MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 20254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017430	TCA	2	6	213776	213781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240621
4002	NC_017430	CTTT	2	8	213794	213801	0 %	75 %	0 %	25 %	385240621
4003	NC_017430	CCAT	2	8	213824	213831	25 %	25 %	0 %	50 %	385240621
4004	NC_017430	GA	3	6	213842	213847	50 %	0 %	50 %	0 %	385240621
4005	NC_017430	T	6	6	213862	213867	0 %	100 %	0 %	0 %	385240621
4006	NC_017430	AGG	2	6	213886	213891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240621
4007	NC_017430	CATT	2	8	213908	213915	25 %	50 %	0 %	25 %	385240621
4008	NC_017430	AGA	2	6	213942	213947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240621
4009	NC_017430	CAA	2	6	213955	213960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240621
4010	NC_017430	ATA	4	12	213998	214009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240621
4011	NC_017430	GCT	2	6	214067	214072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240621
4012	NC_017430	GAA	2	6	214152	214157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240621
4013	NC_017430	ACG	2	6	214168	214173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240621
4014	NC_017430	AGCG	2	8	214278	214285	25 %	0 %	50 %	25 %	385240621
4015	NC_017430	CT	3	6	214315	214320	0 %	50 %	0 %	50 %	385240621
4016	NC_017430	CT	3	6	214323	214328	0 %	50 %	0 %	50 %	385240621
4017	NC_017430	AGC	2	6	214330	214335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240621
4018	NC_017430	A	6	6	214402	214407	100 %	0 %	0 %	0 %	385240621
4019	NC_017430	CAC	2	6	214422	214427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240621
4020	NC_017430	TGTTT	2	10	214472	214481	0 %	80 %	20 %	0 %	385240621
4021	NC_017430	CTA	2	6	214524	214529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240621
4022	NC_017430	TCT	2	6	214544	214549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240621
4023	NC_017430	TAGA	2	8	214575	214582	50 %	25 %	25 %	0 %	385240621
4024	NC_017430	CTTGT	2	10	214653	214662	0 %	60 %	20 %	20 %	385240621
4025	NC_017430	ATT	2	6	214669	214674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240621
4026	NC_017430	CAT	2	6	214743	214748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240621
4027	NC_017430	AGA	2	6	214845	214850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240621
4028	NC_017430	CG	3	6	214948	214953	0 %	0 %	50 %	50 %	385240621
4029	NC_017430	CTGGAT	2	12	214980	214991	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385240621
4030	NC_017430	GTA	2	6	215205	215210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240621
4031	NC_017430	ACC	2	6	215219	215224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240621
4032	NC_017430	CTTG	2	8	215247	215254	0 %	50 %	25 %	25 %	385240621
4033	NC_017430	GAAATA	2	12	215303	215314	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385240621
4034	NC_017430	AAC	2	6	215335	215340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240621
4035	NC_017430	CCA	2	6	215385	215390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240621
4036	NC_017430	CGT	2	6	215496	215501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240621
4037	NC_017430	TTTCT	2	10	215503	215512	0 %	80 %	0 %	20 %	385240621
4038	NC_017430	TAA	2	6	215532	215537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240622
4039	NC_017430	CTG	2	6	215570	215575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240622
4040	NC_017430	CTT	2	6	215700	215705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240622
4041	NC_017430	ACG	2	6	215838	215843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240622
4042	NC_017430	ACA	2	6	216085	216090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240623
4043	NC_017430	AATA	2	8	216130	216137	75 %	25 %	0 %	0 %	385240623
4044	NC_017430	CTT	2	6	216180	216185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240623
4045	NC_017430	AAC	2	6	216188	216193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240623
4046	NC_017430	TTG	2	6	216313	216318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240623
4047	NC_017430	TCC	2	6	216323	216328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240623
4048	NC_017430	AAG	2	6	216363	216368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240623
4049	NC_017430	CTT	2	6	216369	216374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240623
4050	NC_017430	CTT	2	6	216396	216401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240623
4051	NC_017430	TGC	2	6	216456	216461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240623
4052	NC_017430	CCA	2	6	216518	216523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240623
4053	NC_017430	CAAA	2	8	216538	216545	75 %	0 %	0 %	25 %	385240623
4054	NC_017430	GCA	2	6	216569	216574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240623
4055	NC_017430	CAA	2	6	216582	216587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240623
4056	NC_017430	TAC	2	6	216633	216638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240623
4057	NC_017430	CTT	2	6	216696	216701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240623
4058	NC_017430	CTC	2	6	216721	216726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240623
4059	NC_017430	TA	3	6	216823	216828	50 %	50 %	0 %	0 %	385240624
4060	NC_017430	ATG	2	6	216876	216881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240624
4061	NC_017430	TGT	2	6	216884	216889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240624
4062	NC_017430	GC	3	6	216949	216954	0 %	0 %	50 %	50 %	385240624
4063	NC_017430	AGA	2	6	217011	217016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240624
4064	NC_017430	ATT	2	6	217026	217031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240624
4065	NC_017430	CTG	2	6	217178	217183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240624
4066	NC_017430	CAC	2	6	217206	217211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240624
4067	NC_017430	TCT	2	6	217276	217281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240624
4068	NC_017430	C	6	6	217320	217325	0 %	0 %	0 %	100 %	385240624
