MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCVAL chromosome

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017293	GC	3	6	1790	1795	0 %	0 %	50 %	50 %	409191059
2	NC_017293	AT	3	6	1885	1890	50 %	50 %	0 %	0 %	409191059
3	NC_017293	CG	4	8	5244	5251	0 %	0 %	50 %	50 %	409191061
4	NC_017293	CG	3	6	6232	6237	0 %	0 %	50 %	50 %	409191063
5	NC_017293	CT	3	6	7257	7262	0 %	50 %	0 %	50 %	409191064
6	NC_017293	CT	3	6	7921	7926	0 %	50 %	0 %	50 %	409191064
7	NC_017293	GC	3	6	9720	9725	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
8	NC_017293	GC	3	6	9728	9733	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
9	NC_017293	CA	4	8	9878	9885	50 %	0 %	0 %	50 %	409191065
10	NC_017293	GC	3	6	10353	10358	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
11	NC_017293	CG	3	6	10387	10392	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
12	NC_017293	GC	3	6	10486	10491	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
13	NC_017293	GC	3	6	10537	10542	0 %	0 %	50 %	50 %	409191065
14	NC_017293	TG	3	6	11223	11228	0 %	50 %	50 %	0 %	409191066
15	NC_017293	CG	3	6	12116	12121	0 %	0 %	50 %	50 %	409191067
16	NC_017293	CA	3	6	13663	13668	50 %	0 %	0 %	50 %	409191068
17	NC_017293	TG	3	6	14000	14005	0 %	50 %	50 %	0 %	409191069
18	NC_017293	CG	3	6	14173	14178	0 %	0 %	50 %	50 %	409191070
19	NC_017293	TA	3	6	14534	14539	50 %	50 %	0 %	0 %	409191070
20	NC_017293	GA	3	6	14820	14825	50 %	0 %	50 %	0 %	409191070
21	NC_017293	AG	3	6	15139	15144	50 %	0 %	50 %	0 %	409191071
22	NC_017293	GC	3	6	16823	16828	0 %	0 %	50 %	50 %	409191072
23	NC_017293	GC	3	6	16878	16883	0 %	0 %	50 %	50 %	409191072
24	NC_017293	TC	3	6	17966	17971	0 %	50 %	0 %	50 %	409191072
25	NC_017293	TG	3	6	18091	18096	0 %	50 %	50 %	0 %	409191072
26	NC_017293	CG	3	6	18624	18629	0 %	0 %	50 %	50 %	409191074
27	NC_017293	GC	3	6	18649	18654	0 %	0 %	50 %	50 %	409191074
28	NC_017293	AG	3	6	19242	19247	50 %	0 %	50 %	0 %	409191074
29	NC_017293	GC	3	6	20261	20266	0 %	0 %	50 %	50 %	409191074
30	NC_017293	GC	3	6	20914	20919	0 %	0 %	50 %	50 %	409191074
31	NC_017293	CG	4	8	21444	21451	0 %	0 %	50 %	50 %	409191074
32	NC_017293	CG	4	8	22285	22292	0 %	0 %	50 %	50 %	409191075
33	NC_017293	TG	3	6	22658	22663	0 %	50 %	50 %	0 %	409191075
34	NC_017293	TA	3	6	22707	22712	50 %	50 %	0 %	0 %	409191075
35	NC_017293	GC	3	6	22762	22767	0 %	0 %	50 %	50 %	409191075
36	NC_017293	CA	3	6	23041	23046	50 %	0 %	0 %	50 %	409191075
37	NC_017293	CT	3	6	23094	23099	0 %	50 %	0 %	50 %	409191075
38	NC_017293	GC	3	6	23107	23112	0 %	0 %	50 %	50 %	409191075
39	NC_017293	GC	3	6	23216	23221	0 %	0 %	50 %	50 %	409191075
40	NC_017293	TG	3	6	24388	24393	0 %	50 %	50 %	0 %	409191076
41	NC_017293	GA	3	6	25490	25495	50 %	0 %	50 %	0 %	409191077
42	NC_017293	TC	3	6	26183	26188	0 %	50 %	0 %	50 %	409191078
43	NC_017293	GT	3	6	36257	36262	0 %	50 %	50 %	0 %	409191081
44	NC_017293	AC	3	6	36293	36298	50 %	0 %	0 %	50 %	409191081
45	NC_017293	GC	3	6	36518	36523	0 %	0 %	50 %	50 %	409191081
