MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 37785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017300	TGGG	2	8	351169	351176	0 %	25 %	75 %	0 %	384503931
6002	NC_017300	ACA	2	6	351204	351209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503931
6003	NC_017300	ACT	2	6	351241	351246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503931
6004	NC_017300	AT	3	6	351404	351409	50 %	50 %	0 %	0 %	384503932
6005	NC_017300	CA	3	6	351424	351429	50 %	0 %	0 %	50 %	384503932
6006	NC_017300	TGC	3	9	351484	351492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503932
6007	NC_017300	AAC	2	6	351519	351524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503932
6008	NC_017300	GCT	2	6	351586	351591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503932
6009	NC_017300	AT	3	6	351597	351602	50 %	50 %	0 %	0 %	384503932
6010	NC_017300	ACT	2	6	351642	351647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503932
6011	NC_017300	GCT	2	6	351653	351658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503932
6012	NC_017300	GCG	2	6	351708	351713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503932
6013	NC_017300	GAT	2	6	351768	351773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503932
6014	NC_017300	ATA	2	6	351853	351858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384503932
6015	NC_017300	TGCT	2	8	351865	351872	0 %	50 %	25 %	25 %	384503932
6016	NC_017300	GGC	2	6	351922	351927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503932
6017	NC_017300	T	6	6	351943	351948	0 %	100 %	0 %	0 %	384503932
6018	NC_017300	CAT	2	6	351979	351984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503932
6019	NC_017300	AGA	2	6	352007	352012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503932
6020	NC_017300	CCG	2	6	352030	352035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503932
6021	NC_017300	AGC	2	6	352117	352122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503932
6022	NC_017300	CTTA	2	8	352123	352130	25 %	50 %	0 %	25 %	384503932
6023	NC_017300	GCC	2	6	352382	352387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503933
6024	NC_017300	TGC	2	6	352395	352400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503933
6025	NC_017300	CTG	2	6	352464	352469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503933
6026	NC_017300	TCC	2	6	352482	352487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503933
6027	NC_017300	ATG	2	6	352556	352561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503933
6028	NC_017300	TCT	2	6	352637	352642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503933
6029	NC_017300	AGCATC	2	12	352662	352673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384503933
6030	NC_017300	GA	3	6	352699	352704	50 %	0 %	50 %	0 %	384503933
6031	NC_017300	CCT	2	6	352720	352725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503933
6032	NC_017300	CTT	2	6	352899	352904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503933
6033	NC_017300	ATG	2	6	352910	352915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503933
6034	NC_017300	CCAC	2	8	352916	352923	25 %	0 %	0 %	75 %	384503933
6035	NC_017300	TAG	2	6	352941	352946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503933
6036	NC_017300	TGG	2	6	352956	352961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503933
6037	NC_017300	TTAC	2	8	353045	353052	25 %	50 %	0 %	25 %	384503933
6038	NC_017300	GC	3	6	353067	353072	0 %	0 %	50 %	50 %	384503933
6039	NC_017300	AGC	2	6	353094	353099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503934
6040	NC_017300	CAG	2	6	353124	353129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503934
6041	NC_017300	TGC	2	6	353169	353174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503934
6042	NC_017300	TCG	2	6	353198	353203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503934
6043	NC_017300	GAG	2	6	353310	353315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503934
6044	NC_017300	AGC	2	6	353316	353321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503934
6045	NC_017300	GT	3	6	353435	353440	0 %	50 %	50 %	0 %	384503934
6046	NC_017300	CGC	2	6	353511	353516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503934
6047	NC_017300	CGG	2	6	353526	353531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503934
6048	NC_017300	GA	3	6	353564	353569	50 %	0 %	50 %	0 %	384503934
6049	NC_017300	GC	3	6	353586	353591	0 %	0 %	50 %	50 %	384503934
6050	NC_017300	AC	4	8	353628	353635	50 %	0 %	0 %	50 %	384503934
6051	NC_017300	GCC	3	9	353660	353668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503934
6052	NC_017300	CAGT	2	8	353684	353691	25 %	25 %	25 %	25 %	384503934
6053	NC_017300	AAGC	2	8	353743	353750	50 %	0 %	25 %	25 %	384503934
6054	NC_017300	CTT	2	6	353786	353791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503935
6055	NC_017300	GT	3	6	353850	353855	0 %	50 %	50 %	0 %	384503935
6056	NC_017300	CGC	2	6	353857	353862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503935
6057	NC_017300	CGC	2	6	354005	354010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503935
6058	NC_017300	CCG	2	6	354036	354041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503935
6059	NC_017300	GGA	2	6	354116	354121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503935
6060	NC_017300	TAA	2	6	354129	354134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384503935
6061	NC_017300	TCC	2	6	354141	354146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503935
6062	NC_017300	TCC	2	6	354183	354188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503935
6063	NC_017300	CGG	2	6	354214	354219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503935
6064	NC_017300	CAT	2	6	354340	354345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503935
6065	NC_017300	ATC	2	6	354360	354365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503935
6066	NC_017300	TCA	2	6	354540	354545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503935
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6068	NC_017300	CTG	2	6	354610	354615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503935
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6070	NC_017300	TAA	2	6	354712	354717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384503935
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6072	NC_017300	GGC	2	6	354835	354840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503935
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6082	NC_017300	CCAG	2	8	355375	355382	25 %	0 %	25 %	50 %	384503935
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6087	NC_017300	TGA	2	6	355793	355798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503936
6088	NC_017300	GAAT	2	8	355801	355808	50 %	25 %	25 %	0 %	384503936
6089	NC_017300	GAC	2	6	355851	355856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503936
6090	NC_017300	TA	3	6	355891	355896	50 %	50 %	0 %	0 %	384503936
6091	NC_017300	GCT	2	6	355926	355931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503936
6092	NC_017300	ATGG	2	8	355934	355941	25 %	25 %	50 %	0 %	384503936
6093	NC_017300	GCG	2	6	355980	355985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503936
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6100	NC_017300	TGCGG	2	10	356087	356096	0 %	20 %	60 %	20 %	384503936
6101	NC_017300	TTC	2	6	356153	356158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503936
