MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 37785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017300	A	7	7	180756	180762	100 %	0 %	0 %	0 %	384503775
3002	NC_017300	TGG	2	6	180914	180919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503775
3003	NC_017300	CAAC	2	8	180946	180953	50 %	0 %	0 %	50 %	384503775
3004	NC_017300	ACT	2	6	181022	181027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503775
3005	NC_017300	GCG	2	6	181072	181077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503775
3006	NC_017300	GAA	2	6	181103	181108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503775
3007	NC_017300	GTGGA	2	10	181181	181190	20 %	20 %	60 %	0 %	384503775
3008	NC_017300	CAG	2	6	181275	181280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503775
3009	NC_017300	CCA	2	6	181324	181329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503775
3010	NC_017300	GTC	2	6	181392	181397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503775
3011	NC_017300	CAA	2	6	181442	181447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503775
3012	NC_017300	CGG	2	6	181453	181458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503775
3013	NC_017300	TGC	2	6	181484	181489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503775
3014	NC_017300	AAC	2	6	181611	181616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503775
3015	NC_017300	GGCAAG	2	12	181752	181763	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384503775
3016	NC_017300	GCT	2	6	181798	181803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503775
3017	NC_017300	GAA	2	6	181809	181814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503775
3018	NC_017300	GAA	2	6	181856	181861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503775
3019	NC_017300	AAG	2	6	181953	181958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503775
3020	NC_017300	ACCTTT	2	12	181995	182006	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384503775
3021	NC_017300	TGA	2	6	182168	182173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503775
3022	NC_017300	CAG	2	6	182349	182354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503775
3023	NC_017300	GAA	2	6	182393	182398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503775
3024	NC_017300	GCAC	2	8	182406	182413	25 %	0 %	25 %	50 %	384503775
3025	NC_017300	TGC	2	6	182444	182449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503775
3026	NC_017300	TCC	2	6	182473	182478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503775
3027	NC_017300	TGACTA	2	12	182751	182762	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384503776
3028	NC_017300	CGT	2	6	182770	182775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503776
3029	NC_017300	GAG	2	6	182819	182824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503776
3030	NC_017300	T	6	6	182851	182856	0 %	100 %	0 %	0 %	384503776
3031	NC_017300	CTG	2	6	182871	182876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503776
3032	NC_017300	TC	3	6	182942	182947	0 %	50 %	0 %	50 %	384503776
3033	NC_017300	GCA	2	6	182982	182987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503776
3034	NC_017300	GCC	2	6	183017	183022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503776
3035	NC_017300	TGG	2	6	183033	183038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503776
3036	NC_017300	AAC	2	6	183110	183115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503776
3037	NC_017300	ATT	2	6	183128	183133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503776
3038	NC_017300	CAC	2	6	183148	183153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503776
3039	NC_017300	AGA	2	6	183337	183342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503776
3040	NC_017300	CGTG	2	8	183495	183502	0 %	25 %	50 %	25 %	384503776
3041	NC_017300	AC	3	6	183523	183528	50 %	0 %	0 %	50 %	384503776
3042	NC_017300	TGG	2	6	183531	183536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503776
3043	NC_017300	AGT	2	6	183610	183615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503776
3044	NC_017300	GCT	2	6	183638	183643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503776
3045	NC_017300	TGA	2	6	183649	183654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503776
3046	NC_017300	TTGG	2	8	183659	183666	0 %	50 %	50 %	0 %	384503776
3047	NC_017300	GCT	2	6	183775	183780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503776
3048	NC_017300	TATT	2	8	183849	183856	25 %	75 %	0 %	0 %	384503777
3049	NC_017300	GCT	2	6	183884	183889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503777
3050	NC_017300	CG	4	8	183905	183912	0 %	0 %	50 %	50 %	384503777
3051	NC_017300	TGC	2	6	183958	183963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503777
3052	NC_017300	ACG	2	6	184009	184014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503777
3053	NC_017300	AGGG	2	8	184021	184028	25 %	0 %	75 %	0 %	384503777
3054	NC_017300	GGT	2	6	184066	184071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503777
3055	NC_017300	TGG	2	6	184080	184085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503777
3056	NC_017300	CGG	2	6	184092	184097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503777
3057	NC_017300	GGA	2	6	184120	184125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503777
3058	NC_017300	GGGC	2	8	184133	184140	0 %	0 %	75 %	25 %	384503777
3059	NC_017300	AGGT	2	8	184247	184254	25 %	25 %	50 %	0 %	384503777
3060	NC_017300	TCG	2	6	184268	184273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503777
3061	NC_017300	TC	3	6	184326	184331	0 %	50 %	0 %	50 %	384503777
3062	NC_017300	CGC	2	6	184359	184364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503777
