MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 42/02-A chromosome

Total Repeats: 37300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017306	CGG	2	6	298732	298737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135834
5002	NC_017306	CGA	2	6	298854	298859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135835
5003	NC_017306	GTGC	2	8	298884	298891	0 %	25 %	50 %	25 %	387135835
5004	NC_017306	TGA	2	6	299053	299058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135835
5005	NC_017306	GTT	3	9	299072	299080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135835
5006	NC_017306	GTG	2	6	299098	299103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135835
5007	NC_017306	AGC	2	6	299163	299168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135835
5008	NC_017306	CGTG	2	8	299191	299198	0 %	25 %	50 %	25 %	387135835
5009	NC_017306	ATT	2	6	299199	299204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135835
5010	NC_017306	CCA	2	6	299267	299272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135835
5011	NC_017306	CTG	2	6	299280	299285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135835
5012	NC_017306	TAT	2	6	299326	299331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135835
5013	NC_017306	AGC	2	6	299340	299345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135835
5014	NC_017306	CAG	2	6	299352	299357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135835
5015	NC_017306	TGAC	2	8	299417	299424	25 %	25 %	25 %	25 %	387135835
5016	NC_017306	ACT	2	6	299478	299483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135836
5017	NC_017306	TG	3	6	299536	299541	0 %	50 %	50 %	0 %	387135836
5018	NC_017306	AGT	2	6	299580	299585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135836
5019	NC_017306	AAG	2	6	299629	299634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135836
5020	NC_017306	GGC	2	6	299655	299660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135836
5021	NC_017306	TGTT	2	8	299666	299673	0 %	75 %	25 %	0 %	387135836
5022	NC_017306	CGG	2	6	299766	299771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135836
5023	NC_017306	GGT	2	6	299772	299777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135836
5024	NC_017306	GCT	2	6	299781	299786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135836
5025	NC_017306	GTG	2	6	299794	299799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135836
5026	NC_017306	CTT	2	6	299817	299822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135836
5027	NC_017306	AAG	2	6	299825	299830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135836
5028	NC_017306	GCT	2	6	299877	299882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135836
5029	NC_017306	GGA	2	6	299884	299889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135836
5030	NC_017306	AGC	2	6	299931	299936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135836
5031	NC_017306	TAT	2	6	299937	299942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135836
5032	NC_017306	CTG	2	6	299951	299956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135836
5033	NC_017306	AAC	2	6	299967	299972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135836
5034	NC_017306	TGGGAT	2	12	300011	300022	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	387135836
5035	NC_017306	TGC	2	6	300077	300082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135836
5036	NC_017306	GGC	2	6	300083	300088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135836
5037	NC_017306	GTGG	2	8	300109	300116	0 %	25 %	75 %	0 %	387135836
5038	NC_017306	TTA	2	6	300170	300175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135836
5039	NC_017306	TTTA	2	8	300214	300221	25 %	75 %	0 %	0 %	387135836
5040	NC_017306	GCT	2	6	300256	300261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135837
5041	NC_017306	TCT	2	6	300325	300330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135837
5042	NC_017306	TTG	2	6	300356	300361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135837
5043	NC_017306	TAA	2	6	300406	300411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387135837
5044	NC_017306	CTG	2	6	300420	300425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135837
5045	NC_017306	CTG	2	6	300491	300496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135837
5046	NC_017306	ATC	2	6	300518	300523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135837
5047	NC_017306	A	6	6	300577	300582	100 %	0 %	0 %	0 %	387135837
5048	NC_017306	AGA	3	9	300640	300648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135837
5049	NC_017306	TGG	2	6	300780	300785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135837
5050	NC_017306	GTTG	2	8	300790	300797	0 %	50 %	50 %	0 %	387135837
5051	NC_017306	TTC	2	6	300818	300823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135837
5052	NC_017306	ATC	2	6	300839	300844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135837
5053	NC_017306	CGA	2	6	300853	300858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135837
5054	NC_017306	TTCC	2	8	300907	300914	0 %	50 %	0 %	50 %	387135837
5055	NC_017306	CA	3	6	300966	300971	50 %	0 %	0 %	50 %	387135837
5056	NC_017306	CTG	2	6	300978	300983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135837
5057	NC_017306	GCA	2	6	301072	301077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135837
5058	NC_017306	ATC	2	6	301095	301100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135837
5059	NC_017306	GCCG	2	8	301261	301268	0 %	0 %	50 %	50 %	387135837
5060	NC_017306	CCT	2	6	301338	301343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387135837
5061	NC_017306	ATCAG	2	10	301599	301608	40 %	20 %	20 %	20 %	387135837
5062	NC_017306	CT	3	6	301660	301665	0 %	50 %	0 %	50 %	387135837
5063	NC_017306	ATT	2	6	301675	301680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135837
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5065	NC_017306	GTGCGC	2	12	301703	301714	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387135837
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5067	NC_017306	TCCCGA	2	12	301822	301833	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387135837
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5069	NC_017306	TTG	2	6	301980	301985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135838
5070	NC_017306	CTT	2	6	302011	302016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135838
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5072	NC_017306	TCC	2	6	302100	302105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387135838
5073	NC_017306	AG	3	6	302121	302126	50 %	0 %	50 %	0 %	387135838
5074	NC_017306	TGG	2	6	302142	302147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135838
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5082	NC_017306	CCATG	2	10	302765	302774	20 %	20 %	20 %	40 %	387135839
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5085	NC_017306	ATG	2	6	302869	302874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135839
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5088	NC_017306	TCG	2	6	302911	302916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135839
5089	NC_017306	TTG	2	6	302934	302939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135839
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5091	NC_017306	GCC	2	6	302976	302981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135839
