MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017429	TAG	2	6	184616	184621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239669
3503	NC_017429	AGT	2	6	184746	184751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239669
3504	NC_017429	ATCG	2	8	184773	184780	25 %	25 %	25 %	25 %	385239669
3505	NC_017429	TCA	2	6	184856	184861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239670
3506	NC_017429	GGA	2	6	184871	184876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239670
3507	NC_017429	AGAGA	2	10	184964	184973	60 %	0 %	40 %	0 %	385239670
3508	NC_017429	GCA	2	6	185060	185065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239670
3509	NC_017429	TTA	2	6	185357	185362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239670
3510	NC_017429	GAA	2	6	185426	185431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239670
3511	NC_017429	ATA	2	6	185486	185491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239670
3512	NC_017429	TCTA	2	8	185527	185534	25 %	50 %	0 %	25 %	385239670
3513	NC_017429	TGC	2	6	185728	185733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239671
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3515	NC_017429	AGA	2	6	185864	185869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239671
3516	NC_017429	T	7	7	186220	186226	0 %	100 %	0 %	0 %	385239672
3517	NC_017429	TCT	2	6	186244	186249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239672
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3519	NC_017429	GTC	2	6	186345	186350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239672
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3521	NC_017429	TCT	2	6	186434	186439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239672
3522	NC_017429	CTT	2	6	186450	186455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239672
3523	NC_017429	AAGC	2	8	186488	186495	50 %	0 %	25 %	25 %	385239672
3524	NC_017429	GAA	2	6	186518	186523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239672
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3527	NC_017429	CTT	2	6	186693	186698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239672
3528	NC_017429	TAG	2	6	186699	186704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239672
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3531	NC_017429	GCTT	2	8	186769	186776	0 %	50 %	25 %	25 %	385239672
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3538	NC_017429	AAG	2	6	187065	187070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239672
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3541	NC_017429	A	6	6	187205	187210	100 %	0 %	0 %	0 %	385239672
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3544	NC_017429	T	7	7	187267	187273	0 %	100 %	0 %	0 %	385239672
3545	NC_017429	A	6	6	187308	187313	100 %	0 %	0 %	0 %	385239672
3546	NC_017429	GCT	2	6	187397	187402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239672
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3549	NC_017429	TAG	2	6	187734	187739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239672
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3555	NC_017429	CCT	2	6	188912	188917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239673
3556	NC_017429	CTC	2	6	189005	189010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239673
3557	NC_017429	TTA	2	6	189029	189034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239673
3558	NC_017429	CGTA	2	8	189052	189059	25 %	25 %	25 %	25 %	385239673
3559	NC_017429	G	10	10	189071	189080	0 %	0 %	100 %	0 %	385239673
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3589	NC_017429	CAGAT	2	10	190236	190245	40 %	20 %	20 %	20 %	385239674
3590	NC_017429	GTAT	2	8	190248	190255	25 %	50 %	25 %	0 %	385239674
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3603	NC_017429	CAA	2	6	191149	191154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239675
3604	NC_017429	ACGAT	2	10	191155	191164	40 %	20 %	20 %	20 %	385239675
3605	NC_017429	ACT	2	6	191307	191312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239675
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3610	NC_017429	TGT	2	6	191699	191704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239675
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3621	NC_017429	TTGTA	2	10	192133	192142	20 %	60 %	20 %	0 %	385239675
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3995	NC_017429	TAA	2	6	211652	211657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239699
3996	NC_017429	GCC	2	6	211694	211699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385239699
3997	NC_017429	AGTA	2	8	211741	211748	50 %	25 %	25 %	0 %	385239699
3998	NC_017429	TTC	2	6	211795	211800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239699
3999	NC_017429	ATC	2	6	211875	211880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239699
4000	NC_017429	TGA	2	6	211892	211897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239699

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