46	NC_017293	GT	3	6	36648	36653	0 %	50 %	50 %	0 %	409191081
47	NC_017293	CG	3	6	39024	39029	0 %	0 %	50 %	50 %	409191083
48	NC_017293	AT	3	6	39328	39333	50 %	50 %	0 %	0 %	409191083
49	NC_017293	GT	3	6	39343	39348	0 %	50 %	50 %	0 %	409191083
50	NC_017293	CG	4	8	40078	40085	0 %	0 %	50 %	50 %	409191083
51	NC_017293	CG	3	6	40511	40516	0 %	0 %	50 %	50 %	409191084
52	NC_017293	GC	3	6	40976	40981	0 %	0 %	50 %	50 %	409191084
53	NC_017293	TG	3	6	41328	41333	0 %	50 %	50 %	0 %	409191084
54	NC_017293	TG	3	6	41609	41614	0 %	50 %	50 %	0 %	409191085
55	NC_017293	TA	3	6	41635	41640	50 %	50 %	0 %	0 %	409191085
56	NC_017293	CG	3	6	41773	41778	0 %	0 %	50 %	50 %	409191085
57	NC_017293	CA	3	6	42435	42440	50 %	0 %	0 %	50 %	409191085
58	NC_017293	GC	3	6	42704	42709	0 %	0 %	50 %	50 %	409191085
59	NC_017293	CA	3	6	42805	42810	50 %	0 %	0 %	50 %	409191085
60	NC_017293	CG	3	6	42933	42938	0 %	0 %	50 %	50 %	409191086
61	NC_017293	GC	3	6	43650	43655	0 %	0 %	50 %	50 %	409191088
62	NC_017293	GT	3	6	46521	46526	0 %	50 %	50 %	0 %	409191089
63	NC_017293	CG	3	6	49340	49345	0 %	0 %	50 %	50 %	409191090
64	NC_017293	CA	3	6	49613	49618	50 %	0 %	0 %	50 %	409191091
65	NC_017293	GC	3	6	49621	49626	0 %	0 %	50 %	50 %	409191091
66	NC_017293	AC	3	6	50014	50019	50 %	0 %	0 %	50 %	409191092
67	NC_017293	GC	3	6	50216	50221	0 %	0 %	50 %	50 %	409191092
68	NC_017293	CG	4	8	51319	51326	0 %	0 %	50 %	50 %	409191093
69	NC_017293	GC	3	6	51578	51583	0 %	0 %	50 %	50 %	409191093
70	NC_017293	GA	3	6	53953	53958	50 %	0 %	50 %	0 %	409191095
71	NC_017293	CT	3	6	55185	55190	0 %	50 %	0 %	50 %	409191096
72	NC_017293	CG	3	6	55431	55436	0 %	0 %	50 %	50 %	409191096
73	NC_017293	GC	3	6	55518	55523	0 %	0 %	50 %	50 %	409191096
74	NC_017293	CG	3	6	55776	55781	0 %	0 %	50 %	50 %	409191096
75	NC_017293	AC	3	6	55808	55813	50 %	0 %	0 %	50 %	409191096
76	NC_017293	GC	3	6	58885	58890	0 %	0 %	50 %	50 %	409191097
77	NC_017293	GC	3	6	58914	58919	0 %	0 %	50 %	50 %	409191097
78	NC_017293	AT	3	6	58957	58962	50 %	50 %	0 %	0 %	409191097
79	NC_017293	CA	3	6	58983	58988	50 %	0 %	0 %	50 %	409191097
80	NC_017293	GC	3	6	59276	59281	0 %	0 %	50 %	50 %	409191097
81	NC_017293	CA	3	6	60515	60520	50 %	0 %	0 %	50 %	409191098
82	NC_017293	CA	3	6	60524	60529	50 %	0 %	0 %	50 %	409191098
83	NC_017293	GC	3	6	61796	61801	0 %	0 %	50 %	50 %	409191101
84	NC_017293	GC	3	6	63164	63169	0 %	0 %	50 %	50 %	409191102
85	NC_017293	CT	3	6	64532	64537	0 %	50 %	0 %	50 %	409191104
86	NC_017293	CA	3	6	65212	65217	50 %	0 %	0 %	50 %	409191104
87	NC_017293	AT	3	6	65632	65637	50 %	50 %	0 %	0 %	409191104
88	NC_017293	CG	3	6	68811	68816	0 %	0 %	50 %	50 %	409191105
89	NC_017293	CT	3	6	69715	69720	0 %	50 %	0 %	50 %	409191105
90	NC_017293	AC	3	6	69756	69761	50 %	0 %	0 %	50 %	409191105
91	NC_017293	GC	3	6	69993	69998	0 %	0 %	50 %	50 %	409191105
92	NC_017293	CG	3	6	70403	70408	0 %	0 %	50 %	50 %	409191106
93	NC_017293	AC	3	6	71271	71276	50 %	0 %	0 %	50 %	409191106
94	NC_017293	CT	4	8	71677	71684	0 %	50 %	0 %	50 %	409191107
