MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 37477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017305	TC	3	6	182828	182833	0 %	50 %	0 %	50 %	384510054
3002	NC_017305	GCA	2	6	182868	182873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510054
3003	NC_017305	GCC	2	6	182903	182908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510054
3004	NC_017305	TGG	2	6	182919	182924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510054
3005	NC_017305	AAC	2	6	182996	183001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510054
3006	NC_017305	ATT	2	6	183014	183019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510054
3007	NC_017305	CAC	2	6	183034	183039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510054
3008	NC_017305	AGA	2	6	183223	183228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510054
3009	NC_017305	CGTG	2	8	183381	183388	0 %	25 %	50 %	25 %	384510054
3010	NC_017305	AC	3	6	183409	183414	50 %	0 %	0 %	50 %	384510054
3011	NC_017305	TGG	2	6	183417	183422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510054
3012	NC_017305	AGT	2	6	183496	183501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510054
3013	NC_017305	GCT	2	6	183524	183529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510054
3014	NC_017305	TGA	2	6	183535	183540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510054
3015	NC_017305	TTGG	2	8	183545	183552	0 %	50 %	50 %	0 %	384510054
3016	NC_017305	GCT	2	6	183661	183666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510054
3017	NC_017305	TATT	2	8	183735	183742	25 %	75 %	0 %	0 %	384510055
3018	NC_017305	GCT	2	6	183770	183775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510055
3019	NC_017305	CG	4	8	183791	183798	0 %	0 %	50 %	50 %	384510055
3020	NC_017305	TGC	2	6	183844	183849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510055
3021	NC_017305	ACG	2	6	183895	183900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510055
3022	NC_017305	AGGG	2	8	183907	183914	25 %	0 %	75 %	0 %	384510055
3023	NC_017305	GGT	2	6	183952	183957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510055
3024	NC_017305	TGG	2	6	183966	183971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510055
3025	NC_017305	CGG	2	6	183978	183983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510055
3026	NC_017305	GGA	2	6	184006	184011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510055
3027	NC_017305	GGGC	2	8	184019	184026	0 %	0 %	75 %	25 %	384510055
3028	NC_017305	AGGT	2	8	184133	184140	25 %	25 %	50 %	0 %	384510055
3029	NC_017305	TCG	2	6	184154	184159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510055
3030	NC_017305	TC	3	6	184212	184217	0 %	50 %	0 %	50 %	384510055
3031	NC_017305	CGC	2	6	184245	184250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510055
3032	NC_017305	ATC	2	6	184282	184287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510055
3033	NC_017305	TTC	2	6	184298	184303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510055
3034	NC_017305	ACA	2	6	184508	184513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510056
3035	NC_017305	GCTC	2	8	184609	184616	0 %	25 %	25 %	50 %	384510056
3036	NC_017305	TGGC	2	8	184773	184780	0 %	25 %	50 %	25 %	384510056
3037	NC_017305	CAA	2	6	184867	184872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510056
3038	NC_017305	CTT	2	6	184882	184887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510056
3039	NC_017305	ACCT	2	8	185015	185022	25 %	25 %	0 %	50 %	384510056
3040	NC_017305	CCA	2	6	185056	185061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510056
3041	NC_017305	GAG	2	6	185099	185104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510056
3042	NC_017305	CAT	2	6	185204	185209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510056
3043	NC_017305	TGACC	2	10	185317	185326	20 %	20 %	20 %	40 %	384510056
3044	NC_017305	AGC	2	6	185415	185420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510056
3045	NC_017305	CG	3	6	185486	185491	0 %	0 %	50 %	50 %	384510056
3046	NC_017305	GGT	2	6	185560	185565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510056
3047	NC_017305	CGG	2	6	185616	185621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510056
3048	NC_017305	TGA	2	6	185671	185676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510056
3049	NC_017305	GAT	2	6	185789	185794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510056
3050	NC_017305	TGA	2	6	185833	185838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510056
3051	NC_017305	GA	3	6	185841	185846	50 %	0 %	50 %	0 %	384510056
3052	NC_017305	GAG	2	6	185903	185908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510056
3053	NC_017305	GTACTG	2	12	185914	185925	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384510056
3054	NC_017305	CCA	2	6	185973	185978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510056
3055	NC_017305	AAC	2	6	185985	185990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510056
3056	NC_017305	ACG	2	6	186007	186012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510057
3057	NC_017305	T	6	6	186056	186061	0 %	100 %	0 %	0 %	384510057
3058	NC_017305	AGA	2	6	186665	186670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510058
3059	NC_017305	TGG	2	6	186698	186703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510058
3060	NC_017305	GAC	2	6	186779	186784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510058
3061	NC_017305	TTC	2	6	186943	186948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510058