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6103	NC_017300	CAG	2	6	356640	356645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503937
6104	NC_017300	GCC	2	6	356659	356664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503937
6105	NC_017300	CGT	2	6	356715	356720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503937
6106	NC_017300	GT	3	6	356734	356739	0 %	50 %	50 %	0 %	384503937
6107	NC_017300	ACC	2	6	356742	356747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503937
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6110	NC_017300	ATC	2	6	356916	356921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503937
6111	NC_017300	GCTC	2	8	356964	356971	0 %	25 %	25 %	50 %	384503937
6112	NC_017300	AAG	2	6	356985	356990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503937
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6116	NC_017300	GTTG	2	8	357304	357311	0 %	50 %	50 %	0 %	384503938
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6120	NC_017300	ACG	2	6	357895	357900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503939
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6122	NC_017300	TGGA	2	8	357918	357925	25 %	25 %	50 %	0 %	384503939
6123	NC_017300	GCT	2	6	357960	357965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503939
6124	NC_017300	CAT	2	6	357998	358003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503939
6125	NC_017300	GTTGAG	2	12	358032	358043	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384503939
6126	NC_017300	AAG	2	6	358090	358095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503939
6127	NC_017300	GCT	2	6	358131	358136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503939
6128	NC_017300	CAT	2	6	358214	358219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503939
6129	NC_017300	TTG	2	6	358288	358293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503939
6130	NC_017300	CTT	2	6	358296	358301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503939
6131	NC_017300	GCT	2	6	358389	358394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503939
6132	NC_017300	GAG	2	6	358467	358472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503939
6133	NC_017300	GAG	2	6	358482	358487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503939
6134	NC_017300	CGA	2	6	358649	358654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503939
6135	NC_017300	CGA	2	6	358685	358690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503939
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6138	NC_017300	ACT	2	6	358920	358925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503939
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6143	NC_017300	AAG	2	6	359262	359267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503939
6144	NC_017300	TGG	2	6	359273	359278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503939
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6146	NC_017300	GGT	2	6	359388	359393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503939
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6148	NC_017300	ATGCA	2	10	359440	359449	40 %	20 %	20 %	20 %	384503939
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6151	NC_017300	TTA	2	6	359626	359631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503939
6152	NC_017300	GAG	2	6	359637	359642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503939
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6160	NC_017300	TTG	2	6	360593	360598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503940
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6192	NC_017300	CGT	2	6	362223	362228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503942
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6203	NC_017300	TCG	2	6	362900	362905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503944
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6205	NC_017300	CCA	2	6	362928	362933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503944
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6208	NC_017300	GCGA	2	8	363016	363023	25 %	0 %	50 %	25 %	384503944
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6213	NC_017300	GGCG	2	8	363300	363307	0 %	0 %	75 %	25 %	384503944
6214	NC_017300	TGGGGC	2	12	363330	363341	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384503944
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6218	NC_017300	GCA	2	6	363576	363581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503945
6219	NC_017300	CTGGG	2	10	363607	363616	0 %	20 %	60 %	20 %	384503945
6220	NC_017300	CGG	2	6	363669	363674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503945
6221	NC_017300	AGCG	2	8	363690	363697	25 %	0 %	50 %	25 %	384503945
6222	NC_017300	ACG	2	6	363704	363709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503945
6223	NC_017300	CTG	2	6	363742	363747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503945
6224	NC_017300	ATTT	2	8	363859	363866	25 %	75 %	0 %	0 %	384503946
6225	NC_017300	GC	3	6	363879	363884	0 %	0 %	50 %	50 %	384503946
6226	NC_017300	GAG	2	6	363922	363927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503946
6227	NC_017300	CCA	2	6	363960	363965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503946
6228	NC_017300	ACG	2	6	364037	364042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503947
6229	NC_017300	GAC	2	6	364048	364053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503947
6230	NC_017300	CGA	2	6	364101	364106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503947
6231	NC_017300	TTGA	2	8	364107	364114	25 %	50 %	25 %	0 %	384503947
6232	NC_017300	TAA	2	6	364139	364144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384503947
6233	NC_017300	CCG	2	6	364247	364252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503947
6234	NC_017300	T	6	6	364284	364289	0 %	100 %	0 %	0 %	384503947
6235	NC_017300	CAT	2	6	364437	364442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503948
6236	NC_017300	CTG	2	6	364609	364614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503948
6237	NC_017300	GGAAT	2	10	364634	364643	40 %	20 %	40 %	0 %	384503948
6238	NC_017300	CT	3	6	364702	364707	0 %	50 %	0 %	50 %	384503948
6239	NC_017300	CCA	2	6	364731	364736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503948
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6483	NC_017300	CGT	2	6	378069	378074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503967
6484	NC_017300	GAA	2	6	378137	378142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503968
6485	NC_017300	TGAA	2	8	378156	378163	50 %	25 %	25 %	0 %	384503968
6486	NC_017300	GTT	2	6	378209	378214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503968
6487	NC_017300	CGT	2	6	378311	378316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503968
6488	NC_017300	AAG	2	6	378320	378325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503968
6489	NC_017300	GTG	2	6	378384	378389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503968
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6491	NC_017300	CAG	2	6	378467	378472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503968
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6499	NC_017300	CCTA	2	8	379513	379520	25 %	25 %	0 %	50 %	384503969
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