MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum F str. 230613 plasmid pCBF

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017298	ATTT	2	8	679	686	25 %	75 %	0 %	0 %	384463965
2	NC_017298	CTAT	2	8	756	763	25 %	50 %	0 %	25 %	384463965
3	NC_017298	TTGT	2	8	1283	1290	0 %	75 %	25 %	0 %	384463966
4	NC_017298	TAAT	2	8	1695	1702	50 %	50 %	0 %	0 %	384463967
5	NC_017298	ATAA	2	8	2243	2250	75 %	25 %	0 %	0 %	384463969
6	NC_017298	TAAT	2	8	2381	2388	50 %	50 %	0 %	0 %	384463969
7	NC_017298	AAAT	2	8	2396	2403	75 %	25 %	0 %	0 %	384463970
8	NC_017298	ATGA	2	8	3195	3202	50 %	25 %	25 %	0 %	384463971
9	NC_017298	GGCT	2	8	3353	3360	0 %	25 %	50 %	25 %	384463971
10	NC_017298	ATTA	2	8	3475	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	384463971
11	NC_017298	TTAT	3	12	4723	4734	25 %	75 %	0 %	0 %	384463973
12	NC_017298	TTTG	2	8	5183	5190	0 %	75 %	25 %	0 %	384463973
13	NC_017298	ATCT	2	8	5677	5684	25 %	50 %	0 %	25 %	384463974
14	NC_017298	CTTT	2	8	5760	5767	0 %	75 %	0 %	25 %	384463974
15	NC_017298	CTTT	2	8	5982	5989	0 %	75 %	0 %	25 %	384463974
16	NC_017298	AATA	2	8	6005	6012	75 %	25 %	0 %	0 %	384463974
17	NC_017298	TAAA	2	8	6248	6255	75 %	25 %	0 %	0 %	384463974
18	NC_017298	TTAT	2	8	6270	6277	25 %	75 %	0 %	0 %	384463974
19	NC_017298	TAAT	2	8	6517	6524	50 %	50 %	0 %	0 %	384463974
20	NC_017298	AATT	2	8	6560	6567	50 %	50 %	0 %	0 %	384463974
21	NC_017298	AATA	2	8	7577	7584	75 %	25 %	0 %	0 %	384463976
22	NC_017298	ATCT	2	8	8257	8264	25 %	50 %	0 %	25 %	384463977
23	NC_017298	TACA	2	8	8554	8561	50 %	25 %	0 %	25 %	384463978
24	NC_017298	TAAA	2	8	9092	9099	75 %	25 %	0 %	0 %	384463978
25	NC_017298	AGTA	2	8	9460	9467	50 %	25 %	25 %	0 %	384463979
26	NC_017298	ACTG	2	8	9565	9572	25 %	25 %	25 %	25 %	384463979
27	NC_017298	ATAA	2	8	9920	9927	75 %	25 %	0 %	0 %	384463980
28	NC_017298	TAAT	2	8	10032	10039	50 %	50 %	0 %	0 %	384463981
29	NC_017298	GCTT	2	8	10113	10120	0 %	50 %	25 %	25 %	384463981
30	NC_017298	AATA	2	8	10178	10185	75 %	25 %	0 %	0 %	384463981
31	NC_017298	ATTT	2	8	10343	10350	25 %	75 %	0 %	0 %	384463982
32	NC_017298	TTCA	2	8	10428	10435	25 %	50 %	0 %	25 %	384463982
33	NC_017298	ATCT	2	8	10499	10506	25 %	50 %	0 %	25 %	384463982
34	NC_017298	TTTA	2	8	11269	11276	25 %	75 %	0 %	0 %	384463984
35	NC_017298	CTAT	2	8	11963	11970	25 %	50 %	0 %	25 %	384463984
36	NC_017298	ATTT	2	8	12366	12373	25 %	75 %	0 %	0 %	384463984
37	NC_017298	ACTG	2	8	12539	12546	25 %	25 %	25 %	25 %	384463984
38	NC_017298	ATAC	2	8	12879	12886	50 %	25 %	0 %	25 %	384463985
39	NC_017298	AATT	2	8	13525	13532	50 %	50 %	0 %	0 %	384463985
40	NC_017298	CTAT	2	8	13848	13855	25 %	50 %	0 %	25 %	384463986
41	NC_017298	TTTA	2	8	14216	14223	25 %	75 %	0 %	0 %	384463986
42	NC_017298	ATTT	2	8	14276	14283	25 %	75 %	0 %	0 %	384463986
43	NC_017298	ATTT	2	8	14519	14526	25 %	75 %	0 %	0 %	384463986
44	NC_017298	TCCC	2	8	15156	15163	0 %	25 %	0 %	75 %	384463987
45	NC_017298	TACC	2	8	15233	15240	25 %	25 %	0 %	50 %	384463987
46	NC_017298	ATTC	2	8	15372	15379	25 %	50 %	0 %	25 %	384463987
47	NC_017298	GCTC	2	8	15395	15402	0 %	25 %	25 %	50 %	384463987
48	NC_017298	TAAA	2	8	15657	15664	75 %	25 %	0 %	0 %	384463987
49	NC_017298	TATT	2	8	15735	15742	25 %	75 %	0 %	0 %	384463987
50	NC_017298	TTAT	2	8	16205	16212	25 %	75 %	0 %	0 %	384463987
51	NC_017298	CTAT	2	8	16502	16509	25 %	50 %	0 %	25 %	384463987
52	NC_017298	TAAA	2	8	16672	16679	75 %	25 %	0 %	0 %	384463987
53	NC_017298	TAAA	2	8	17133	17140	75 %	25 %	0 %	0 %	384463987
54	NC_017298	CCTT	2	8	17222	17229	0 %	50 %	0 %	50 %	384463987

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.