MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCVAL chromosome

Total Repeats: 1157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017293	GCA	2	6	1867	1872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191059
2	NC_017293	GTG	2	6	1875	1880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191059
3	NC_017293	GCA	2	6	1896	1901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191059
4	NC_017293	TCA	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191059
5	NC_017293	GTA	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191059
6	NC_017293	ATG	2	6	2013	2018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191059
7	NC_017293	ATA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191059
8	NC_017293	TCA	2	6	2233	2238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191059
9	NC_017293	GTC	2	6	2352	2357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191059
10	NC_017293	ATG	2	6	2414	2419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191059
11	NC_017293	AGG	3	9	3128	3136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191060
12	NC_017293	GTT	2	6	3201	3206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191060
13	NC_017293	GCC	2	6	3256	3261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191060
14	NC_017293	CCT	3	9	3275	3283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191060
15	NC_017293	CAT	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191060
16	NC_017293	TGC	2	6	3309	3314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191060
17	NC_017293	CGC	2	6	3324	3329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191060
18	NC_017293	GCA	2	6	5384	5389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191061
19	NC_017293	GCA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191061
20	NC_017293	GAT	2	6	5585	5590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191061
21	NC_017293	GCA	2	6	5720	5725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191062
22	NC_017293	GGT	2	6	5762	5767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191062
23	NC_017293	CGG	3	9	5783	5791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191062
24	NC_017293	TGG	2	6	5795	5800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191062
25	NC_017293	AAG	2	6	5919	5924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191062
26	NC_017293	AGG	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191062
27	NC_017293	TGC	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191063
28	NC_017293	GCG	2	6	6042	6047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191063
29	NC_017293	GCG	2	6	6072	6077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191063
30	NC_017293	TGT	2	6	6202	6207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191063
31	NC_017293	ACC	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191063
32	NC_017293	GCG	2	6	6279	6284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191063
33	NC_017293	CAT	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191064
34	NC_017293	CCA	2	6	6525	6530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191064
35	NC_017293	CGT	2	6	6559	6564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191064
36	NC_017293	GTC	2	6	6749	6754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191064
37	NC_017293	TAC	2	6	6840	6845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191064
38	NC_017293	GCG	2	6	6978	6983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191064
39	NC_017293	CGG	2	6	7198	7203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191064
40	NC_017293	TGC	2	6	7218	7223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191064
41	NC_017293	ACG	2	6	7269	7274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191064
42	NC_017293	TAA	2	6	7281	7286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191064
43	NC_017293	GGA	2	6	7287	7292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191064
44	NC_017293	CAG	2	6	7353	7358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191064
45	NC_017293	GCG	2	6	7359	7364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191064
46	NC_017293	GAA	2	6	7431	7436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191064
47	NC_017293	GCG	2	6	7457	7462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191064
48	NC_017293	TTG	2	6	7530	7535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191064
49	NC_017293	TGC	2	6	7536	7541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191064
50	NC_017293	GAG	2	6	7631	7636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191064
51	NC_017293	GGA	2	6	7811	7816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191064
52	NC_017293	TGG	2	6	7827	7832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191064
53	NC_017293	GCA	2	6	7853	7858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191064
54	NC_017293	AGG	2	6	7861	7866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191064
55	NC_017293	TCA	2	6	7896	7901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191064
56	NC_017293	CAA	2	6	7915	7920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191064
57	NC_017293	GCA	2	6	7967	7972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191064
58	NC_017293	GGC	2	6	7974	7979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191064
59	NC_017293	ACG	2	6	8022	8027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191064
60	NC_017293	ATG	2	6	9622	9627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191065
61	NC_017293	GGC	2	6	9692	9697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191065
62	NC_017293	TGC	2	6	9705	9710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191065
63	NC_017293	ACG	2	6	9712	9717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191065
64	NC_017293	AGC	2	6	9749	9754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191065
65	NC_017293	ATG	2	6	9819	9824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191065
66	NC_017293	TGC	2	6	9893	9898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191065
67	NC_017293	GCT	2	6	10055	10060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191065
68	NC_017293	TGC	2	6	10061	10066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191065
69	NC_017293	AGC	2	6	10182	10187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191065
70	NC_017293	CAG	2	6	10237	10242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191065
71	NC_017293	CCT	2	6	10336	10341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191065
72	NC_017293	TGC	2	6	10419	10424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191065
73	NC_017293	CTC	2	6	10449	10454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191065
74	NC_017293	CAG	2	6	10469	10474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191065
75	NC_017293	AGC	2	6	10502	10507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191065
76	NC_017293	GAG	2	6	10510	10515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191065
77	NC_017293	TGC	2	6	10517	10522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191065
78	NC_017293	CGC	2	6	10526	10531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191065
79	NC_017293	AGG	2	6	10604	10609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191066
80	NC_017293	CGA	2	6	10723	10728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191066
81	NC_017293	CAG	2	6	10731	10736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191066
82	NC_017293	TGC	2	6	11070	11075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191066
83	NC_017293	TCA	2	6	11097	11102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191066
84	NC_017293	GCT	2	6	11105	11110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191066
85	NC_017293	CTG	2	6	11265	11270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191066
86	NC_017293	CAT	2	6	11319	11324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191066
87	NC_017293	TCT	2	6	11367	11372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191066
88	NC_017293	GCT	2	6	11503	11508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191066
89	NC_017293	TGC	2	6	11510	11515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191066
90	NC_017293	GAG	2	6	11644	11649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191066
91	NC_017293	TGC	2	6	11762	11767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191066
92	NC_017293	GCT	2	6	12000	12005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
93	NC_017293	ACG	2	6	12026	12031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191067
94	NC_017293	TAG	2	6	12047	12052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191067
95	NC_017293	GTG	2	6	12085	12090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191067
