MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 37477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017305	GTG	2	6	30305	30310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509921
502	NC_017305	T	7	7	30311	30317	0 %	100 %	0 %	0 %	384509921
503	NC_017305	TGA	2	6	30348	30353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509921
504	NC_017305	GCT	2	6	30411	30416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509921
505	NC_017305	TGC	2	6	30486	30491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509921
506	NC_017305	GCC	2	6	30520	30525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509921
507	NC_017305	TTGCT	2	10	30570	30579	0 %	60 %	20 %	20 %	384509921
508	NC_017305	GATC	2	8	30587	30594	25 %	25 %	25 %	25 %	384509921
509	NC_017305	TTC	2	6	30595	30600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509921
510	NC_017305	GTG	2	6	30710	30715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509921
511	NC_017305	AGC	2	6	30763	30768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509921
512	NC_017305	GCA	2	6	30887	30892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509921
513	NC_017305	GGA	2	6	30986	30991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509921
514	NC_017305	GA	3	6	31079	31084	50 %	0 %	50 %	0 %	384509921
515	NC_017305	TGG	2	6	31128	31133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509921
516	NC_017305	CGT	2	6	31134	31139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509921
517	NC_017305	GC	3	6	31143	31148	0 %	0 %	50 %	50 %	384509921
518	NC_017305	ATC	2	6	31193	31198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509921
519	NC_017305	CGT	2	6	31236	31241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509921
520	NC_017305	TCT	2	6	31310	31315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509921
521	NC_017305	CAA	2	6	31413	31418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509921
522	NC_017305	GCA	2	6	31503	31508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509921
523	NC_017305	CCT	2	6	31630	31635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509922
524	NC_017305	TGA	2	6	31717	31722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509922
525	NC_017305	GGAA	2	8	31725	31732	50 %	0 %	50 %	0 %	384509922
526	NC_017305	GGC	2	6	31786	31791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509922
527	NC_017305	AAC	2	6	31797	31802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509922
528	NC_017305	TTC	2	6	31881	31886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509922
529	NC_017305	ACT	2	6	31941	31946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509922
530	NC_017305	TCC	2	6	31959	31964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509922
531	NC_017305	CAA	2	6	31965	31970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509922
532	NC_017305	TGGC	2	8	31987	31994	0 %	25 %	50 %	25 %	384509922
533	NC_017305	TGC	2	6	32019	32024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509922
534	NC_017305	GAG	2	6	32025	32030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509922
535	NC_017305	TCC	2	6	32080	32085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384509922
536	NC_017305	TTG	2	6	32093	32098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384509922
537	NC_017305	GTG	2	6	32185	32190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509922
538	NC_017305	GGTT	2	8	32232	32239	0 %	50 %	50 %	0 %	384509922
539	NC_017305	CTG	2	6	32250	32255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509922
540	NC_017305	CTGA	2	8	32264	32271	25 %	25 %	25 %	25 %	384509922
541	NC_017305	GTA	2	6	32299	32304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509922
542	NC_017305	GTG	2	6	32417	32422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509922
543	NC_017305	GCC	3	9	32620	32628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509922
544	NC_017305	AGG	2	6	32677	32682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384509922
545	NC_017305	AAT	2	6	32724	32729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384509922
546	NC_017305	GCC	2	6	32743	32748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509922
547	NC_017305	GA	3	6	32811	32816	50 %	0 %	50 %	0 %	384509922
548	NC_017305	CAC	2	6	32819	32824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509922
549	NC_017305	GAT	2	6	32913	32918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509922
550	NC_017305	GTC	2	6	33024	33029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509922
551	NC_017305	GCC	2	6	33051	33056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509922
552	NC_017305	GTC	2	6	33084	33089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509922
553	NC_017305	GC	3	6	33156	33161	0 %	0 %	50 %	50 %	384509923
554	NC_017305	GCT	2	6	33167	33172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509923
555	NC_017305	GCT	2	6	33176	33181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509923
556	NC_017305	GGC	2	6	33205	33210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384509923
557	NC_017305	ACC	2	6	33217	33222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509923
558	NC_017305	TGC	2	6	33226	33231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509923