3062	NC_017305	GGA	2	6	186966	186971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510058
3063	NC_017305	ATT	2	6	187048	187053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510058
3064	NC_017305	GGC	2	6	187074	187079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510058
3065	NC_017305	CCAG	2	8	187110	187117	25 %	0 %	25 %	50 %	384510058
3066	NC_017305	T	6	6	187126	187131	0 %	100 %	0 %	0 %	384510058
3067	NC_017305	ATG	2	6	187171	187176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510058
3068	NC_017305	ACG	2	6	187189	187194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510058
3069	NC_017305	A	6	6	187239	187244	100 %	0 %	0 %	0 %	384510058
3070	NC_017305	ATG	2	6	187263	187268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510058
3071	NC_017305	TAA	2	6	187353	187358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510058
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3073	NC_017305	TGA	2	6	187468	187473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510059
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3078	NC_017305	CT	3	6	187855	187860	0 %	50 %	0 %	50 %	384510060
3079	NC_017305	GAAAAA	2	12	187963	187974	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384510060
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3081	NC_017305	ATGG	2	8	188018	188025	25 %	25 %	50 %	0 %	384510060
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3084	NC_017305	GGCA	2	8	188153	188160	25 %	0 %	50 %	25 %	384510060
3085	NC_017305	A	7	7	188167	188173	100 %	0 %	0 %	0 %	384510060
3086	NC_017305	AT	3	6	188193	188198	50 %	50 %	0 %	0 %	384510060
3087	NC_017305	GAA	2	6	188236	188241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510060
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3089	NC_017305	TGGT	2	8	188281	188288	0 %	50 %	50 %	0 %	384510060
3090	NC_017305	GA	3	6	188306	188311	50 %	0 %	50 %	0 %	384510060
3091	NC_017305	GCA	2	6	188391	188396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510061
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3094	NC_017305	TTG	2	6	188488	188493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510061
3095	NC_017305	GTTTG	2	10	188543	188552	0 %	60 %	40 %	0 %	384510061
3096	NC_017305	GAA	2	6	188613	188618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510061
3097	NC_017305	GTT	2	6	188687	188692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510061
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3101	NC_017305	A	6	6	188840	188845	100 %	0 %	0 %	0 %	384510061
3102	NC_017305	GAG	2	6	188850	188855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510061
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3104	NC_017305	CGA	2	6	188882	188887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510061
3105	NC_017305	TTG	2	6	188890	188895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510061
3106	NC_017305	CT	3	6	188915	188920	0 %	50 %	0 %	50 %	384510061
3107	NC_017305	TGG	2	6	188934	188939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510061
3108	NC_017305	T	6	6	188951	188956	0 %	100 %	0 %	0 %	384510062
3109	NC_017305	AGA	2	6	188967	188972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510062
3110	NC_017305	CAG	3	9	188975	188983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510062
3111	NC_017305	GTG	2	6	189071	189076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510062
3112	NC_017305	AAG	2	6	189159	189164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510062
3113	NC_017305	ATGC	2	8	189170	189177	25 %	25 %	25 %	25 %	384510062
3114	NC_017305	GGT	2	6	189178	189183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510062
3115	NC_017305	CA	3	6	189189	189194	50 %	0 %	0 %	50 %	384510062
3116	NC_017305	AC	3	6	189247	189252	50 %	0 %	0 %	50 %	384510062
3117	NC_017305	TG	3	6	189259	189264	0 %	50 %	50 %	0 %	384510062
3118	NC_017305	GGC	2	6	189325	189330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510062
3119	NC_017305	GAC	2	6	189368	189373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510062
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3121	NC_017305	CGGAT	2	10	189483	189492	20 %	20 %	40 %	20 %	384510062
3122	NC_017305	GCG	2	6	189494	189499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510062
3123	NC_017305	CCGC	2	8	189597	189604	0 %	0 %	25 %	75 %	384510062
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3243	NC_017305	CTGCCG	2	12	196012	196023	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384510068
3244	NC_017305	CT	3	6	196076	196081	0 %	50 %	0 %	50 %	384510068
3245	NC_017305	CAC	2	6	196090	196095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510068
3246	NC_017305	GCA	2	6	196124	196129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510068
3247	NC_017305	ATC	2	6	196181	196186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510068
3248	NC_017305	CCA	2	6	196206	196211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510068
3249	NC_017305	CTCA	2	8	196222	196229	25 %	25 %	0 %	50 %	384510068
3250	NC_017305	TAC	2	6	196251	196256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510068
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3252	NC_017305	TGG	2	6	196374	196379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510068
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3255	NC_017305	TCA	2	6	196484	196489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510068
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3260	NC_017305	TGA	2	6	196807	196812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510069
