MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/9768 chromosome

Total Repeats: 20302

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017429	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239534
502	NC_017429	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239534
503	NC_017429	TTC	2	6	28689	28694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239534
504	NC_017429	GC	4	8	28860	28867	0 %	0 %	50 %	50 %	385239534
505	NC_017429	AAG	2	6	28868	28873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239534
506	NC_017429	TA	3	6	28982	28987	50 %	50 %	0 %	0 %	385239534
507	NC_017429	GAA	2	6	29071	29076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239534
508	NC_017429	TGT	2	6	29103	29108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239535
509	NC_017429	TCT	2	6	29171	29176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239535
510	NC_017429	ACA	2	6	29399	29404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239535
511	NC_017429	ATG	2	6	29409	29414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239535
512	NC_017429	CTTT	2	8	29551	29558	0 %	75 %	0 %	25 %	385239535
513	NC_017429	TTTG	2	8	29566	29573	0 %	75 %	25 %	0 %	385239535
514	NC_017429	TTGT	2	8	29601	29608	0 %	75 %	25 %	0 %	385239535
515	NC_017429	CCTAT	2	10	29620	29629	20 %	40 %	0 %	40 %	385239535
516	NC_017429	T	6	6	29636	29641	0 %	100 %	0 %	0 %	385239535
517	NC_017429	ATC	2	6	29715	29720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239535
518	NC_017429	TGGC	2	8	29764	29771	0 %	25 %	50 %	25 %	385239535
519	NC_017429	T	8	8	29870	29877	0 %	100 %	0 %	0 %	385239535
520	NC_017429	ATG	2	6	29895	29900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239535
521	NC_017429	GA	3	6	29933	29938	50 %	0 %	50 %	0 %	385239535
522	NC_017429	AG	3	6	30031	30036	50 %	0 %	50 %	0 %	385239536
523	NC_017429	GTT	2	6	30112	30117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239536
524	NC_017429	GAA	2	6	30121	30126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239536
525	NC_017429	TC	3	6	30140	30145	0 %	50 %	0 %	50 %	385239536
526	NC_017429	TCT	2	6	30187	30192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239536
527	NC_017429	ACT	2	6	30277	30282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385239536
528	NC_017429	TTC	2	6	30305	30310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239536
529	NC_017429	AAAG	2	8	30324	30331	75 %	0 %	25 %	0 %	385239536
530	NC_017429	CCT	2	6	30341	30346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385239536
531	NC_017429	AAAC	2	8	30394	30401	75 %	0 %	0 %	25 %	385239536
532	NC_017429	T	6	6	30411	30416	0 %	100 %	0 %	0 %	385239536
533	NC_017429	GAAGG	2	10	30419	30428	40 %	0 %	60 %	0 %	385239536
534	NC_017429	GGC	2	6	30447	30452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385239536
535	NC_017429	GAT	2	6	30526	30531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239536
536	NC_017429	GATG	2	8	30537	30544	25 %	25 %	50 %	0 %	385239536
537	NC_017429	TAG	2	6	30548	30553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239536
538	NC_017429	GTT	2	6	30622	30627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239536
539	NC_017429	TAA	2	6	30732	30737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385239536
540	NC_017429	GA	3	6	30761	30766	50 %	0 %	50 %	0 %	385239536
541	NC_017429	GAA	2	6	30871	30876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239536
542	NC_017429	AGA	2	6	30891	30896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239536
543	NC_017429	TCG	2	6	30954	30959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239536
544	NC_017429	ATG	2	6	30988	30993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239536
545	NC_017429	TGG	2	6	31002	31007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239536
546	NC_017429	GAA	2	6	31033	31038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239536
547	NC_017429	ATT	2	6	31069	31074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239536
548	NC_017429	ATG	2	6	31192	31197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239536
549	NC_017429	AAG	2	6	31204	31209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239536
550	NC_017429	T	6	6	31210	31215	0 %	100 %	0 %	0 %	385239536
551	NC_017429	GA	3	6	31229	31234	50 %	0 %	50 %	0 %	385239536
552	NC_017429	A	7	7	31252	31258	100 %	0 %	0 %	0 %	385239536
553	NC_017429	ACA	2	6	31298	31303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385239537
554	NC_017429	TGT	2	6	31319	31324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239537
