MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 657

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017429	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	385239513
2	NC_017429	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	385239514
3	NC_017429	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	385239514
4	NC_017429	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	385239514
5	NC_017429	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	385239514
6	NC_017429	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	385239515
7	NC_017429	TGGTA	2	10	7691	7700	20 %	40 %	40 %	0 %	385239517
8	NC_017429	CGAAA	2	10	9099	9108	60 %	0 %	20 %	20 %	385239518
9	NC_017429	GGCTG	2	10	9733	9742	0 %	20 %	60 %	20 %	385239519
10	NC_017429	CCTCT	2	10	10525	10534	0 %	40 %	0 %	60 %	385239520
11	NC_017429	AAAGG	2	10	10684	10693	60 %	0 %	40 %	0 %	385239520
12	NC_017429	AAGAA	2	10	11804	11813	80 %	0 %	20 %	0 %	385239521
13	NC_017429	AAAGA	2	10	13202	13211	80 %	0 %	20 %	0 %	385239522
14	NC_017429	GGTGT	2	10	13306	13315	0 %	40 %	60 %	0 %	385239522
15	NC_017429	GATTT	2	10	15049	15058	20 %	60 %	20 %	0 %	385239524
16	NC_017429	CGTTC	2	10	16160	16169	0 %	40 %	20 %	40 %	385239525
17	NC_017429	GCTTC	2	10	16533	16542	0 %	40 %	20 %	40 %	385239525
18	NC_017429	GAAGG	2	10	16904	16913	40 %	0 %	60 %	0 %	385239525
19	NC_017429	GTTGT	2	10	20330	20339	0 %	60 %	40 %	0 %	385239528
20	NC_017429	AAGAT	2	10	21442	21451	60 %	20 %	20 %	0 %	385239530
21	NC_017429	TTTGC	2	10	22053	22062	0 %	60 %	20 %	20 %	385239530
22	NC_017429	GGAAA	2	10	23807	23816	60 %	0 %	40 %	0 %	385239530
23	NC_017429	AGAGG	2	10	25532	25541	40 %	0 %	60 %	0 %	385239531
24	NC_017429	GGAGA	2	10	27311	27320	40 %	0 %	60 %	0 %	385239532
25	NC_017429	GGATA	2	10	27337	27346	40 %	20 %	40 %	0 %	385239532
26	NC_017429	ATCCG	2	10	28062	28071	20 %	20 %	20 %	40 %	385239534
27	NC_017429	AGGGT	2	10	28580	28589	20 %	20 %	60 %	0 %	385239534
28	NC_017429	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385239535
29	NC_017429	GAAGG	2	10	30419	30428	40 %	0 %	60 %	0 %	385239536
30	NC_017429	GAGCT	2	10	31459	31468	20 %	20 %	40 %	20 %	385239537
31	NC_017429	CTATT	2	10	36133	36142	20 %	60 %	0 %	20 %	385239543
32	NC_017429	TCCTA	2	10	36180	36189	20 %	40 %	0 %	40 %	385239543
33	NC_017429	ACGAT	2	10	38096	38105	40 %	20 %	20 %	20 %	385239544
34	NC_017429	TTTGA	2	10	38461	38470	20 %	60 %	20 %	0 %	385239544
35	NC_017429	AGCAA	2	10	42112	42121	60 %	0 %	20 %	20 %	385239547
36	NC_017429	CGATG	2	10	42169	42178	20 %	20 %	40 %	20 %	385239547
37	NC_017429	TGCAA	2	10	42327	42336	40 %	20 %	20 %	20 %	385239548
38	NC_017429	CAAAA	2	10	42646	42655	80 %	0 %	0 %	20 %	385239548
39	NC_017429	TTTAT	2	10	44243	44252	20 %	80 %	0 %	0 %	385239552
40	NC_017429	CTTTC	2	10	46339	46348	0 %	60 %	0 %	40 %	385239554
41	NC_017429	AGTTT	2	10	46878	46887	20 %	60 %	20 %	0 %	385239554
42	NC_017429	CTTTT	2	10	50041	50050	0 %	80 %	0 %	20 %	385239557
43	NC_017429	CCGTA	2	10	53768	53777	20 %	20 %	20 %	40 %	385239560
44	NC_017429	TCAGA	2	10	54626	54635	40 %	20 %	20 %	20 %	385239561
