MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 2527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017430	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	385240432
2	NC_017430	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	385240433
3	NC_017430	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	385240433
4	NC_017430	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	385240434
5	NC_017430	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	385240434
6	NC_017430	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	385240434
7	NC_017430	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	385240435
8	NC_017430	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	385240435
9	NC_017430	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	385240435
10	NC_017430	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	385240435
11	NC_017430	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	385240436
12	NC_017430	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	385240436
13	NC_017430	GGGA	2	8	6215	6222	25 %	0 %	75 %	0 %	385240436
14	NC_017430	GGTG	2	8	6518	6525	0 %	25 %	75 %	0 %	385240437
15	NC_017430	AAAT	2	8	6584	6591	75 %	25 %	0 %	0 %	385240437
16	NC_017430	AAGC	2	8	7821	7828	50 %	0 %	25 %	25 %	385240438
17	NC_017430	ATTG	2	8	8219	8226	25 %	50 %	25 %	0 %	385240439
18	NC_017430	AGCG	2	8	8686	8693	25 %	0 %	50 %	25 %	385240439
19	NC_017430	AAAG	2	8	8707	8714	75 %	0 %	25 %	0 %	385240439
20	NC_017430	CTTT	2	8	9047	9054	0 %	75 %	0 %	25 %	385240439
21	NC_017430	TTCG	2	8	9419	9426	0 %	50 %	25 %	25 %	385240440
22	NC_017430	AATT	2	8	9524	9531	50 %	50 %	0 %	0 %	385240440
23	NC_017430	ATGG	2	8	9583	9590	25 %	25 %	50 %	0 %	385240440
24	NC_017430	CTTT	2	8	10208	10215	0 %	75 %	0 %	25 %	385240441
25	NC_017430	GCAA	2	8	10425	10432	50 %	0 %	25 %	25 %	385240441
26	NC_017430	AGCC	2	8	10655	10662	25 %	0 %	25 %	50 %	385240441
27	NC_017430	GAAA	2	8	10798	10805	75 %	0 %	25 %	0 %	385240441
28	NC_017430	AATG	2	8	11541	11548	50 %	25 %	25 %	0 %	385240442
29	NC_017430	ATTT	2	8	12318	12325	25 %	75 %	0 %	0 %	385240442
30	NC_017430	GTTT	2	8	12573	12580	0 %	75 %	25 %	0 %	385240443
31	NC_017430	ATGC	2	8	13003	13010	25 %	25 %	25 %	25 %	385240443
32	NC_017430	TTGT	2	8	14039	14046	0 %	75 %	25 %	0 %	385240444
33	NC_017430	ATTT	2	8	14416	14423	25 %	75 %	0 %	0 %	385240444
34	NC_017430	TTTC	2	8	15078	15085	0 %	75 %	0 %	25 %	385240445
35	NC_017430	AAAT	2	8	15560	15567	75 %	25 %	0 %	0 %	385240445
36	NC_017430	GTAA	2	8	16402	16409	50 %	25 %	25 %	0 %	385240446
37	NC_017430	CTAA	2	8	16595	16602	50 %	25 %	0 %	25 %	385240446
38	NC_017430	AGAA	2	8	16858	16865	75 %	0 %	25 %	0 %	385240446
39	NC_017430	ATTT	2	8	17004	17011	25 %	75 %	0 %	0 %	385240446
40	NC_017430	CTTT	2	8	18565	18572	0 %	75 %	0 %	25 %	385240448
41	NC_017430	GAAG	2	8	19510	19517	50 %	0 %	50 %	0 %	385240448
42	NC_017430	TTTG	2	8	19536	19543	0 %	75 %	25 %	0 %	385240448
43	NC_017430	TGTA	2	8	20228	20235	25 %	50 %	25 %	0 %	385240449
44	NC_017430	GATG	2	8	21644	21651	25 %	25 %	50 %	0 %	385240451
