MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 37477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017305	ACT	2	6	149768	149773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510029
2502	NC_017305	GAGGAA	2	12	149807	149818	50 %	0 %	50 %	0 %	384510029
2503	NC_017305	ACC	2	6	149856	149861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510029
2504	NC_017305	AGC	2	6	149898	149903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510029
2505	NC_017305	GC	3	6	149909	149914	0 %	0 %	50 %	50 %	384510029
2506	NC_017305	GGCGCA	2	12	150056	150067	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384510030
2507	NC_017305	AATGG	2	10	150168	150177	40 %	20 %	40 %	0 %	384510030
2508	NC_017305	AGC	2	6	150180	150185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510030
2509	NC_017305	GGA	2	6	150215	150220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510030
2510	NC_017305	TTG	2	6	150244	150249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510030
2511	NC_017305	AGA	2	6	150295	150300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510030
2512	NC_017305	TGT	2	6	150457	150462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510031
2513	NC_017305	TGA	2	6	150488	150493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510031
2514	NC_017305	TGC	2	6	150633	150638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510031
2515	NC_017305	GTG	2	6	150705	150710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510031
2516	NC_017305	TGGG	2	8	150775	150782	0 %	25 %	75 %	0 %	384510031
2517	NC_017305	GCTA	2	8	150794	150801	25 %	25 %	25 %	25 %	384510031
2518	NC_017305	TGC	2	6	150835	150840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510031
2519	NC_017305	CTT	2	6	150973	150978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510031
2520	NC_017305	TGG	2	6	151012	151017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510031
2521	NC_017305	ACC	2	6	151135	151140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510032
2522	NC_017305	GTGAG	2	10	151151	151160	20 %	20 %	60 %	0 %	384510032
2523	NC_017305	TAG	2	6	151191	151196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510032
2524	NC_017305	GCT	2	6	151329	151334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510032
2525	NC_017305	GCT	2	6	151462	151467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510032
2526	NC_017305	ATA	2	6	151481	151486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510032
2527	NC_017305	CCA	2	6	151525	151530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510032
2528	NC_017305	ATG	3	9	151549	151557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510032
2529	NC_017305	GAA	2	6	151591	151596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510032
2530	NC_017305	ACC	2	6	151642	151647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510032
2531	NC_017305	CCA	2	6	151652	151657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510032
2532	NC_017305	ATG	2	6	151747	151752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510032
2533	NC_017305	TGG	2	6	151804	151809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510032
2534	NC_017305	GCG	2	6	151816	151821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510032
2535	NC_017305	GGC	2	6	151878	151883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510032
2536	NC_017305	ATA	2	6	151884	151889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510032
2537	NC_017305	CTGAA	2	10	151949	151958	40 %	20 %	20 %	20 %	384510032
2538	NC_017305	GCG	2	6	151988	151993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510032
2539	NC_017305	ATA	2	6	152098	152103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510032
2540	NC_017305	GCT	2	6	152143	152148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510032
2541	NC_017305	AAT	2	6	152232	152237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510032
2542	NC_017305	CGG	2	6	152429	152434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510032
2543	NC_017305	AGC	3	9	152443	152451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510032
2544	NC_017305	ATT	2	6	152467	152472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510032
2545	NC_017305	TGGG	2	8	152496	152503	0 %	25 %	75 %	0 %	384510033
2546	NC_017305	GC	3	6	152536	152541	0 %	0 %	50 %	50 %	384510033
2547	NC_017305	TGC	2	6	152571	152576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510033
2548	NC_017305	CGG	3	9	152578	152586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510033
2549	NC_017305	GGC	2	6	152618	152623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510033
2550	NC_017305	TCCT	2	8	152681	152688	0 %	50 %	0 %	50 %	384510033
2551	NC_017305	AGG	2	6	152734	152739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510033
2552	NC_017305	GCG	2	6	152742	152747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510033
2553	NC_017305	AGCGCC	2	12	152802	152813	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384510033
2554	NC_017305	TTGA	2	8	152849	152856	25 %	50 %	25 %	0 %	384510033
2555	NC_017305	ACC	2	6	152946	152951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510033
2556	NC_017305	CTGC	2	8	152988	152995	0 %	25 %	25 %	50 %	384510033
2557	NC_017305	GCC	2	6	153005	153010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510033
