MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017429	ATA	2	6	211915	211920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239699
4002	NC_017429	TCT	2	6	211921	211926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239699
4003	NC_017429	ACG	2	6	211965	211970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239699
4004	NC_017429	TTC	2	6	212004	212009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239699
4005	NC_017429	TAAC	2	8	212024	212031	50 %	25 %	0 %	25 %	385239699
4006	NC_017429	TCT	2	6	212032	212037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239699
4007	NC_017429	ATA	2	6	212055	212060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239699
4008	NC_017429	TGT	2	6	212191	212196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239699
4009	NC_017429	TAC	2	6	212235	212240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239699
4010	NC_017429	AAG	2	6	212266	212271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239699
4011	NC_017429	TTTA	2	8	212301	212308	25 %	75 %	0 %	0 %	385239699
4012	NC_017429	TTC	2	6	212321	212326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239699
4013	NC_017429	AAC	2	6	212469	212474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239699
4014	NC_017429	T	6	6	212490	212495	0 %	100 %	0 %	0 %	385239699
4015	NC_017429	CACGA	2	10	212505	212514	40 %	0 %	20 %	40 %	385239699
4016	NC_017429	ATTT	2	8	212606	212613	25 %	75 %	0 %	0 %	385239699
4017	NC_017429	AAT	2	6	212637	212642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239699
4018	NC_017429	GC	3	6	212686	212691	0 %	0 %	50 %	50 %	385239699
4019	NC_017429	AAT	2	6	212748	212753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239699
4020	NC_017429	CCT	2	6	212755	212760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239699
4021	NC_017429	AATT	2	8	212844	212851	50 %	50 %	0 %	0 %	385239699
4022	NC_017429	TTG	2	6	212876	212881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239699
4023	NC_017429	GAG	2	6	212902	212907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239699
4024	NC_017429	GCA	2	6	213061	213066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239699
4025	NC_017429	CAA	2	6	213107	213112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239699
4026	NC_017429	AAT	2	6	213327	213332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239699
4027	NC_017429	GAT	2	6	213393	213398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239699
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4029	NC_017429	TTTA	2	8	213405	213412	25 %	75 %	0 %	0 %	385239699
4030	NC_017429	ATT	2	6	213443	213448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239700
4031	NC_017429	TTG	2	6	213589	213594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239700
4032	NC_017429	TC	3	6	213619	213624	0 %	50 %	0 %	50 %	385239700
4033	NC_017429	TTC	2	6	213658	213663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239700
4034	NC_017429	AGT	2	6	213676	213681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239700
4035	NC_017429	AACA	2	8	213703	213710	75 %	0 %	0 %	25 %	385239700
4036	NC_017429	TCT	2	6	213729	213734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239700
4037	NC_017429	TGGA	2	8	213761	213768	25 %	25 %	50 %	0 %	385239700
4038	NC_017429	TTC	2	6	213815	213820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239700
4039	NC_017429	TA	3	6	213835	213840	50 %	50 %	0 %	0 %	385239700
4040	NC_017429	TTC	2	6	213863	213868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239700
4041	NC_017429	GCA	2	6	213873	213878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239700
4042	NC_017429	GCT	2	6	213882	213887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239700
4043	NC_017429	GGA	2	6	213939	213944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239700
4044	NC_017429	T	6	6	214007	214012	0 %	100 %	0 %	0 %	385239700
4045	NC_017429	AACG	2	8	214055	214062	50 %	0 %	25 %	25 %	385239700
4046	NC_017429	TCA	2	6	214098	214103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239700
4047	NC_017429	CTTT	2	8	214116	214123	0 %	75 %	0 %	25 %	385239700
4048	NC_017429	CCAT	2	8	214146	214153	25 %	25 %	0 %	50 %	385239700
4049	NC_017429	GA	3	6	214164	214169	50 %	0 %	50 %	0 %	385239700
4050	NC_017429	T	6	6	214184	214189	0 %	100 %	0 %	0 %	385239700
4051	NC_017429	AGG	2	6	214208	214213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239700
4052	NC_017429	CATT	2	8	214230	214237	25 %	50 %	0 %	25 %	385239700
4053	NC_017429	AGA	2	6	214264	214269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239700
4054	NC_017429	CAA	2	6	214277	214282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239700
4055	NC_017429	ATA	4	12	214320	214331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239700
4056	NC_017429	GCT	2	6	214389	214394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239700
4057	NC_017429	GAA	2	6	214474	214479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239700
4058	NC_017429	ACG	2	6	214490	214495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239700
4059	NC_017429	AGCG	2	8	214600	214607	25 %	0 %	50 %	25 %	385239700
4060	NC_017429	CT	3	6	214637	214642	0 %	50 %	0 %	50 %	385239700
4061	NC_017429	CT	3	6	214645	214650	0 %	50 %	0 %	50 %	385239700
4062	NC_017429	AGC	2	6	214652	214657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239700
4063	NC_017429	A	6	6	214724	214729	100 %	0 %	0 %	0 %	385239700
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4068	NC_017429	TAGA	2	8	214897	214904	50 %	25 %	25 %	0 %	385239700
4069	NC_017429	CTTGT	2	10	214975	214984	0 %	60 %	20 %	20 %	385239700
4070	NC_017429	ATT	2	6	214991	214996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239700
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4074	NC_017429	CTGGAT	2	12	215302	215313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385239700
4075	NC_017429	GTA	2	6	215527	215532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239700
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4078	NC_017429	GAAATA	2	12	215625	215636	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385239700
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4082	NC_017429	TTTCT	2	10	215825	215834	0 %	80 %	0 %	20 %	385239700
4083	NC_017429	TAA	2	6	215854	215859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239701
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4088	NC_017429	AATA	2	8	216452	216459	75 %	25 %	0 %	0 %	385239702
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4090	NC_017429	AAC	2	6	216510	216515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239702
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4105	NC_017429	TA	3	6	217145	217150	50 %	50 %	0 %	0 %	385239703
4106	NC_017429	ATG	2	6	217198	217203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239703
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4108	NC_017429	GC	3	6	217271	217276	0 %	0 %	50 %	50 %	385239703
4109	NC_017429	AGA	2	6	217333	217338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239703
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4123	NC_017429	T	6	6	217921	217926	0 %	100 %	0 %	0 %	385239703
4124	NC_017429	TAA	2	6	218001	218006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239703
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4128	NC_017429	AGA	2	6	218514	218519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239704
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4144	NC_017429	TTC	2	6	219070	219075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239704
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4156	NC_017429	CTG	2	6	219726	219731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239704
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4232	NC_017429	T	6	6	223363	223368	0 %	100 %	0 %	0 %	385239708
4233	NC_017429	GAT	2	6	223375	223380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239708
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4243	NC_017429	CAT	2	6	223617	223622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239708
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4491	NC_017429	A	7	7	236203	236209	100 %	0 %	0 %	0 %	385239718
4492	NC_017429	CAT	2	6	236226	236231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239718
4493	NC_017429	ACA	2	6	236263	236268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239719
4494	NC_017429	TTCAC	2	10	236305	236314	20 %	40 %	0 %	40 %	385239719
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4497	NC_017429	CTGT	2	8	236435	236442	0 %	50 %	25 %	25 %	385239719
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4499	NC_017429	AGA	2	6	236739	236744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239719
4500	NC_017429	TCT	2	6	236974	236979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239719

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