MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A chromosome

Total Repeats: 37300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017306	CAT	2	6	60343	60348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135621
1002	NC_017306	AAC	2	6	60369	60374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135621
1003	NC_017306	TCC	2	6	60537	60542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387135621
1004	NC_017306	CGG	2	6	60601	60606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135621
1005	NC_017306	TGCT	2	8	60764	60771	0 %	50 %	25 %	25 %	387135622
1006	NC_017306	GA	3	6	60821	60826	50 %	0 %	50 %	0 %	387135622
1007	NC_017306	GC	4	8	60847	60854	0 %	0 %	50 %	50 %	387135622
1008	NC_017306	TGG	2	6	60899	60904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135622
1009	NC_017306	GCG	2	6	60975	60980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135622
1010	NC_017306	AGC	2	6	61012	61017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135623
1011	NC_017306	GCG	2	6	61044	61049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135623
1012	NC_017306	GTGC	2	8	61175	61182	0 %	25 %	50 %	25 %	387135623
1013	NC_017306	GTG	2	6	61296	61301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135623
1014	NC_017306	CGTA	2	8	61307	61314	25 %	25 %	25 %	25 %	387135623
1015	NC_017306	A	6	6	61541	61546	100 %	0 %	0 %	0 %	387135624
1016	NC_017306	GTA	2	6	61562	61567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135624
1017	NC_017306	GGA	2	6	61576	61581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135624
1018	NC_017306	CGG	2	6	61746	61751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135624
1019	NC_017306	CT	3	6	61754	61759	0 %	50 %	0 %	50 %	387135624
1020	NC_017306	TA	3	6	61868	61873	50 %	50 %	0 %	0 %	387135624
1021	NC_017306	TCG	2	6	61900	61905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135624
1022	NC_017306	ACCT	2	8	61936	61943	25 %	25 %	0 %	50 %	387135624
1023	NC_017306	TGA	2	6	61954	61959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135624
1024	NC_017306	GC	3	6	62048	62053	0 %	0 %	50 %	50 %	387135624
1025	NC_017306	ATAC	2	8	62095	62102	50 %	25 %	0 %	25 %	387135624
1026	NC_017306	CATG	2	8	62119	62126	25 %	25 %	25 %	25 %	387135624
1027	NC_017306	CG	3	6	62217	62222	0 %	0 %	50 %	50 %	387135624
1028	NC_017306	AGCCTG	2	12	62249	62260	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387135624
1029	NC_017306	TGA	2	6	62400	62405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135624
1030	NC_017306	ACC	2	6	62481	62486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135624
1031	NC_017306	GAC	2	6	62492	62497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135624
1032	NC_017306	CGA	2	6	62620	62625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135624
1033	NC_017306	ACT	2	6	62665	62670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135624
1034	NC_017306	ATGTG	2	10	62844	62853	20 %	40 %	40 %	0 %	387135624
1035	NC_017306	CTT	2	6	62873	62878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135624
1036	NC_017306	GCGG	2	8	63096	63103	0 %	0 %	75 %	25 %	387135625
1037	NC_017306	AACA	2	8	63127	63134	75 %	0 %	0 %	25 %	387135625
1038	NC_017306	GTT	2	6	63198	63203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135625
1039	NC_017306	AGC	2	6	63245	63250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135625
1040	NC_017306	GC	3	6	63262	63267	0 %	0 %	50 %	50 %	387135625
1041	NC_017306	GCT	2	6	63269	63274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135625
1042	NC_017306	TTA	2	6	63340	63345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135625
1043	NC_017306	CCCGGA	2	12	63365	63376	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387135625
1044	NC_017306	CGG	2	6	63440	63445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135625
1045	NC_017306	CAC	2	6	63470	63475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135625
1046	NC_017306	CG	3	6	63498	63503	0 %	0 %	50 %	50 %	387135625
1047	NC_017306	CAA	2	6	63608	63613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135625
1048	NC_017306	GAT	2	6	63638	63643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135625
1049	NC_017306	CT	3	6	63703	63708	0 %	50 %	0 %	50 %	387135625
1050	NC_017306	CGG	2	6	63722	63727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135625
1051	NC_017306	CTG	2	6	63754	63759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135625
1052	NC_017306	AG	3	6	63818	63823	50 %	0 %	50 %	0 %	387135625
1053	NC_017306	CAG	2	6	63868	63873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135625
1054	NC_017306	ATT	2	6	63886	63891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135625