45	NC_017429	TTATC	2	10	55153	55162	20 %	60 %	0 %	20 %	385239561
46	NC_017429	TGAGT	2	10	55174	55183	20 %	40 %	40 %	0 %	385239561
47	NC_017429	GTTGT	2	10	56221	56230	0 %	60 %	40 %	0 %	385239562
48	NC_017429	GAGCA	2	10	59733	59742	40 %	0 %	40 %	20 %	385239564
49	NC_017429	TGTGA	2	10	62182	62191	20 %	40 %	40 %	0 %	385239566
50	NC_017429	AGTGA	2	10	63709	63718	40 %	20 %	40 %	0 %	385239567
51	NC_017429	CCTTC	2	10	63983	63992	0 %	40 %	0 %	60 %	385239567
52	NC_017429	AGGAG	2	10	66211	66220	40 %	0 %	60 %	0 %	385239569
53	NC_017429	GTTAA	2	10	66341	66350	40 %	40 %	20 %	0 %	385239569
54	NC_017429	CAAGC	2	10	68719	68728	40 %	0 %	20 %	40 %	385239571
55	NC_017429	GCGAT	2	10	69779	69788	20 %	20 %	40 %	20 %	385239572
56	NC_017429	CTCTT	2	10	70133	70142	0 %	60 %	0 %	40 %	385239572
57	NC_017429	AGGGG	2	10	70779	70788	20 %	0 %	80 %	0 %	385239572
58	NC_017429	AAGAA	2	10	70821	70830	80 %	0 %	20 %	0 %	385239572
59	NC_017429	ATTGG	2	10	72111	72120	20 %	40 %	40 %	0 %	385239574
60	NC_017429	GAAAA	2	10	73183	73192	80 %	0 %	20 %	0 %	385239574
61	NC_017429	TGGGA	2	10	73600	73609	20 %	20 %	60 %	0 %	385239575
62	NC_017429	TATTT	2	10	76127	76136	20 %	80 %	0 %	0 %	385239576
63	NC_017429	TGTCT	2	10	79920	79929	0 %	60 %	20 %	20 %	385239580
64	NC_017429	TTACT	2	10	80427	80436	20 %	60 %	0 %	20 %	385239580
65	NC_017429	AGAAA	2	10	81817	81826	80 %	0 %	20 %	0 %	385239582
66	NC_017429	GGAAG	2	10	82330	82339	40 %	0 %	60 %	0 %	385239582
67	NC_017429	GATCC	2	10	85881	85890	20 %	20 %	20 %	40 %	385239585
68	NC_017429	AGAGC	2	10	87216	87225	40 %	0 %	40 %	20 %	385239586
69	NC_017429	TTTTC	2	10	90948	90957	0 %	80 %	0 %	20 %	385239589
70	NC_017429	GGATG	2	10	91208	91217	20 %	20 %	60 %	0 %	385239590
71	NC_017429	CAACA	2	10	92747	92756	60 %	0 %	0 %	40 %	385239591
72	NC_017429	ACAGC	2	10	93792	93801	40 %	0 %	20 %	40 %	385239593
73	NC_017429	GGAAC	2	10	94504	94513	40 %	0 %	40 %	20 %	385239594
74	NC_017429	GGATT	2	10	95404	95413	20 %	40 %	40 %	0 %	385239594
75	NC_017429	CAATC	2	10	96506	96515	40 %	20 %	0 %	40 %	385239596
76	NC_017429	TTTGC	2	10	96640	96649	0 %	60 %	20 %	20 %	385239596
77	NC_017429	ATTCA	2	10	96904	96913	40 %	40 %	0 %	20 %	385239596
78	NC_017429	GATCC	2	10	97163	97172	20 %	20 %	20 %	40 %	385239596
79	NC_017429	GTTTT	2	10	97584	97593	0 %	80 %	20 %	0 %	385239596
80	NC_017429	AAGCT	2	10	98787	98796	40 %	20 %	20 %	20 %	385239597
81	NC_017429	AGGGG	2	10	99146	99155	20 %	0 %	80 %	0 %	385239597
82	NC_017429	ATAGC	2	10	99845	99854	40 %	20 %	20 %	20 %	385239598
83	NC_017429	TTCCC	2	10	100449	100458	0 %	40 %	0 %	60 %	385239599
84	NC_017429	AGCGA	2	10	102773	102782	40 %	0 %	40 %	20 %	385239601
85	NC_017429	TTTCT	2	10	103131	103140	0 %	80 %	0 %	20 %	385239601
86	NC_017429	CTTCT	2	10	103185	103194	0 %	60 %	0 %	40 %	385239601
87	NC_017429	ATCAT	2	10	104337	104346	40 %	40 %	0 %	20 %	385239602
88	NC_017429	GGCAT	2	10	105045	105054	20 %	20 %	40 %	20 %	385239602
89	NC_017429	AAAGC	2	10	108771	108780	60 %	0 %	20 %	20 %	385239605
90	NC_017429	GCATT	2	10	109931	109940	20 %	40 %	20 %	20 %	385239607
91	NC_017429	TGTTT	2	10	114608	114617	0 %	80 %	20 %	0 %	385239610