96	NC_017293	GAT	2	6	12214	12219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191067
97	NC_017293	GGC	2	6	12334	12339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191067
98	NC_017293	GTG	2	6	12349	12354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191067
99	NC_017293	TTC	2	6	12371	12376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191067
100	NC_017293	CCG	2	6	12489	12494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191067
101	NC_017293	GCT	2	6	12534	12539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
102	NC_017293	GTG	2	6	12562	12567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191067
103	NC_017293	GGC	2	6	12616	12621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191067
104	NC_017293	AGA	2	6	12734	12739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191067
105	NC_017293	TAT	2	6	12789	12794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409191067
106	NC_017293	TCG	2	6	12860	12865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
107	NC_017293	AGA	2	6	12914	12919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191067
108	NC_017293	AAT	2	6	13089	13094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191067
109	NC_017293	CGT	2	6	13149	13154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
110	NC_017293	GTT	2	6	13225	13230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191067
111	NC_017293	TGC	2	6	13363	13368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
112	NC_017293	CTG	2	6	13394	13399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
113	NC_017293	GCT	2	6	13443	13448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191067
114	NC_017293	GCG	2	6	13552	13557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191068
115	NC_017293	GGC	2	6	13755	13760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191068
116	NC_017293	CAG	2	6	13762	13767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191068
117	NC_017293	CGT	3	9	13946	13954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191069
118	NC_017293	ACG	2	6	14031	14036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191069
119	NC_017293	GCG	2	6	14058	14063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191069
120	NC_017293	GTA	2	6	14399	14404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191070
121	NC_017293	GAA	2	6	14417	14422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191070
122	NC_017293	CAC	2	6	14446	14451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191070
123	NC_017293	TCG	2	6	14481	14486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191070
124	NC_017293	TGG	2	6	14491	14496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191070
125	NC_017293	CGC	2	6	14559	14564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191070
126	NC_017293	AGC	2	6	14649	14654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191070
127	NC_017293	GCG	2	6	14710	14715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191070
128	NC_017293	CTG	2	6	14765	14770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191070
129	NC_017293	CTG	2	6	14828	14833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191070
130	NC_017293	GAT	2	6	15093	15098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191071
131	NC_017293	CCA	2	6	16473	16478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191072
132	NC_017293	GCT	2	6	16497	16502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191072
133	NC_017293	TCC	2	6	16503	16508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191072
134	NC_017293	GTA	2	6	16539	16544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191072
135	NC_017293	TGC	2	6	16646	16651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191072
136	NC_017293	GAC	2	6	16689	16694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191072
137	NC_017293	CCT	2	6	16708	16713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191072
138	NC_017293	TCC	2	6	16746	16751	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191072
139	NC_017293	CGC	3	9	16843	16851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191072
140	NC_017293	CTC	2	6	16865	16870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191072
141	NC_017293	TCT	2	6	16899	16904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191072
142	NC_017293	CTT	2	6	16913	16918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191072
143	NC_017293	TGA	2	6	16954	16959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191072
144	NC_017293	CCG	2	6	16968	16973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191072
145	NC_017293	CCT	2	6	17026	17031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191072
146	NC_017293	TAT	2	6	17093	17098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409191072
147	NC_017293	GGT	3	9	17099	17107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191072
148	NC_017293	ACA	2	6	17190	17195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191072
149	NC_017293	CTG	2	6	17266	17271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191072
150	NC_017293	ATT	2	6	17294	17299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409191072
151	NC_017293	AAC	2	6	17300	17305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191072
152	NC_017293	GAG	2	6	17348	17353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191072
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154	NC_017293	CTT	2	6	17414	17419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191072
155	NC_017293	CAG	2	6	17426	17431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191072
156	NC_017293	GTT	2	6	17471	17476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191072
157	NC_017293	ACC	2	6	17523	17528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191072
158	NC_017293	CCT	2	6	17575	17580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191072
159	NC_017293	ATC	2	6	17607	17612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191072
160	NC_017293	GTT	2	6	17630	17635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191072
161	NC_017293	CTG	2	6	17685	17690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191072
162	NC_017293	TCT	2	6	17692	17697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191072
163	NC_017293	CTG	2	6	17710	17715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191072
164	NC_017293	GGC	2	6	17855	17860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191072
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166	NC_017293	TCC	3	9	18156	18164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191073
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175	NC_017293	GCG	2	6	18840	18845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191074
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201	NC_017293	ATA	2	6	20415	20420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191074
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243	NC_017293	ATG	2	6	23760	23765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191075
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246	NC_017293	CAT	2	6	23950	23955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191076
247	NC_017293	CTT	2	6	24030	24035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191076
248	NC_017293	CGA	2	6	24041	24046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191076
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250	NC_017293	TTG	2	6	24244	24249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191076
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254	NC_017293	TGA	2	6	24347	24352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191076
255	NC_017293	CGG	2	6	24515	24520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191076
256	NC_017293	GCA	2	6	24525	24530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191076
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370	NC_017293	ACT	2	6	47233	47238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191089
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495	NC_017293	CGG	2	6	69750	69755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191105
496	NC_017293	CCT	2	6	69874	69879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191105
497	NC_017293	GTG	2	6	69914	69919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191105
498	NC_017293	CGA	2	6	69973	69978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191105
499	NC_017293	CGG	2	6	70471	70476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191106
500	NC_017293	GGA	2	6	70480	70485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191106

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