MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Yit

Total Repeats: 819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017294	TATAAA	2	12	2068	2079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455127
2	NC_017294	ATGATA	2	12	2987	2998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384455128
3	NC_017294	AAATAT	2	12	3411	3422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455128
4	NC_017294	TAATGG	2	12	4472	4483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455130
5	NC_017294	AATAAA	2	12	4760	4771	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384455130
6	NC_017294	AAATAT	2	12	10969	10980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455134
7	NC_017294	GATTTT	2	12	11105	11116	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384455134
8	NC_017294	AAATTT	2	12	12806	12817	50 %	50 %	0 %	0 %	384455135
9	NC_017294	CCTTAT	2	12	13670	13681	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384455135
10	NC_017294	TGAATT	2	12	15460	15471	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455135
11	NC_017294	TAAGAA	2	12	15760	15771	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455135
12	NC_017294	AATGGA	2	12	15875	15886	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384455135
13	NC_017294	ATGAGG	2	12	16631	16642	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384455136
14	NC_017294	TATGAT	2	12	19132	19143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455136
15	NC_017294	TATCTG	2	12	19169	19180	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384455136
16	NC_017294	ATATAA	2	12	21034	21045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455138
17	NC_017294	TGATAT	2	12	29983	29994	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455145
18	NC_017294	ATAACT	2	12	31311	31322	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384455148
19	NC_017294	TATAAA	2	12	31706	31717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455149
20	NC_017294	TTAAGT	2	12	32458	32469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455149
21	NC_017294	TATAAA	2	12	33194	33205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455150
22	NC_017294	AGAGGA	2	12	33846	33857	50 %	0 %	50 %	0 %	384455150
23	NC_017294	AGATTT	2	12	36007	36018	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455153
24	NC_017294	AAGGAT	2	12	39042	39053	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384455155
25	NC_017294	TTTATT	2	12	56626	56637	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384455164
26	NC_017294	TTTAAT	2	12	56650	56661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455164
27	NC_017294	TTAATT	2	12	56709	56720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455164
28	NC_017294	ATTTAA	2	12	57067	57078	50 %	50 %	0 %	0 %	384455164
29	NC_017294	GTCTCC	2	12	60315	60326	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384455168
30	NC_017294	AATTTA	2	12	61179	61190	50 %	50 %	0 %	0 %	384455169
31	NC_017294	AATAAG	2	12	61433	61444	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455169
32	NC_017294	ATTATA	2	12	64455	64466	50 %	50 %	0 %	0 %	384455171
33	NC_017294	GTTCAT	2	12	67697	67708	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384455174
34	NC_017294	TATAAA	2	12	78297	78308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455186
35	NC_017294	CATATA	2	12	78682	78693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384455187
36	NC_017294	TATAAA	2	12	81302	81313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455191
37	NC_017294	TAGAGA	2	12	81513	81524	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384455191
38	NC_017294	TTACCT	2	12	81818	81829	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384455191
39	NC_017294	ATAATT	2	12	81876	81887	50 %	50 %	0 %	0 %	384455191
40	NC_017294	TAATGA	2	12	85517	85528	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384455194
41	NC_017294	TTAATA	2	12	89297	89308	50 %	50 %	0 %	0 %	384455196
42	NC_017294	TCTGGA	2	12	91371	91382	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384455197
43	NC_017294	ATGAAA	2	12	93446	93457	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455198
44	NC_017294	GATTTG	2	12	94522	94533	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384455199
45	NC_017294	AGATAA	2	12	96055	96066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455200
46	NC_017294	GATAGT	2	12	103054	103065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455206
47	NC_017294	TAAATT	2	12	103227	103238	50 %	50 %	0 %	0 %	384455206
48	NC_017294	ATGTTA	2	12	107070	107081	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455207
49	NC_017294	CTTTTT	2	12	112381	112392	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384455210
50	NC_017294	TAGAAA	2	12	112757	112768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455211
51	NC_017294	TAGATA	2	12	113581	113592	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384455211
52	NC_017294	AAAGAA	2	12	114291	114302	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384455212
53	NC_017294	AGTACA	2	12	123200	123211	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384455222
54	NC_017294	AGGATA	2	12	127195	127206	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384455224
55	NC_017294	TGAAAT	2	12	129173	129184	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384455227
56	NC_017294	TTTGGA	2	12	134543	134554	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384455234
57	NC_017294	GCTAAA	2	12	136682	136693	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384455236
58	NC_017294	TGAGTT	2	12	137162	137173	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384455237
59	NC_017294	TAAATT	2	12	138066	138077	50 %	50 %	0 %	0 %	384455238
60	NC_017294	GTACAA	2	12	138733	138744	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384455239
61	NC_017294	AGGTAC	2	12	140256	140267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384455242
62	NC_017294	GATAAG	2	12	147123	147134	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384455248
63	NC_017294	AAAGCT	2	12	147633	147644	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384455248
64	NC_017294	ATTAAT	2	12	148188	148199	50 %	50 %	0 %	0 %	384455250
65	NC_017294	TAAAAA	2	12	154249	154260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384455256
66	NC_017294	TTTTAA	2	12	155837	155848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455260
67	NC_017294	ATTGAA	2	12	157143	157154	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384455261
68	NC_017294	AATTTA	2	12	157176	157187	50 %	50 %	0 %	0 %	384455261
69	NC_017294	AATTTA	2	12	160004	160015	50 %	50 %	0 %	0 %	384455263