3063	NC_017300	ATC	2	6	184396	184401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503777
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3066	NC_017300	GCTC	2	8	184723	184730	0 %	25 %	25 %	50 %	384503778
3067	NC_017300	TGGC	2	8	184887	184894	0 %	25 %	50 %	25 %	384503778
3068	NC_017300	CAA	2	6	184981	184986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503778
3069	NC_017300	CTT	2	6	184996	185001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503778
3070	NC_017300	ACCT	2	8	185129	185136	25 %	25 %	0 %	50 %	384503778
3071	NC_017300	CCA	2	6	185170	185175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503778
3072	NC_017300	GAG	2	6	185213	185218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503778
3073	NC_017300	CAT	2	6	185318	185323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503778
3074	NC_017300	TGACC	2	10	185431	185440	20 %	20 %	20 %	40 %	384503778
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3078	NC_017300	CGG	2	6	185730	185735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503778
3079	NC_017300	TGA	2	6	185785	185790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503778
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3081	NC_017300	TGA	2	6	185947	185952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503778
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3083	NC_017300	GAG	2	6	186017	186022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503778
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3087	NC_017300	ACG	2	6	186121	186126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503779
3088	NC_017300	T	6	6	186170	186175	0 %	100 %	0 %	0 %	384503779
3089	NC_017300	TTGCA	2	10	186717	186726	20 %	40 %	20 %	20 %	384503780
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3092	NC_017300	GAC	2	6	186893	186898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503780
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3094	NC_017300	GGA	2	6	187080	187085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503780
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3097	NC_017300	CCAG	2	8	187224	187231	25 %	0 %	25 %	50 %	384503780
3098	NC_017300	T	6	6	187240	187245	0 %	100 %	0 %	0 %	384503780
3099	NC_017300	ATG	2	6	187285	187290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503780
3100	NC_017300	ACG	2	6	187303	187308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503780
3101	NC_017300	GTC	2	6	187342	187347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503780
3102	NC_017300	A	6	6	187353	187358	100 %	0 %	0 %	0 %	384503780
3103	NC_017300	ATG	2	6	187377	187382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503780
3104	NC_017300	TAA	2	6	187467	187472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384503780
3105	NC_017300	TAT	2	6	187520	187525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503781
3106	NC_017300	TGA	2	6	187582	187587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503781
3107	NC_017300	G	6	6	187620	187625	0 %	0 %	100 %	0 %	384503781
3108	NC_017300	A	6	6	188281	188286	100 %	0 %	0 %	0 %	384503782
3109	NC_017300	AT	3	6	188306	188311	50 %	50 %	0 %	0 %	384503782
3110	NC_017300	GAA	2	6	188349	188354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503782
3111	NC_017300	ATG	2	6	188364	188369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503782
3112	NC_017300	TGGT	2	8	188394	188401	0 %	50 %	50 %	0 %	384503782
3113	NC_017300	GA	3	6	188419	188424	50 %	0 %	50 %	0 %	384503782
3114	NC_017300	GCA	2	6	188504	188509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503783
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3117	NC_017300	TTG	2	6	188601	188606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503783
3118	NC_017300	GTTTG	2	10	188656	188665	0 %	60 %	40 %	0 %	384503783
3119	NC_017300	GAA	2	6	188726	188731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503783
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3121	NC_017300	TGG	2	6	188895	188900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503783
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3242	NC_017300	ACC	2	6	194507	194512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503788
3243	NC_017300	CAAC	2	8	194514	194521	50 %	0 %	0 %	50 %	384503788
3244	NC_017300	GCA	2	6	194549	194554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503788
3245	NC_017300	CGA	2	6	194589	194594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503788
3246	NC_017300	CAC	2	6	194680	194685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503788
3247	NC_017300	AGG	2	6	194698	194703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503788
3248	NC_017300	TCA	2	6	194799	194804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503788
3249	NC_017300	AAGCC	2	10	194814	194823	40 %	0 %	20 %	40 %	384503788
3250	NC_017300	AAG	2	6	194831	194836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503788
3251	NC_017300	TCA	2	6	194951	194956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503788
3252	NC_017300	ATT	2	6	194983	194988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503788
3253	NC_017300	CCG	2	6	195075	195080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503788
3254	NC_017300	AT	3	6	195268	195273	50 %	50 %	0 %	0 %	384503789
3255	NC_017300	GTT	2	6	195346	195351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503789
3256	NC_017300	GCC	2	6	195369	195374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503789
3257	NC_017300	ACC	2	6	195424	195429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503789
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3259	NC_017300	ACG	2	6	195585	195590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503789
