MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 37477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017305	GAA	2	6	296520	296525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510161
5003	NC_017305	CTG	2	6	296539	296544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510161
5004	NC_017305	CCA	2	6	296545	296550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510161
5005	NC_017305	TGCTT	2	10	296558	296567	0 %	60 %	20 %	20 %	384510161
5006	NC_017305	GGT	2	6	296833	296838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510162
5007	NC_017305	GC	3	6	296853	296858	0 %	0 %	50 %	50 %	384510162
5008	NC_017305	GGA	2	6	297099	297104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510162
5009	NC_017305	GGCT	2	8	297152	297159	0 %	25 %	50 %	25 %	384510162
5010	NC_017305	GCC	2	6	297173	297178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510162
5011	NC_017305	ATT	2	6	297184	297189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510162
5012	NC_017305	GCT	2	6	297225	297230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510162
5013	NC_017305	CCG	2	6	297296	297301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510162
5014	NC_017305	GTG	2	6	297313	297318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510162
5015	NC_017305	ATG	2	6	297362	297367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510162
5016	NC_017305	CAT	2	6	297381	297386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510162
5017	NC_017305	TGA	2	6	297497	297502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510162
5018	NC_017305	CCT	2	6	297515	297520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510162
5019	NC_017305	GGTT	2	8	297526	297533	0 %	50 %	50 %	0 %	384510162
5020	NC_017305	ACC	2	6	297562	297567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510162
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5022	NC_017305	TGG	2	6	297609	297614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510162
5023	NC_017305	CT	3	6	297671	297676	0 %	50 %	0 %	50 %	384510162
5024	NC_017305	GCC	2	6	297697	297702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510162
5025	NC_017305	GTGC	2	8	297748	297755	0 %	25 %	50 %	25 %	384510162
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5027	NC_017305	GC	3	6	297788	297793	0 %	0 %	50 %	50 %	384510162
5028	NC_017305	ATCC	2	8	297843	297850	25 %	25 %	0 %	50 %	384510162
5029	NC_017305	TTC	2	6	297919	297924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510162
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5032	NC_017305	CGA	2	6	297999	298004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510162
5033	NC_017305	ACC	2	6	298089	298094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510163
5034	NC_017305	ACC	2	6	298165	298170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510163
5035	NC_017305	GCT	2	6	298194	298199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510163
5036	NC_017305	AGCT	2	8	298205	298212	25 %	25 %	25 %	25 %	384510163
5037	NC_017305	ACG	2	6	298225	298230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510163
5038	NC_017305	GC	4	8	298259	298266	0 %	0 %	50 %	50 %	384510163
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5040	NC_017305	CGA	2	6	298316	298321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510163
5041	NC_017305	TCT	2	6	298325	298330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510163
5042	NC_017305	GCT	2	6	298421	298426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510163
5043	NC_017305	G	6	6	298435	298440	0 %	0 %	100 %	0 %	384510163
5044	NC_017305	ATG	2	6	298467	298472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510163
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5053	NC_017305	TGA	2	6	298912	298917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510164
5054	NC_017305	GTT	3	9	298931	298939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510164
5055	NC_017305	GTG	2	6	298957	298962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510164
5056	NC_017305	AGC	2	6	299022	299027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510164
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5058	NC_017305	ATT	2	6	299058	299063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510164
5059	NC_017305	CCA	2	6	299126	299131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510164
5060	NC_017305	CTG	2	6	299139	299144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510164
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5062	NC_017305	AGC	2	6	299199	299204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510164
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5104	NC_017305	CA	3	6	300825	300830	50 %	0 %	0 %	50 %	384510166
5105	NC_017305	CTG	2	6	300837	300842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510166
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5121	NC_017305	TCC	2	6	301959	301964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510167
5122	NC_017305	AG	3	6	301980	301985	50 %	0 %	50 %	0 %	384510167
5123	NC_017305	TGG	2	6	302001	302006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510167
5124	NC_017305	CGT	2	6	302008	302013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510167
5125	NC_017305	ACC	2	6	302055	302060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510167
5126	NC_017305	GTT	2	6	302155	302160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510167
5127	NC_017305	GTTT	2	8	302219	302226	0 %	75 %	25 %	0 %	384510167
5128	NC_017305	CTG	2	6	302426	302431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510167
5129	NC_017305	GTG	2	6	302507	302512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510168
5130	NC_017305	A	6	6	302513	302518	100 %	0 %	0 %	0 %	384510168
5131	NC_017305	CCATG	2	10	302624	302633	20 %	20 %	20 %	40 %	384510168
5132	NC_017305	TGC	2	6	302664	302669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510168
5133	NC_017305	GTG	2	6	302713	302718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510168
5134	NC_017305	ATG	2	6	302728	302733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510168
5135	NC_017305	GAT	2	6	302756	302761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510168
5136	NC_017305	TGG	2	6	302762	302767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510168
5137	NC_017305	TCG	2	6	302770	302775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510168
5138	NC_017305	TTG	2	6	302793	302798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510168