45	NC_017430	CATT	2	8	22703	22710	25 %	50 %	0 %	25 %	385240451
46	NC_017430	GCTT	2	8	23046	23053	0 %	50 %	25 %	25 %	385240451
47	NC_017430	GGTT	2	8	23094	23101	0 %	50 %	50 %	0 %	385240451
48	NC_017430	TTCT	2	8	23464	23471	0 %	75 %	0 %	25 %	385240451
49	NC_017430	TAAC	2	8	23566	23573	50 %	25 %	0 %	25 %	385240451
50	NC_017430	CATT	2	8	23689	23696	25 %	50 %	0 %	25 %	385240451
51	NC_017430	GGTA	2	8	24059	24066	25 %	25 %	50 %	0 %	385240451
52	NC_017430	TTCG	2	8	25199	25206	0 %	50 %	25 %	25 %	385240452
53	NC_017430	TAGG	2	8	25278	25285	25 %	25 %	50 %	0 %	385240452
54	NC_017430	TTCC	2	8	25402	25409	0 %	50 %	0 %	50 %	385240452
55	NC_017430	TAGG	2	8	25516	25523	25 %	25 %	50 %	0 %	385240452
56	NC_017430	GCTT	2	8	26288	26295	0 %	50 %	25 %	25 %	385240452
57	NC_017430	GGAA	2	8	26871	26878	50 %	0 %	50 %	0 %	385240453
58	NC_017430	TTAA	2	8	26944	26951	50 %	50 %	0 %	0 %	385240453
59	NC_017430	AAAG	2	8	26994	27001	75 %	0 %	25 %	0 %	385240453
60	NC_017430	GGGC	2	8	27274	27281	0 %	0 %	75 %	25 %	385240453
61	NC_017430	GTTT	2	8	27557	27564	0 %	75 %	25 %	0 %	385240454
62	NC_017430	CAGA	2	8	27579	27586	50 %	0 %	25 %	25 %	385240454
63	NC_017430	CTTT	2	8	29551	29558	0 %	75 %	0 %	25 %	385240456
64	NC_017430	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385240456
65	NC_017430	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	385240456
66	NC_017430	TGGC	2	8	29764	29771	0 %	25 %	50 %	25 %	385240456
67	NC_017430	AAAG	2	8	30324	30331	75 %	0 %	25 %	0 %	385240457
68	NC_017430	AAAC	2	8	30394	30401	75 %	0 %	0 %	25 %	385240457
69	NC_017430	GATG	2	8	30537	30544	25 %	25 %	50 %	0 %	385240457
70	NC_017430	GATA	2	8	31646	31653	50 %	25 %	25 %	0 %	385240459
71	NC_017430	TGAT	2	8	34141	34148	25 %	50 %	25 %	0 %	385240462
72	NC_017430	AAGA	3	12	34269	34280	75 %	0 %	25 %	0 %	385240462
73	NC_017430	AAGC	2	8	34489	34496	50 %	0 %	25 %	25 %	385240463
74	NC_017430	GTTC	2	8	34522	34529	0 %	50 %	25 %	25 %	385240463
75	NC_017430	GGCA	2	8	34901	34908	25 %	0 %	50 %	25 %	385240464
76	NC_017430	TCGA	2	8	35158	35165	25 %	25 %	25 %	25 %	385240464
77	NC_017430	TGCT	2	8	35311	35318	0 %	50 %	25 %	25 %	385240464
78	NC_017430	TATG	2	8	35454	35461	25 %	50 %	25 %	0 %	385240464
79	NC_017430	TTGG	2	8	35543	35550	0 %	50 %	50 %	0 %	385240464
80	NC_017430	AGAT	2	8	36263	36270	50 %	25 %	25 %	0 %	385240464
81	NC_017430	CTTT	2	8	36636	36643	0 %	75 %	0 %	25 %	385240465
82	NC_017430	ATGA	2	8	37126	37133	50 %	25 %	25 %	0 %	385240465
83	NC_017430	TAGG	2	8	37285	37292	25 %	25 %	50 %	0 %	385240465
84	NC_017430	CAAT	2	8	37469	37476	50 %	25 %	0 %	25 %	385240465
85	NC_017430	AATG	2	8	38256	38263	50 %	25 %	25 %	0 %	385240465
86	NC_017430	AGAA	2	8	39093	39100	75 %	0 %	25 %	0 %	385240466
87	NC_017430	AAGA	2	8	39145	39152	75 %	0 %	25 %	0 %	385240466
88	NC_017430	ATCC	2	8	39153	39160	25 %	25 %	0 %	50 %	385240466
89	NC_017430	TAAT	2	8	39364	39371	50 %	50 %	0 %	0 %	385240466
90	NC_017430	GTGC	2	8	41453	41460	0 %	25 %	50 %	25 %	385240468
91	NC_017430	AGAA	2	8	41872	41879	75 %	0 %	25 %	0 %	385240468
