MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 37785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017300	CAG	2	6	237893	237898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503830
4002	NC_017300	GGC	2	6	237951	237956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503830
4003	NC_017300	GCC	2	6	237978	237983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503830
4004	NC_017300	GAT	2	6	237984	237989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503830
4005	NC_017300	GC	3	6	237994	237999	0 %	0 %	50 %	50 %	384503830
4006	NC_017300	AAGT	2	8	238001	238008	50 %	25 %	25 %	0 %	384503830
4007	NC_017300	TCA	2	6	238313	238318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503831
4008	NC_017300	TGC	2	6	238319	238324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503831
4009	NC_017300	GC	3	6	238359	238364	0 %	0 %	50 %	50 %	384503831
4010	NC_017300	CTT	2	6	238383	238388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503831
4011	NC_017300	CCG	2	6	238501	238506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503831
4012	NC_017300	CAA	2	6	238517	238522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503831
4013	NC_017300	GCG	2	6	238591	238596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503831
4014	NC_017300	GCG	2	6	238654	238659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503831
4015	NC_017300	TGC	2	6	238679	238684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503831
4016	NC_017300	A	6	6	238719	238724	100 %	0 %	0 %	0 %	384503831
4017	NC_017300	GGT	2	6	238773	238778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503831
4018	NC_017300	TTC	2	6	238842	238847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503831
4019	NC_017300	CAT	2	6	238926	238931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503831
4020	NC_017300	GCCT	2	8	238941	238948	0 %	25 %	25 %	50 %	384503831
4021	NC_017300	ACA	2	6	239050	239055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503831
4022	NC_017300	GTA	2	6	239163	239168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503831
4023	NC_017300	CGA	2	6	239192	239197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503831
4024	NC_017300	AAC	2	6	239215	239220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503831
4025	NC_017300	GGC	2	6	239248	239253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503831
4026	NC_017300	AGAGT	2	10	239257	239266	40 %	20 %	40 %	0 %	384503831
4027	NC_017300	CGG	2	6	239275	239280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503831
4028	NC_017300	GCT	2	6	239293	239298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503831
4029	NC_017300	ACA	2	6	239344	239349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503831
4030	NC_017300	CGA	2	6	239369	239374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503831
4031	NC_017300	AAC	2	6	239554	239559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503831
4032	NC_017300	CAC	2	6	239568	239573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503831
4033	NC_017300	CCA	2	6	239591	239596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503831
4034	NC_017300	GGT	2	6	239727	239732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503831
4035	NC_017300	GC	3	6	239773	239778	0 %	0 %	50 %	50 %	384503831
4036	NC_017300	TCT	2	6	239856	239861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503832
4037	NC_017300	GAGC	2	8	239875	239882	25 %	0 %	50 %	25 %	384503832
4038	NC_017300	GCG	2	6	239906	239911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503832
4039	NC_017300	GCG	2	6	239915	239920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503832
4040	NC_017300	GTT	2	6	239959	239964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503832
4041	NC_017300	GGC	2	6	239995	240000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503832
4042	NC_017300	CGGT	2	8	240052	240059	0 %	25 %	50 %	25 %	384503832
4043	NC_017300	TGCG	2	8	240147	240154	0 %	25 %	50 %	25 %	384503832
4044	NC_017300	GCC	2	6	240242	240247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503832
4045	NC_017300	AGA	2	6	240268	240273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503832
4046	NC_017300	C	6	6	240275	240280	0 %	0 %	0 %	100 %	384503832
4047	NC_017300	GCT	2	6	240340	240345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503832
4048	NC_017300	GCC	2	6	240354	240359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503832
4049	NC_017300	AGT	2	6	240391	240396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503832
4050	NC_017300	AGA	3	9	240427	240435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503832
4051	NC_017300	GCA	2	6	240446	240451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503832
4052	NC_017300	TCC	2	6	240455	240460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503832
4053	NC_017300	GGGC	2	8	240473	240480	0 %	0 %	75 %	25 %	384503832
4054	NC_017300	GCC	2	6	240513	240518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503832
4055	NC_017300	ACG	2	6	240636	240641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503832
4056	NC_017300	A	6	6	240752	240757	100 %	0 %	0 %	0 %	384503832
4057	NC_017300	GGA	2	6	240759	240764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503832
4058	NC_017300	CGCA	2	8	240843	240850	25 %	0 %	25 %	50 %	384503832
