MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis PAT10 chromosome

Total Repeats: 37477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017305	CGG	2	6	270705	270710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510136
4502	NC_017305	TGC	2	6	270728	270733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510136
4503	NC_017305	CCG	2	6	270753	270758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510136
4504	NC_017305	TCC	2	6	270772	270777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510136
4505	NC_017305	ATG	2	6	270782	270787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510136
4506	NC_017305	TCT	2	6	270824	270829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510136
4507	NC_017305	ATG	2	6	270833	270838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510136
4508	NC_017305	GTTG	2	8	270894	270901	0 %	50 %	50 %	0 %	384510136
4509	NC_017305	CTT	2	6	270945	270950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510136
4510	NC_017305	GAC	2	6	271035	271040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510136
4511	NC_017305	CGA	2	6	271062	271067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510136
4512	NC_017305	GAG	2	6	271105	271110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510136
4513	NC_017305	TGGATA	2	12	271188	271199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510136
4514	NC_017305	CGG	2	6	271212	271217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510136
4515	NC_017305	TTCT	2	8	271270	271277	0 %	75 %	0 %	25 %	384510136
4516	NC_017305	ATG	2	6	271289	271294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510136
4517	NC_017305	TC	3	6	271326	271331	0 %	50 %	0 %	50 %	384510136
4518	NC_017305	GAG	2	6	271399	271404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510136
4519	NC_017305	GCC	2	6	271468	271473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510136
4520	NC_017305	TCA	2	6	271659	271664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510136
4521	NC_017305	GCATC	2	10	271707	271716	20 %	20 %	20 %	40 %	384510136
4522	NC_017305	G	6	6	271746	271751	0 %	0 %	100 %	0 %	384510136
4523	NC_017305	GGC	2	6	271780	271785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510136
4524	NC_017305	AG	3	6	271854	271859	50 %	0 %	50 %	0 %	384510136
4525	NC_017305	ACG	2	6	271871	271876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510136
4526	NC_017305	GCG	2	6	271907	271912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510136
4527	NC_017305	CAGA	2	8	271933	271940	50 %	0 %	25 %	25 %	384510136
4528	NC_017305	TGGC	2	8	272049	272056	0 %	25 %	50 %	25 %	384510136
4529	NC_017305	GTG	2	6	272102	272107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510136
4530	NC_017305	GTA	2	6	272143	272148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510136
4531	NC_017305	GCG	2	6	272561	272566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510137
4532	NC_017305	CGT	2	6	272617	272622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510137
4533	NC_017305	AGG	2	6	272741	272746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510137
4534	NC_017305	CCCA	2	8	272752	272759	25 %	0 %	0 %	75 %	384510137
4535	NC_017305	GCA	2	6	272764	272769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510137
4536	NC_017305	CGGG	2	8	272774	272781	0 %	0 %	75 %	25 %	384510137
4537	NC_017305	ATT	2	6	272834	272839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510137
4538	NC_017305	GGTGG	2	10	272853	272862	0 %	20 %	80 %	0 %	384510137
4539	NC_017305	AGC	2	6	272981	272986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510137
4540	NC_017305	TGG	2	6	272990	272995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510137
4541	NC_017305	CAT	2	6	273049	273054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510137
4542	NC_017305	ACGCA	2	10	273124	273133	40 %	0 %	20 %	40 %	384510137
4543	NC_017305	TGC	2	6	273227	273232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510137
4544	NC_017305	GCT	2	6	273235	273240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510137
4545	NC_017305	CGC	2	6	273256	273261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510137
4546	NC_017305	GGC	2	6	273420	273425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510137
4547	NC_017305	TTG	2	6	273431	273436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510137
4548	NC_017305	TTG	2	6	273467	273472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510137
4549	NC_017305	G	6	6	273519	273524	0 %	0 %	100 %	0 %	384510137
4550	NC_017305	GCT	2	6	273609	273614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510137
4551	NC_017305	GGA	2	6	273645	273650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510137
4552	NC_017305	GCC	2	6	273682	273687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510137
4553	NC_017305	AGG	2	6	273704	273709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510137
4554	NC_017305	TTGATG	2	12	273731	273742	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384510137
4555	NC_017305	TTC	2	6	273914	273919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510138
4556	NC_017305	CGAGGC	2	12	273996	274007	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384510138
4557	NC_017305	GCG	3	9	274013	274021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510138
4558	NC_017305	CAA	2	6	274033	274038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384510138
4559	NC_017305	TGT	2	6	274053	274058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510138
4560	NC_017305	CTTCT	2	10	274064	274073	0 %	60 %	0 %	40 %	384510138
4561	NC_017305	TCG	2	6	274074	274079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510138
4562	NC_017305	CGG	2	6	274112	274117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510138