559	NC_017305	ACC	2	6	33244	33249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509923
560	NC_017305	T	6	6	33251	33256	0 %	100 %	0 %	0 %	384509923
561	NC_017305	ACC	2	6	33257	33262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509923
562	NC_017305	CAG	2	6	33351	33356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509923
563	NC_017305	CAA	2	6	33510	33515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384509923
564	NC_017305	GCC	2	6	33547	33552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509923
565	NC_017305	GGAC	2	8	33588	33595	25 %	0 %	50 %	25 %	384509923
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567	NC_017305	GCT	2	6	33719	33724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509923
568	NC_017305	CTT	2	6	33810	33815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509923
569	NC_017305	TGG	2	6	33964	33969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509923
570	NC_017305	GCA	2	6	34064	34069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509923
571	NC_017305	CTA	2	6	34128	34133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509923
572	NC_017305	CTT	2	6	34176	34181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509923
573	NC_017305	CAC	2	6	34247	34252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509923
574	NC_017305	ATC	2	6	34270	34275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509923
575	NC_017305	GATA	2	8	34334	34341	50 %	25 %	25 %	0 %	384509923
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583	NC_017305	GA	3	6	34706	34711	50 %	0 %	50 %	0 %	384509924
584	NC_017305	AAG	2	6	34728	34733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509924
585	NC_017305	GCC	2	6	34758	34763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509924
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587	NC_017305	CAC	2	6	34824	34829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509924
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589	NC_017305	GA	3	6	35090	35095	50 %	0 %	50 %	0 %	384509924
590	NC_017305	GTA	2	6	35182	35187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509924
591	NC_017305	CCG	2	6	35188	35193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509924
592	NC_017305	ACC	2	6	35197	35202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509924
593	NC_017305	TGG	2	6	35237	35242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509924
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595	NC_017305	TAA	2	6	35427	35432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384509924
596	NC_017305	GAA	2	6	35439	35444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509924
597	NC_017305	CAG	2	6	35451	35456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509924
598	NC_017305	TGG	2	6	35531	35536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384509924
599	NC_017305	AAG	2	6	35556	35561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509924
600	NC_017305	AT	3	6	35584	35589	50 %	50 %	0 %	0 %	384509924
601	NC_017305	GA	3	6	35597	35602	50 %	0 %	50 %	0 %	384509924
602	NC_017305	TAC	2	6	35631	35636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384509924
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605	NC_017305	CAAG	2	8	35927	35934	50 %	0 %	25 %	25 %	384509924
606	NC_017305	CGT	2	6	35947	35952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509924
607	NC_017305	CT	3	6	35988	35993	0 %	50 %	0 %	50 %	384509925
608	NC_017305	GA	3	6	36013	36018	50 %	0 %	50 %	0 %	384509925
609	NC_017305	CCGGCT	2	12	36023	36034	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384509925
610	NC_017305	CTCCTG	2	12	36054	36065	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384509925
611	NC_017305	AGC	2	6	36069	36074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509925
612	NC_017305	CTT	2	6	36126	36131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509925
613	NC_017305	GCA	2	6	36173	36178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509925
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615	NC_017305	TGC	2	6	36202	36207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509925
616	NC_017305	CGT	2	6	36212	36217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384509925
617	NC_017305	GA	3	6	36322	36327	50 %	0 %	50 %	0 %	384509925
618	NC_017305	CAGG	2	8	36342	36349	25 %	0 %	50 %	25 %	384509925
619	NC_017305	CGC	2	6	36398	36403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384509925
620	NC_017305	CTT	2	6	36431	36436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509925
621	NC_017305	TAA	2	6	36454	36459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384509925
622	NC_017305	CCA	2	6	36483	36488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384509925
623	NC_017305	GCA	2	6	36505	36510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384509925
624	NC_017305	AAG	2	6	36516	36521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384509925
625	NC_017305	TGA	2	6	36524	36529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384509925
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627	NC_017305	TCT	2	6	36560	36565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384509925
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