2558	NC_017305	ACA	2	6	153027	153032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510033
2559	NC_017305	GCT	2	6	153052	153057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510033
2560	NC_017305	GTT	2	6	153166	153171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510033
2561	NC_017305	AAC	2	6	153194	153199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510033
2562	NC_017305	GCT	2	6	153213	153218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510033
2563	NC_017305	CCAGC	2	10	153241	153250	20 %	0 %	20 %	60 %	384510033
2564	NC_017305	TGG	2	6	153319	153324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510033
2565	NC_017305	ACA	2	6	153354	153359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510033
2566	NC_017305	GA	3	6	153368	153373	50 %	0 %	50 %	0 %	384510033
2567	NC_017305	GGC	2	6	155046	155051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510034
2568	NC_017305	TC	3	6	155059	155064	0 %	50 %	0 %	50 %	384510034
2569	NC_017305	TGA	2	6	155089	155094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510034
2570	NC_017305	CAG	2	6	155211	155216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510034
2571	NC_017305	GGT	2	6	155244	155249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510034
2572	NC_017305	AGC	2	6	155286	155291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510034
2573	NC_017305	GCC	3	9	155335	155343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510034
2574	NC_017305	GAT	2	6	155350	155355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510034
2575	NC_017305	GATA	2	8	155387	155394	50 %	25 %	25 %	0 %	384510034
2576	NC_017305	TAAG	2	8	155562	155569	50 %	25 %	25 %	0 %	384510034
2577	NC_017305	GTTT	2	8	155577	155584	0 %	75 %	25 %	0 %	384510034
2578	NC_017305	CGG	2	6	155586	155591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510034
2579	NC_017305	ATT	2	6	155635	155640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510034
2580	NC_017305	CGCA	2	8	155828	155835	25 %	0 %	25 %	50 %	384510035
2581	NC_017305	ATG	2	6	155875	155880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510035
2582	NC_017305	GCT	2	6	155888	155893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510035
2583	NC_017305	ATC	2	6	155994	155999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510035
2584	NC_017305	TG	3	6	156000	156005	0 %	50 %	50 %	0 %	384510035
2585	NC_017305	CGA	2	6	156104	156109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510035
2586	NC_017305	GTG	2	6	156165	156170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510035
2587	NC_017305	CGGAGG	2	12	156202	156213	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384510035
2588	NC_017305	TGA	2	6	156235	156240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510035
2589	NC_017305	TACGC	2	10	156267	156276	20 %	20 %	20 %	40 %	384510035
2590	NC_017305	TGAA	2	8	156379	156386	50 %	25 %	25 %	0 %	384510035
2591	NC_017305	CAG	2	6	156430	156435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510035
2592	NC_017305	CG	3	6	156518	156523	0 %	0 %	50 %	50 %	384510035
2593	NC_017305	CGG	2	6	156531	156536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510035
2594	NC_017305	CAA	2	6	156626	156631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510035
2595	NC_017305	GCT	2	6	156769	156774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510036
2596	NC_017305	CAG	2	6	156787	156792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510036
2597	NC_017305	TTCA	2	8	156826	156833	25 %	50 %	0 %	25 %	384510036
2598	NC_017305	CAT	2	6	156834	156839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510036
2599	NC_017305	TCC	2	6	156863	156868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510036
2600	NC_017305	TGG	2	6	156947	156952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510036
2601	NC_017305	GT	3	6	156956	156961	0 %	50 %	50 %	0 %	384510036
2602	NC_017305	TG	3	6	157029	157034	0 %	50 %	50 %	0 %	384510037
2603	NC_017305	ACC	2	6	157058	157063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510037
2604	NC_017305	AT	3	6	157099	157104	50 %	50 %	0 %	0 %	384510037
2605	NC_017305	TCG	2	6	157278	157283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510038
2606	NC_017305	TGG	2	6	157501	157506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510038
2607	NC_017305	CGG	2	6	157549	157554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510038
2608	NC_017305	GTG	2	6	157617	157622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510038
2609	NC_017305	CGGC	2	8	157716	157723	0 %	0 %	50 %	50 %	384510038
2610	NC_017305	TGC	2	6	157727	157732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510038
2611	NC_017305	GCC	2	6	157742	157747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510038
2612	NC_017305	CTG	2	6	157765	157770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510038
2613	NC_017305	CGT	2	6	157912	157917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510038
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2615	NC_017305	GTCA	2	8	157964	157971	25 %	25 %	25 %	25 %	384510038
2616	NC_017305	AG	3	6	158161	158166	50 %	0 %	50 %	0 %	384510039
2617	NC_017305	CTC	2	6	158176	158181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510039
2618	NC_017305	AG	3	6	158203	158208	50 %	0 %	50 %	0 %	384510039
2619	NC_017305	TGC	2	6	158330	158335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510039