92	NC_017430	GGAT	2	8	42024	42031	25 %	25 %	50 %	0 %	385240468
93	NC_017430	AAAC	2	8	43233	43240	75 %	0 %	0 %	25 %	385240471
94	NC_017430	CAAT	2	8	43437	43444	50 %	25 %	0 %	25 %	385240471
95	NC_017430	ATTT	2	8	44194	44201	25 %	75 %	0 %	0 %	385240473
96	NC_017430	GCTC	2	8	44502	44509	0 %	25 %	25 %	50 %	385240473
97	NC_017430	TTCT	2	8	44644	44651	0 %	75 %	0 %	25 %	385240473
98	NC_017430	TTGA	2	8	45244	45251	25 %	50 %	25 %	0 %	385240474
99	NC_017430	TGTT	2	8	45416	45423	0 %	75 %	25 %	0 %	385240474
100	NC_017430	CTAT	2	8	45446	45453	25 %	50 %	0 %	25 %	385240474
101	NC_017430	TGTT	2	8	45475	45482	0 %	75 %	25 %	0 %	385240474
102	NC_017430	CTAT	2	8	45771	45778	25 %	50 %	0 %	25 %	385240474
103	NC_017430	AAGA	2	8	46266	46273	75 %	0 %	25 %	0 %	385240475
104	NC_017430	AAGA	2	8	46323	46330	75 %	0 %	25 %	0 %	385240475
105	NC_017430	AAAG	2	8	46363	46370	75 %	0 %	25 %	0 %	385240475
106	NC_017430	AAGA	2	8	46478	46485	75 %	0 %	25 %	0 %	385240475
107	NC_017430	ACTT	2	8	46739	46746	25 %	50 %	0 %	25 %	385240475
108	NC_017430	ATGG	2	8	47365	47372	25 %	25 %	50 %	0 %	385240475
109	NC_017430	AGGA	2	8	47396	47403	50 %	0 %	50 %	0 %	385240475
110	NC_017430	GAAC	2	8	47943	47950	50 %	0 %	25 %	25 %	385240475
111	NC_017430	AACA	2	8	48187	48194	75 %	0 %	0 %	25 %	385240476
112	NC_017430	CTTT	2	8	49268	49275	0 %	75 %	0 %	25 %	385240477
113	NC_017430	GTAG	2	8	49286	49293	25 %	25 %	50 %	0 %	385240477
114	NC_017430	GAAG	2	8	50714	50721	50 %	0 %	50 %	0 %	385240478
115	NC_017430	TTCA	2	8	51136	51143	25 %	50 %	0 %	25 %	385240478
116	NC_017430	GGAA	2	8	52411	52418	50 %	0 %	50 %	0 %	385240480
117	NC_017430	TTAA	2	8	53152	53159	50 %	50 %	0 %	0 %	385240480
118	NC_017430	CCTT	2	8	53359	53366	0 %	50 %	0 %	50 %	385240481
119	NC_017430	TTTA	2	8	53526	53533	25 %	75 %	0 %	0 %	385240481
120	NC_017430	AAAG	2	8	53750	53757	75 %	0 %	25 %	0 %	385240481
121	NC_017430	GATT	2	8	53887	53894	25 %	50 %	25 %	0 %	385240481
122	NC_017430	AATC	2	8	53942	53949	50 %	25 %	0 %	25 %	385240481
123	NC_017430	TATT	2	8	54003	54010	25 %	75 %	0 %	0 %	385240481
124	NC_017430	GGAT	2	8	54262	54269	25 %	25 %	50 %	0 %	385240482
125	NC_017430	TCGA	2	8	54424	54431	25 %	25 %	25 %	25 %	385240482
126	NC_017430	CTTC	2	8	54509	54516	0 %	50 %	0 %	50 %	385240482
127	NC_017430	GAAT	2	8	54544	54551	50 %	25 %	25 %	0 %	385240482
128	NC_017430	TTGA	2	8	54614	54621	25 %	50 %	25 %	0 %	385240482
129	NC_017430	GGAA	2	8	54973	54980	50 %	0 %	50 %	0 %	385240482
130	NC_017430	CTGG	3	12	55872	55883	0 %	25 %	50 %	25 %	385240483
131	NC_017430	TTGC	2	8	56009	56016	0 %	50 %	25 %	25 %	385240483
132	NC_017430	AGCG	2	8	56049	56056	25 %	0 %	50 %	25 %	385240483
133	NC_017430	CGTT	2	8	59344	59351	0 %	50 %	25 %	25 %	385240485
134	NC_017430	GGAG	2	8	59353	59360	25 %	0 %	75 %	0 %	385240485
135	NC_017430	GTAA	2	8	59405	59412	50 %	25 %	25 %	0 %	385240485
136	NC_017430	ATGG	2	8	59632	59639	25 %	25 %	50 %	0 %	385240485
137	NC_017430	ATAA	2	8	59778	59785	75 %	25 %	0 %	0 %	385240485
138	NC_017430	ATGT	2	8	60228	60235	25 %	50 %	25 %	0 %	385240485
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