MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 20254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017430	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240455
502	NC_017430	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240455
503	NC_017430	TTC	2	6	28689	28694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240455
504	NC_017430	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385240455
505	NC_017430	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240455
506	NC_017430	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385240455
507	NC_017430	GAA	2	6	29071	29076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240455
508	NC_017430	TGT	2	6	29103	29108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240456
509	NC_017430	TCT	2	6	29171	29176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240456
510	NC_017430	ACA	2	6	29399	29404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240456
511	NC_017430	ATG	2	6	29409	29414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240456
512	NC_017430	CTTT	2	8	29551	29558	0 %	75 %	0 %	25 %	385240456
513	NC_017430	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385240456
514	NC_017430	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	385240456
515	NC_017430	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385240456
516	NC_017430	T	6	6	29636	29641	0 %	100 %	0 %	0 %	385240456
517	NC_017430	ATC	2	6	29715	29720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240456
518	NC_017430	TGGC	2	8	29764	29771	0 %	25 %	50 %	25 %	385240456
519	NC_017430	T	8	8	29870	29877	0 %	100 %	0 %	0 %	385240456
520	NC_017430	ATG	2	6	29895	29900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240456
521	NC_017430	GA	3	6	29933	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	385240456
522	NC_017430	AG	3	6	30031	30036	50 %	0 %	50 %	0 %	385240457
523	NC_017430	GTT	2	6	30112	30117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240457
524	NC_017430	GAA	2	6	30121	30126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240457
525	NC_017430	TC	3	6	30140	30145	0 %	50 %	0 %	50 %	385240457
526	NC_017430	TCT	2	6	30187	30192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240457
527	NC_017430	ACT	2	6	30277	30282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240457
528	NC_017430	TTC	2	6	30305	30310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240457
529	NC_017430	AAAG	2	8	30324	30331	75 %	0 %	25 %	0 %	385240457
530	NC_017430	CCT	2	6	30341	30346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240457
531	NC_017430	AAAC	2	8	30394	30401	75 %	0 %	0 %	25 %	385240457
532	NC_017430	T	6	6	30411	30416	0 %	100 %	0 %	0 %	385240457
533	NC_017430	GAAGG	2	10	30419	30428	40 %	0 %	60 %	0 %	385240457
534	NC_017430	GGC	2	6	30447	30452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385240457
535	NC_017430	GAT	2	6	30526	30531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240457
536	NC_017430	GATG	2	8	30537	30544	25 %	25 %	50 %	0 %	385240457
537	NC_017430	TAG	2	6	30548	30553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240457
538	NC_017430	GTT	2	6	30622	30627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240457
539	NC_017430	TAA	2	6	30732	30737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240457
540	NC_017430	GA	3	6	30761	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	385240457
541	NC_017430	GAA	2	6	30871	30876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240457
542	NC_017430	AGA	2	6	30891	30896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240457
543	NC_017430	TCG	2	6	30954	30959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240457
544	NC_017430	ATG	2	6	30988	30993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240457
545	NC_017430	TGG	2	6	31002	31007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240457
546	NC_017430	GAA	2	6	31033	31038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240457
547	NC_017430	ATT	2	6	31069	31074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240457
548	NC_017430	ATG	2	6	31192	31197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240457
549	NC_017430	AAG	2	6	31204	31209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240457
550	NC_017430	T	6	6	31210	31215	0 %	100 %	0 %	0 %	385240457
551	NC_017430	GA	3	6	31229	31234	50 %	0 %	50 %	0 %	385240457
552	NC_017430	A	7	7	31252	31258	100 %	0 %	0 %	0 %	385240457
553	NC_017430	ACA	2	6	31298	31303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240458
554	NC_017430	TGT	2	6	31319	31324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240458
555	NC_017430	AT	3	6	31370	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	385240458
556	NC_017430	T	6	6	31438	31443	0 %	100 %	0 %	0 %	385240458
557	NC_017430	GAGCT	2	10	31459	31468	20 %	20 %	40 %	20 %	385240458
558	NC_017430	A	6	6	31533	31538	100 %	0 %	0 %	0 %	385240458
559	NC_017430	A	6	6	31564	31569	100 %	0 %	0 %	0 %	385240458
560	NC_017430	TGC	2	6	31592	31597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240458
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563	NC_017430	TC	3	6	31655	31660	0 %	50 %	0 %	50 %	385240459
564	NC_017430	AAG	2	6	31859	31864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240459
565	NC_017430	AAG	2	6	31866	31871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240459
566	NC_017430	CTT	2	6	31905	31910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240459
567	NC_017430	CGT	2	6	31936	31941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240459
568	NC_017430	TGA	2	6	31982	31987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240459
569	NC_017430	GAG	2	6	32013	32018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240459
570	NC_017430	GCG	2	6	32055	32060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385240459
571	NC_017430	GC	3	6	32085	32090	0 %	0 %	50 %	50 %	385240459
572	NC_017430	CT	3	6	32135	32140	0 %	50 %	0 %	50 %	385240459
573	NC_017430	AGA	2	6	32233	32238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240459
574	NC_017430	AG	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	385240459
575	NC_017430	AAG	2	6	32421	32426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240459
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592	NC_017430	AG	3	6	33777	33782	50 %	0 %	50 %	0 %	385240461
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595	NC_017430	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	385240462
596	NC_017430	GTC	2	6	33947	33952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240462
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599	NC_017430	TTA	2	6	34076	34081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240462
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601	NC_017430	GAA	2	6	34169	34174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240462
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604	NC_017430	AAGA	3	12	34269	34280	75 %	0 %	25 %	0 %	385240462
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609	NC_017430	GAA	2	6	34389	34394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240462
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611	NC_017430	GTTC	2	8	34522	34529	0 %	50 %	25 %	25 %	385240463
612	NC_017430	GAT	2	6	34600	34605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240463
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614	NC_017430	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	385240463
615	NC_017430	AGA	2	6	34666	34671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240463
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617	NC_017430	TGA	2	6	34862	34867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240464
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623	NC_017430	GAG	2	6	35170	35175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240464
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627	NC_017430	TATG	2	8	35454	35461	25 %	50 %	25 %	0 %	385240464
628	NC_017430	GCA	2	6	35505	35510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240464
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