2620	NC_017305	TCG	2	6	158369	158374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510039
2621	NC_017305	GCG	2	6	158490	158495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510039
2622	NC_017305	CCT	2	6	158499	158504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510039
2623	NC_017305	CGA	2	6	158530	158535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510039
2624	NC_017305	GA	3	6	158550	158555	50 %	0 %	50 %	0 %	384510039
2625	NC_017305	CGT	2	6	158646	158651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510039
2626	NC_017305	CGT	2	6	158736	158741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510039
2627	NC_017305	CGT	2	6	158763	158768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510039
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2630	NC_017305	TTG	2	6	158834	158839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510039
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2642	NC_017305	CATG	2	8	159371	159378	25 %	25 %	25 %	25 %	384510040
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2725	NC_017305	CT	3	6	165466	165471	0 %	50 %	0 %	50 %	384510044
2726	NC_017305	ATT	2	6	165521	165526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510044
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2730	NC_017305	CTG	2	6	165644	165649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510044
2731	NC_017305	TTGATC	2	12	165716	165727	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384510044
2732	NC_017305	AGA	2	6	165747	165752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510044
2733	NC_017305	GGA	2	6	165760	165765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510044
2734	NC_017305	CTT	2	6	165802	165807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510044
2735	NC_017305	TGC	2	6	165820	165825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510044
2736	NC_017305	TTG	2	6	165897	165902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510044
2737	NC_017305	AGA	2	6	165912	165917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510044
2738	NC_017305	AG	3	6	165921	165926	50 %	0 %	50 %	0 %	384510044
2739	NC_017305	TG	3	6	165964	165969	0 %	50 %	50 %	0 %	384510044
2740	NC_017305	TTAT	2	8	165990	165997	25 %	75 %	0 %	0 %	384510044
2741	NC_017305	TCT	2	6	166017	166022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510044
2742	NC_017305	GT	3	6	166116	166121	0 %	50 %	50 %	0 %	384510044
2743	NC_017305	GTA	2	6	166540	166545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510044
2744	NC_017305	GTC	2	6	166605	166610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510045
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2847	NC_017305	CAA	2	6	173032	173037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510048
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2850	NC_017305	AAT	2	6	173283	173288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510048
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2855	NC_017305	CTG	2	6	173641	173646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510048
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2859	NC_017305	TGA	2	6	173972	173977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510049
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2861	NC_017305	GAA	2	6	174048	174053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510049
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2982	NC_017305	TGC	2	6	181370	181375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510053
2983	NC_017305	AAC	2	6	181497	181502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510053
2984	NC_017305	GGCAAG	2	12	181638	181649	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384510053
2985	NC_017305	GCT	2	6	181684	181689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510053
2986	NC_017305	GAA	2	6	181695	181700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510053
2987	NC_017305	GAA	2	6	181742	181747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510053
2988	NC_017305	AAG	2	6	181839	181844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510053
2989	NC_017305	ACCTTT	2	12	181881	181892	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384510053
2990	NC_017305	TGA	2	6	182054	182059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510053
2991	NC_017305	CAG	2	6	182235	182240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510053
2992	NC_017305	GAA	2	6	182279	182284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510053
2993	NC_017305	GCAC	2	8	182292	182299	25 %	0 %	25 %	50 %	384510053
2994	NC_017305	TGC	2	6	182330	182335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510053
2995	NC_017305	TCC	2	6	182359	182364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510053
2996	NC_017305	TGACTA	2	12	182637	182648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384510054
2997	NC_017305	CGT	2	6	182656	182661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510054
2998	NC_017305	GAG	2	6	182705	182710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510054
2999	NC_017305	T	6	6	182737	182742	0 %	100 %	0 %	0 %	384510054
3000	NC_017305	CTG	2	6	182757	182762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510054

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