555	NC_017429	AT	3	6	31370	31375	50 %	50 %	0 %	0 %	385239537
556	NC_017429	T	6	6	31438	31443	0 %	100 %	0 %	0 %	385239537
557	NC_017429	GAGCT	2	10	31459	31468	20 %	20 %	40 %	20 %	385239537
558	NC_017429	A	6	6	31533	31538	100 %	0 %	0 %	0 %	385239537
559	NC_017429	A	6	6	31564	31569	100 %	0 %	0 %	0 %	385239537
560	NC_017429	TGC	2	6	31592	31597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239537
561	NC_017429	AGC	2	6	31610	31615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385239537
562	NC_017429	GATA	2	8	31646	31653	50 %	25 %	25 %	0 %	385239538
563	NC_017429	TC	3	6	31655	31660	0 %	50 %	0 %	50 %	385239538
564	NC_017429	AAG	2	6	31859	31864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239538
565	NC_017429	AAG	2	6	31866	31871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239538
566	NC_017429	CTT	2	6	31905	31910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239538
567	NC_017429	CGT	2	6	31936	31941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239538
568	NC_017429	TGA	2	6	31982	31987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239538
569	NC_017429	GAG	2	6	32013	32018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239538
570	NC_017429	GCG	2	6	32055	32060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385239538
571	NC_017429	GC	3	6	32085	32090	0 %	0 %	50 %	50 %	385239538
572	NC_017429	CT	3	6	32135	32140	0 %	50 %	0 %	50 %	385239538
573	NC_017429	AGA	2	6	32233	32238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239538
574	NC_017429	AG	3	6	32267	32272	50 %	0 %	50 %	0 %	385239538
575	NC_017429	AAG	2	6	32421	32426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239538
576	NC_017429	ATT	2	6	32471	32476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239538
577	NC_017429	T	6	6	32576	32581	0 %	100 %	0 %	0 %	385239538
578	NC_017429	AGG	2	6	32826	32831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239539
579	NC_017429	GGT	2	6	32881	32886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385239539
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581	NC_017429	GCT	2	6	33076	33081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239539
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583	NC_017429	A	6	6	33191	33196	100 %	0 %	0 %	0 %	385239540
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587	NC_017429	AGG	2	6	33470	33475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385239540
588	NC_017429	CTT	2	6	33494	33499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385239540
589	NC_017429	T	6	6	33516	33521	0 %	100 %	0 %	0 %	385239540
590	NC_017429	GTT	2	6	33534	33539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385239540
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593	NC_017429	AG	3	6	33777	33782	50 %	0 %	50 %	0 %	385239540
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596	NC_017429	AG	3	6	33915	33920	50 %	0 %	50 %	0 %	385239541
597	NC_017429	GTC	2	6	33947	33952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385239541
598	NC_017429	ATT	2	6	33994	33999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239541
599	NC_017429	T	6	6	34046	34051	0 %	100 %	0 %	0 %	385239541
600	NC_017429	TTA	2	6	34076	34081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385239541
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602	NC_017429	GAA	2	6	34169	34174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239541
603	NC_017429	AAG	2	6	34216	34221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239541
604	NC_017429	AGA	2	6	34267	34272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239541
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610	NC_017429	GAA	2	6	34389	34394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239541
611	NC_017429	AAGC	2	8	34489	34496	50 %	0 %	25 %	25 %	385239542
612	NC_017429	GTTC	2	8	34522	34529	0 %	50 %	25 %	25 %	385239542
613	NC_017429	GAT	2	6	34600	34605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385239542
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615	NC_017429	GA	4	8	34631	34638	50 %	0 %	50 %	0 %	385239542
616	NC_017429	AGA	2	6	34666	34671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385239542
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623	NC_017429	TCGA	2	8	35158	35165	25 %	25 %	25 %	25 %	385239543
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627	NC_017429	TGCT	2	8	35311	35318	0 %	50 %	25 %	25 %	385239543
628	NC_017429	TATG	2	8	35454	35461	25 %	50 %	25 %	0 %	385239543
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