5139	NC_017305	TC	3	6	302829	302834	0 %	50 %	0 %	50 %	384510168
5140	NC_017305	GCC	2	6	302835	302840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510168
5141	NC_017305	AG	3	6	302874	302879	50 %	0 %	50 %	0 %	384510168
5142	NC_017305	TG	3	6	302918	302923	0 %	50 %	50 %	0 %	384510168
5143	NC_017305	GAA	2	6	302998	303003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510168
5144	NC_017305	ACC	2	6	303019	303024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510168
5145	NC_017305	GTGA	2	8	303052	303059	25 %	25 %	50 %	0 %	384510168
5146	NC_017305	TCTATT	2	12	303076	303087	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384510168
5147	NC_017305	GC	3	6	303121	303126	0 %	0 %	50 %	50 %	384510168
5148	NC_017305	GGT	2	6	303132	303137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510168
5149	NC_017305	ACAG	2	8	303301	303308	50 %	0 %	25 %	25 %	384510169
5150	NC_017305	GTG	2	6	303310	303315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510169
5151	NC_017305	GGA	2	6	303316	303321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510169
5152	NC_017305	TG	3	6	303341	303346	0 %	50 %	50 %	0 %	384510169
5153	NC_017305	ATT	2	6	303354	303359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510169
5154	NC_017305	AG	3	6	303435	303440	50 %	0 %	50 %	0 %	384510169
5155	NC_017305	TGC	2	6	303638	303643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510169
5156	NC_017305	TGC	2	6	303646	303651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510169
5157	NC_017305	GGAC	2	8	303665	303672	25 %	0 %	50 %	25 %	384510169
5158	NC_017305	T	6	6	303756	303761	0 %	100 %	0 %	0 %	384510169
5159	NC_017305	GCC	2	6	303903	303908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510169
5160	NC_017305	GGA	2	6	304034	304039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510169
5161	NC_017305	TCA	2	6	304102	304107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510169
5162	NC_017305	CCG	2	6	304169	304174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510169
5163	NC_017305	CGC	2	6	304181	304186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510169
5164	NC_017305	AGTG	2	8	304191	304198	25 %	25 %	50 %	0 %	384510169
5165	NC_017305	TCT	2	6	304241	304246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510169
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5169	NC_017305	CGG	2	6	304556	304561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510170
5170	NC_017305	AAT	2	6	304698	304703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510170
5171	NC_017305	ACC	2	6	304711	304716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510170
5172	NC_017305	GC	3	6	304725	304730	0 %	0 %	50 %	50 %	384510170
5173	NC_017305	GAT	2	6	304797	304802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510170
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5178	NC_017305	CTGA	2	8	305337	305344	25 %	25 %	25 %	25 %	384510170
5179	NC_017305	GAT	2	6	305807	305812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510171
5180	NC_017305	GAT	2	6	305863	305868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510171
5181	NC_017305	GTT	3	9	305882	305890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510171
5182	NC_017305	CGC	2	6	305893	305898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510171
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5185	NC_017305	GCTCT	2	10	306059	306068	0 %	40 %	20 %	40 %	384510171
5186	NC_017305	T	6	6	306068	306073	0 %	100 %	0 %	0 %	384510171
5187	NC_017305	GTA	2	6	306107	306112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510171
5188	NC_017305	CTG	2	6	306209	306214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510171
5189	NC_017305	GCAAG	2	10	306229	306238	40 %	0 %	40 %	20 %	384510171
5190	NC_017305	ATT	2	6	306347	306352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510171
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5192	NC_017305	GCAC	2	8	306454	306461	25 %	0 %	25 %	50 %	384510171
5193	NC_017305	T	6	6	306539	306544	0 %	100 %	0 %	0 %	384510171
5194	NC_017305	TGG	2	6	306552	306557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510171
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5197	NC_017305	GCT	2	6	306807	306812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510172
5198	NC_017305	TCC	2	6	306825	306830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510172
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5200	NC_017305	TTC	2	6	306878	306883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510172
5201	NC_017305	GAG	2	6	306907	306912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510172
5202	NC_017305	TCT	2	6	306928	306933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510172
5203	NC_017305	GAA	3	9	306991	306999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510172
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5206	NC_017305	GCG	2	6	307642	307647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510173
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5208	NC_017305	AACC	2	8	307776	307783	50 %	0 %	0 %	50 %	384510173
5209	NC_017305	CAA	2	6	307827	307832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510173
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5211	NC_017305	CCA	2	6	307945	307950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510173
5212	NC_017305	GCT	2	6	307985	307990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510173
5213	NC_017305	AGC	2	6	308008	308013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510173
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5215	NC_017305	TCA	2	6	308075	308080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510173
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5218	NC_017305	TGGGCT	2	12	308186	308197	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384510173
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5220	NC_017305	GAT	2	6	308212	308217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510173
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5222	NC_017305	TGT	2	6	308310	308315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510174
5223	NC_017305	ATC	2	6	308417	308422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510174
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5225	NC_017305	GCC	2	6	308517	308522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510174
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5227	NC_017305	GCCT	2	8	308605	308612	0 %	25 %	25 %	50 %	384510174