4563	NC_017305	CTC	2	6	274259	274264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384510138
4564	NC_017305	AGGA	2	8	274547	274554	50 %	0 %	50 %	0 %	384510138
4565	NC_017305	TACC	2	8	274575	274582	25 %	25 %	0 %	50 %	384510138
4566	NC_017305	GGCAGC	2	12	274593	274604	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384510138
4567	NC_017305	TGC	2	6	274620	274625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510138
4568	NC_017305	GGC	2	6	274630	274635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510138
4569	NC_017305	GGTC	2	8	274737	274744	0 %	25 %	50 %	25 %	384510139
4570	NC_017305	ACC	2	6	274791	274796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510139
4571	NC_017305	TGC	2	6	274807	274812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510139
4572	NC_017305	GTG	2	6	274848	274853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510139
4573	NC_017305	TGT	2	6	274873	274878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510139
4574	NC_017305	GA	3	6	274969	274974	50 %	0 %	50 %	0 %	384510139
4575	NC_017305	TGA	2	6	275087	275092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384510139
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4580	NC_017305	GAA	2	6	275426	275431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510139
4581	NC_017305	GCG	2	6	275434	275439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510139
4582	NC_017305	CGG	2	6	275473	275478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384510139
4583	NC_017305	TCA	2	6	275488	275493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384510139
4584	NC_017305	ATTA	2	8	275502	275509	50 %	50 %	0 %	0 %	384510139
4585	NC_017305	AATGC	2	10	275517	275526	40 %	20 %	20 %	20 %	384510139
4586	NC_017305	TTC	2	6	275634	275639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510139
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4588	NC_017305	TGC	2	6	275708	275713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510139
4589	NC_017305	TTG	2	6	275844	275849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510139
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4591	NC_017305	AAGG	2	8	275967	275974	50 %	0 %	50 %	0 %	384510140
4592	NC_017305	GTT	2	6	275985	275990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510140
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4594	NC_017305	TTA	2	6	276048	276053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384510140
4595	NC_017305	TG	3	6	276086	276091	0 %	50 %	50 %	0 %	384510140
4596	NC_017305	CCGC	2	8	276136	276143	0 %	0 %	25 %	75 %	384510140
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4600	NC_017305	CGA	2	6	276293	276298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510140
4601	NC_017305	TACCGT	2	12	276341	276352	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384510140
4602	NC_017305	GAA	2	6	276528	276533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384510140
4603	NC_017305	CTT	2	6	276538	276543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510140
4604	NC_017305	AAGACT	2	12	276589	276600	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384510140
4605	NC_017305	AGC	3	9	276614	276622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510141
4606	NC_017305	GAG	2	6	276717	276722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384510141
4607	NC_017305	GTG	2	6	276798	276803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510141
4608	NC_017305	CGC	2	6	276823	276828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510141
4609	NC_017305	TGG	2	6	276862	276867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510141
4610	NC_017305	TGG	2	6	276987	276992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384510141
4611	NC_017305	ACC	2	6	277053	277058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510141
4612	NC_017305	GTC	3	9	277091	277099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510141
4613	NC_017305	ACCA	2	8	277113	277120	50 %	0 %	0 %	50 %	384510141
4614	NC_017305	TCG	2	6	277140	277145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510141
4615	NC_017305	CGTC	2	8	277159	277166	0 %	25 %	25 %	50 %	384510141
4616	NC_017305	TCT	2	6	277167	277172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384510141
4617	NC_017305	AGC	2	6	277218	277223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510141
4618	NC_017305	TCG	3	9	277236	277244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510141
4619	NC_017305	GCA	2	6	277265	277270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510141
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4621	NC_017305	CGC	2	6	277435	277440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384510141
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4743	NC_017305	GTT	2	6	282927	282932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384510150
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4985	NC_017305	TGC	2	6	295783	295788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510160
4986	NC_017305	AGC	2	6	295792	295797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384510160
4987	NC_017305	CTG	2	6	295880	295885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510161
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4989	NC_017305	CTG	2	6	295978	295983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384510161
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4991	NC_017305	AGGCC	2	10	296047	296056	20 %	0 %	40 %	40 %	384510161
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4999	NC_017305	CAC	2	6	296327	296332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384510161
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