3260	NC_017300	CAC	2	6	195591	195596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503789
3261	NC_017300	ATC	2	6	195648	195653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503789
3262	NC_017300	GCA	2	6	195724	195729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503789
3263	NC_017300	GCC	2	6	195853	195858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503789
3264	NC_017300	ACA	2	6	195860	195865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503789
3265	NC_017300	AAT	2	6	195897	195902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384503789
3266	NC_017300	TCA	3	9	195919	195927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503789
3267	NC_017300	ACA	2	6	195928	195933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503789
3268	NC_017300	CTA	2	6	196008	196013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503790
3269	NC_017300	T	6	6	196041	196046	0 %	100 %	0 %	0 %	384503790
3270	NC_017300	CTGCCG	2	12	196147	196158	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384503790
3271	NC_017300	CT	3	6	196211	196216	0 %	50 %	0 %	50 %	384503790
3272	NC_017300	CAC	2	6	196225	196230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503790
3273	NC_017300	GCA	2	6	196259	196264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503790
3274	NC_017300	ATC	2	6	196316	196321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503790
3275	NC_017300	CCA	2	6	196341	196346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503790
3276	NC_017300	CTCA	2	8	196357	196364	25 %	25 %	0 %	50 %	384503790
3277	NC_017300	TAC	2	6	196386	196391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503790
3278	NC_017300	CG	4	8	196486	196493	0 %	0 %	50 %	50 %	384503790
3279	NC_017300	TGG	2	6	196509	196514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503790
3280	NC_017300	GCC	2	6	196565	196570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503790
3281	NC_017300	TTAA	2	8	196574	196581	50 %	50 %	0 %	0 %	384503790
3282	NC_017300	TCA	2	6	196619	196624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503790
3283	NC_017300	CAC	2	6	196663	196668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503790
3284	NC_017300	ACGC	2	8	196688	196695	25 %	0 %	25 %	50 %	384503790
3285	NC_017300	TTG	2	6	196859	196864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503791
3286	NC_017300	GGCCC	2	10	196886	196895	0 %	0 %	40 %	60 %	384503791
3287	NC_017300	TGA	2	6	196942	196947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503791
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3292	NC_017300	ATC	2	6	197294	197299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503792
3293	NC_017300	ATC	2	6	197354	197359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503792
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3303	NC_017300	TGC	2	6	197756	197761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503793
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3332	NC_017300	CAA	2	6	199357	199362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503794
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3336	NC_017300	TCG	2	6	199550	199555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503795
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3342	NC_017300	ACTT	2	8	199838	199845	25 %	50 %	0 %	25 %	384503795
3343	NC_017300	CTC	3	9	199846	199854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503796
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3347	NC_017300	GGC	2	6	199958	199963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503796
3348	NC_017300	ATC	2	6	199984	199989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503796
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3350	NC_017300	AC	3	6	200127	200132	50 %	0 %	0 %	50 %	384503796
3351	NC_017300	AGGA	2	8	200195	200202	50 %	0 %	50 %	0 %	384503796
3352	NC_017300	GCGT	2	8	200271	200278	0 %	25 %	50 %	25 %	384503796
3353	NC_017300	GA	3	6	200309	200314	50 %	0 %	50 %	0 %	384503796
3354	NC_017300	CAT	2	6	200323	200328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503796
3355	NC_017300	CAA	2	6	200340	200345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503796
3356	NC_017300	GCC	3	9	200359	200367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503796
3357	NC_017300	AGA	2	6	200388	200393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503796
3358	NC_017300	GACA	2	8	200398	200405	50 %	0 %	25 %	25 %	384503796
3359	NC_017300	GAATT	2	10	200451	200460	40 %	40 %	20 %	0 %	384503796
3360	NC_017300	TAC	2	6	200617	200622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503796
3361	NC_017300	CCA	2	6	200630	200635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503796
3362	NC_017300	ACA	2	6	200694	200699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503796
3363	NC_017300	GCT	2	6	200796	200801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503796
3364	NC_017300	ACC	2	6	200807	200812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503796
3365	NC_017300	ATC	2	6	200813	200818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503796
3366	NC_017300	ATG	2	6	200819	200824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503796
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3370	NC_017300	CAT	2	6	201207	201212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503796
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3487	NC_017300	AGT	2	6	207866	207871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503800
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3490	NC_017300	AAGC	2	8	207986	207993	50 %	0 %	25 %	25 %	384503800
3491	NC_017300	GC	3	6	208740	208745	0 %	0 %	50 %	50 %	384503801
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