MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis CIP 52.97 chromosome

Total Repeats: 26838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017307	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137614
2	NC_017307	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
3	NC_017307	ACT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137614
4	NC_017307	TGC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
5	NC_017307	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387137614
6	NC_017307	TTC	3	9	456	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137614
7	NC_017307	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137614
8	NC_017307	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
9	NC_017307	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
10	NC_017307	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137614
11	NC_017307	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137614
12	NC_017307	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137614
13	NC_017307	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387137614
14	NC_017307	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137614
15	NC_017307	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137614
16	NC_017307	ACT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137614
17	NC_017307	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137614
18	NC_017307	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137614
19	NC_017307	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137614
20	NC_017307	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137614
21	NC_017307	CGA	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137614
22	NC_017307	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
23	NC_017307	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137614
24	NC_017307	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137614
25	NC_017307	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
26	NC_017307	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137614
27	NC_017307	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137614
28	NC_017307	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137615
29	NC_017307	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137616
30	NC_017307	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137616
31	NC_017307	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137616
32	NC_017307	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137616
33	NC_017307	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137616
34	NC_017307	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137616
35	NC_017307	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137616
36	NC_017307	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137616
37	NC_017307	GAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137616
38	NC_017307	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137617
39	NC_017307	CTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137617
40	NC_017307	TTG	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137617
41	NC_017307	GAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137617
42	NC_017307	GAG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137617
43	NC_017307	TCA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137617
44	NC_017307	GAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137617
45	NC_017307	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137617
46	NC_017307	GCC	2	6	4734	4739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137617
47	NC_017307	CTG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137618
48	NC_017307	AGA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137618
49	NC_017307	GCG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137618
50	NC_017307	CGG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137618
51	NC_017307	TGG	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137618
52	NC_017307	AGC	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137618
53	NC_017307	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137618
54	NC_017307	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137619
55	NC_017307	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137619
56	NC_017307	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387137619
57	NC_017307	ACC	3	9	6098	6106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387137619
58	NC_017307	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137619
59	NC_017307	CGT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137619
60	NC_017307	TGA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
61	NC_017307	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137619
62	NC_017307	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137619
63	NC_017307	GAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137619
64	NC_017307	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137619
65	NC_017307	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
66	NC_017307	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137619
67	NC_017307	TGA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
68	NC_017307	TCT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137619
69	NC_017307	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137619
70	NC_017307	TGG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137619
71	NC_017307	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137619
72	NC_017307	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
73	NC_017307	CAA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387137619
74	NC_017307	GCT	3	9	7210	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137619
75	NC_017307	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137619
76	NC_017307	CCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137619
77	NC_017307	GAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137619
78	NC_017307	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387137619
79	NC_017307	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
80	NC_017307	ATG	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
81	NC_017307	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
82	NC_017307	TCG	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137619
83	NC_017307	CAG	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137620
84	NC_017307	TTC	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137620
85	NC_017307	GAG	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137620
86	NC_017307	AGC	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137620
87	NC_017307	TGC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137620
88	NC_017307	GAG	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137620
89	NC_017307	ATT	2	6	8304	8309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137621
90	NC_017307	CTG	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137622
91	NC_017307	TGT	2	6	8593	8598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137622
92	NC_017307	CTG	2	6	8601	8606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137622
93	NC_017307	TGC	2	6	8652	8657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137622
94	NC_017307	GTC	2	6	8662	8667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137622
95	NC_017307	GCG	2	6	8724	8729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137623
96	NC_017307	TGA	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137623
97	NC_017307	GCT	2	6	8827	8832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137623
98	NC_017307	CGA	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137624
99	NC_017307	GCG	2	6	9102	9107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137624
100	NC_017307	GAG	2	6	9143	9148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137624
101	NC_017307	CCG	2	6	9235	9240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137624
102	NC_017307	ACG	2	6	9441	9446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137624
103	NC_017307	CGC	2	6	9451	9456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137624
104	NC_017307	TTC	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137624
105	NC_017307	TGA	2	6	9600	9605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137624
106	NC_017307	TCT	2	6	9681	9686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137624
107	NC_017307	GAA	3	9	9857	9865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137624
108	NC_017307	ACA	2	6	9918	9923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387137624
109	NC_017307	TGC	2	6	10158	10163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137624
110	NC_017307	TTA	2	6	10165	10170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137624
111	NC_017307	TCG	2	6	10198	10203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137624
112	NC_017307	GAA	2	6	10220	10225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137624
113	NC_017307	CGA	2	6	10279	10284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137624
114	NC_017307	AGA	2	6	10422	10427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137624
115	NC_017307	CGT	2	6	10556	10561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137624
116	NC_017307	ATT	2	6	10568	10573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137624
117	NC_017307	GAA	2	6	10595	10600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137624
118	NC_017307	GTG	2	6	10622	10627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137624
119	NC_017307	CGT	2	6	10688	10693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137624
120	NC_017307	CTT	2	6	10747	10752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137624
121	NC_017307	AAG	2	6	10973	10978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137624
122	NC_017307	GGT	2	6	11012	11017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137624
123	NC_017307	GAA	2	6	11039	11044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137624
124	NC_017307	ATG	2	6	11076	11081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137624
125	NC_017307	GCT	2	6	11086	11091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137624
126	NC_017307	GAA	2	6	11102	11107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137624
127	NC_017307	TGA	3	9	11131	11139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137624
128	NC_017307	CGA	2	6	11197	11202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137624
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499	NC_017307	TGC	2	6	39904	39909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137655
500	NC_017307	ACC	2	6	39931	39936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387137655

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