MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 EA2018plasmid

Total Repeats: 3817

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017296	TGAATT	2	12	50015	50026	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384456589
1003	NC_017296	CTA	2	6	50118	50123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456589
1004	NC_017296	TTTC	2	8	50177	50184	0 %	75 %	0 %	25 %	384456589
1005	NC_017296	ATT	2	6	50255	50260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456589
1006	NC_017296	AAG	2	6	50261	50266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456589
1007	NC_017296	CTTT	2	8	50267	50274	0 %	75 %	0 %	25 %	384456589
1008	NC_017296	TCT	2	6	50356	50361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456589
1009	NC_017296	ATCT	2	8	50367	50374	25 %	50 %	0 %	25 %	384456589
1010	NC_017296	AT	3	6	50376	50381	50 %	50 %	0 %	0 %	384456589
1011	NC_017296	CAA	2	6	50385	50390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384456589
1012	NC_017296	GAA	2	6	50412	50417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456589
1013	NC_017296	CCAA	2	8	50476	50483	50 %	0 %	0 %	50 %	384456589
1014	NC_017296	T	6	6	50555	50560	0 %	100 %	0 %	0 %	384456589
1015	NC_017296	TAA	2	6	50577	50582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456589
1016	NC_017296	ATAA	2	8	50822	50829	75 %	25 %	0 %	0 %	384456590
1017	NC_017296	A	7	7	50923	50929	100 %	0 %	0 %	0 %	384456590
1018	NC_017296	GCA	2	6	50934	50939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456590
1019	NC_017296	GAA	2	6	50966	50971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456590
1020	NC_017296	A	6	6	51028	51033	100 %	0 %	0 %	0 %	384456590
1021	NC_017296	TGG	2	6	51058	51063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384456590
1022	NC_017296	TTA	2	6	51094	51099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456590
1023	NC_017296	AAG	2	6	51120	51125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456590
1024	NC_017296	ATG	2	6	51189	51194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456590
1025	NC_017296	AAT	2	6	51229	51234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456590
1026	NC_017296	GGA	2	6	51272	51277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456590
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1028	NC_017296	CAAAGG	2	12	51348	51359	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384456590
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1030	NC_017296	AT	4	8	51438	51445	50 %	50 %	0 %	0 %	384456590
1031	NC_017296	A	6	6	51511	51516	100 %	0 %	0 %	0 %	384456590
1032	NC_017296	GCA	2	6	51518	51523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456590
1033	NC_017296	GAC	2	6	51536	51541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456590
1034	NC_017296	AGC	2	6	51548	51553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456590
1035	NC_017296	TA	3	6	51566	51571	50 %	50 %	0 %	0 %	384456590
1036	NC_017296	TGA	2	6	51586	51591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456590
1037	NC_017296	ATG	2	6	51669	51674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456590
1038	NC_017296	TTTA	2	8	51682	51689	25 %	75 %	0 %	0 %	384456590
1039	NC_017296	TAA	2	6	51691	51696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456590
1040	NC_017296	AGG	2	6	51715	51720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456590
1041	NC_017296	AG	3	6	51733	51738	50 %	0 %	50 %	0 %	384456590
1042	NC_017296	GAAT	2	8	51747	51754	50 %	25 %	25 %	0 %	384456590
1043	NC_017296	AGA	2	6	51805	51810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456590
1044	NC_017296	GAT	2	6	51811	51816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456590
1045	NC_017296	T	6	6	51847	51852	0 %	100 %	0 %	0 %	384456590
1046	NC_017296	A	7	7	51888	51894	100 %	0 %	0 %	0 %	384456590
1047	NC_017296	ATA	2	6	51990	51995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456590
1048	NC_017296	A	6	6	52052	52057	100 %	0 %	0 %	0 %	384456590
1049	NC_017296	TGA	2	6	52174	52179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456590
1050	NC_017296	AAT	2	6	52196	52201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456590
1051	NC_017296	GA	3	6	52228	52233	50 %	0 %	50 %	0 %	384456590
1052	NC_017296	TA	3	6	52242	52247	50 %	50 %	0 %	0 %	384456590
1053	NC_017296	AT	3	6	52251	52256	50 %	50 %	0 %	0 %	384456590
1054	NC_017296	AT	4	8	52372	52379	50 %	50 %	0 %	0 %	384456591
1055	NC_017296	TTTTC	2	10	52380	52389	0 %	80 %	0 %	20 %	384456591
1056	NC_017296	T	6	6	52390	52395	0 %	100 %	0 %	0 %	384456591
1057	NC_017296	TA	3	6	52406	52411	50 %	50 %	0 %	0 %	384456591
1058	NC_017296	CAG	2	6	52418	52423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456591
1059	NC_017296	CAG	2	6	52430	52435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456591
1060	NC_017296	GCTT	2	8	52465	52472	0 %	50 %	25 %	25 %	384456591
1061	NC_017296	TA	3	6	52484	52489	50 %	50 %	0 %	0 %	384456591
1062	NC_017296	CCAG	2	8	52491	52498	25 %	0 %	25 %	50 %	384456591
