MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 37785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017300	TGA	2	6	322674	322679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503911
5502	NC_017300	CGC	2	6	322698	322703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503911
5503	NC_017300	AGC	2	6	322713	322718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503911
5504	NC_017300	AGC	2	6	322751	322756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503911
5505	NC_017300	GCA	2	6	322780	322785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503911
5506	NC_017300	GAA	2	6	322854	322859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503911
5507	NC_017300	ATC	2	6	322879	322884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503911
5508	NC_017300	TGCG	2	8	322931	322938	0 %	25 %	50 %	25 %	384503911
5509	NC_017300	TTGAGG	2	12	322946	322957	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384503911
5510	NC_017300	CTT	2	6	323038	323043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503911
5511	NC_017300	GTT	2	6	323092	323097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503911
5512	NC_017300	GCAAC	2	10	323138	323147	40 %	0 %	20 %	40 %	384503911
5513	NC_017300	CGG	2	6	323208	323213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503911
5514	NC_017300	AGGTTG	2	12	323282	323293	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384503911
5515	NC_017300	GC	3	6	323330	323335	0 %	0 %	50 %	50 %	384503911
5516	NC_017300	GAA	3	9	323768	323776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503912
5517	NC_017300	TTA	2	6	323788	323793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503912
5518	NC_017300	CAT	2	6	323867	323872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503912
5519	NC_017300	TGC	2	6	323894	323899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503912
5520	NC_017300	GTT	2	6	323922	323927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503912
5521	NC_017300	CAG	2	6	323986	323991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503912
5522	NC_017300	TGC	2	6	323998	324003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503912
5523	NC_017300	GCT	2	6	324009	324014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503912
5524	NC_017300	GCT	2	6	324135	324140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503912
5525	NC_017300	CAT	2	6	324143	324148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503912
5526	NC_017300	GTT	2	6	324177	324182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503912
5527	NC_017300	CAA	2	6	324275	324280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503913
5528	NC_017300	A	6	6	324279	324284	100 %	0 %	0 %	0 %	384503913
5529	NC_017300	CGC	3	9	324299	324307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503913
5530	NC_017300	GTC	2	6	324325	324330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503913
5531	NC_017300	GCT	2	6	324348	324353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503913
5532	NC_017300	TCC	2	6	324372	324377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503913
5533	NC_017300	ACG	2	6	324385	324390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503913
5534	NC_017300	GCA	2	6	324537	324542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503913
5535	NC_017300	ACC	2	6	324561	324566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503913
5536	NC_017300	CCAGA	2	10	324624	324633	40 %	0 %	20 %	40 %	384503913
5537	NC_017300	GCT	2	6	324774	324779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503913
5538	NC_017300	AAG	2	6	324900	324905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503913
5539	NC_017300	TCCA	2	8	324951	324958	25 %	25 %	0 %	50 %	384503913
5540	NC_017300	GAA	2	6	324959	324964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503913
5541	NC_017300	AACT	2	8	326472	326479	50 %	25 %	0 %	25 %	384503914
5542	NC_017300	CTA	2	6	326565	326570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503914
5543	NC_017300	CT	3	6	326599	326604	0 %	50 %	0 %	50 %	384503914
5544	NC_017300	CCA	2	6	326619	326624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503914
5545	NC_017300	GCT	2	6	326667	326672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503914
5546	NC_017300	GTG	2	6	326700	326705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503914
5547	NC_017300	AT	3	6	326752	326757	50 %	50 %	0 %	0 %	384503914
5548	NC_017300	ACT	2	6	326787	326792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503914
5549	NC_017300	GATG	2	8	326803	326810	25 %	25 %	50 %	0 %	384503914
5550	NC_017300	TGA	2	6	326869	326874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503914
5551	NC_017300	TGG	2	6	326875	326880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503914
5552	NC_017300	TGTT	2	8	326892	326899	0 %	75 %	25 %	0 %	384503914
5553	NC_017300	CAG	2	6	326956	326961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503914
5554	NC_017300	GAG	2	6	327006	327011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503914
5555	NC_017300	GAA	2	6	327047	327052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503914
5556	NC_017300	TAC	2	6	327079	327084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503914
5557	NC_017300	C	6	6	327097	327102	0 %	0 %	0 %	100 %	384503914
5558	NC_017300	GAT	2	6	327137	327142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503914
5559	NC_017300	TGA	2	6	327196	327201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503914
5560	NC_017300	TG	3	6	327218	327223	0 %	50 %	50 %	0 %	384503914
5561	NC_017300	TGT	2	6	327280	327285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503914
5562	NC_017300	ACGT	2	8	327302	327309	25 %	25 %	25 %	25 %	384503914
5563	NC_017300	TGA	2	6	327510	327515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503914
5564	NC_017300	AGA	2	6	327550	327555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503914