4059	NC_017300	GTT	2	6	241365	241370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503833
4060	NC_017300	CGG	2	6	241375	241380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503833
4061	NC_017300	GCT	2	6	241414	241419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503833
4062	NC_017300	AAG	2	6	241477	241482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503833
4063	NC_017300	GA	3	6	241507	241512	50 %	0 %	50 %	0 %	384503833
4064	NC_017300	TTTTG	2	10	241556	241565	0 %	80 %	20 %	0 %	384503833
4065	NC_017300	GA	3	6	241780	241785	50 %	0 %	50 %	0 %	384503834
4066	NC_017300	ATT	2	6	241828	241833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503834
4067	NC_017300	T	6	6	241832	241837	0 %	100 %	0 %	0 %	384503834
4068	NC_017300	CGC	2	6	241938	241943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503834
4069	NC_017300	TGCC	2	8	241962	241969	0 %	25 %	25 %	50 %	384503834
4070	NC_017300	CTT	2	6	241983	241988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503834
4071	NC_017300	GAT	2	6	242023	242028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503834
4072	NC_017300	GTT	2	6	242158	242163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503834
4073	NC_017300	AGA	2	6	242169	242174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503834
4074	NC_017300	ATTGTC	2	12	242203	242214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384503834
4075	NC_017300	TTC	2	6	242278	242283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503834
4076	NC_017300	TGC	2	6	242316	242321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503834
4077	NC_017300	GGA	2	6	242395	242400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503834
4078	NC_017300	GAG	2	6	242477	242482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503834
4079	NC_017300	CTT	2	6	242523	242528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503834
4080	NC_017300	TAA	2	6	242550	242555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384503834
4081	NC_017300	TG	3	6	242602	242607	0 %	50 %	50 %	0 %	384503834
4082	NC_017300	GC	3	6	242642	242647	0 %	0 %	50 %	50 %	384503834
4083	NC_017300	TG	3	6	242657	242662	0 %	50 %	50 %	0 %	384503834
4084	NC_017300	TGC	2	6	242751	242756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503834
4085	NC_017300	GAG	2	6	242849	242854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503834
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4087	NC_017300	GAG	2	6	242998	243003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503834
4088	NC_017300	AGC	2	6	243031	243036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503834
4089	NC_017300	CGT	3	9	243165	243173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503834
4090	NC_017300	GTA	2	6	243230	243235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503834
4091	NC_017300	AAG	2	6	243250	243255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503834
4092	NC_017300	A	6	6	243267	243272	100 %	0 %	0 %	0 %	384503834
4093	NC_017300	GGA	2	6	243277	243282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503834
4094	NC_017300	GAA	2	6	243308	243313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503834
4095	NC_017300	CGT	2	6	243365	243370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503834
4096	NC_017300	CAG	2	6	243618	243623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503835
4097	NC_017300	TAT	2	6	243697	243702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503835
4098	NC_017300	CGG	2	6	243868	243873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503835
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4100	NC_017300	AGT	2	6	243937	243942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503835
4101	NC_017300	GCT	2	6	244016	244021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503835
4102	NC_017300	GCA	2	6	244049	244054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503835
4103	NC_017300	CAT	2	6	244126	244131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503835
4104	NC_017300	CGG	2	6	244155	244160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503835
4105	NC_017300	GCA	2	6	244524	244529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503836
4106	NC_017300	GC	3	6	244601	244606	0 %	0 %	50 %	50 %	384503836
4107	NC_017300	GAT	2	6	244630	244635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503836
4108	NC_017300	AGG	3	9	244668	244676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503836
4109	NC_017300	CTCA	2	8	244678	244685	25 %	25 %	0 %	50 %	384503836
4110	NC_017300	CGCT	2	8	244799	244806	0 %	25 %	25 %	50 %	384503836
4111	NC_017300	AGC	2	6	244831	244836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503836
4112	NC_017300	TTC	2	6	244897	244902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503836
4113	NC_017300	GCCAT	2	10	244913	244922	20 %	20 %	20 %	40 %	384503836
4114	NC_017300	ACT	2	6	244937	244942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503836
4115	NC_017300	AG	3	6	245012	245017	50 %	0 %	50 %	0 %	384503836
4116	NC_017300	CGT	2	6	245067	245072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503836
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4119	NC_017300	CCTG	2	8	245237	245244	0 %	25 %	25 %	50 %	384503836
4120	NC_017300	TAG	2	6	245264	245269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503836
4121	NC_017300	ATC	2	6	245270	245275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503836