1063	NC_017296	AT	3	6	52515	52520	50 %	50 %	0 %	0 %	384456591
1064	NC_017296	TGCT	2	8	52526	52533	0 %	50 %	25 %	25 %	384456591
1065	NC_017296	TTAG	2	8	52534	52541	25 %	50 %	25 %	0 %	384456591
1066	NC_017296	TA	3	6	52613	52618	50 %	50 %	0 %	0 %	384456591
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1069	NC_017296	AT	3	6	52712	52717	50 %	50 %	0 %	0 %	384456591
1070	NC_017296	TCT	2	6	52732	52737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456591
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1072	NC_017296	GCC	2	6	52803	52808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384456591
1073	NC_017296	TCA	2	6	52813	52818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456591
1074	NC_017296	TTCTT	2	10	52920	52929	0 %	80 %	0 %	20 %	384456591
1075	NC_017296	TA	3	6	52947	52952	50 %	50 %	0 %	0 %	384456591
1076	NC_017296	T	7	7	52968	52974	0 %	100 %	0 %	0 %	384456591
1077	NC_017296	T	6	6	53019	53024	0 %	100 %	0 %	0 %	384456591
1078	NC_017296	ATT	2	6	53026	53031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456591
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1082	NC_017296	TTTA	2	8	53212	53219	25 %	75 %	0 %	0 %	384456592
1083	NC_017296	TTC	2	6	53223	53228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456592
1084	NC_017296	T	6	6	53241	53246	0 %	100 %	0 %	0 %	384456592
1085	NC_017296	GCT	2	6	53359	53364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456592
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1087	NC_017296	TTC	2	6	53461	53466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456592
1088	NC_017296	TTATT	2	10	53469	53478	20 %	80 %	0 %	0 %	384456592
1089	NC_017296	TAAG	2	8	53638	53645	50 %	25 %	25 %	0 %	384456593
1090	NC_017296	AT	3	6	53726	53731	50 %	50 %	0 %	0 %	384456593
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1092	NC_017296	TGAGT	2	10	53804	53813	20 %	40 %	40 %	0 %	384456593
1093	NC_017296	GCT	2	6	53993	53998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456593
1094	NC_017296	TAT	2	6	54013	54018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456593
1095	NC_017296	ATTA	2	8	54028	54035	50 %	50 %	0 %	0 %	384456593
1096	NC_017296	CTG	2	6	54067	54072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456593
1097	NC_017296	CAATC	2	10	54084	54093	40 %	20 %	0 %	40 %	384456593
1098	NC_017296	AAG	2	6	54132	54137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456593
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1100	NC_017296	CAA	2	6	54168	54173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384456593
1101	NC_017296	GCT	2	6	54267	54272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456593
1102	NC_017296	AGC	2	6	54490	54495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456593
1103	NC_017296	ATA	2	6	54581	54586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456593
1104	NC_017296	T	7	7	54635	54641	0 %	100 %	0 %	0 %	384456594
1105	NC_017296	TAA	2	6	54669	54674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456594
1106	NC_017296	CAT	2	6	54780	54785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456594
1107	NC_017296	ATT	2	6	54853	54858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456594
1108	NC_017296	GCA	2	6	54863	54868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456594
1109	NC_017296	AGT	2	6	54889	54894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456594
1110	NC_017296	GCT	2	6	55013	55018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456594
1111	NC_017296	ATC	2	6	55075	55080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456594
1112	NC_017296	CTT	2	6	55099	55104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456594
1113	NC_017296	ATT	2	6	55225	55230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456594
1114	NC_017296	ACA	2	6	55250	55255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384456594
1115	NC_017296	AGA	2	6	55262	55267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456594
1116	NC_017296	T	6	6	55357	55362	0 %	100 %	0 %	0 %	384456594
1117	NC_017296	TGT	2	6	55757	55762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456595
1118	NC_017296	TAGCAA	2	12	55769	55780	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384456595
1119	NC_017296	ATTT	2	8	55816	55823	25 %	75 %	0 %	0 %	384456595
1120	NC_017296	ATG	2	6	55847	55852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456595
1121	NC_017296	A	7	7	55911	55917	100 %	0 %	0 %	0 %	384456595
1122	NC_017296	TA	3	6	55919	55924	50 %	50 %	0 %	0 %	384456595
1123	NC_017296	AGAA	2	8	55932	55939	75 %	0 %	25 %	0 %	384456595
1124	NC_017296	AAT	2	6	55947	55952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456595
1125	NC_017296	TGG	2	6	55968	55973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384456595
1126	NC_017296	GT	3	6	56009	56014	0 %	50 %	50 %	0 %	384456595
1127	NC_017296	TAG	2	6	56057	56062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456595
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