MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 37477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_017305	CGTG	2	8	118002	118009	0 %	25 %	50 %	25 %	384510005
2003	NC_017305	CAT	2	6	118076	118081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510005
2004	NC_017305	GCC	2	6	118119	118124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510005
2005	NC_017305	CGA	2	6	118241	118246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510005
2006	NC_017305	TCG	2	6	118262	118267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510005
2007	NC_017305	GGT	2	6	118312	118317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510005
2008	NC_017305	GCC	2	6	118386	118391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510005
2009	NC_017305	GGATC	2	10	118406	118415	20 %	20 %	40 %	20 %	384510005
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2011	NC_017305	TGG	2	6	118486	118491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510005
2012	NC_017305	GCAA	2	8	118644	118651	50 %	0 %	25 %	25 %	384510006
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2015	NC_017305	CCAT	2	8	118923	118930	25 %	25 %	0 %	50 %	384510006
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2121	NC_017305	GAA	2	6	128281	128286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510011
2122	NC_017305	GCT	2	6	128322	128327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510011
2123	NC_017305	CTT	2	6	128370	128375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510011
2124	NC_017305	TCG	2	6	128378	128383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510011
2125	NC_017305	TGT	2	6	128387	128392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510011
2126	NC_017305	AGG	2	6	128442	128447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510011
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2128	NC_017305	AGG	2	6	128577	128582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510011
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2130	NC_017305	GGCG	2	8	128658	128665	0 %	0 %	75 %	25 %	384510011
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2132	NC_017305	CT	3	6	128789	128794	0 %	50 %	0 %	50 %	384510011
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2134	NC_017305	CTC	2	6	128879	128884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510011
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2142	NC_017305	TGG	2	6	129156	129161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510011
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2150	NC_017305	GAT	2	6	129547	129552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510011
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2154	NC_017305	CAT	2	6	129741	129746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510011
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2200	NC_017305	TGA	2	6	132758	132763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510014
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2202	NC_017305	GTTT	2	8	132827	132834	0 %	75 %	25 %	0 %	384510014
2203	NC_017305	GAT	2	6	132887	132892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510014
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2214	NC_017305	GGCA	2	8	133661	133668	25 %	0 %	50 %	25 %	384510015
2215	NC_017305	ATC	2	6	133745	133750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510015
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2220	NC_017305	GA	3	6	134022	134027	50 %	0 %	50 %	0 %	384510016
2221	NC_017305	CTC	2	6	134113	134118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510016
2222	NC_017305	GC	3	6	134145	134150	0 %	0 %	50 %	50 %	384510016
2223	NC_017305	CGT	2	6	134154	134159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510016
2224	NC_017305	CA	3	6	134214	134219	50 %	0 %	0 %	50 %	384510016
2225	NC_017305	AGCC	2	8	134244	134251	25 %	0 %	25 %	50 %	384510016
2226	NC_017305	CAA	2	6	134316	134321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510016
2227	NC_017305	GC	3	6	134362	134367	0 %	0 %	50 %	50 %	384510016
2228	NC_017305	GCT	2	6	134383	134388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510016
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2230	NC_017305	ACC	2	6	134575	134580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510016
2231	NC_017305	CG	4	8	134601	134608	0 %	0 %	50 %	50 %	384510016
2232	NC_017305	GCG	2	6	134813	134818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510016
2233	NC_017305	GC	3	6	135005	135010	0 %	0 %	50 %	50 %	384510017
2234	NC_017305	CGC	2	6	135016	135021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510017
2235	NC_017305	TCC	2	6	135053	135058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510017
2236	NC_017305	GAT	2	6	135131	135136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510017
2237	NC_017305	GCGT	2	8	135168	135175	0 %	25 %	50 %	25 %	384510017
2238	NC_017305	TTG	2	6	135176	135181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510017
2239	NC_017305	GCT	2	6	135197	135202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510017
2240	NC_017305	GAT	2	6	135209	135214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510017
2241	NC_017305	GAC	2	6	135263	135268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510017
2242	NC_017305	TGGGCG	2	12	135309	135320	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384510017
2243	NC_017305	AGACG	2	10	135343	135352	40 %	0 %	40 %	20 %	384510017