1055	NC_017306	TGA	2	6	63908	63913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135625
1056	NC_017306	CAA	2	6	64005	64010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135625
1057	NC_017306	GGC	2	6	64063	64068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135625
1058	NC_017306	CTG	2	6	64132	64137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135625
1059	NC_017306	TGT	2	6	64187	64192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135625
1060	NC_017306	TTC	2	6	64264	64269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135625
1061	NC_017306	GAA	2	6	64325	64330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135625
1062	NC_017306	GAA	2	6	64358	64363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135625
1063	NC_017306	ATT	2	6	64766	64771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135626
1064	NC_017306	ATG	2	6	64787	64792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135626
1065	NC_017306	CGT	2	6	64799	64804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135626
1066	NC_017306	CAG	3	9	64933	64941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135626
1067	NC_017306	GCTGG	2	10	65005	65014	0 %	20 %	60 %	20 %	387135626
1068	NC_017306	GCA	2	6	65110	65115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135626
1069	NC_017306	TC	3	6	65139	65144	0 %	50 %	0 %	50 %	387135626
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1072	NC_017306	GATT	2	8	65398	65405	25 %	50 %	25 %	0 %	387135626
1073	NC_017306	TCG	2	6	65442	65447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135626
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1078	NC_017306	GTA	2	6	65588	65593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135626
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1081	NC_017306	GCC	2	6	65648	65653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135626
1082	NC_017306	CAC	2	6	65692	65697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135626
1083	NC_017306	ATT	2	6	65786	65791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135626
1084	NC_017306	CTG	2	6	65792	65797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135626
1085	NC_017306	GC	3	6	65854	65859	0 %	0 %	50 %	50 %	387135626
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1087	NC_017306	CG	3	6	66014	66019	0 %	0 %	50 %	50 %	387135627
1088	NC_017306	TCG	2	6	66027	66032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135627
1089	NC_017306	GCT	2	6	66037	66042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135627
1090	NC_017306	TCA	2	6	66055	66060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135627
1091	NC_017306	CGA	2	6	66096	66101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135627
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1094	NC_017306	CCAG	2	8	66250	66257	25 %	0 %	25 %	50 %	387135627
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1097	NC_017306	CGC	2	6	66433	66438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135627
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1099	NC_017306	CG	3	6	66674	66679	0 %	0 %	50 %	50 %	387135627
1100	NC_017306	GTA	2	6	66743	66748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135627
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1106	NC_017306	GCC	2	6	67349	67354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135628
1107	NC_017306	AG	3	6	67406	67411	50 %	0 %	50 %	0 %	387135628
1108	NC_017306	GAT	2	6	67433	67438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135628
1109	NC_017306	GAT	2	6	67457	67462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135628
1110	NC_017306	ACC	2	6	67494	67499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135628
1111	NC_017306	GGC	2	6	67532	67537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135628
1112	NC_017306	GAA	2	6	67542	67547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135628
1113	NC_017306	AGC	2	6	67550	67555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135628
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1115	NC_017306	GCC	2	6	67644	67649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135628
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1125	NC_017306	ATG	2	6	68545	68550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135629
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1131	NC_017306	CTG	2	6	68915	68920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135629
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1499	NC_017306	GGA	2	6	89222	89227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135649
1500	NC_017306	CAG	2	6	89377	89382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135649

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