MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A chromosome

Total Repeats: 37300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017306	AGC	2	6	30763	30768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135593
502	NC_017306	GCA	2	6	30887	30892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135593
503	NC_017306	GGA	2	6	30986	30991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135593
504	NC_017306	GA	3	6	31079	31084	50 %	0 %	50 %	0 %	387135593
505	NC_017306	TGG	2	6	31128	31133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135593
506	NC_017306	CGT	2	6	31134	31139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135593
507	NC_017306	GC	3	6	31143	31148	0 %	0 %	50 %	50 %	387135593
508	NC_017306	ATC	2	6	31193	31198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135593
509	NC_017306	CGT	2	6	31236	31241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135593
510	NC_017306	TCT	2	6	31310	31315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135593
511	NC_017306	CAA	2	6	31413	31418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135593
512	NC_017306	GCA	2	6	31503	31508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135593
513	NC_017306	CCT	2	6	31630	31635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387135594
514	NC_017306	TGA	2	6	31717	31722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135594
515	NC_017306	GGAA	2	8	31725	31732	50 %	0 %	50 %	0 %	387135594
516	NC_017306	GGC	2	6	31786	31791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135594
517	NC_017306	AAC	2	6	31797	31802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135594
518	NC_017306	TTC	2	6	31881	31886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135594
519	NC_017306	ACT	2	6	31941	31946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135594
520	NC_017306	TCC	2	6	31959	31964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387135594
521	NC_017306	CAA	2	6	31965	31970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135594
522	NC_017306	TGGC	2	8	31987	31994	0 %	25 %	50 %	25 %	387135594
523	NC_017306	TGC	2	6	32019	32024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135594
524	NC_017306	GAG	2	6	32025	32030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135594
525	NC_017306	TCC	2	6	32080	32085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387135594
526	NC_017306	TTG	2	6	32093	32098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135594
527	NC_017306	GTG	2	6	32185	32190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135594
528	NC_017306	GGTT	2	8	32232	32239	0 %	50 %	50 %	0 %	387135594
529	NC_017306	CTG	2	6	32250	32255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135594
530	NC_017306	CTGA	2	8	32264	32271	25 %	25 %	25 %	25 %	387135594
531	NC_017306	GTA	2	6	32299	32304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135594
532	NC_017306	GTG	2	6	32417	32422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135594
533	NC_017306	GCC	3	9	32620	32628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135594
534	NC_017306	AGG	2	6	32677	32682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135594
535	NC_017306	AAT	2	6	32724	32729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387135594
536	NC_017306	GCC	2	6	32743	32748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135594
537	NC_017306	GA	3	6	32811	32816	50 %	0 %	50 %	0 %	387135594
538	NC_017306	CAC	2	6	32819	32824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135594
539	NC_017306	GAT	2	6	32913	32918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135594
540	NC_017306	GTC	2	6	33024	33029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135594
541	NC_017306	GCC	2	6	33051	33056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135594
542	NC_017306	GTC	2	6	33084	33089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135594
543	NC_017306	GC	3	6	33156	33161	0 %	0 %	50 %	50 %	387135595
544	NC_017306	GCT	2	6	33167	33172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135595
545	NC_017306	GCT	2	6	33176	33181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135595
546	NC_017306	GGC	2	6	33205	33210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135595
547	NC_017306	ACC	2	6	33217	33222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135595
548	NC_017306	TGC	2	6	33226	33231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135595
549	NC_017306	ACC	2	6	33244	33249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135595
550	NC_017306	T	6	6	33251	33256	0 %	100 %	0 %	0 %	387135595
551	NC_017306	ACC	2	6	33257	33262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135595
552	NC_017306	CAG	2	6	33351	33356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135595
553	NC_017306	CAA	2	6	33510	33515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135595
554	NC_017306	GCC	2	6	33547	33552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135595
555	NC_017306	GGAC	2	8	33588	33595	25 %	0 %	50 %	25 %	387135595
556	NC_017306	AGA	2	6	33643	33648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135595
557	NC_017306	GCT	2	6	33719	33724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135595
558	NC_017306	CTT	2	6	33810	33815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135595
559	NC_017306	TGG	2	6	33964	33969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135595
560	NC_017306	GCA	2	6	34064	34069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135595
561	NC_017306	CTA	2	6	34128	34133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135595
562	NC_017306	CTT	2	6	34176	34181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135595