95	NC_017293	GC	4	8	71735	71742	0 %	0 %	50 %	50 %	409191107
96	NC_017293	CG	3	6	71745	71750	0 %	0 %	50 %	50 %	409191107
97	NC_017293	CA	3	6	71961	71966	50 %	0 %	0 %	50 %	409191107
98	NC_017293	TG	4	8	72184	72191	0 %	50 %	50 %	0 %	409191107
99	NC_017293	AT	3	6	72310	72315	50 %	50 %	0 %	0 %	409191107
100	NC_017293	GT	3	6	72597	72602	0 %	50 %	50 %	0 %	409191107
101	NC_017293	GC	3	6	73521	73526	0 %	0 %	50 %	50 %	409191108
102	NC_017293	GC	3	6	73558	73563	0 %	0 %	50 %	50 %	409191108
103	NC_017293	CA	3	6	73626	73631	50 %	0 %	0 %	50 %	409191108
104	NC_017293	CG	3	6	73754	73759	0 %	0 %	50 %	50 %	409191109
105	NC_017293	GC	3	6	74041	74046	0 %	0 %	50 %	50 %	409191109
106	NC_017293	GC	4	8	74146	74153	0 %	0 %	50 %	50 %	409191109
107	NC_017293	GC	3	6	74164	74169	0 %	0 %	50 %	50 %	409191109
108	NC_017293	GC	3	6	74376	74381	0 %	0 %	50 %	50 %	409191110
109	NC_017293	GC	4	8	74582	74589	0 %	0 %	50 %	50 %	409191110
110	NC_017293	TG	3	6	75301	75306	0 %	50 %	50 %	0 %	409191111
111	NC_017293	GC	3	6	75338	75343	0 %	0 %	50 %	50 %	409191111
112	NC_017293	GC	4	8	75655	75662	0 %	0 %	50 %	50 %	409191111
113	NC_017293	CG	3	6	76281	76286	0 %	0 %	50 %	50 %	409191112
114	NC_017293	CG	3	6	76570	76575	0 %	0 %	50 %	50 %	409191113
115	NC_017293	AC	3	6	76609	76614	50 %	0 %	0 %	50 %	409191113
116	NC_017293	CG	3	6	76672	76677	0 %	0 %	50 %	50 %	409191113
117	NC_017293	GC	3	6	77106	77111	0 %	0 %	50 %	50 %	409191114
118	NC_017293	AC	3	6	77396	77401	50 %	0 %	0 %	50 %	409191114
119	NC_017293	TG	3	6	77874	77879	0 %	50 %	50 %	0 %	409191115
120	NC_017293	CG	3	6	79127	79132	0 %	0 %	50 %	50 %	409191116
121	NC_017293	AC	3	6	80249	80254	50 %	0 %	0 %	50 %	409191119
122	NC_017293	GC	3	6	80333	80338	0 %	0 %	50 %	50 %	409191119
123	NC_017293	GC	3	6	81123	81128	0 %	0 %	50 %	50 %	409191120
124	NC_017293	CG	3	6	81448	81453	0 %	0 %	50 %	50 %	409191121
125	NC_017293	GC	3	6	81460	81465	0 %	0 %	50 %	50 %	409191121
126	NC_017293	CG	3	6	82568	82573	0 %	0 %	50 %	50 %	409191125
127	NC_017293	GC	3	6	82817	82822	0 %	0 %	50 %	50 %	409191126
128	NC_017293	CG	3	6	82839	82844	0 %	0 %	50 %	50 %	409191126
129	NC_017293	CA	3	6	83129	83134	50 %	0 %	0 %	50 %	409191127
130	NC_017293	GC	3	6	83189	83194	0 %	0 %	50 %	50 %	409191127
131	NC_017293	GC	3	6	83664	83669	0 %	0 %	50 %	50 %	409191128
132	NC_017293	GC	3	6	84579	84584	0 %	0 %	50 %	50 %	409191130
133	NC_017293	GC	3	6	84663	84668	0 %	0 %	50 %	50 %	409191131
134	NC_017293	TC	3	6	84826	84831	0 %	50 %	0 %	50 %	409191131
135	NC_017293	CT	3	6	85247	85252	0 %	50 %	0 %	50 %	409191132
136	NC_017293	GC	3	6	86056	86061	0 %	0 %	50 %	50 %	409191134
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138	NC_017293	GC	3	6	86243	86248	0 %	0 %	50 %	50 %	409191134
139	NC_017293	GC	3	6	86649	86654	0 %	0 %	50 %	50 %	409191135
140	NC_017293	CG	3	6	87124	87129	0 %	0 %	50 %	50 %	409191136
141	NC_017293	GC	3	6	88588	88593	0 %	0 %	50 %	50 %	409191139
142	NC_017293	GC	3	6	88658	88663	0 %	0 %	50 %	50 %	409191139
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.