MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 1002 chromosome

Total Repeats: 37785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017300	TCT	2	6	268183	268188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503857
4502	NC_017300	TCG	2	6	268335	268340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503857
4503	NC_017300	GCC	2	6	268361	268366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503857
4504	NC_017300	GCG	2	6	268398	268403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503857
4505	NC_017300	CGT	2	6	268417	268422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503857
4506	NC_017300	GTG	2	6	268510	268515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503857
4507	NC_017300	GAATG	2	10	268935	268944	40 %	20 %	40 %	0 %	384503858
4508	NC_017300	GTG	2	6	268975	268980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503858
4509	NC_017300	ACC	2	6	269079	269084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503858
4510	NC_017300	TAC	2	6	269091	269096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503858
4511	NC_017300	ACG	2	6	269245	269250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503858
4512	NC_017300	TGCA	2	8	269280	269287	25 %	25 %	25 %	25 %	384503858
4513	NC_017300	GCTG	2	8	269296	269303	0 %	25 %	50 %	25 %	384503858
4514	NC_017300	AGC	2	6	269415	269420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503859
4515	NC_017300	CT	3	6	269440	269445	0 %	50 %	0 %	50 %	384503859
4516	NC_017300	CAC	2	6	269461	269466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503859
4517	NC_017300	CGG	2	6	269476	269481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503859
4518	NC_017300	CGC	2	6	269491	269496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503859
4519	NC_017300	CG	3	6	269513	269518	0 %	0 %	50 %	50 %	384503859
4520	NC_017300	GTG	2	6	269522	269527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503859
4521	NC_017300	CAG	2	6	269652	269657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503859
4522	NC_017300	GGTGT	2	10	269690	269699	0 %	40 %	60 %	0 %	384503859
4523	NC_017300	GTC	2	6	269708	269713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503859
4524	NC_017300	G	6	6	269738	269743	0 %	0 %	100 %	0 %	384503859
4525	NC_017300	CTG	2	6	269772	269777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503859
4526	NC_017300	CTG	2	6	269883	269888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503859
4527	NC_017300	CGGGG	2	10	269931	269940	0 %	0 %	80 %	20 %	384503859
4528	NC_017300	TGG	2	6	270037	270042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503859
4529	NC_017300	GAT	2	6	270125	270130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503859
4530	NC_017300	CCG	2	6	270144	270149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503859
4531	NC_017300	T	6	6	270155	270160	0 %	100 %	0 %	0 %	384503859
4532	NC_017300	ATT	2	6	270170	270175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503859
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4534	NC_017300	CCA	2	6	270354	270359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503859
4535	NC_017300	TGG	2	6	270408	270413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503859
4536	NC_017300	GAACCA	2	12	270467	270478	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384503859
4537	NC_017300	CGG	3	9	270637	270645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503860
4538	NC_017300	AAT	2	6	270728	270733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384503860
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4540	NC_017300	ACA	2	6	270787	270792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384503860
4541	NC_017300	CGG	2	6	270827	270832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503860
4542	NC_017300	TGC	2	6	270850	270855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503860
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4544	NC_017300	TCC	2	6	270894	270899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503860
4545	NC_017300	ATG	2	6	270904	270909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503860
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4549	NC_017300	CTT	2	6	271067	271072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503860
4550	NC_017300	GAC	2	6	271157	271162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503860
4551	NC_017300	CGA	2	6	271184	271189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503860
4552	NC_017300	GAG	2	6	271227	271232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503860
4553	NC_017300	TGGATA	2	12	271310	271321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503860
4554	NC_017300	CGG	2	6	271334	271339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503860
4555	NC_017300	TTCT	2	8	271392	271399	0 %	75 %	0 %	25 %	384503860
4556	NC_017300	ATG	2	6	271411	271416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503860
4557	NC_017300	TC	3	6	271448	271453	0 %	50 %	0 %	50 %	384503860
4558	NC_017300	GAG	2	6	271521	271526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384503860
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4560	NC_017300	TCA	2	6	271781	271786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503860
4561	NC_017300	GCATC	2	10	271829	271838	20 %	20 %	20 %	40 %	384503860
4562	NC_017300	G	6	6	271868	271873	0 %	0 %	100 %	0 %	384503860
4563	NC_017300	GGC	2	6	271902	271907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503860
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4565	NC_017300	ACG	2	6	271993	271998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503860
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4567	NC_017300	CAGA	2	8	272055	272062	50 %	0 %	25 %	25 %	384503860
4568	NC_017300	TGGC	2	8	272171	272178	0 %	25 %	50 %	25 %	384503860
4569	NC_017300	GTG	2	6	272224	272229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384503860
4570	NC_017300	GTA	2	6	272265	272270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503860
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4572	NC_017300	CGT	2	6	272739	272744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503861
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4575	NC_017300	GCA	2	6	272886	272891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503861
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4588	NC_017300	TTG	2	6	273589	273594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503861
4589	NC_017300	G	6	6	273641	273646	0 %	0 %	100 %	0 %	384503861
4590	NC_017300	GCT	2	6	273731	273736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503861
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4594	NC_017300	TGA	2	6	273860	273865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503861
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4600	NC_017300	CTTCT	2	10	274186	274195	0 %	60 %	0 %	40 %	384503862
4601	NC_017300	TCG	2	6	274196	274201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503862
4602	NC_017300	CGG	2	6	274234	274239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503862
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4604	NC_017300	AGGA	2	8	274669	274676	50 %	0 %	50 %	0 %	384503862
4605	NC_017300	TACC	2	8	274697	274704	25 %	25 %	0 %	50 %	384503862
4606	NC_017300	GGCAGC	2	12	274715	274726	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384503862
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4609	NC_017300	GGTC	2	8	274859	274866	0 %	25 %	50 %	25 %	384503863
4610	NC_017300	ACC	2	6	274913	274918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384503863
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4613	NC_017300	TGT	2	6	274995	275000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503863
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4615	NC_017300	TGA	2	6	275209	275214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503863
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4621	NC_017300	GCG	2	6	275556	275561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503863
4622	NC_017300	CGG	2	6	275595	275600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503863
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4741	NC_017300	CGG	2	6	281042	281047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503870
4742	NC_017300	CCT	2	6	281105	281110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384503870
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4747	NC_017300	AGT	2	6	281323	281328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503871
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4862	NC_017300	GAC	3	9	287704	287712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503879
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4983	NC_017300	GTAG	2	8	293331	293338	25 %	25 %	50 %	0 %	384503882
4984	NC_017300	GCTT	2	8	293426	293433	0 %	50 %	25 %	25 %	384503883
4985	NC_017300	TGT	2	6	293448	293453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384503883
4986	NC_017300	ATT	2	6	293456	293461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384503883
4987	NC_017300	CGT	2	6	293525	293530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503883
4988	NC_017300	GCCG	2	8	293552	293559	0 %	0 %	50 %	50 %	384503883
4989	NC_017300	CTT	2	6	293627	293632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384503883
4990	NC_017300	GCC	2	6	293714	293719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384503883
4991	NC_017300	GGC	2	6	293930	293935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384503883
4992	NC_017300	ATG	2	6	293966	293971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384503883
4993	NC_017300	GCT	2	6	294269	294274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503883
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4995	NC_017300	TGC	2	6	294309	294314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384503883
4996	NC_017300	GAC	2	6	294350	294355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384503883
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4999	NC_017300	TCAT	2	8	294498	294505	25 %	50 %	0 %	25 %	384503883
5000	NC_017300	CAT	2	6	294593	294598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384503884

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