MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1/06-A chromosome

Total Repeats: 34733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017308	ACGC	2	8	358629	358636	25 %	0 %	25 %	50 %	387139991
5502	NC_017308	CGT	2	6	358655	358660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139991
5503	NC_017308	AGG	2	6	358680	358685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139991
5504	NC_017308	GTG	2	6	358871	358876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139992
5505	NC_017308	AAG	2	6	359089	359094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139992
5506	NC_017308	GAG	2	6	359154	359159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139993
5507	NC_017308	GCT	2	6	359214	359219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139993
5508	NC_017308	CAA	2	6	359234	359239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139993
5509	NC_017308	CCG	2	6	359240	359245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139993
5510	NC_017308	TGAG	2	8	359343	359350	25 %	25 %	50 %	0 %	387139994
5511	NC_017308	AAG	2	6	359363	359368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139994
5512	NC_017308	AGA	2	6	359421	359426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139994
5513	NC_017308	TCG	2	6	359430	359435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139994
5514	NC_017308	AGC	2	6	359454	359459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139994
5515	NC_017308	GAG	2	6	359552	359557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139994
5516	NC_017308	ATC	2	6	359600	359605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139994
5517	NC_017308	AGT	2	6	359616	359621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139994
5518	NC_017308	CTT	2	6	359853	359858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139995
5519	NC_017308	GTTT	2	8	359939	359946	0 %	75 %	25 %	0 %	387139995
5520	NC_017308	TCA	2	6	359950	359955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139995
5521	NC_017308	AG	3	6	360036	360041	50 %	0 %	50 %	0 %	387139995
5522	NC_017308	TCA	2	6	360112	360117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139995
5523	NC_017308	AGA	2	6	360141	360146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139995
5524	NC_017308	TCT	2	6	360191	360196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139995
5525	NC_017308	TCA	2	6	360313	360318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139995
5526	NC_017308	AGA	2	6	360319	360324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139995
5527	NC_017308	TTC	2	6	360379	360384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139995
5528	NC_017308	G	6	6	360411	360416	0 %	0 %	100 %	0 %	387139995
5529	NC_017308	CAG	2	6	360596	360601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139995
5530	NC_017308	GACGG	2	10	360616	360625	20 %	0 %	60 %	20 %	387139995
5531	NC_017308	CAG	3	9	360662	360670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139995
5532	NC_017308	CCA	2	6	360720	360725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139995
5533	NC_017308	CTTT	2	8	360812	360819	0 %	75 %	0 %	25 %	387139995
5534	NC_017308	GAT	2	6	360864	360869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139995
5535	NC_017308	CCA	2	6	360885	360890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387139995
5536	NC_017308	AGA	2	6	360975	360980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139995
5537	NC_017308	GGT	2	6	361020	361025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139995
5538	NC_017308	CAT	2	6	361055	361060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139995
5539	NC_017308	TGG	2	6	361211	361216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139995
5540	NC_017308	TGG	2	6	361237	361242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139995
5541	NC_017308	TGC	2	6	361249	361254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139995
5542	NC_017308	GGA	2	6	361371	361376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139995
5543	NC_017308	GCAA	2	8	361393	361400	50 %	0 %	25 %	25 %	387139995
5544	NC_017308	GCA	2	6	361411	361416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139995
5545	NC_017308	CTT	2	6	361444	361449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139995
5546	NC_017308	GAT	2	6	361526	361531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139996
5547	NC_017308	TCG	2	6	361584	361589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139996
5548	NC_017308	TGG	2	6	361591	361596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139996
5549	NC_017308	GAT	2	6	361686	361691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139996
5550	NC_017308	CGG	2	6	361826	361831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139996
5551	NC_017308	GA	3	6	361858	361863	50 %	0 %	50 %	0 %	387139996
5552	NC_017308	GC	3	6	361896	361901	0 %	0 %	50 %	50 %	387139996
5553	NC_017308	TCA	2	6	361909	361914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387139996
5554	NC_017308	AATATG	2	12	362061	362072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	387139996
5555	NC_017308	AGA	2	6	362236	362241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139996
5556	NC_017308	GGT	3	9	362334	362342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139996
