MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis C231 chromosome

Total Repeats: 37654

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017301	CGA	2	6	180142	180147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505867
3002	NC_017301	AGT	2	6	180208	180213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505867
3003	NC_017301	GGC	2	6	180239	180244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505867
3004	NC_017301	AGC	2	6	180354	180359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505867
3005	NC_017301	CAA	2	6	180514	180519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505867
3006	NC_017301	CCA	2	6	180552	180557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505867
3007	NC_017301	AAG	2	6	180626	180631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505867
3008	NC_017301	A	7	7	180722	180728	100 %	0 %	0 %	0 %	384505867
3009	NC_017301	TGG	2	6	180880	180885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505867
3010	NC_017301	CAAC	2	8	180912	180919	50 %	0 %	0 %	50 %	384505867
3011	NC_017301	ACT	2	6	180988	180993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505867
3012	NC_017301	GCG	2	6	181038	181043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505867
3013	NC_017301	GAA	2	6	181069	181074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505867
3014	NC_017301	GTGGA	2	10	181147	181156	20 %	20 %	60 %	0 %	384505867
3015	NC_017301	CAG	2	6	181241	181246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505867
3016	NC_017301	CCA	2	6	181290	181295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505867
3017	NC_017301	GTC	2	6	181358	181363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505867
3018	NC_017301	CAA	2	6	181408	181413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505867
3019	NC_017301	CGG	2	6	181419	181424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505867
3020	NC_017301	TGC	2	6	181450	181455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505867
3021	NC_017301	AAC	2	6	181577	181582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505867
3022	NC_017301	GGCAAG	2	12	181718	181729	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384505867
3023	NC_017301	GCT	2	6	181764	181769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505867
3024	NC_017301	GAA	2	6	181775	181780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505867
3025	NC_017301	GAA	2	6	181822	181827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505867
3026	NC_017301	AAG	2	6	181919	181924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505867
3027	NC_017301	ACCTTT	2	12	181961	181972	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384505867
3028	NC_017301	TGA	2	6	182134	182139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505867
3029	NC_017301	CAG	2	6	182315	182320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505867
3030	NC_017301	GAA	2	6	182359	182364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505867
3031	NC_017301	GCAC	2	8	182372	182379	25 %	0 %	25 %	50 %	384505867
3032	NC_017301	TGC	2	6	182410	182415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505867
3033	NC_017301	TCC	2	6	182439	182444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384505867
3034	NC_017301	TGACTA	2	12	182717	182728	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384505868
3035	NC_017301	CGT	2	6	182736	182741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505868
3036	NC_017301	GAG	2	6	182785	182790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505868
3037	NC_017301	T	6	6	182817	182822	0 %	100 %	0 %	0 %	384505868
3038	NC_017301	CTG	2	6	182837	182842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505868
3039	NC_017301	TC	3	6	182908	182913	0 %	50 %	0 %	50 %	384505868
3040	NC_017301	GCA	2	6	182948	182953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505868
3041	NC_017301	GCC	2	6	182983	182988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505868
3042	NC_017301	TGG	2	6	182999	183004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505868
3043	NC_017301	AAC	2	6	183076	183081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505868
3044	NC_017301	ATT	2	6	183094	183099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505868
3045	NC_017301	CAC	2	6	183114	183119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505868
3046	NC_017301	AGA	2	6	183303	183308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384505868
3047	NC_017301	CGTG	2	8	183461	183468	0 %	25 %	50 %	25 %	384505868
3048	NC_017301	AC	3	6	183489	183494	50 %	0 %	0 %	50 %	384505868
3049	NC_017301	TGG	2	6	183497	183502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505868
3050	NC_017301	AGT	2	6	183576	183581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505868
3051	NC_017301	GCT	2	6	183604	183609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505868
3052	NC_017301	TGA	2	6	183615	183620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505868
3053	NC_017301	TTGG	2	8	183625	183632	0 %	50 %	50 %	0 %	384505868
3054	NC_017301	GCT	2	6	183741	183746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505868
3055	NC_017301	TATT	2	8	183815	183822	25 %	75 %	0 %	0 %	384505869
3056	NC_017301	GCT	2	6	183850	183855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505869
3057	NC_017301	CG	4	8	183871	183878	0 %	0 %	50 %	50 %	384505869
3058	NC_017301	TGC	2	6	183924	183929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505869
3059	NC_017301	ACG	2	6	183975	183980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505869
3060	NC_017301	AGGG	2	8	183987	183994	25 %	0 %	75 %	0 %	384505869
3061	NC_017301	GGT	2	6	184032	184037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505869
3062	NC_017301	TGG	2	6	184046	184051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505869
3063	NC_017301	CGG	2	6	184058	184063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505869
3064	NC_017301	GGA	2	6	184086	184091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505869
3065	NC_017301	GGGC	2	8	184099	184106	0 %	0 %	75 %	25 %	384505869