4122	NC_017300	GCT	2	6	245298	245303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503836
4123	NC_017300	GAT	2	6	245356	245361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503836
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4125	NC_017300	GTG	2	6	245396	245401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503837
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4127	NC_017300	ACC	2	6	245720	245725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503837
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4129	NC_017300	TGCG	2	8	245739	245746	0 %	25 %	50 %	25 %	384503837
4130	NC_017300	CAC	2	6	245788	245793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503837
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4132	NC_017300	CAG	2	6	245847	245852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503837
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4134	NC_017300	AGC	2	6	245968	245973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503837
4135	NC_017300	AGC	2	6	246016	246021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503837
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4142	NC_017300	GATG	2	8	246711	246718	25 %	25 %	50 %	0 %	384503837
4143	NC_017300	CAT	2	6	246721	246726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503837
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4151	NC_017300	TGA	2	6	247411	247416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503838
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4157	NC_017300	CGG	2	6	247699	247704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503838
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4231	NC_017300	AGAA	2	8	251771	251778	75 %	0 %	25 %	0 %	384503841
4232	NC_017300	CGT	2	6	251786	251791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503841
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4235	NC_017300	GACATG	2	12	251836	251847	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384503841
4236	NC_017300	GAT	2	6	251850	251855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503841
4237	NC_017300	GC	3	6	251857	251862	0 %	0 %	50 %	50 %	384503841
4238	NC_017300	TTG	2	6	251863	251868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503841
4239	NC_017300	GCC	2	6	251937	251942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503841
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4241	NC_017300	GTA	2	6	251973	251978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503841
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4363	NC_017300	TCAA	2	8	259779	259786	50 %	25 %	0 %	25 %	384503848
4364	NC_017300	TGC	2	6	259856	259861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503848
4365	NC_017300	TGAT	2	8	259993	260000	25 %	50 %	25 %	0 %	384503848
4366	NC_017300	GGCA	2	8	260060	260067	25 %	0 %	50 %	25 %	384503848
4367	NC_017300	CCG	2	6	260077	260082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503848
4368	NC_017300	CAA	2	6	260093	260098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503848
4369	NC_017300	TTC	2	6	260115	260120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503848
4370	NC_017300	GAC	2	6	260130	260135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503848
4371	NC_017300	TCG	2	6	260308	260313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503849
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4373	NC_017300	GC	3	6	260375	260380	0 %	0 %	50 %	50 %	384503849
4374	NC_017300	TGC	2	6	260397	260402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503849
4375	NC_017300	CTAC	2	8	260429	260436	25 %	25 %	0 %	50 %	384503849
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4377	NC_017300	TGCTC	2	10	260463	260472	0 %	40 %	20 %	40 %	384503849
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4379	NC_017300	CCA	2	6	260493	260498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503849
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4382	NC_017300	TGC	2	6	260928	260933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503850
4383	NC_017300	T	7	7	260939	260945	0 %	100 %	0 %	0 %	384503850
4384	NC_017300	TGGG	2	8	260989	260996	0 %	25 %	75 %	0 %	384503850
4385	NC_017300	GGC	2	6	261006	261011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503850
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4388	NC_017300	TTA	2	6	261332	261337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503850
4389	NC_017300	ACC	2	6	261378	261383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503850
4390	NC_017300	CAG	2	6	261400	261405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503850
4391	NC_017300	GGC	2	6	261415	261420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503850
4392	NC_017300	AAG	2	6	261463	261468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503850
4393	NC_017300	GC	4	8	261510	261517	0 %	0 %	50 %	50 %	384503850
4394	NC_017300	CTT	2	6	261518	261523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503850
4395	NC_017300	TGG	2	6	261548	261553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503850
4396	NC_017300	GGCA	2	8	261623	261630	25 %	0 %	50 %	25 %	384503850
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4399	NC_017300	CTG	2	6	261808	261813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503850