5228	NC_017305	TAA	2	6	308656	308661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384510174
5229	NC_017305	GCC	2	6	308726	308731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510174
5230	NC_017305	TCG	2	6	308761	308766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510174
5231	NC_017305	GGC	2	6	308779	308784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510174
5232	NC_017305	TA	3	6	308788	308793	50 %	50 %	0 %	0 %	384510174
5233	NC_017305	CAC	2	6	308831	308836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510174
5234	NC_017305	CG	3	6	308858	308863	0 %	0 %	50 %	50 %	384510174
5235	NC_017305	GTC	2	6	308867	308872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510174
5236	NC_017305	GCC	2	6	308888	308893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510174
5237	NC_017305	CCA	2	6	308932	308937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510174
5238	NC_017305	ATG	2	6	308974	308979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510174
5239	NC_017305	TGC	2	6	309005	309010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510174
5240	NC_017305	AGC	2	6	309023	309028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510174
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5242	NC_017305	TGA	2	6	309114	309119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510174
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5364	NC_017305	GA	3	6	317744	317749	50 %	0 %	50 %	0 %	384510181
5365	NC_017305	CAT	2	6	317781	317786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510181
5366	NC_017305	T	6	6	317879	317884	0 %	100 %	0 %	0 %	384510181
5367	NC_017305	TGC	2	6	317973	317978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510181
5368	NC_017305	CGC	2	6	318008	318013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510181
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5370	NC_017305	GCG	2	6	318085	318090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510181
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5372	NC_017305	AC	3	6	318203	318208	50 %	0 %	0 %	50 %	384510181
5373	NC_017305	CAA	3	9	318296	318304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510181
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5375	NC_017305	GCA	2	6	318597	318602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510182
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5377	NC_017305	AG	3	6	318691	318696	50 %	0 %	50 %	0 %	384510182
5378	NC_017305	AATC	2	8	318750	318757	50 %	25 %	0 %	25 %	384510182
5379	NC_017305	GCT	2	6	318785	318790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510182
5380	NC_017305	CAA	2	6	318850	318855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510182
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5382	NC_017305	GAA	2	6	318921	318926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510182
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5384	NC_017305	CG	3	6	318953	318958	0 %	0 %	50 %	50 %	384510182
5385	NC_017305	TCG	2	6	319046	319051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510182
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5390	NC_017305	TGC	2	6	319346	319351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510182
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5393	NC_017305	T	6	6	319509	319514	0 %	100 %	0 %	0 %	384510182
5394	NC_017305	CGC	2	6	319548	319553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510182
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5402	NC_017305	GCT	2	6	320174	320179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510183
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5435	NC_017305	TTGAGG	2	12	322807	322818	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384510185
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5462	NC_017305	CCAGA	2	10	324485	324494	40 %	0 %	20 %	40 %	384510187
5463	NC_017305	GCT	2	6	324635	324640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510187
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5467	NC_017305	AACT	2	8	326333	326340	50 %	25 %	0 %	25 %	384510188
5468	NC_017305	CTA	2	6	326426	326431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510188
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5470	NC_017305	CCA	2	6	326480	326485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510188
5471	NC_017305	GCT	2	6	326528	326533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510188
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5473	NC_017305	AT	3	6	326613	326618	50 %	50 %	0 %	0 %	384510188
5474	NC_017305	ACT	2	6	326648	326653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510188
5475	NC_017305	GATG	2	8	326664	326671	25 %	25 %	50 %	0 %	384510188
5476	NC_017305	TGA	2	6	326730	326735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510188
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5478	NC_017305	TGTT	2	8	326753	326760	0 %	75 %	25 %	0 %	384510188
5479	NC_017305	CAG	2	6	326817	326822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510188
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5481	NC_017305	GAA	2	6	326908	326913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510188
5482	NC_017305	TAC	2	6	326940	326945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510188
5483	NC_017305	C	6	6	326958	326963	0 %	0 %	0 %	100 %	384510188
5484	NC_017305	GAT	2	6	326998	327003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510188
5485	NC_017305	TGA	2	6	327057	327062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510188
5486	NC_017305	TG	3	6	327079	327084	0 %	50 %	50 %	0 %	384510188
5487	NC_017305	TGT	2	6	327141	327146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510188
5488	NC_017305	ACGT	2	8	327163	327170	25 %	25 %	25 %	25 %	384510188
5489	NC_017305	TGA	2	6	327371	327376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510188
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5491	NC_017305	AAC	2	6	327627	327632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510188
5492	NC_017305	TTAT	2	8	327722	327729	25 %	75 %	0 %	0 %	384510189
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5496	NC_017305	GCA	2	6	327980	327985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510189
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5499	NC_017305	CTG	2	6	328144	328149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510189
5500	NC_017305	CGT	2	6	328230	328235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510189

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