2244	NC_017305	TGG	2	6	135356	135361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510017
2245	NC_017305	CGA	2	6	135403	135408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510017
2246	NC_017305	CGA	2	6	135415	135420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510017
2247	NC_017305	CAT	2	6	135483	135488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510018
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2249	NC_017305	TCG	2	6	135576	135581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510018
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2252	NC_017305	GC	3	6	135730	135735	0 %	0 %	50 %	50 %	384510018
2253	NC_017305	GTG	2	6	135799	135804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510018
2254	NC_017305	CTG	2	6	135812	135817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510018
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2256	NC_017305	T	7	7	135882	135888	0 %	100 %	0 %	0 %	384510018
2257	NC_017305	TGGT	2	8	136423	136430	0 %	50 %	50 %	0 %	384510019
2258	NC_017305	TGCT	2	8	136451	136458	0 %	50 %	25 %	25 %	384510019
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2262	NC_017305	A	6	6	136572	136577	100 %	0 %	0 %	0 %	384510019
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2264	NC_017305	TGA	2	6	136662	136667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510019
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2266	NC_017305	TGC	2	6	136748	136753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510019
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2274	NC_017305	GCT	2	6	137077	137082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510019
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2282	NC_017305	TGG	2	6	137348	137353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510019
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2285	NC_017305	TGGTG	2	10	137574	137583	0 %	40 %	60 %	0 %	384510019
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2347	NC_017305	AT	3	6	140707	140712	50 %	50 %	0 %	0 %	384510021
2348	NC_017305	TGAC	2	8	140787	140794	25 %	25 %	25 %	25 %	384510021
2349	NC_017305	CG	3	6	140880	140885	0 %	0 %	50 %	50 %	384510021
2350	NC_017305	GCT	2	6	141172	141177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510022
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2352	NC_017305	GAC	2	6	141384	141389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510022
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2354	NC_017305	CGGG	2	8	141402	141409	0 %	0 %	75 %	25 %	384510022
2355	NC_017305	GCG	2	6	141451	141456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510022
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2359	NC_017305	CTGG	2	8	141794	141801	0 %	25 %	50 %	25 %	384510022
2360	NC_017305	GTG	2	6	141848	141853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510022
2361	NC_017305	TGC	2	6	141913	141918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510022
2362	NC_017305	TGC	2	6	141954	141959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510022
2363	NC_017305	ATTGC	2	10	141980	141989	20 %	40 %	20 %	20 %	384510022
2364	NC_017305	CTT	2	6	142015	142020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510022
2365	NC_017305	TGGT	2	8	142211	142218	0 %	50 %	50 %	0 %	384510022
2366	NC_017305	GGC	2	6	142297	142302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510022
2367	NC_017305	CGG	2	6	142303	142308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510022
2368	NC_017305	TACG	2	8	142437	142444	25 %	25 %	25 %	25 %	384510022
2369	NC_017305	TGG	2	6	142464	142469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510022
2370	NC_017305	AGC	2	6	142542	142547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510023
2371	NC_017305	TCG	2	6	142591	142596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510023
2372	NC_017305	GCAA	2	8	142678	142685	50 %	0 %	25 %	25 %	384510023
2373	NC_017305	CATGTA	2	12	142700	142711	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384510023
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2375	NC_017305	CGC	2	6	142784	142789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510023
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2377	NC_017305	CGT	2	6	142847	142852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510023
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2383	NC_017305	GTGA	2	8	143084	143091	25 %	25 %	50 %	0 %	384510024
2384	NC_017305	TCA	2	6	143142	143147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510024
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2391	NC_017305	GCT	2	6	143442	143447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510024
2392	NC_017305	AGCT	2	8	143453	143460	25 %	25 %	25 %	25 %	384510024
2393	NC_017305	TTCC	2	8	143497	143504	0 %	50 %	0 %	50 %	384510024
2394	NC_017305	GCGA	2	8	143553	143560	25 %	0 %	50 %	25 %	384510024
2395	NC_017305	CGCC	2	8	143561	143568	0 %	0 %	25 %	75 %	384510024
2396	NC_017305	TCT	2	6	143604	143609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510024
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2472	NC_017305	TGC	3	9	148452	148460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510029
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2480	NC_017305	CG	4	8	148865	148872	0 %	0 %	50 %	50 %	384510029
2481	NC_017305	AAG	2	6	148901	148906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510029
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