4400	NC_017300	GAT	2	6	261865	261870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503850
4401	NC_017300	GC	4	8	261890	261897	0 %	0 %	50 %	50 %	384503850
4402	NC_017300	ATT	2	6	261952	261957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503850
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4409	NC_017300	GCT	2	6	262330	262335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503851
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4412	NC_017300	TGA	2	6	262529	262534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503852
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4422	NC_017300	CTA	2	6	263143	263148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503853
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4425	NC_017300	GCT	2	6	263319	263324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503853
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4428	NC_017300	T	6	6	263482	263487	0 %	100 %	0 %	0 %	384503853
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4430	NC_017300	GTC	2	6	263507	263512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503853
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4434	NC_017300	CTT	2	6	263743	263748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503853
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4439	NC_017300	GTTG	2	8	264280	264287	0 %	50 %	50 %	0 %	384503854
4440	NC_017300	TCG	2	6	264322	264327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503854
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4443	NC_017300	CTT	2	6	264440	264445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503854
4444	NC_017300	CGC	2	6	264485	264490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503854
4445	NC_017300	CCG	3	9	264505	264513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503854
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4450	NC_017300	GTG	2	6	265048	265053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503855
4451	NC_017300	GA	3	6	265064	265069	50 %	0 %	50 %	0 %	384503855
4452	NC_017300	GCT	3	9	265077	265085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503855
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4454	NC_017300	TGCATT	2	12	265219	265230	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384503855
4455	NC_017300	TCA	2	6	265400	265405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503856
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4457	NC_017300	TTGCC	2	10	265593	265602	0 %	40 %	20 %	40 %	384503856
4458	NC_017300	TG	3	6	265690	265695	0 %	50 %	50 %	0 %	384503856
4459	NC_017300	GTC	2	6	265714	265719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503856
4460	NC_017300	GTC	3	9	265726	265734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503856
4461	NC_017300	CGA	2	6	265842	265847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503856
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4463	NC_017300	TTGC	2	8	266077	266084	0 %	50 %	25 %	25 %	384503856
4464	NC_017300	TCA	2	6	266093	266098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503856
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4466	NC_017300	TTGC	2	8	266164	266171	0 %	50 %	25 %	25 %	384503856
4467	NC_017300	AC	3	6	266187	266192	50 %	0 %	0 %	50 %	384503856
4468	NC_017300	GGC	2	6	266203	266208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503856
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4470	NC_017300	AGA	2	6	266322	266327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503856
4471	NC_017300	AGG	2	6	266385	266390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503856
4472	NC_017300	TCT	2	6	266414	266419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503856
4473	NC_017300	GA	3	6	266606	266611	50 %	0 %	50 %	0 %	384503856
4474	NC_017300	GGC	2	6	266626	266631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503856
4475	NC_017300	CTT	2	6	266685	266690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503856
4476	NC_017300	GA	3	6	266709	266714	50 %	0 %	50 %	0 %	384503856
4477	NC_017300	CTT	2	6	266749	266754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503856
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4482	NC_017300	CTT	2	6	267048	267053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503856
4483	NC_017300	CTT	2	6	267060	267065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503856
4484	NC_017300	GCCA	2	8	267087	267094	25 %	0 %	25 %	50 %	384503856
4485	NC_017300	CAT	2	6	267103	267108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503856
4486	NC_017300	GTCT	2	8	267127	267134	0 %	50 %	25 %	25 %	384503856
4487	NC_017300	GTC	2	6	267154	267159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503856
4488	NC_017300	GGTGTC	2	12	267202	267213	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384503856
4489	NC_017300	CTT	2	6	267229	267234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503856
4490	NC_017300	AAG	2	6	267305	267310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503856
4491	NC_017300	CGT	2	6	267315	267320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503856
4492	NC_017300	CGG	2	6	267384	267389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503856
4493	NC_017300	CGTT	2	8	267411	267418	0 %	50 %	25 %	25 %	384503856
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