	6	286654	286659	0 %	100 %	0 %	0 %	385241619
5506	NC_017431	TTC	2	6	286678	286683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241619
5507	NC_017431	TGT	2	6	286710	286715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241619
5508	NC_017431	CTT	2	6	286754	286759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241619
5509	NC_017431	TTTG	2	8	286785	286792	0 %	75 %	25 %	0 %	385241619
5510	NC_017431	TCTTT	2	10	286793	286802	0 %	80 %	0 %	20 %	385241619
5511	NC_017431	TTTA	2	8	286813	286820	25 %	75 %	0 %	0 %	385241619
5512	NC_017431	A	8	8	286901	286908	100 %	0 %	0 %	0 %	385241619
5513	NC_017431	TTA	2	6	287107	287112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241620
5514	NC_017431	T	6	6	287118	287123	0 %	100 %	0 %	0 %	385241620
5515	NC_017431	TTC	2	6	287149	287154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241620
5516	NC_017431	GAG	2	6	287196	287201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385241620
5517	NC_017431	CGA	2	6	287204	287209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241620
5518	NC_017431	CTT	2	6	287238	287243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241620
5519	NC_017431	AAG	2	6	287273	287278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241620
5520	NC_017431	AGTA	2	8	287296	287303	50 %	25 %	25 %	0 %	385241620
5521	NC_017431	TA	3	6	287383	287388	50 %	50 %	0 %	0 %	385241620
5522	NC_017431	TTC	2	6	287485	287490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241620
5523	NC_017431	TTC	2	6	287687	287692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241621
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5527	NC_017431	TCT	2	6	287872	287877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241621
5528	NC_017431	TAG	2	6	287923	287928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241621
5529	NC_017431	ATC	2	6	288054	288059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241621
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5531	NC_017431	GTC	2	6	288229	288234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241621
5532	NC_017431	CTAT	2	8	288245	288252	25 %	50 %	0 %	25 %	385241621
5533	NC_017431	GAA	2	6	288258	288263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241621
5534	NC_017431	T	6	6	288304	288309	0 %	100 %	0 %	0 %	385241621
5535	NC_017431	ATG	2	6	288310	288315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241621
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5537	NC_017431	GGT	2	6	288393	288398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385241621
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5539	NC_017431	GAA	2	6	288468	288473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241621
5540	NC_017431	ATC	2	6	288538	288543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241621
5541	NC_017431	TAT	2	6	288569	288574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241621
5542	NC_017431	TGA	2	6	288578	288583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241621
5543	NC_017431	TGA	2	6	288638	288643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241621
5544	NC_017431	CTCA	2	8	288679	288686	25 %	25 %	0 %	50 %	385241621
5545	NC_017431	TGT	2	6	288695	288700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241621
5546	NC_017431	TGC	2	6	288704	288709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241621
5547	NC_017431	CTA	2	6	288760	288765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241621
5548	NC_017431	TG	3	6	288885	288890	0 %	50 %	50 %	0 %	385241621
5549	NC_017431	TA	3	6	288900	288905	50 %	50 %	0 %	0 %	385241621
5550	NC_017431	AACT	2	8	288921	288928	50 %	25 %	0 %	25 %	385241621
5551	NC_017431	CCT	2	6	288954	288959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241622
5552	NC_017431	ATG	2	6	288988	288993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385241622
5553	NC_017431	A	6	6	289054	289059	100 %	0 %	0 %	0 %	385241622
5554	NC_017431	TTA	2	6	289079	289084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241622
5555	NC_017431	TCA	2	6	289153	289158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241622
5556	NC_017431	ATT	2	6	289213	289218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241622
5557	NC_017431	GTC	2	6	289222	289227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385241622
5558	NC_017431	AATT	2	8	289238	289245	50 %	50 %	0 %	0 %	385241622
5559	NC_017431	TC	3	6	289256	289261	0 %	50 %	0 %	50 %	385241622
5560	NC_017431	A	6	6	289274	289279	100 %	0 %	0 %	0 %	385241622
5561	NC_017431	TCA	2	6	289446	289451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385241622
5562	NC_017431	TCGT	2	8	289586	289593	0 %	50 %	25 %	25 %	385241622
5563	NC_017431	A	6	6	289662	289667	100 %	0 %	0 %	0 %	385241622
5564	NC_017431	TGT	2	6	289695	289700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385241622
5565	NC_017431	TCAT	2	8	289745	289752	25 %	50 %	0 %	25 %	385241622
5566	NC_017431	ATA	2	6	289802	289807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385241622
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5569	NC_017431	AC	3	6	289928	289933	50 %	0 %	0 %	50 %	385241622
5570	NC_017431	ATT	2	6	289963	289968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241622
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5594	NC_017431	TTTC	2	8	291130	291137	0 %	75 %	0 %	25 %	385241623
5595	NC_017431	TA	3	6	291248	291253	50 %	50 %	0 %	0 %	385241623
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5602	NC_017431	GAC	2	6	291482	291487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241624
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5606	NC_017431	AAG	2	6	291860	291865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241624
5607	NC_017431	GCAATG	2	12	291901	291912	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385241624
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5609	NC_017431	CTAA	2	8	291958	291965	50 %	25 %	0 %	25 %	385241624
5610	NC_017431	CAA	2	6	292001	292006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241624
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5613	NC_017431	A	8	8	292152	292159	100 %	0 %	0 %	0 %	385241625
5614	NC_017431	GAA	3	9	292194	292202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385241625
5615	NC_017431	C	11	11	292214	292224	0 %	0 %	0 %	100 %	385241625
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5618	NC_017431	CT	3	6	292456	292461	0 %	50 %	0 %	50 %	385241626
5619	NC_017431	CAG	2	6	292524	292529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385241626
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5621	NC_017431	ATT	2	6	292617	292622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241626
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5623	NC_017431	CTT	2	6	292715	292720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241626
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5993	NC_017431	AATC	2	8	310868	310875	50 %	25 %	0 %	25 %	385241644
5994	NC_017431	ATT	2	6	310931	310936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241644
5995	NC_017431	TCT	2	6	311073	311078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241645
5996	NC_017431	TAT	2	6	311082	311087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385241645
5997	NC_017431	CAA	2	6	311133	311138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385241645
5998	NC_017431	TTC	2	6	311162	311167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385241645
5999	NC_017431	TA	3	6	311215	311220	50 %	50 %	0 %	0 %	385241645
6000	NC_017431	CTC	2	6	311254	311259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385241645

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