5565	NC_017300	AAC	2	6	327766	327771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503914
5566	NC_017300	GGC	2	6	327954	327959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503915
5567	NC_017300	CG	3	6	327973	327978	0 %	0 %	50 %	50 %	384503915
5568	NC_017300	GC	3	6	327998	328003	0 %	0 %	50 %	50 %	384503915
5569	NC_017300	GCA	2	6	328119	328124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503915
5570	NC_017300	ATGC	2	8	328189	328196	25 %	25 %	25 %	25 %	384503915
5571	NC_017300	GGC	2	6	328225	328230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503915
5572	NC_017300	CTG	2	6	328283	328288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503915
5573	NC_017300	CGT	2	6	328369	328374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503915
5574	NC_017300	TCCT	2	8	328446	328453	0 %	50 %	0 %	50 %	384503915
5575	NC_017300	GGC	2	6	328477	328482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503915
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5578	NC_017300	GAG	2	6	328612	328617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503915
5579	NC_017300	TC	3	6	328674	328679	0 %	50 %	0 %	50 %	384503915
5580	NC_017300	TCA	2	6	328713	328718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503915
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5585	NC_017300	CGG	2	6	329253	329258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503916
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5587	NC_017300	GAA	2	6	329310	329315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503916
5588	NC_017300	TCG	2	6	329320	329325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503916
5589	NC_017300	CGT	2	6	329416	329421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503916
5590	NC_017300	CTG	2	6	329464	329469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503916
5591	NC_017300	GCTG	2	8	329472	329479	0 %	25 %	50 %	25 %	384503916
5592	NC_017300	AAG	2	6	329483	329488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503916
5593	NC_017300	TGA	2	6	329505	329510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503916
5594	NC_017300	TCTCC	2	10	329511	329520	0 %	40 %	0 %	60 %	384503916
5595	NC_017300	TTA	2	6	329540	329545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503916
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5599	NC_017300	GCGCT	2	10	329783	329792	0 %	20 %	40 %	40 %	384503916
5600	NC_017300	GAA	2	6	329799	329804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503916
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5602	NC_017300	GCT	3	9	329998	330006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503917
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5605	NC_017300	GCT	3	9	330046	330054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503917
5606	NC_017300	GAAGA	2	10	330055	330064	60 %	0 %	40 %	0 %	384503917
5607	NC_017300	GTT	2	6	330076	330081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503917
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5609	NC_017300	GGCCTG	2	12	330142	330153	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384503917
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5744	NC_017300	TCT	2	6	337706	337711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503923
5745	NC_017300	AAG	2	6	337718	337723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384503923
5746	NC_017300	A	6	6	337733	337738	100 %	0 %	0 %	0 %	384503923
5747	NC_017300	AAAG	2	8	337747	337754	75 %	0 %	25 %	0 %	384503923
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5764	NC_017300	CTA	2	6	338585	338590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503924
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5776	NC_017300	CTT	2	6	339347	339352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503925
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5849	NC_017300	CAT	2	6	343051	343056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503926
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5852	NC_017300	CAT	2	6	343237	343242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503926
5853	NC_017300	GACCA	2	10	343274	343283	40 %	0 %	20 %	40 %	384503926
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5861	NC_017300	TGA	2	6	343543	343548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503926
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5985	NC_017300	CAGCT	2	10	350338	350347	20 %	20 %	20 %	40 %	384503930
5986	NC_017300	ATT	2	6	350557	350562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503931
5987	NC_017300	GCA	2	6	350571	350576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503931
5988	NC_017300	CGT	2	6	350620	350625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503931
5989	NC_017300	GCG	2	6	350643	350648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503931
5990	NC_017300	GAT	2	6	350689	350694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503931
5991	NC_017300	GCTG	2	8	350704	350711	0 %	25 %	50 %	25 %	384503931
5992	NC_017300	CTT	2	6	350770	350775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503931
5993	NC_017300	TCT	2	6	350833	350838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503931
5994	NC_017300	AGTGGG	2	12	350851	350862	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384503931
5995	NC_017300	A	6	6	350913	350918	100 %	0 %	0 %	0 %	384503931
5996	NC_017300	TGG	2	6	350931	350936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503931
5997	NC_017300	GCT	2	6	350981	350986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503931
5998	NC_017300	TGC	2	6	351004	351009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503931
5999	NC_017300	GTCA	2	8	351119	351126	25 %	25 %	25 %	25 %	384503931
6000	NC_017300	TCC	2	6	351161	351166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503931

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