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5093	NC_017306	TG	3	6	303059	303064	0 %	50 %	50 %	0 %	387135839
5094	NC_017306	GAA	2	6	303139	303144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135839
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5100	NC_017306	ACAG	2	8	303442	303449	50 %	0 %	25 %	25 %	387135840
5101	NC_017306	GTG	2	6	303451	303456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135840
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5104	NC_017306	ATT	2	6	303495	303500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135840
5105	NC_017306	AG	3	6	303576	303581	50 %	0 %	50 %	0 %	387135840
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5108	NC_017306	GGAC	2	8	303806	303813	25 %	0 %	50 %	25 %	387135840
5109	NC_017306	T	6	6	303897	303902	0 %	100 %	0 %	0 %	387135840
5110	NC_017306	GCC	2	6	304044	304049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135840
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5112	NC_017306	TCA	2	6	304243	304248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135840
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5115	NC_017306	AGTG	2	8	304332	304339	25 %	25 %	50 %	0 %	387135840
5116	NC_017306	TCT	2	6	304382	304387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135840
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5120	NC_017306	CGG	2	6	304697	304702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135841
5121	NC_017306	AAT	2	6	304839	304844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387135841
5122	NC_017306	ACC	2	6	304852	304857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135841
5123	NC_017306	GC	3	6	304866	304871	0 %	0 %	50 %	50 %	387135841
5124	NC_017306	GAT	2	6	304938	304943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135841
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5126	NC_017306	CGC	2	6	305121	305126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135841
5127	NC_017306	ACT	2	6	305200	305205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135841
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5130	NC_017306	GAT	2	6	305948	305953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135842
5131	NC_017306	GAT	2	6	306004	306009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135842
5132	NC_017306	GTT	3	9	306023	306031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387135842
5133	NC_017306	CGC	2	6	306034	306039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387135842
5134	NC_017306	GCG	2	6	306134	306139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135842
5135	NC_017306	TTC	2	6	306140	306145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135842
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5138	NC_017306	GTA	2	6	306248	306253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135842
5139	NC_017306	CTG	2	6	306350	306355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135842
5140	NC_017306	GCAAG	2	10	306370	306379	40 %	0 %	40 %	20 %	387135842
5141	NC_017306	ATT	2	6	306488	306493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387135842
5142	NC_017306	GGGAT	2	10	306535	306544	20 %	20 %	60 %	0 %	387135842
5143	NC_017306	GCAC	2	8	306595	306602	25 %	0 %	25 %	50 %	387135842
5144	NC_017306	T	6	6	306680	306685	0 %	100 %	0 %	0 %	387135842
5145	NC_017306	TGG	2	6	306693	306698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387135842
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5151	NC_017306	TTC	2	6	307019	307024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135843
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5153	NC_017306	TCT	2	6	307069	307074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387135843
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5213	NC_017306	CGT	3	9	310239	310247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135847
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5221	NC_017306	GT	3	6	310763	310768	0 %	50 %	50 %	0 %	387135848
5222	NC_017306	CAA	2	6	310781	310786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135848
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5225	NC_017306	TGGA	2	8	310930	310937	25 %	25 %	50 %	0 %	387135848
5226	NC_017306	GGC	2	6	311016	311021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135848
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5230	NC_017306	A	6	6	311188	311193	100 %	0 %	0 %	0 %	387135848
5231	NC_017306	GAT	2	6	311244	311249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135848
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5233	NC_017306	ACG	2	6	311335	311340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135848
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5235	NC_017306	GGA	2	6	311363	311368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135848
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5237	NC_017306	TGC	2	6	311458	311463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135848
5238	NC_017306	CGA	2	6	311489	311494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135848
5239	NC_017306	CCA	2	6	311511	311516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387135848
5240	NC_017306	GAT	2	6	311646	311651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135848
5241	NC_017306	CGG	2	6	311699	311704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387135848
5242	NC_017306	GAG	2	6	311733	311738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387135848
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5244	NC_017306	AGT	2	6	311968	311973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387135848
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5345	NC_017306	CAT	2	6	317915	317920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135854
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5352	NC_017306	AC	3	6	318337	318342	50 %	0 %	0 %	50 %	387135854
5353	NC_017306	CAA	3	9	318430	318438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135854
5354	NC_017306	CAA	2	6	318623	318628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135855
5355	NC_017306	GCA	2	6	318731	318736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387135855
5356	NC_017306	CATG	2	8	318817	318824	25 %	25 %	25 %	25 %	387135855
5357	NC_017306	AG	3	6	318825	318830	50 %	0 %	50 %	0 %	387135855
5358	NC_017306	AATC	2	8	318884	318891	50 %	25 %	0 %	25 %	387135855
5359	NC_017306	GCT	2	6	318919	318924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135855
5360	NC_017306	CAA	2	6	318984	318989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387135855
5361	NC_017306	TCG	2	6	319027	319032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135855
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5364	NC_017306	CG	3	6	319087	319092	0 %	0 %	50 %	50 %	387135855
5365	NC_017306	TCG	2	6	319180	319185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387135855
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5485	NC_017306	TC	3	6	328669	328674	0 %	50 %	0 %	50 %	387135862
5486	NC_017306	TCA	2	6	328708	328713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387135862
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5488	NC_017306	AAG	2	6	328872	328877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387135862
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