MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11222 chromosome

Total Repeats: 20254

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017430	TCC	2	6	240105	240110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240642
4502	NC_017430	ACGG	2	8	240118	240125	25 %	0 %	50 %	25 %	385240642
4503	NC_017430	AGA	2	6	240138	240143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240642
4504	NC_017430	CAA	2	6	240168	240173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240642
4505	NC_017430	TCA	2	6	240226	240231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240642
4506	NC_017430	A	6	6	240245	240250	100 %	0 %	0 %	0 %	385240642
4507	NC_017430	TCT	2	6	240253	240258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240642
4508	NC_017430	AAACCA	2	12	240323	240334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240642
4509	NC_017430	A	6	6	240344	240349	100 %	0 %	0 %	0 %	385240642
4510	NC_017430	AATCT	2	10	240439	240448	40 %	40 %	0 %	20 %	385240643
4511	NC_017430	TCA	2	6	240464	240469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240643
4512	NC_017430	CA	3	6	240481	240486	50 %	0 %	0 %	50 %	385240643
4513	NC_017430	ACT	2	6	240629	240634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240643
4514	NC_017430	AGAT	2	8	240643	240650	50 %	25 %	25 %	0 %	385240643
4515	NC_017430	CTT	2	6	240705	240710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240643
4516	NC_017430	CTG	2	6	240711	240716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240643
4517	NC_017430	T	6	6	240730	240735	0 %	100 %	0 %	0 %	385240643
4518	NC_017430	AAT	2	6	240796	240801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240643
4519	NC_017430	ATTA	2	8	240838	240845	50 %	50 %	0 %	0 %	385240643
4520	NC_017430	T	7	7	240896	240902	0 %	100 %	0 %	0 %	385240644
4521	NC_017430	AAT	2	6	240968	240973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240644
4522	NC_017430	TC	3	6	241092	241097	0 %	50 %	0 %	50 %	385240644
4523	NC_017430	AGA	2	6	241139	241144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240644
4524	NC_017430	CTA	2	6	241213	241218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240644
4525	NC_017430	GAA	3	9	241243	241251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240644
4526	NC_017430	T	6	6	241252	241257	0 %	100 %	0 %	0 %	385240644
4527	NC_017430	CTC	2	6	241276	241281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240644
4528	NC_017430	TCCA	2	8	241319	241326	25 %	25 %	0 %	50 %	385240644
4529	NC_017430	CT	3	6	241472	241477	0 %	50 %	0 %	50 %	385240644
4530	NC_017430	CA	4	8	241502	241509	50 %	0 %	0 %	50 %	385240644
4531	NC_017430	CCA	2	6	241519	241524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240644
4532	NC_017430	GAA	2	6	241575	241580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240644
4533	NC_017430	GTT	2	6	241594	241599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240644
4534	NC_017430	AAT	2	6	241708	241713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240645
4535	NC_017430	TTAA	2	8	241729	241736	50 %	50 %	0 %	0 %	385240645
4536	NC_017430	CT	3	6	241751	241756	0 %	50 %	0 %	50 %	385240645
4537	NC_017430	TAG	2	6	241790	241795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240645
4538	NC_017430	CTC	2	6	241826	241831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385240645
4539	NC_017430	TAA	2	6	241845	241850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240645
4540	NC_017430	AG	3	6	241857	241862	50 %	0 %	50 %	0 %	385240645
4541	NC_017430	T	8	8	241878	241885	0 %	100 %	0 %	0 %	385240645
4542	NC_017430	TGA	2	6	241887	241892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240645
4543	NC_017430	TCT	2	6	241913	241918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240645
4544	NC_017430	AAG	2	6	241937	241942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240645
4545	NC_017430	TAA	2	6	242012	242017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240645
4546	NC_017430	GAA	2	6	242056	242061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240645
4547	NC_017430	CAAT	2	8	242069	242076	50 %	25 %	0 %	25 %	385240645
4548	NC_017430	CAA	2	6	242115	242120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240645
4549	NC_017430	ACA	2	6	242196	242201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240645
4550	NC_017430	ACAA	2	8	242222	242229	75 %	0 %	0 %	25 %	385240645
4551	NC_017430	CTT	2	6	242234	242239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240645
4552	NC_017430	TCT	2	6	242266	242271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240645
4553	NC_017430	ACT	2	6	242322	242327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240645
4554	NC_017430	CAG	2	6	242417	242422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240645
4555	NC_017430	GAAAA	2	10	242467	242476	80 %	0 %	20 %	0 %	385240645
