MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium thermocellum DSM 1313 chromosome

Total Repeats: 60963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5003	NC_017304	CAT	2	6	290561	290566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777646
5004	NC_017304	GTC	2	6	290616	290621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777646
5005	NC_017304	TCT	3	9	290722	290730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777646
5006	NC_017304	TAGAAT	2	12	290822	290833	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385777646
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5010	NC_017304	CTG	2	6	290905	290910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777646
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5013	NC_017304	AG	3	6	290950	290955	50 %	0 %	50 %	0 %	385777646
5014	NC_017304	A	6	6	290984	290989	100 %	0 %	0 %	0 %	385777646
5015	NC_017304	TTA	2	6	290990	290995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385777646
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5017	NC_017304	CTT	2	6	291062	291067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777646
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5019	NC_017304	GCG	2	6	291381	291386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777647
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5034	NC_017304	AT	3	6	292559	292564	50 %	50 %	0 %	0 %	385777647
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5043	NC_017304	CAT	2	6	293182	293187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385777647
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5047	NC_017304	GTG	2	6	293274	293279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385777647
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5050	NC_017304	GCT	2	6	293484	293489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777647
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5234	NC_017304	TA	3	6	305090	305095	50 %	50 %	0 %	0 %	385777657
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5241	NC_017304	T	6	6	305447	305452	0 %	100 %	0 %	0 %	385777657
5242	NC_017304	CTC	2	6	305518	305523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385777657
5243	NC_017304	CTG	2	6	305621	305626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385777657
5244	NC_017304	T	6	6	305674	305679	0 %	100 %	0 %	0 %	385777657
5245	NC_017304	CGGTCA	2	12	305751	305762	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385777657
5246	NC_017304	GACTT	2	10	305806	305815	20 %	40 %	20 %	20 %	385777657
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5498	NC_017304	CTT	2	6	320354	320359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385777671
5499	NC_017304	CGG	2	6	320470	320475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385777671
5500	NC_017304	ATGGGA	2	12	320483	320494	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385777671

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