MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium thermocellum DSM 1313 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017304	TGA	2	6	230488	230493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777589
4002	NC_017304	TAT	2	6	230525	230530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777589
4003	NC_017304	GTC	2	6	230536	230541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777589
4004	NC_017304	TTG	2	6	230577	230582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777589
4005	NC_017304	TCAG	2	8	230617	230624	25 %	25 %	25 %	25 %	385777589
4006	NC_017304	AAT	2	6	230648	230653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777589
4007	NC_017304	AATA	2	8	230754	230761	75 %	25 %	0 %	0 %	385777590
4008	NC_017304	AGC	2	6	230781	230786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777590
4009	NC_017304	A	6	6	230817	230822	100 %	0 %	0 %	0 %	385777590
4010	NC_017304	ACAA	2	8	230908	230915	75 %	0 %	0 %	25 %	385777590
4011	NC_017304	CTG	2	6	230950	230955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777590
4012	NC_017304	AGG	2	6	231004	231009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777590
4013	NC_017304	AGC	2	6	231052	231057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777590
4014	NC_017304	TGA	2	6	231136	231141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777591
4015	NC_017304	TA	3	6	231167	231172	50 %	50 %	0 %	0 %	385777591
4016	NC_017304	TAA	2	6	231181	231186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777591
4017	NC_017304	ATTT	2	8	231200	231207	25 %	75 %	0 %	0 %	385777591
4018	NC_017304	T	6	6	231218	231223	0 %	100 %	0 %	0 %	385777591
4019	NC_017304	GATT	2	8	231374	231381	25 %	50 %	25 %	0 %	385777591
4020	NC_017304	AT	3	6	231429	231434	50 %	50 %	0 %	0 %	385777591
4021	NC_017304	AAC	2	6	231465	231470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385777591
4022	NC_017304	GCC	2	6	231480	231485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385777591
4023	NC_017304	T	6	6	231497	231502	0 %	100 %	0 %	0 %	385777591
4024	NC_017304	TGG	2	6	231529	231534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385777591
4025	NC_017304	TGT	2	6	231584	231589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777591
4026	NC_017304	AT	3	6	231628	231633	50 %	50 %	0 %	0 %	385777591
4027	NC_017304	GCG	2	6	231660	231665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777591
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4031	NC_017304	CAT	2	6	231754	231759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777591
4032	NC_017304	AT	3	6	231758	231763	50 %	50 %	0 %	0 %	385777591
4033	NC_017304	CGGA	2	8	231823	231830	25 %	0 %	50 %	25 %	385777591
4034	NC_017304	GAA	2	6	231864	231869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777591
4035	NC_017304	GGT	2	6	231971	231976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385777591
4036	NC_017304	GAC	2	6	231990	231995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777591
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4038	NC_017304	TCG	2	6	232110	232115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777591
4039	NC_017304	CGG	2	6	232172	232177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777591
4040	NC_017304	GAT	2	6	232190	232195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777591
4041	NC_017304	GGA	2	6	232248	232253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777591
4042	NC_017304	GTT	2	6	232260	232265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777591
4043	NC_017304	TGGCAA	2	12	232393	232404	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385777592
4044	NC_017304	CTC	2	6	232417	232422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385777592
4045	NC_017304	CCTG	2	8	232458	232465	0 %	25 %	25 %	50 %	385777592
4046	NC_017304	GTTT	2	8	232491	232498	0 %	75 %	25 %	0 %	385777592
4047	NC_017304	CTTT	2	8	232524	232531	0 %	75 %	0 %	25 %	385777592
4048	NC_017304	GAA	2	6	232537	232542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777592
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4050	NC_017304	AGT	2	6	232591	232596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777592
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4052	NC_017304	CCTG	2	8	232638	232645	0 %	25 %	25 %	50 %	385777592
4053	NC_017304	T	6	6	232710	232715	0 %	100 %	0 %	0 %	385777592
4054	NC_017304	TTGA	2	8	233684	233691	25 %	50 %	25 %	0 %	385777593
4055	NC_017304	A	6	6	233734	233739	100 %	0 %	0 %	0 %	385777593
4056	NC_017304	CTTT	2	8	233757	233764	0 %	75 %	0 %	25 %	385777593
4057	NC_017304	GGT	2	6	233917	233922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385777593
4058	NC_017304	TGAT	2	8	234045	234052	25 %	50 %	25 %	0 %	385777593
4059	NC_017304	AAG	2	6	234059	234064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777593
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4063	NC_017304	TAA	3	9	234409	234417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777594
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4065	NC_017304	TGC	2	6	234527	234532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777594
4066	NC_017304	GAT	2	6	234559	234564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777594
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4070	NC_017304	GCG	2	6	234690	234695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777594
4071	NC_017304	GAAA	2	8	234806	234813	75 %	0 %	25 %	0 %	385777594
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4081	NC_017304	TA	3	6	235399	235404	50 %	50 %	0 %	0 %	385777594
4082	NC_017304	CTTT	2	8	235414	235421	0 %	75 %	0 %	25 %	385777594
4083	NC_017304	ATTT	2	8	235549	235556	25 %	75 %	0 %	0 %	385777594
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4097	NC_017304	TGA	2	6	236711	236716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777595
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4103	NC_017304	GCAG	2	8	237248	237255	25 %	0 %	50 %	25 %	385777596
4104	NC_017304	GGAA	2	8	237265	237272	50 %	0 %	50 %	0 %	385777596
4105	NC_017304	GCC	2	6	237787	237792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385777597
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4107	NC_017304	TTG	2	6	237911	237916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777597
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4109	NC_017304	A	6	6	237944	237949	100 %	0 %	0 %	0 %	385777597
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4112	NC_017304	ATT	2	6	238141	238146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777597
4113	NC_017304	CGGA	2	8	238166	238173	25 %	0 %	50 %	25 %	385777597
4114	NC_017304	AAG	2	6	238188	238193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777597
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4119	NC_017304	A	7	7	238389	238395	100 %	0 %	0 %	0 %	385777597
4120	NC_017304	CAG	2	6	238419	238424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777597
4121	NC_017304	AGGC	2	8	238463	238470	25 %	0 %	50 %	25 %	385777597
4122	NC_017304	TGA	2	6	238548	238553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777597
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4499	NC_017304	AAT	2	6	256388	256393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777613
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