5557	NC_017308	CGA	2	6	362363	362368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139996
5558	NC_017308	CTT	2	6	362384	362389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387139996
5559	NC_017308	TCAGA	2	10	362477	362486	40 %	20 %	20 %	20 %	387139996
5560	NC_017308	GCG	2	6	362549	362554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387139996
5561	NC_017308	ATGC	2	8	362608	362615	25 %	25 %	25 %	25 %	387139996
5562	NC_017308	TCG	2	6	362707	362712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139996
5563	NC_017308	AGG	2	6	362730	362735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139996
5564	NC_017308	GTG	2	6	362749	362754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139996
5565	NC_017308	CAAG	2	8	362795	362802	50 %	0 %	25 %	25 %	387139996
5566	NC_017308	CATA	2	8	362873	362880	50 %	25 %	0 %	25 %	387139996
5567	NC_017308	ACA	2	6	362908	362913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139996
5568	NC_017308	ATG	2	6	362932	362937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139996
5569	NC_017308	GTG	2	6	363013	363018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139996
5570	NC_017308	TTG	2	6	363046	363051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139996
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5572	NC_017308	ACG	2	6	363120	363125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139996
5573	NC_017308	CGA	2	6	363143	363148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139996
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5575	NC_017308	CGA	2	6	363218	363223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139996
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5579	NC_017308	GCA	2	6	363658	363663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139997
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5583	NC_017308	AAG	2	6	363822	363827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387139997
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5585	NC_017308	AT	3	6	363901	363906	50 %	50 %	0 %	0 %	387139997
5586	NC_017308	AG	3	6	363921	363926	50 %	0 %	50 %	0 %	387139997
5587	NC_017308	GTA	2	6	363951	363956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139997
5588	NC_017308	CATC	2	8	363957	363964	25 %	25 %	0 %	50 %	387139997
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5591	NC_017308	AGG	2	6	364054	364059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139997
5592	NC_017308	AAT	2	6	364065	364070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387139997
5593	NC_017308	GCC	2	6	364095	364100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387139997
5594	NC_017308	TGC	2	6	364107	364112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139997
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5601	NC_017308	T	6	6	364420	364425	0 %	100 %	0 %	0 %	387139997
5602	NC_017308	CTG	2	6	364452	364457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139997
5603	NC_017308	GGTA	2	8	364536	364543	25 %	25 %	50 %	0 %	387139997
5604	NC_017308	GTT	2	6	364581	364586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387139997
5605	NC_017308	ACA	2	6	364637	364642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387139998
5606	NC_017308	TTA	2	6	364724	364729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387139998
5607	NC_017308	TGG	2	6	364731	364736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139998
5608	NC_017308	GGT	2	6	364825	364830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387139998
5609	NC_017308	ATG	2	6	364841	364846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139998
5610	NC_017308	GCGG	2	8	364900	364907	0 %	0 %	75 %	25 %	387139998
5611	NC_017308	GGA	2	6	364953	364958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387139998
5612	NC_017308	GAT	2	6	364978	364983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139998
5613	NC_017308	TGC	2	6	365012	365017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387139998
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5615	NC_017308	AC	3	6	365226	365231	50 %	0 %	0 %	50 %	387139998
5616	NC_017308	AGC	2	6	365246	365251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139998
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5618	NC_017308	AGC	2	6	365276	365281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387139998
5619	NC_017308	CCCAGT	2	12	365346	365357	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387139998
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5621	NC_017308	ATTGAG	2	12	365413	365424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387139998
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5984	NC_017308	AGA	2	6	392284	392289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387140026
5985	NC_017308	CCT	2	6	392301	392306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387140027
5986	NC_017308	GCA	2	6	392314	392319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387140027
5987	NC_017308	CGC	2	6	392325	392330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387140027
5988	NC_017308	GTC	2	6	392335	392340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387140027
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