MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 25425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017308	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139675
2	NC_017308	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
3	NC_017308	ACT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139675
4	NC_017308	TGC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
5	NC_017308	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139675
6	NC_017308	TTC	3	9	456	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139675
7	NC_017308	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139675
8	NC_017308	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
9	NC_017308	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
10	NC_017308	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139675
11	NC_017308	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139675
12	NC_017308	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139675
13	NC_017308	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387139675
14	NC_017308	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139675
15	NC_017308	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139675
16	NC_017308	ACT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139675
17	NC_017308	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139675
18	NC_017308	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139675
19	NC_017308	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139675
20	NC_017308	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139675
21	NC_017308	CGA	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139675
22	NC_017308	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
23	NC_017308	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139675
24	NC_017308	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139675
25	NC_017308	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139675
26	NC_017308	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139675
27	NC_017308	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139675
28	NC_017308	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139676
29	NC_017308	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139676
30	NC_017308	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139676
31	NC_017308	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139676
32	NC_017308	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139676
33	NC_017308	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139676
34	NC_017308	GCT	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139676
35	NC_017308	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139676
36	NC_017308	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139676
37	NC_017308	GAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139676
38	NC_017308	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139677
39	NC_017308	CTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139677
40	NC_017308	TTG	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139677
41	NC_017308	GAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139677
42	NC_017308	GAG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139677
43	NC_017308	TCA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139677
44	NC_017308	GAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139677
45	NC_017308	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139677
46	NC_017308	GCC	2	6	4734	4739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139677
47	NC_017308	CTG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139678
48	NC_017308	AGA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139678
49	NC_017308	GCG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139678
50	NC_017308	CGG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139678
51	NC_017308	TGG	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139678
52	NC_017308	AGC	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139678
53	NC_017308	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139678
54	NC_017308	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139679
55	NC_017308	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139679
56	NC_017308	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139679
57	NC_017308	ACC	3	9	6098	6106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139679
58	NC_017308	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139679
59	NC_017308	CGT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139679
60	NC_017308	TGA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
61	NC_017308	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139679
62	NC_017308	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139679
63	NC_017308	GAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139679
64	NC_017308	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139679
65	NC_017308	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
66	NC_017308	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139679
67	NC_017308	TGA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
68	NC_017308	TCT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139679
69	NC_017308	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139679
70	NC_017308	TGG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139679
71	NC_017308	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139679
72	NC_017308	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
73	NC_017308	CAA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139679
74	NC_017308	GCT	3	9	7210	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139679
75	NC_017308	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139679
76	NC_017308	CCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139679
77	NC_017308	GAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139679
78	NC_017308	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139679
79	NC_017308	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
80	NC_017308	ATG	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
81	NC_017308	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139679
82	NC_017308	TCG	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139679
83	NC_017308	CAG	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139680
84	NC_017308	TTC	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139680
85	NC_017308	GAG	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139680
86	NC_017308	AGC	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139680
87	NC_017308	TGC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139680
88	NC_017308	GAG	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139680
89	NC_017308	ATT	2	6	8300	8305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139681
90	NC_017308	GCG	2	6	8720	8725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139682
91	NC_017308	TGA	2	6	8806	8811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139682
92	NC_017308	GCT	2	6	8823	8828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139682
93	NC_017308	CGA	2	6	9084	9089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139683
94	NC_017308	GCG	2	6	9098	9103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139683
95	NC_017308	GAG	2	6	9139	9144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139683
96	NC_017308	CCG	2	6	9231	9236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139683
97	NC_017308	ACG	2	6	9437	9442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139683
98	NC_017308	CGC	2	6	9447	9452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139683
99	NC_017308	TTC	2	6	9569	9574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139683
100	NC_017308	TGA	2	6	9596	9601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139683
101	NC_017308	TCT	2	6	9677	9682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139683
102	NC_017308	GAA	3	9	9853	9861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139683
103	NC_017308	ACA	2	6	9914	9919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139683
104	NC_017308	TGC	2	6	10154	10159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139683
105	NC_017308	TTA	2	6	10161	10166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139683
106	NC_017308	TCG	2	6	10194	10199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139683
107	NC_017308	GAA	2	6	10216	10221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139683
108	NC_017308	CGA	2	6	10275	10280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139683
109	NC_017308	AGA	2	6	10418	10423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139683
110	NC_017308	CGT	2	6	10552	10557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139683
111	NC_017308	ATT	2	6	10564	10569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139683
112	NC_017308	GAA	2	6	10591	10596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139683
113	NC_017308	GTG	2	6	10618	10623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139683
114	NC_017308	CGT	2	6	10684	10689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139683
115	NC_017308	CTT	2	6	10743	10748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139683
116	NC_017308	AAG	2	6	10969	10974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139683
117	NC_017308	GGT	2	6	11008	11013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139683
118	NC_017308	GAA	2	6	11035	11040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139683
119	NC_017308	ATG	2	6	11072	11077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139683
120	NC_017308	GCT	2	6	11082	11087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139683
121	NC_017308	GAA	2	6	11098	11103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139683
122	NC_017308	TGA	3	9	11127	11135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139683
123	NC_017308	CGA	2	6	11193	11198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139683
124	NC_017308	GCT	2	6	11202	11207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139683
125	NC_017308	TCT	2	6	11238	11243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139683
126	NC_017308	GGC	2	6	11257	11262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139683
127	NC_017308	CAG	2	6	11296	11301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139683
128	NC_017308	GTG	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139683
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253	NC_017308	GTT	2	6	23127	23132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139696
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257	NC_017308	AAT	2	6	23773	23778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387139697
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