3066	NC_017301	AGGT	2	8	184213	184220	25 %	25 %	50 %	0 %	384505869
3067	NC_017301	TCG	2	6	184234	184239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505869
3068	NC_017301	TC	3	6	184292	184297	0 %	50 %	0 %	50 %	384505869
3069	NC_017301	CGC	2	6	184325	184330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505869
3070	NC_017301	ATC	2	6	184362	184367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505869
3071	NC_017301	TTC	2	6	184378	184383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505869
3072	NC_017301	ACA	2	6	184588	184593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505870
3073	NC_017301	GCTC	2	8	184689	184696	0 %	25 %	25 %	50 %	384505870
3074	NC_017301	TGGC	2	8	184853	184860	0 %	25 %	50 %	25 %	384505870
3075	NC_017301	CAA	2	6	184947	184952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505870
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3077	NC_017301	ACCT	2	8	185095	185102	25 %	25 %	0 %	50 %	384505870
3078	NC_017301	CCA	2	6	185136	185141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505870
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3080	NC_017301	CAT	2	6	185284	185289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505870
3081	NC_017301	TGACC	2	10	185397	185406	20 %	20 %	20 %	40 %	384505870
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3084	NC_017301	GGT	2	6	185640	185645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505870
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3086	NC_017301	TGA	2	6	185751	185756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505870
3087	NC_017301	GAT	2	6	185869	185874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505870
3088	NC_017301	TGA	2	6	185913	185918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505870
3089	NC_017301	GA	3	6	185921	185926	50 %	0 %	50 %	0 %	384505870
3090	NC_017301	GAG	2	6	185983	185988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505870
3091	NC_017301	GTACTG	2	12	185994	186005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384505870
3092	NC_017301	CCA	2	6	186053	186058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505870
3093	NC_017301	AAC	2	6	186065	186070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505870
3094	NC_017301	ACG	2	6	186087	186092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505871
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3101	NC_017301	ATT	2	6	187128	187133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505872
3102	NC_017301	GGC	2	6	187154	187159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384505872
3103	NC_017301	CCAG	2	8	187190	187197	25 %	0 %	25 %	50 %	384505872
3104	NC_017301	T	6	6	187206	187211	0 %	100 %	0 %	0 %	384505872
3105	NC_017301	ATG	2	6	187251	187256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505872
3106	NC_017301	ACG	2	6	187269	187274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505872
3107	NC_017301	A	6	6	187319	187324	100 %	0 %	0 %	0 %	384505872
3108	NC_017301	ATG	2	6	187343	187348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505872
3109	NC_017301	TAA	2	6	187433	187438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384505872
3110	NC_017301	TAT	2	6	187486	187491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505873
3111	NC_017301	TGA	2	6	187548	187553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384505873
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3113	NC_017301	ATT	2	6	187677	187682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384505874
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3115	NC_017301	T	6	6	187892	187897	0 %	100 %	0 %	0 %	384505874
3116	NC_017301	CT	3	6	187935	187940	0 %	50 %	0 %	50 %	384505874
3117	NC_017301	GAAAAA	2	12	188043	188054	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384505874
3118	NC_017301	CGGA	2	8	188060	188067	25 %	0 %	50 %	25 %	384505874
3119	NC_017301	ATGG	2	8	188098	188105	25 %	25 %	50 %	0 %	384505874
3120	NC_017301	GTT	2	6	188169	188174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384505874
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3122	NC_017301	GGCA	2	8	188233	188240	25 %	0 %	50 %	25 %	384505874
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3245	NC_017301	TGC	2	6	194212	194217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505880
3246	NC_017301	GGT	2	6	194229	194234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384505880
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3248	NC_017301	TCT	2	6	194348	194353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384505880
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3250	NC_017301	GTC	2	6	194394	194399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384505880
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3255	NC_017301	GCA	2	6	194494	194499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384505880
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3365	NC_017301	CAT	2	6	200268	200273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505888
3366	NC_017301	CAA	2	6	200285	200290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384505888
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3369	NC_017301	GACA	2	8	200343	200350	50 %	0 %	25 %	25 %	384505888
3370	NC_017301	GAATT	2	10	200396	200405	40 %	40 %	20 %	0 %	384505888
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3376	NC_017301	ATC	2	6	200758	200763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505888
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3382	NC_017301	CAT	2	6	201152	201157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384505888
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3384	NC_017301	ACC	2	6	201244	201249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384505888
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3392	NC_017301	AGG	2	6	201529	201534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384505888
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3395	NC_017301	CGC	2	6	201636	201641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384505888
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