70	NC_017294	ATAAAA	2	12	161125	161136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384455263
71	NC_017294	TTTATT	2	12	161824	161835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384455264
72	NC_017294	ATTTAT	2	12	167875	167886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455269
73	NC_017294	ATTTTG	2	12	172388	172399	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384455274
74	NC_017294	TTTAAT	2	12	176374	176385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455278
75	NC_017294	TTGATT	2	12	180000	180011	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384455281
76	NC_017294	AAATAT	2	12	180667	180678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455282
77	NC_017294	ATATTT	2	12	183741	183752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455285
78	NC_017294	ATTTTT	2	12	184161	184172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384455286
79	NC_017294	GTATTT	2	12	189703	189714	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384455287
80	NC_017294	TAATTA	2	12	190169	190180	50 %	50 %	0 %	0 %	384455287
81	NC_017294	TAAAAA	2	12	190218	190229	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384455287
82	NC_017294	TTTTAA	2	12	193402	193413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455290
83	NC_017294	TACTTT	2	12	195323	195334	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384455293
84	NC_017294	TTAAAT	2	12	205030	205041	50 %	50 %	0 %	0 %	384455297
85	NC_017294	TCCAAC	2	12	208335	208346	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384455299
86	NC_017294	GGAATT	2	12	209241	209252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455300
87	NC_017294	ACAAAG	2	12	214111	214122	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384455304
88	NC_017294	ATTGAT	2	12	214284	214295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455304
89	NC_017294	ATTTCT	2	12	214719	214730	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384455305
90	NC_017294	TAAAGA	2	12	216266	216277	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455308
91	NC_017294	GACCAG	2	12	221364	221375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384455310
92	NC_017294	GAATTT	2	12	221905	221916	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455310
93	NC_017294	ATTAAC	2	12	222970	222981	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384455310
94	NC_017294	AGAAGG	2	12	226575	226586	50 %	0 %	50 %	0 %	384455311
95	NC_017294	TTTATA	2	12	227552	227563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455313
96	NC_017294	AATGGT	2	12	228500	228511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455314
97	NC_017294	CCAGGA	2	12	229464	229475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384455315
98	NC_017294	TGATAG	2	12	230183	230194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455315
99	NC_017294	TATGAA	2	12	231725	231736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384455316
100	NC_017294	AATAAG	2	12	232209	232220	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455316
101	NC_017294	TATATT	2	12	235438	235449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455319
102	NC_017294	ATTTAG	2	12	243177	243188	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455327
103	NC_017294	GAGGAT	2	12	245083	245094	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384455329
104	NC_017294	CAGGTA	2	12	245552	245563	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384455329
105	NC_017294	AATTTA	2	12	246369	246380	50 %	50 %	0 %	0 %	384455330
106	NC_017294	TGAGAT	2	12	246530	246541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455330
107	NC_017294	TTTCAT	2	12	249402	249413	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384455331
108	NC_017294	TAGTGG	2	12	253368	253379	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384455335
109	NC_017294	TATATT	2	12	255532	255543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384455336
110	NC_017294	ATAAGA	2	12	270197	270208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384455349
111	NC_017294	TTGAGA	2	12	271716	271727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455350
112	NC_017294	TTAAGG	2	12	272064	272075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455350
113	NC_017294	TATAAT	2	12	274860	274871	50 %	50 %	0 %	0 %	384455351
114	NC_017294	TTAAAA	2	12	276675	276686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384455353
115	NC_017294	TTTATT	2	12	277182	277193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384455354
116	NC_017294	AAAATA	2	12	277358	277369	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384455354
117	NC_017294	ATTTTG	2	12	278404	278415	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384455355
118	NC_017294	ACTTGC	2	12	279694	279705	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384455356
119	NC_017294	ATATGG	2	12	282352	282363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384455359
120	NC_017294	ATTTAA	2	12	283898	283909	50 %	50 %	0 %	0 %	384455360
121	NC_017294	GATTTA	2	12	285720	285731	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384455362
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351	NC_017294	CCAGAT	2	12	769146	769157	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384455806
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469	NC_017294	TCTAAT	2	12	992862	992873	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384456002
470	NC_017294	AAATCC	2	12	993765	993776	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384456003
471	NC_017294	ATTTTT	2	12	996309	996320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384456005
472	NC_017294	TATACC	2	12	996608	996619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456005
473	NC_017294	ATTTAA	2	12	1000057	1000068	50 %	50 %	0 %	0 %	384456008
474	NC_017294	CATCCA	2	12	1001065	1001076	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384456010
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477	NC_017294	CTGATT	2	12	1004236	1004247	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384456014
478	NC_017294	TAGAAT	2	12	1005102	1005113	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456015
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495	NC_017294	CTCAGA	2	12	1037594	1037605	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384456055
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499	NC_017294	AATTAA	2	12	1042440	1042451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456061
500	NC_017294	CCAAAT	2	12	1042807	1042818	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384456061

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