MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017429	TCAGA	2	10	54626	54635	40 %	20 %	20 %	20 %	385239561
1002	NC_017429	A	6	6	54725	54730	100 %	0 %	0 %	0 %	385239561
1003	NC_017429	G	6	6	54781	54786	0 %	0 %	100 %	0 %	385239561
1004	NC_017429	GGAA	2	8	54892	54899	50 %	0 %	50 %	0 %	385239561
1005	NC_017429	GATCTG	2	12	54915	54926	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385239561
1006	NC_017429	GTGTAA	2	12	54963	54974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239561
1007	NC_017429	GCA	2	6	54977	54982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239561
1008	NC_017429	TGG	2	6	55029	55034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239561
1009	NC_017429	GGTTCA	2	12	55052	55063	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385239561
1010	NC_017429	TTATC	2	10	55153	55162	20 %	60 %	0 %	20 %	385239561
1011	NC_017429	TGAGT	2	10	55174	55183	20 %	40 %	40 %	0 %	385239561
1012	NC_017429	TCA	3	9	55187	55195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239561
1013	NC_017429	GTT	2	6	55202	55207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239561
1014	NC_017429	CTG	2	6	55248	55253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239561
1015	NC_017429	GAG	2	6	55254	55259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239561
1016	NC_017429	TGC	2	6	55288	55293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239561
1017	NC_017429	AT	3	6	55498	55503	50 %	50 %	0 %	0 %	385239561
1018	NC_017429	TTA	2	6	55513	55518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239561
1019	NC_017429	CTGG	3	12	55791	55802	0 %	25 %	50 %	25 %	385239562
1020	NC_017429	ATT	2	6	55806	55811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239562
1021	NC_017429	GAT	2	6	55819	55824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239562
1022	NC_017429	TCT	2	6	55837	55842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239562
1023	NC_017429	TCC	2	6	55872	55877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239562
1024	NC_017429	TTA	2	6	55885	55890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239562
1025	NC_017429	TTGC	2	8	55928	55935	0 %	50 %	25 %	25 %	385239562
1026	NC_017429	AGCG	2	8	55968	55975	25 %	0 %	50 %	25 %	385239562
1027	NC_017429	T	6	6	55980	55985	0 %	100 %	0 %	0 %	385239562
1028	NC_017429	GTA	2	6	56011	56016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239562
1029	NC_017429	GTT	2	6	56122	56127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239562
1030	NC_017429	TGG	2	6	56142	56147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239562
1031	NC_017429	GTTGT	2	10	56221	56230	0 %	60 %	40 %	0 %	385239562
1032	NC_017429	T	6	6	56276	56281	0 %	100 %	0 %	0 %	385239562
1033	NC_017429	TGA	2	6	57916	57921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239563
1034	NC_017429	TGAAAA	2	12	59048	59059	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385239564
1035	NC_017429	AGA	2	6	59060	59065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239564
1036	NC_017429	TCT	2	6	59076	59081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239564
1037	NC_017429	T	6	6	59108	59113	0 %	100 %	0 %	0 %	385239564
1038	NC_017429	CGTT	2	8	59259	59266	0 %	50 %	25 %	25 %	385239564
1039	NC_017429	GGAG	2	8	59268	59275	25 %	0 %	75 %	0 %	385239564
1040	NC_017429	GTAA	2	8	59320	59327	50 %	25 %	25 %	0 %	385239564
1041	NC_017429	TCCTAA	2	12	59387	59398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239564
1042	NC_017429	AGT	2	6	59416	59421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239564
1043	NC_017429	T	6	6	59448	59453	0 %	100 %	0 %	0 %	385239564
1044	NC_017429	TAG	2	6	59495	59500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239564
1045	NC_017429	GCT	2	6	59508	59513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239564
1046	NC_017429	GTC	2	6	59534	59539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239564
1047	NC_017429	ATGG	2	8	59547	59554	25 %	25 %	50 %	0 %	385239564
1048	NC_017429	AGG	2	6	59581	59586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239564
1049	NC_017429	GA	3	6	59633	59638	50 %	0 %	50 %	0 %	385239564
1050	NC_017429	CAA	2	6	59656	59661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239564
1051	NC_017429	ATAA	2	8	59693	59700	75 %	25 %	0 %	0 %	385239564
1052	NC_017429	GAGCA	2	10	59733	59742	40 %	0 %	40 %	20 %	385239564
1053	NC_017429	GT	3	6	59771	59776	0 %	50 %	50 %	0 %	385239564
1054	NC_017429	TAG	2	6	59783	59788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239564
1055	NC_017429	AAG	2	6	59968	59973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239564
1056	NC_017429	CTC	2	6	59980	59985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239564
1057	NC_017429	AAC	2	6	60013	60018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239564
1058	NC_017429	T	7	7	60032	60038	0 %	100 %	0 %	0 %	385239564
1059	NC_017429	CTT	2	6	60082	60087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239564
1060	NC_017429	AAT	2	6	60112	60117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239564
1061	NC_017429	TTC	2	6	60123	60128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239564
1062	NC_017429	ATGT	2	8	60143	60150	25 %	50 %	25 %	0 %	385239564
1063	NC_017429	CATT	2	8	60172	60179	25 %	50 %	0 %	25 %	385239564
1064	NC_017429	ATG	2	6	60193	60198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239565
1065	NC_017429	CCT	2	6	60199	60204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239565
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1067	NC_017429	TCA	2	6	60289	60294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239565
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1070	NC_017429	TTCT	2	8	60468	60475	0 %	75 %	0 %	25 %	385239565
1071	NC_017429	TTC	2	6	60507	60512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239565
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1073	NC_017429	T	6	6	60531	60536	0 %	100 %	0 %	0 %	385239565
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1089	NC_017429	GA	3	6	61418	61423	50 %	0 %	50 %	0 %	385239566
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1103	NC_017429	GA	3	6	62359	62364	50 %	0 %	50 %	0 %	385239566
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1109	NC_017429	AAG	2	6	62681	62686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239566
1110	NC_017429	TC	3	6	62780	62785	0 %	50 %	0 %	50 %	385239566
1111	NC_017429	CAA	2	6	62881	62886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239566
1112	NC_017429	AT	3	6	62961	62966	50 %	50 %	0 %	0 %	385239566
1113	NC_017429	TTC	2	6	62967	62972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239566
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1117	NC_017429	CT	4	8	63169	63176	0 %	50 %	0 %	50 %	385239566
1118	NC_017429	T	6	6	63188	63193	0 %	100 %	0 %	0 %	385239566
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1123	NC_017429	TATG	2	8	63466	63473	25 %	50 %	25 %	0 %	385239566
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