MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 20254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017430	GCT	2	6	187071	187076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240593
3503	NC_017430	TTC	2	6	187250	187255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240593
3504	NC_017430	GCTT	2	8	187376	187383	0 %	50 %	25 %	25 %	385240593
3505	NC_017430	TAG	2	6	187414	187419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240593
3506	NC_017430	GAT	2	6	187452	187457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240593
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3511	NC_017430	CCT	2	6	188592	188597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240594
3512	NC_017430	CGTA	2	8	188732	188739	25 %	25 %	25 %	25 %	385240595
3513	NC_017430	G	9	9	188751	188759	0 %	0 %	100 %	0 %	385240595
3514	NC_017430	TCC	2	6	188785	188790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240595
3515	NC_017430	CAG	2	6	188793	188798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240595
3516	NC_017430	A	6	6	188812	188817	100 %	0 %	0 %	0 %	385240595
3517	NC_017430	AGA	2	6	188827	188832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240595
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3521	NC_017430	AGA	2	6	188908	188913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240595
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3529	NC_017430	ACTTCT	2	12	189309	189320	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385240595
3530	NC_017430	GCA	2	6	189341	189346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240595
3531	NC_017430	GAA	2	6	189367	189372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240595
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3533	NC_017430	GAC	2	6	189487	189492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240595
3534	NC_017430	TGA	2	6	189562	189567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240595
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3536	NC_017430	TGCT	2	8	189638	189645	0 %	50 %	25 %	25 %	385240595
3537	NC_017430	AGAA	2	8	189693	189700	75 %	0 %	25 %	0 %	385240595
3538	NC_017430	GAG	2	6	189716	189721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240595
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3540	NC_017430	AAC	2	6	189780	189785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240595
3541	NC_017430	GGATC	2	10	189800	189809	20 %	20 %	40 %	20 %	385240595
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3543	NC_017430	CAGAT	2	10	189915	189924	40 %	20 %	20 %	20 %	385240595
3544	NC_017430	GTAT	2	8	189927	189934	25 %	50 %	25 %	0 %	385240595
3545	NC_017430	GGA	2	6	189940	189945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240595
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3551	NC_017430	CTG	2	6	190416	190421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240595
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3553	NC_017430	ATC	2	6	190545	190550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240595
3554	NC_017430	TCG	2	6	190551	190556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240595
3555	NC_017430	ATT	2	6	190560	190565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240595
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3557	NC_017430	CAA	2	6	190828	190833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240596
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3570	NC_017430	TTA	2	6	191574	191579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240596
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3609	NC_017430	CAT	2	6	193800	193805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240600
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3994	NC_017430	TA	3	6	213513	213518	50 %	50 %	0 %	0 %	385240621
3995	NC_017430	TTC	2	6	213541	213546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240621
3996	NC_017430	GCA	2	6	213551	213556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240621
3997	NC_017430	GCT	2	6	213560	213565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240621
3998	NC_017430	GGA	2	6	213617	213622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240621
3999	NC_017430	T	6	6	213685	213690	0 %	100 %	0 %	0 %	385240621
4000	NC_017430	AACG	2	8	213733	213740	50 %	0 %	25 %	25 %	385240621

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