92	NC_017429	CATGT	2	10	114986	114995	20 %	40 %	20 %	20 %	385239610
93	NC_017429	TATCG	2	10	115690	115699	20 %	40 %	20 %	20 %	385239610
94	NC_017429	TTTCT	2	10	116206	116215	0 %	80 %	0 %	20 %	385239611
95	NC_017429	AAAGA	2	10	118451	118460	80 %	0 %	20 %	0 %	385239613
96	NC_017429	GCTTC	2	10	122441	122450	0 %	40 %	20 %	40 %	385239616
97	NC_017429	TACAA	2	10	126230	126239	60 %	20 %	0 %	20 %	385239620
98	NC_017429	ATCCA	2	10	128635	128644	40 %	20 %	0 %	40 %	385239623
99	NC_017429	GAAGA	2	10	130185	130194	60 %	0 %	40 %	0 %	385239623
100	NC_017429	AAAAG	2	10	132098	132107	80 %	0 %	20 %	0 %	385239624
101	NC_017429	GATTC	2	10	132429	132438	20 %	40 %	20 %	20 %	385239624
102	NC_017429	GGATA	2	10	135049	135058	40 %	20 %	40 %	0 %	385239626
103	NC_017429	ATTGG	2	10	135714	135723	20 %	40 %	40 %	0 %	385239627
104	NC_017429	ATTGT	2	10	135747	135756	20 %	60 %	20 %	0 %	385239627
105	NC_017429	TGTTT	2	10	136173	136182	0 %	80 %	20 %	0 %	385239628
106	NC_017429	TCCAG	2	10	139917	139926	20 %	20 %	20 %	40 %	385239634
107	NC_017429	GTACA	2	10	140648	140657	40 %	20 %	20 %	20 %	385239635
108	NC_017429	TAGAT	2	10	141021	141030	40 %	40 %	20 %	0 %	385239635
109	NC_017429	AAAAC	2	10	141913	141922	80 %	0 %	0 %	20 %	385239636
110	NC_017429	TGCTA	2	10	142999	143008	20 %	40 %	20 %	20 %	385239638
111	NC_017429	GGAGC	2	10	143046	143055	20 %	0 %	60 %	20 %	385239638
112	NC_017429	CTGGG	2	10	144460	144469	0 %	20 %	60 %	20 %	385239640
113	NC_017429	GTTTT	2	10	145207	145216	0 %	80 %	20 %	0 %	385239641
114	NC_017429	GAACC	2	10	148941	148950	40 %	0 %	20 %	40 %	385239642
115	NC_017429	ATTCT	2	10	152437	152446	20 %	60 %	0 %	20 %	385239646
116	NC_017429	CTGTG	2	10	152641	152650	0 %	40 %	40 %	20 %	385239646
117	NC_017429	TTCTT	2	10	155114	155123	0 %	80 %	0 %	20 %	385239649
118	NC_017429	AGGAA	2	10	159670	159679	60 %	0 %	40 %	0 %	385239653
119	NC_017429	AGAGA	2	10	162901	162910	60 %	0 %	40 %	0 %	385239656
120	NC_017429	AGCAA	2	10	163336	163345	60 %	0 %	20 %	20 %	385239656
121	NC_017429	CAAAA	2	10	166839	166848	80 %	0 %	0 %	20 %	385239658
122	NC_017429	AAGAG	2	10	167672	167681	60 %	0 %	40 %	0 %	385239658
123	NC_017429	GTTTT	2	10	174496	174505	0 %	80 %	20 %	0 %	385239662
124	NC_017429	TATTG	2	10	174519	174528	20 %	60 %	20 %	0 %	385239662
125	NC_017429	CAGCA	2	10	174878	174887	40 %	0 %	20 %	40 %	385239662
126	NC_017429	TAGGA	2	10	175185	175194	40 %	20 %	40 %	0 %	385239663
127	NC_017429	TGATT	2	10	177112	177121	20 %	60 %	20 %	0 %	385239664
128	NC_017429	TCAAT	2	10	177753	177762	40 %	40 %	0 %	20 %	385239664
129	NC_017429	TTTTC	2	10	177792	177801	0 %	80 %	0 %	20 %	385239664
130	NC_017429	AGAGT	2	10	180747	180756	40 %	20 %	40 %	0 %	385239665
131	NC_017429	TTGAA	2	10	181280	181289	40 %	40 %	20 %	0 %	385239666
132	NC_017429	AGGGG	2	10	182291	182300	20 %	0 %	80 %	0 %	385239666
133	NC_017429	TTGAG	2	10	182854	182863	20 %	40 %	40 %	0 %	385239667
134	NC_017429	GAATG	2	10	182879	182888	40 %	20 %	40 %	0 %	385239667
135	NC_017429	AGAGA	2	10	184964	184973	60 %	0 %	40 %	0 %	385239670
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