MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium thermocellum DSM 1313 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017304	TCT	2	6	87905	87910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777465
1502	NC_017304	TCA	2	6	87933	87938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777465
1503	NC_017304	T	7	7	87950	87956	0 %	100 %	0 %	0 %	385777465
1504	NC_017304	CCA	2	6	88006	88011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385777465
1505	NC_017304	TCC	2	6	88060	88065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385777465
1506	NC_017304	T	6	6	88176	88181	0 %	100 %	0 %	0 %	385777465
1507	NC_017304	ATT	2	6	88268	88273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777465
1508	NC_017304	CGC	2	6	88302	88307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385777465
1509	NC_017304	GATG	2	8	88328	88335	25 %	25 %	50 %	0 %	385777465
1510	NC_017304	GCA	2	6	88336	88341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777465
1511	NC_017304	T	6	6	88386	88391	0 %	100 %	0 %	0 %	385777465
1512	NC_017304	GTTT	2	8	88399	88406	0 %	75 %	25 %	0 %	385777465
1513	NC_017304	CTT	2	6	88435	88440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777465
1514	NC_017304	CAGG	2	8	88509	88516	25 %	0 %	50 %	25 %	385777465
1515	NC_017304	GAA	2	6	88545	88550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777465
1516	NC_017304	TGCC	2	8	88565	88572	0 %	25 %	25 %	50 %	385777465
1517	NC_017304	T	6	6	88625	88630	0 %	100 %	0 %	0 %	385777465
1518	NC_017304	AATT	2	8	88743	88750	50 %	50 %	0 %	0 %	385777465
1519	NC_017304	TCA	2	6	88802	88807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777465
1520	NC_017304	T	6	6	88899	88904	0 %	100 %	0 %	0 %	385777465
1521	NC_017304	CTT	2	6	88977	88982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777465
1522	NC_017304	GA	3	6	89020	89025	50 %	0 %	50 %	0 %	385777465
1523	NC_017304	AGC	2	6	89029	89034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777465
1524	NC_017304	T	6	6	89180	89185	0 %	100 %	0 %	0 %	385777465
1525	NC_017304	CTT	2	6	89258	89263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777465
1526	NC_017304	CTTTA	2	10	89353	89362	20 %	60 %	0 %	20 %	385777465
1527	NC_017304	T	7	7	89453	89459	0 %	100 %	0 %	0 %	385777465
1528	NC_017304	GAA	2	6	89468	89473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777465
1529	NC_017304	A	6	6	89472	89477	100 %	0 %	0 %	0 %	385777465
1530	NC_017304	CCG	2	6	89558	89563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385777465
1531	NC_017304	AAT	2	6	89610	89615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777465
1532	NC_017304	GTTT	2	8	89670	89677	0 %	75 %	25 %	0 %	385777465
1533	NC_017304	CTG	2	6	89718	89723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777465
1534	NC_017304	TC	3	6	89746	89751	0 %	50 %	0 %	50 %	385777465
1535	NC_017304	CGG	2	6	89850	89855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777465
1536	NC_017304	CTT	2	6	89862	89867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777465
1537	NC_017304	AT	3	6	89881	89886	50 %	50 %	0 %	0 %	385777465
1538	NC_017304	CAA	2	6	89892	89897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385777465
1539	NC_017304	TCT	2	6	89918	89923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777465
1540	NC_017304	AGT	2	6	90035	90040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777465
1541	NC_017304	TGT	2	6	90068	90073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777465
1542	NC_017304	TAA	2	6	90104	90109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777465
1543	NC_017304	GCA	2	6	90162	90167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777465
1544	NC_017304	ATT	2	6	90175	90180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777465
1545	NC_017304	T	6	6	90275	90280	0 %	100 %	0 %	0 %	385777465
1546	NC_017304	AT	3	6	90400	90405	50 %	50 %	0 %	0 %	385777465
1547	NC_017304	T	6	6	90426	90431	0 %	100 %	0 %	0 %	385777465
1548	NC_017304	GT	3	6	90495	90500	0 %	50 %	50 %	0 %	385777465
1549	NC_017304	GCT	2	6	90589	90594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777465
1550	NC_017304	AAT	2	6	90597	90602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777465
1551	NC_017304	TG	3	6	90646	90651	0 %	50 %	50 %	0 %	385777465
1552	NC_017304	A	7	7	90670	90676	100 %	0 %	0 %	0 %	385777465
1553	NC_017304	T	6	6	90709	90714	0 %	100 %	0 %	0 %	385777465
1554	NC_017304	GTA	2	6	90739	90744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777465
1555	NC_017304	TGCA	2	8	90798	90805	25 %	25 %	25 %	25 %	385777465
1556	NC_017304	GTA	2	6	90817	90822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777465