4069	NC_017430	ATGA	2	8	217326	217333	50 %	25 %	25 %	0 %	385240624
4070	NC_017430	T	6	6	217360	217365	0 %	100 %	0 %	0 %	385240624
4071	NC_017430	GCA	2	6	217448	217453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240624
4072	NC_017430	GAA	2	6	217466	217471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240624
4073	NC_017430	GAAA	2	8	217519	217526	75 %	0 %	25 %	0 %	385240624
4074	NC_017430	TCA	2	6	217567	217572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240624
4075	NC_017430	ATG	2	6	217582	217587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240624
4076	NC_017430	TCC	2	6	217593	217598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240624
4077	NC_017430	T	6	6	217599	217604	0 %	100 %	0 %	0 %	385240624
4078	NC_017430	TAA	2	6	217679	217684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240624
4079	NC_017430	AGC	2	6	217725	217730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240624
4080	NC_017430	GAT	2	6	217760	217765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240624
4081	NC_017430	T	7	7	217902	217908	0 %	100 %	0 %	0 %	385240624
4082	NC_017430	AGA	2	6	218192	218197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240625
4083	NC_017430	AGT	2	6	218217	218222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240625
4084	NC_017430	CTC	2	6	218276	218281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240625
4085	NC_017430	AAC	2	6	218290	218295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240625
4086	NC_017430	ACA	2	6	218316	218321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240625
4087	NC_017430	TC	3	6	218393	218398	0 %	50 %	0 %	50 %	385240625
4088	NC_017430	TTC	2	6	218399	218404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240625
4089	NC_017430	AAAG	2	8	218410	218417	75 %	0 %	25 %	0 %	385240625
4090	NC_017430	TAC	2	6	218432	218437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240625
4091	NC_017430	TGC	2	6	218450	218455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240625
4092	NC_017430	GAA	2	6	218499	218504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240625
4093	NC_017430	T	6	6	218534	218539	0 %	100 %	0 %	0 %	385240625
4094	NC_017430	TAA	2	6	218585	218590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240625
4095	NC_017430	TCT	2	6	218650	218655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240625
4096	NC_017430	GTC	2	6	218656	218661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240625
4097	NC_017430	TCT	2	6	218695	218700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240625
4098	NC_017430	TTC	2	6	218748	218753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240625
4099	NC_017430	CTT	2	6	218804	218809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240625
4100	NC_017430	AAT	2	6	218883	218888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240625
4101	NC_017430	ATT	2	6	218970	218975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240625
4102	NC_017430	CTT	2	6	218993	218998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240625
4103	NC_017430	GTT	2	6	219004	219009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240625
4104	NC_017430	A	6	6	219024	219029	100 %	0 %	0 %	0 %	385240625
4105	NC_017430	TTCC	2	8	219058	219065	0 %	50 %	0 %	50 %	385240625
4106	NC_017430	TTC	2	6	219122	219127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240625
4107	NC_017430	ATC	2	6	219147	219152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240625
4108	NC_017430	TAA	3	9	219257	219265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240625
4109	NC_017430	TA	3	6	219362	219367	50 %	50 %	0 %	0 %	385240625
4110	NC_017430	CTG	2	6	219404	219409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240625
4111	NC_017430	CTT	2	6	219425	219430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240625
4112	NC_017430	TCA	2	6	219448	219453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240625
4113	NC_017430	ATG	2	6	219959	219964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240626
4114	NC_017430	GAT	2	6	220017	220022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240626
4115	NC_017430	AGA	2	6	220036	220041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240626
4116	NC_017430	AAC	2	6	220061	220066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240626
4117	NC_017430	CTC	2	6	220109	220114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240626
4118	NC_017430	T	7	7	220129	220135	0 %	100 %	0 %	0 %	385240626
4119	NC_017430	A	6	6	220139	220144	100 %	0 %	0 %	0 %	385240626
4120	NC_017430	CTC	2	6	220154	220159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240626
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4122	NC_017430	ATT	2	6	220176	220181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240626
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4237	NC_017430	A	7	7	224923	224929	100 %	0 %	0 %	0 %	385240630
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4362	NC_017430	TAA	2	6	231725	231730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240636
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4365	NC_017430	TGA	2	6	231821	231826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240636
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4491	NC_017430	CT	4	8	239100	239107	0 %	50 %	0 %	50 %	385240641
4492	NC_017430	CAG	2	6	239253	239258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240641
4493	NC_017430	CAG	2	6	239392	239397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240641
4494	NC_017430	AC	3	6	239533	239538	50 %	0 %	0 %	50 %	385240641
4495	NC_017430	TCTCCT	2	12	239748	239759	0 %	50 %	0 %	50 %	385240641
4496	NC_017430	TCTTT	2	10	239845	239854	0 %	80 %	0 %	20 %	385240641
4497	NC_017430	TAG	3	9	239859	239867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240641
4498	NC_017430	TTCT	2	8	239933	239940	0 %	75 %	0 %	25 %	385240642
4499	NC_017430	AAT	2	6	239955	239960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240642
4500	NC_017430	GTC	2	6	240060	240065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240642

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