MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium thermocellum DSM 1313 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_017304	GCG	2	6	320543	320548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777671
5503	NC_017304	ATT	2	6	320593	320598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777671
5504	NC_017304	ATA	2	6	320615	320620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777671
5505	NC_017304	TGAT	2	8	320697	320704	25 %	50 %	25 %	0 %	385777671
5506	NC_017304	GGAG	2	8	320713	320720	25 %	0 %	75 %	0 %	385777671
5507	NC_017304	GGA	2	6	320761	320766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777671
5508	NC_017304	G	6	6	320799	320804	0 %	0 %	100 %	0 %	385777671
5509	NC_017304	AAAGG	2	10	320816	320825	60 %	0 %	40 %	0 %	385777671
5510	NC_017304	TG	3	6	320861	320866	0 %	50 %	50 %	0 %	385777671
5511	NC_017304	AGA	2	6	320873	320878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777671
5512	NC_017304	A	8	8	320893	320900	100 %	0 %	0 %	0 %	385777671
5513	NC_017304	A	6	6	320918	320923	100 %	0 %	0 %	0 %	385777671
5514	NC_017304	AGA	2	6	321150	321155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777672
5515	NC_017304	ATT	2	6	321159	321164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777672
5516	NC_017304	GGA	2	6	321198	321203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777672
5517	NC_017304	ATA	2	6	321222	321227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777672
5518	NC_017304	GACAGG	2	12	321282	321293	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385777672
5519	NC_017304	TTTGT	2	10	321294	321303	0 %	80 %	20 %	0 %	385777672
5520	NC_017304	GA	3	6	321345	321350	50 %	0 %	50 %	0 %	385777672
5521	NC_017304	A	6	6	321513	321518	100 %	0 %	0 %	0 %	385777672
5522	NC_017304	ATT	2	6	321520	321525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777672
5523	NC_017304	AGGA	2	8	321559	321566	50 %	0 %	50 %	0 %	385777672
5524	NC_017304	TGGA	2	8	321710	321717	25 %	25 %	50 %	0 %	385777672
5525	NC_017304	TTA	2	6	321721	321726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777672
5526	NC_017304	GT	3	6	321832	321837	0 %	50 %	50 %	0 %	385777672
5527	NC_017304	AAAT	2	8	322071	322078	75 %	25 %	0 %	0 %	385777673
5528	NC_017304	ATG	2	6	322120	322125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777673
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5530	NC_017304	AGT	2	6	322158	322163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777673
5531	NC_017304	CCA	2	6	322299	322304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385777673
5532	NC_017304	TGT	2	6	322350	322355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777673
5533	NC_017304	CGA	2	6	322461	322466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777673
5534	NC_017304	AAT	2	6	322524	322529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777673
5535	NC_017304	GCG	2	6	322564	322569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777673
5536	NC_017304	GAA	2	6	322687	322692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777673
5537	NC_017304	GGA	2	6	322705	322710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777673
5538	NC_017304	CCTGT	2	10	322745	322754	0 %	40 %	20 %	40 %	385777673
5539	NC_017304	CTG	2	6	322835	322840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777673
5540	NC_017304	AAG	2	6	322862	322867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777673
5541	NC_017304	GAT	2	6	323254	323259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777674
5542	NC_017304	TAG	2	6	323295	323300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777674
5543	NC_017304	ACC	2	6	323378	323383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385777674
5544	NC_017304	ATA	2	6	323390	323395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777674
5545	NC_017304	AGC	2	6	323454	323459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777674
5546	NC_017304	CCG	2	6	323501	323506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385777674
5547	NC_017304	A	6	6	323558	323563	100 %	0 %	0 %	0 %	385777674
5548	NC_017304	A	6	6	323568	323573	100 %	0 %	0 %	0 %	385777674
5549	NC_017304	AGC	2	6	323583	323588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777674
5550	NC_017304	CGGT	2	8	323733	323740	0 %	25 %	50 %	25 %	385777674
5551	NC_017304	CA	3	6	323798	323803	50 %	0 %	0 %	50 %	385777674
5552	NC_017304	ATT	2	6	323804	323809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777674
5553	NC_017304	ATA	2	6	323861	323866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777674
5554	NC_017304	AC	3	6	323892	323897	50 %	0 %	0 %	50 %	385777674
5555	NC_017304	TCT	2	6	323963	323968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777674
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5557	NC_017304	GAT	2	6	324032	324037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777674
5558	NC_017304	GTATAT	2	12	324038	324049	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385777674
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5560	NC_017304	GGA	2	6	324220	324225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777674
5561	NC_017304	AGGA	2	8	324243	324250	50 %	0 %	50 %	0 %	385777674
5562	NC_017304	GAA	2	6	324257	324262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777674
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5569	NC_017304	ACGGA	2	10	324599	324608	40 %	0 %	40 %	20 %	385777675
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5573	NC_017304	TTG	2	6	324784	324789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777675
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5579	NC_017304	TGA	2	6	325091	325096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777676
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5582	NC_017304	TTG	2	6	325403	325408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777676
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5587	NC_017304	AT	3	6	325519	325524	50 %	50 %	0 %	0 %	385777676
5588	NC_017304	CAG	2	6	325534	325539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385777676
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5591	NC_017304	AAC	2	6	325696	325701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385777676
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5593	NC_017304	CCCA	2	8	325780	325787	25 %	0 %	0 %	75 %	385777676
5594	NC_017304	GGC	2	6	325834	325839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777676
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5599	NC_017304	ACC	2	6	326125	326130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385777676
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5601	NC_017304	GA	3	6	326165	326170	50 %	0 %	50 %	0 %	385777676
5602	NC_017304	GAA	2	6	326173	326178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777676
5603	NC_017304	TTG	2	6	326240	326245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385777676
5604	NC_017304	GACG	2	8	326268	326275	25 %	0 %	50 %	25 %	385777676
5605	NC_017304	ATG	2	6	326360	326365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385777676
5606	NC_017304	ATA	2	6	326431	326436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385777676
5607	NC_017304	TAT	3	9	326481	326489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777676
5608	NC_017304	GAG	3	9	326496	326504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385777676
5609	NC_017304	GAA	2	6	326610	326615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777677
5610	NC_017304	GAA	2	6	326834	326839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777677
5611	NC_017304	GTAACG	2	12	326868	326879	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385777677
5612	NC_017304	ACGGT	2	10	326893	326902	20 %	20 %	40 %	20 %	385777677
5613	NC_017304	TA	3	6	326949	326954	50 %	50 %	0 %	0 %	385777677
5614	NC_017304	TA	3	6	326977	326982	50 %	50 %	0 %	0 %	385777677
5615	NC_017304	TCACA	2	10	327055	327064	40 %	20 %	0 %	40 %	385777677
5616	NC_017304	GCTG	2	8	327077	327084	0 %	25 %	50 %	25 %	385777677
5617	NC_017304	AAG	2	6	327090	327095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385777677
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5621	NC_017304	AT	3	6	327467	327472	50 %	50 %	0 %	0 %	385777677
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