1557	NC_017304	CGC	2	6	90855	90860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385777465
1558	NC_017304	AT	3	6	90871	90876	50 %	50 %	0 %	0 %	385777465
1559	NC_017304	TTGTCA	2	12	90926	90937	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385777465
1560	NC_017304	ACA	2	6	90972	90977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385777465
1561	NC_017304	GAT	2	6	91018	91023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777465
1562	NC_017304	T	6	6	91023	91028	0 %	100 %	0 %	0 %	385777465
1563	NC_017304	AT	3	6	91041	91046	50 %	50 %	0 %	0 %	385777465
1564	NC_017304	TA	3	6	91266	91271	50 %	50 %	0 %	0 %	385777466
1565	NC_017304	T	6	6	91294	91299	0 %	100 %	0 %	0 %	385777466
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1568	NC_017304	T	6	6	91577	91582	0 %	100 %	0 %	0 %	385777466
1569	NC_017304	T	6	6	91657	91662	0 %	100 %	0 %	0 %	385777466
1570	NC_017304	CCTG	2	8	91681	91688	0 %	25 %	25 %	50 %	385777466
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1572	NC_017304	AAG	2	6	91763	91768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777466
1573	NC_017304	CAA	2	6	91813	91818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385777466
1574	NC_017304	GGGTT	2	10	91844	91853	0 %	40 %	60 %	0 %	385777466
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1580	NC_017304	CATA	2	8	92152	92159	50 %	25 %	0 %	25 %	385777466
1581	NC_017304	TTTA	2	8	92225	92232	25 %	75 %	0 %	0 %	385777466
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1592	NC_017304	AT	4	8	92993	93000	50 %	50 %	0 %	0 %	385777466
1593	NC_017304	T	6	6	93190	93195	0 %	100 %	0 %	0 %	385777467
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1598	NC_017304	GCC	2	6	93727	93732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385777468
1599	NC_017304	GCT	2	6	93771	93776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777468
1600	NC_017304	AT	3	6	93828	93833	50 %	50 %	0 %	0 %	385777468
1601	NC_017304	ATC	2	6	93954	93959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777468
1602	NC_017304	AGT	2	6	93968	93973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777468
1603	NC_017304	GCC	2	6	94186	94191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385777468
1604	NC_017304	CTT	2	6	94205	94210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777468
1605	NC_017304	TAA	2	6	94303	94308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777468
1606	NC_017304	TTTC	2	8	94417	94424	0 %	75 %	0 %	25 %	385777468
1607	NC_017304	CTT	2	6	94436	94441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777468
1608	NC_017304	CAT	2	6	94442	94447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777468
1609	NC_017304	TTCCA	2	10	94459	94468	20 %	40 %	0 %	40 %	385777468
1610	NC_017304	ATTTG	2	10	94474	94483	20 %	60 %	20 %	0 %	385777468
1611	NC_017304	TGG	2	6	94640	94645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385777468
1612	NC_017304	GAC	2	6	94662	94667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777468
1613	NC_017304	CTT	2	6	94691	94696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777468
1614	NC_017304	AG	3	6	94779	94784	50 %	0 %	50 %	0 %	385777468
1615	NC_017304	CGG	2	6	94791	94796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777468
1616	NC_017304	CGA	2	6	94839	94844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777468
1617	NC_017304	CATAC	2	10	94907	94916	40 %	20 %	0 %	40 %	385777468
1618	NC_017304	TAT	2	6	94977	94982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777468
1619	NC_017304	TCA	2	6	94990	94995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777468
1620	NC_017304	TA	3	6	95081	95086	50 %	50 %	0 %	0 %	385777468
1621	NC_017304	GTC	2	6	95094	95099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777468
1622	NC_017304	CTG	2	6	95131	95136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777468
1623	NC_017304	GAA	2	6	95177	95182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777468
1624	NC_017304	AAT	2	6	95265	95270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777468
1625	NC_017304	CGA	2	6	95346	95351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777468
1626	NC_017304	AGG	2	6	95352	95357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777468
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1998	NC_017304	ATG	2	6	117611	117616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777485
1999	NC_017304	ATGC	2	8	117664	117671	25 %	25 %	25 %	25 %	385777485
2000	NC_017304	GAA	2	6	117764	117769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777485

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