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3279	NC_017305	TGG	2	6	197769	197774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510072
3280	NC_017305	CGT	2	6	197821	197826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510072
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3283	NC_017305	TGG	2	6	198107	198112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510072
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3350	NC_017305	GC	3	6	201303	201308	0 %	0 %	50 %	50 %	384510074
3351	NC_017305	CTT	2	6	201345	201350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510074
3352	NC_017305	CAA	2	6	201393	201398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510074
3353	NC_017305	AG	3	6	201423	201428	50 %	0 %	50 %	0 %	384510074
3354	NC_017305	AGG	2	6	201449	201454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510074
3355	NC_017305	CTT	2	6	201507	201512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510074
3356	NC_017305	G	6	6	201532	201537	0 %	0 %	100 %	0 %	384510074
3357	NC_017305	CGC	2	6	201556	201561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510074
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3360	NC_017305	T	7	7	201793	201799	0 %	100 %	0 %	0 %	384510074
3361	NC_017305	GCC	2	6	201827	201832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510074
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3364	NC_017305	GCT	2	6	201974	201979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510074
3365	NC_017305	GGT	2	6	202063	202068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510074
3366	NC_017305	TGG	2	6	202119	202124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510074
3367	NC_017305	GCA	2	6	202139	202144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510074
3368	NC_017305	CAC	2	6	202215	202220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510074
3369	NC_017305	GCC	2	6	202225	202230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510074
3370	NC_017305	GAAG	2	8	202249	202256	50 %	0 %	50 %	0 %	384510074
3371	NC_017305	CGT	2	6	202296	202301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510074
3372	NC_017305	TCA	2	6	202341	202346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510074
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3374	NC_017305	GAG	2	6	202429	202434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510074
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3378	NC_017305	TC	3	6	202618	202623	0 %	50 %	0 %	50 %	384510074
3379	NC_017305	CAGC	2	8	202665	202672	25 %	0 %	25 %	50 %	384510074
3380	NC_017305	GCT	2	6	202925	202930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510075
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3382	NC_017305	CGCC	2	8	203050	203057	0 %	0 %	25 %	75 %	384510075
3383	NC_017305	AGC	2	6	203109	203114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510075
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3386	NC_017305	AAC	2	6	203167	203172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510075
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3392	NC_017305	CG	4	8	203697	203704	0 %	0 %	50 %	50 %	384510075
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3434	NC_017305	GAA	2	6	206523	206528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510077
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3472	NC_017305	TTC	2	6	211274	211279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510079
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3477	NC_017305	TCGC	2	8	211683	211690	0 %	25 %	25 %	50 %	384510080
3478	NC_017305	GAC	2	6	211808	211813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510080
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3481	NC_017305	CAGGC	2	10	211926	211935	20 %	0 %	40 %	40 %	384510080
3482	NC_017305	GCG	2	6	211967	211972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510080
3483	NC_017305	AGC	2	6	212017	212022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510081
3484	NC_017305	TGT	2	6	212023	212028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510081
3485	NC_017305	GTC	2	6	212043	212048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510081
3486	NC_017305	GTT	2	6	212064	212069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510081
3487	NC_017305	TGG	2	6	212105	212110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510081
3488	NC_017305	TCT	2	6	212311	212316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510081
3489	NC_017305	TTGTA	2	10	212336	212345	20 %	60 %	20 %	0 %	384510081
3490	NC_017305	TGC	2	6	212364	212369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510081
3491	NC_017305	GCG	2	6	212386	212391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510081
3492	NC_017305	CGGG	2	8	212404	212411	0 %	0 %	75 %	25 %	384510081
3493	NC_017305	TCG	2	6	212413	212418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510081
3494	NC_017305	CCG	2	6	212419	212424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510081
3495	NC_017305	GA	3	6	212447	212452	50 %	0 %	50 %	0 %	384510081
3496	NC_017305	GTT	2	6	212479	212484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510081
3497	NC_017305	AT	3	6	212497	212502	50 %	50 %	0 %	0 %	384510081
3498	NC_017305	GTG	2	6	212560	212565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510081
3499	NC_017305	GGC	2	6	212574	212579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510081
3500	NC_017305	TGA	2	6	212630	212635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510081

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