4556	NC_017430	AAG	2	6	242487	242492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240645
4557	NC_017430	AGCT	2	8	242505	242512	25 %	25 %	25 %	25 %	385240645
4558	NC_017430	TCT	2	6	242564	242569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240645
4559	NC_017430	CA	3	6	242621	242626	50 %	0 %	0 %	50 %	385240645
4560	NC_017430	GAG	2	6	242657	242662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240645
4561	NC_017430	TCT	2	6	242672	242677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240645
4562	NC_017430	A	7	7	242731	242737	100 %	0 %	0 %	0 %	385240645
4563	NC_017430	ATT	2	6	242829	242834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385240645
4564	NC_017430	TGC	2	6	242848	242853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240645
4565	NC_017430	T	6	6	242859	242864	0 %	100 %	0 %	0 %	385240645
4566	NC_017430	GAA	2	6	242888	242893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385240645
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4568	NC_017430	ATC	2	6	242940	242945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240645
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4570	NC_017430	ACT	2	6	243036	243041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240645
4571	NC_017430	CAA	2	6	243062	243067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240645
4572	NC_017430	TA	4	8	243081	243088	50 %	50 %	0 %	0 %	385240645
4573	NC_017430	CGAT	2	8	243113	243120	25 %	25 %	25 %	25 %	385240645
4574	NC_017430	ACA	2	6	243139	243144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240645
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4577	NC_017430	TGC	2	6	243204	243209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385240645
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4579	NC_017430	CAG	2	6	243218	243223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240645
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4581	NC_017430	TAG	2	6	243305	243310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240645
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4586	NC_017430	A	7	7	243713	243719	100 %	0 %	0 %	0 %	385240646
4587	NC_017430	CTTC	2	8	243732	243739	0 %	50 %	0 %	50 %	385240646
4588	NC_017430	CAGA	2	8	243772	243779	50 %	0 %	25 %	25 %	385240646
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4591	NC_017430	GCTG	2	8	243954	243961	0 %	25 %	50 %	25 %	385240646
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4594	NC_017430	TAAAC	2	10	244037	244046	60 %	20 %	0 %	20 %	385240646
4595	NC_017430	ACA	2	6	244071	244076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385240646
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4601	NC_017430	CTTGG	2	10	244218	244227	0 %	40 %	40 %	20 %	385240646
4602	NC_017430	TGT	2	6	244265	244270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385240646
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4607	NC_017430	TGA	2	6	244409	244414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385240646
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4609	NC_017430	ACC	2	6	244441	244446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385240646
4610	NC_017430	CAG	2	6	244555	244560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240646
4611	NC_017430	TAAT	2	8	244561	244568	50 %	50 %	0 %	0 %	385240646
4612	NC_017430	TGG	2	6	244577	244582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385240646
4613	NC_017430	ATTT	2	8	244662	244669	25 %	75 %	0 %	0 %	385240646
4614	NC_017430	CAT	2	6	244711	244716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240647
4615	NC_017430	TCT	2	6	244723	244728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240647
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4618	NC_017430	GCA	2	6	244879	244884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385240647
4619	NC_017430	TTCA	2	8	244893	244900	25 %	50 %	0 %	25 %	385240647
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4622	NC_017430	CTT	2	6	245112	245117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385240647
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4624	NC_017430	AGG	2	6	245226	245231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385240647
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4626	NC_017430	CTA	2	6	245302	245307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385240647
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4743	NC_017430	CAAA	2	8	251030	251037	75 %	0 %	0 %	25 %	385240654
4744	NC_017430	ATA	2	6	251053	251058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385240654
4745	NC_017430	CAAT	2	8	251140	251147	50 %	25 %	0 %	25 %	385240654
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4998	NC_017430	TG	3	6	263581	263586	0 %	50 %	50 %	0 %	385240667
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