MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017429	GCT	2	6	82688	82693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239582
1502	NC_017429	GTGC	2	8	82700	82707	0 %	25 %	50 %	25 %	385239582
1503	NC_017429	TAA	2	6	82750	82755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239582
1504	NC_017429	CAT	2	6	82766	82771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239582
1505	NC_017429	GAA	2	6	82778	82783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239582
1506	NC_017429	GA	3	6	82863	82868	50 %	0 %	50 %	0 %	385239582
1507	NC_017429	TAC	2	6	82914	82919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239583
1508	NC_017429	T	6	6	82938	82943	0 %	100 %	0 %	0 %	385239583
1509	NC_017429	T	7	7	82950	82956	0 %	100 %	0 %	0 %	385239583
1510	NC_017429	T	6	6	82963	82968	0 %	100 %	0 %	0 %	385239583
1511	NC_017429	GTA	2	6	83049	83054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239583
1512	NC_017429	T	6	6	83060	83065	0 %	100 %	0 %	0 %	385239583
1513	NC_017429	TATG	2	8	83084	83091	25 %	50 %	25 %	0 %	385239583
1514	NC_017429	TAT	2	6	83113	83118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239583
1515	NC_017429	GTCTGT	2	12	83127	83138	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385239583
1516	NC_017429	TCA	2	6	83147	83152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239583
1517	NC_017429	TCAT	2	8	83155	83162	25 %	50 %	0 %	25 %	385239583
1518	NC_017429	CAA	2	6	83197	83202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239583
1519	NC_017429	ACTG	2	8	83207	83214	25 %	25 %	25 %	25 %	385239583
1520	NC_017429	CATT	2	8	83222	83229	25 %	50 %	0 %	25 %	385239583
1521	NC_017429	AGA	2	6	83255	83260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239583
1522	NC_017429	AGCA	2	8	83261	83268	50 %	0 %	25 %	25 %	385239583
1523	NC_017429	TC	3	6	83283	83288	0 %	50 %	0 %	50 %	385239583
1524	NC_017429	TTA	2	6	83304	83309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239583
1525	NC_017429	ATTA	2	8	83414	83421	50 %	50 %	0 %	0 %	385239583
1526	NC_017429	TTTG	2	8	83454	83461	0 %	75 %	25 %	0 %	385239583
1527	NC_017429	TTG	2	6	83551	83556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239583
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1529	NC_017429	TCTA	2	8	83738	83745	25 %	50 %	0 %	25 %	385239583
1530	NC_017429	CTA	2	6	83766	83771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239583
1531	NC_017429	TAT	2	6	83819	83824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239583
1532	NC_017429	TAAG	2	8	83843	83850	50 %	25 %	25 %	0 %	385239583
1533	NC_017429	AGT	2	6	83932	83937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239584
1534	NC_017429	TAT	2	6	83959	83964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239584
1535	NC_017429	TGC	2	6	83974	83979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239584
1536	NC_017429	AAG	2	6	83994	83999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239584
1537	NC_017429	TC	3	6	84006	84011	0 %	50 %	0 %	50 %	385239584
1538	NC_017429	AG	3	6	84017	84022	50 %	0 %	50 %	0 %	385239584
1539	NC_017429	GAA	2	6	84050	84055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239584
1540	NC_017429	CAG	2	6	84189	84194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239584
1541	NC_017429	TAA	2	6	84235	84240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239584
1542	NC_017429	AG	3	6	84284	84289	50 %	0 %	50 %	0 %	385239584
1543	NC_017429	TTC	2	6	84303	84308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239584
1544	NC_017429	GAAG	2	8	84347	84354	50 %	0 %	50 %	0 %	385239584
1545	NC_017429	A	6	6	84371	84376	100 %	0 %	0 %	0 %	385239584
1546	NC_017429	AGA	2	6	84421	84426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239584
1547	NC_017429	TTC	2	6	84499	84504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239584
1548	NC_017429	TAAA	2	8	84513	84520	75 %	25 %	0 %	0 %	385239584
1549	NC_017429	ATCC	2	8	84584	84591	25 %	25 %	0 %	50 %	385239584
1550	NC_017429	TGG	2	6	84612	84617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239584
1551	NC_017429	TGA	2	6	84645	84650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239584
1552	NC_017429	TCC	2	6	84652	84657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239584
1553	NC_017429	ACA	2	6	84676	84681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239584
1554	NC_017429	TTTC	2	8	84731	84738	0 %	75 %	0 %	25 %	385239584
1555	NC_017429	AGAT	2	8	84772	84779	50 %	25 %	25 %	0 %	385239584
1556	NC_017429	CTT	2	6	84809	84814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239584
1557	NC_017429	T	6	6	84835	84840	0 %	100 %	0 %	0 %	385239584
1558	NC_017429	GAA	2	6	84962	84967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239584
1559	NC_017429	AAT	2	6	85216	85221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239585
1560	NC_017429	AT	3	6	85220	85225	50 %	50 %	0 %	0 %	385239585
1561	NC_017429	AGC	2	6	85288	85293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239585
1562	NC_017429	AG	3	6	85315	85320	50 %	0 %	50 %	0 %	385239585
1563	NC_017429	GAAA	2	8	85353	85360	75 %	0 %	25 %	0 %	385239585
1564	NC_017429	T	6	6	85490	85495	0 %	100 %	0 %	0 %	385239585
1565	NC_017429	TGG	2	6	85591	85596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239585
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1569	NC_017429	CTT	2	6	85742	85747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239585
1570	NC_017429	GAAA	2	8	85748	85755	75 %	0 %	25 %	0 %	385239585
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1594	NC_017429	ATG	2	6	87306	87311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239586
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1608	NC_017429	A	6	6	87981	87986	100 %	0 %	0 %	0 %	385239586
1609	NC_017429	TTC	2	6	87987	87992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239586
1610	NC_017429	GAG	2	6	88163	88168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239587
1611	NC_017429	TGT	2	6	88212	88217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239587
1612	NC_017429	TAG	2	6	88238	88243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239587
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1614	NC_017429	GGAT	2	8	88342	88349	25 %	25 %	50 %	0 %	385239587
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1619	NC_017429	GA	3	6	88587	88592	50 %	0 %	50 %	0 %	385239587
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1624	NC_017429	TTCTGA	2	12	88741	88752	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385239587
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1626	NC_017429	A	6	6	88846	88851	100 %	0 %	0 %	0 %	385239587
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