563	NC_017306	CAC	2	6	34247	34252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135595
564	NC_017306	ATC	2	6	34270	34275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135595
565	NC_017306	GATA	2	8	34334	34341	50 %	25 %	25 %	0 %	387135595
566	NC_017306	GTA	2	6	34390	34395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135595
567	NC_017306	GCC	2	6	34432	34437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135595
568	NC_017306	AGG	2	6	34550	34555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135595
569	NC_017306	GAA	2	6	34566	34571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135595
570	NC_017306	CCT	2	6	34616	34621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387135596
571	NC_017306	AAC	2	6	34626	34631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135596
572	NC_017306	AGA	2	6	34647	34652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135596
573	NC_017306	GA	3	6	34706	34711	50 %	0 %	50 %	0 %	387135596
574	NC_017306	AAG	2	6	34728	34733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135596
575	NC_017306	GCC	2	6	34758	34763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135596
576	NC_017306	CGG	2	6	34817	34822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135596
577	NC_017306	CAC	2	6	34824	34829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135596
578	NC_017306	CGC	2	6	35060	35065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135596
579	NC_017306	GA	3	6	35090	35095	50 %	0 %	50 %	0 %	387135596
580	NC_017306	GTA	2	6	35182	35187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135596
581	NC_017306	CCG	2	6	35188	35193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135596
582	NC_017306	ACC	2	6	35197	35202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135596
583	NC_017306	TGG	2	6	35237	35242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135596
584	NC_017306	CAG	2	6	35274	35279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135596
585	NC_017306	TAA	2	6	35427	35432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387135596
586	NC_017306	GAA	2	6	35439	35444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135596
587	NC_017306	CAG	2	6	35451	35456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135596
588	NC_017306	TGG	2	6	35531	35536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135596
589	NC_017306	AAG	2	6	35556	35561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135596
590	NC_017306	AT	3	6	35584	35589	50 %	50 %	0 %	0 %	387135596
591	NC_017306	GA	3	6	35597	35602	50 %	0 %	50 %	0 %	387135596
592	NC_017306	TAC	2	6	35631	35636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135596
593	NC_017306	ATC	2	6	35638	35643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135596
594	NC_017306	TAAC	2	8	35723	35730	50 %	25 %	0 %	25 %	387135596
595	NC_017306	CAAG	2	8	35927	35934	50 %	0 %	25 %	25 %	387135596
596	NC_017306	CGT	2	6	35947	35952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135596
597	NC_017306	CT	3	6	35988	35993	0 %	50 %	0 %	50 %	387135597
598	NC_017306	GA	3	6	36013	36018	50 %	0 %	50 %	0 %	387135597
599	NC_017306	CCGGCT	2	12	36023	36034	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387135597
600	NC_017306	CTCCTG	2	12	36054	36065	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	387135597
601	NC_017306	AGC	2	6	36069	36074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135597
602	NC_017306	CTT	2	6	36126	36131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135597
603	NC_017306	GCA	2	6	36173	36178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135597
604	NC_017306	CTG	2	6	36192	36197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135597
605	NC_017306	TGC	2	6	36202	36207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135597
606	NC_017306	CGT	2	6	36212	36217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135597
607	NC_017306	GA	3	6	36322	36327	50 %	0 %	50 %	0 %	387135597
608	NC_017306	CAGG	2	8	36342	36349	25 %	0 %	50 %	25 %	387135597
609	NC_017306	CGC	2	6	36398	36403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135597
610	NC_017306	CTT	2	6	36431	36436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135597
611	NC_017306	TAA	2	6	36454	36459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387135597
612	NC_017306	CCA	2	6	36483	36488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135597
613	NC_017306	GCA	2	6	36505	36510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135597
614	NC_017306	AAG	2	6	36516	36521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135597
615	NC_017306	TGA	2	6	36524	36529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135597
616	NC_017306	GCCC	2	8	36531	36538	0 %	0 %	25 %	75 %	387135597
617	NC_017306	TCT	2	6	36560	36565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135597
618	NC_017306	G	6	6	36576	36581	0 %	0 %	100 %	0 %	387135597
619	NC_017306	CTG	2	6	36611	36616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135597
620	NC_017306	GT	3	6	36622	36627	0 %	50 %	50 %	0 %	387135597
621	NC_017306	CG	3	6	36632	36637	0 %	0 %	50 %	50 %	387135597
622	NC_017306	TGGC	2	8	36651	36658	0 %	25 %	50 %	25 %	387135597
623	NC_017306	GCC	2	6	36661	36666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135597
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625	NC_017306	CTG	2	6	36737	36742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135597
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627	NC_017306	CCA	2	6	36823	36828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135597
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