MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 chromosome

Total Repeats: 50807

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017295	ATA	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
2	NC_017295	TAA	3	9	651	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
3	NC_017295	ATA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
4	NC_017295	ACT	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456719
5	NC_017295	GAA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456719
6	NC_017295	TTC	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456719
7	NC_017295	TGC	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456719
8	NC_017295	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456719
9	NC_017295	GGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456719
10	NC_017295	ATA	2	6	969	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
11	NC_017295	TCT	2	6	1001	1006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456719
12	NC_017295	GAC	2	6	1043	1048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456719
13	NC_017295	TGA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456719
14	NC_017295	AAG	2	6	1137	1142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456719
15	NC_017295	ACC	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384456719
16	NC_017295	GGA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456719
17	NC_017295	GGA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456719
18	NC_017295	TCT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456719
19	NC_017295	AGA	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456719
20	NC_017295	TGA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456719
21	NC_017295	ATA	2	6	1804	1809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
22	NC_017295	AAG	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
23	NC_017295	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456720
24	NC_017295	CAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384456720
25	NC_017295	AGA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
26	NC_017295	GTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456720
27	NC_017295	AAT	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
28	NC_017295	AAT	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
29	NC_017295	TAA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
30	NC_017295	AAG	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
31	NC_017295	TTA	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456720
32	NC_017295	GAT	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456720
33	NC_017295	ATA	2	6	2748	2753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
34	NC_017295	ACT	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456720
35	NC_017295	AAT	2	6	2792	2797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
36	NC_017295	GAA	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
37	NC_017295	AGA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
38	NC_017295	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456720
39	NC_017295	AGA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
40	NC_017295	GAA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
41	NC_017295	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456720
42	NC_017295	ATG	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456720
43	NC_017295	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456721
44	NC_017295	TTA	2	6	3442	3447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456722
45	NC_017295	ATA	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
46	NC_017295	TAA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
47	NC_017295	AAT	2	6	3537	3542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
48	NC_017295	TTA	2	6	3625	3630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456722
49	NC_017295	GTT	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456722
50	NC_017295	AGA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456722
51	NC_017295	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456722
52	NC_017295	ATA	2	6	3907	3912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
53	NC_017295	ATG	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456722
54	NC_017295	AGC	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456722
55	NC_017295	AGA	2	6	4148	4153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456722
56	NC_017295	ATT	2	6	4154	4159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456722
57	NC_017295	TGA	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456722
58	NC_017295	TAA	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
59	NC_017295	AGG	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456723
60	NC_017295	GTT	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456723
61	NC_017295	AGA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456723
62	NC_017295	TTG	2	6	4685	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456723
63	NC_017295	GTT	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456723
64	NC_017295	ATG	2	6	4866	4871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
65	NC_017295	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456724
66	NC_017295	GAT	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
67	NC_017295	TAA	2	6	5127	5132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456724
68	NC_017295	AGG	2	6	5185	5190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456724
69	NC_017295	TGT	2	6	5212	5217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456724
70	NC_017295	TGA	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
71	NC_017295	TGA	2	6	5464	5469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
72	NC_017295	ATT	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456724
73	NC_017295	ATG	2	6	5625	5630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
74	NC_017295	TAA	2	6	5659	5664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456724
75	NC_017295	CAG	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456724
76	NC_017295	TTG	2	6	5892	5897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456724
77	NC_017295	ATA	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456724
78	NC_017295	GAA	2	6	5933	5938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456724
79	NC_017295	TAG	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
80	NC_017295	GCT	2	6	5999	6004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456724
81	NC_017295	AGA	2	6	6026	6031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456724
82	NC_017295	TCA	2	6	6080	6085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456724
83	NC_017295	GAA	2	6	6153	6158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456724
84	NC_017295	AAT	2	6	6196	6201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456724
85	NC_017295	TGG	2	6	6271	6276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384456724
86	NC_017295	ATT	2	6	6323	6328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456724
87	NC_017295	TTC	2	6	6383	6388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456724
88	NC_017295	GCC	2	6	6439	6444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384456724
89	NC_017295	AGA	2	6	6502	6507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456724
90	NC_017295	TGG	2	6	6523	6528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384456724
91	NC_017295	TAA	2	6	6627	6632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456724
92	NC_017295	GCA	2	6	6656	6661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456724
93	NC_017295	AAG	2	6	6703	6708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456724
94	NC_017295	AGA	2	6	6718	6723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456724
95	NC_017295	CTA	2	6	6729	6734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456724
96	NC_017295	ATC	2	6	7009	7014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456725
97	NC_017295	TTC	2	6	7025	7030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456725
98	NC_017295	GTT	2	6	7083	7088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456725
99	NC_017295	CTG	3	9	7126	7134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456725
100	NC_017295	GAA	2	6	7233	7238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456725
101	NC_017295	GTT	2	6	7248	7253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456725
102	NC_017295	ACC	2	6	7325	7330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384456725
103	NC_017295	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384456725
104	NC_017295	CAG	2	6	7435	7440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456725
105	NC_017295	AAT	3	9	7442	7450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456725
106	NC_017295	TAG	2	6	7594	7599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456725
107	NC_017295	ATA	2	6	7719	7724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456725
108	NC_017295	GCA	2	6	7829	7834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456725
109	NC_017295	AAG	3	9	7862	7870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456725
110	NC_017295	TAA	2	6	7954	7959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456725
111	NC_017295	TAA	2	6	7963	7968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456725
112	NC_017295	AGA	2	6	8096	8101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456725
113	NC_017295	TGA	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456725
114	NC_017295	AAT	2	6	8174	8179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456725
115	NC_017295	TGA	2	6	8216	8221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456725
116	NC_017295	GAA	2	6	8280	8285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456725
117	NC_017295	TGT	2	6	8288	8293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456725
118	NC_017295	ACA	2	6	8385	8390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384456725
119	NC_017295	AGA	2	6	8393	8398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456725
120	NC_017295	TTG	2	6	8404	8409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456725
121	NC_017295	ATA	3	9	8434	8442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456725
122	NC_017295	GAA	2	6	8464	8469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456725
123	NC_017295	AGC	2	6	8510	8515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456725
124	NC_017295	TGT	2	6	8528	8533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456725
125	NC_017295	TGA	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456725
126	NC_017295	CTT	2	6	8606	8611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456725
127	NC_017295	AAT	2	6	8633	8638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456725
128	NC_017295	AGA	2	6	8641	8646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456725
129	NC_017295	TGT	2	6	8648	8653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456725
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131	NC_017295	TGA	3	9	8744	8752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456725
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