MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCVAL chromosome

Total Repeats: 1750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017293	TGG	2	6	83690	83695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191128
1002	NC_017293	CCCTTG	2	12	83708	83719	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409191128
1003	NC_017293	CACC	2	8	83749	83756	25 %	0 %	0 %	75 %	409191128
1004	NC_017293	ACGC	2	8	83761	83768	25 %	0 %	25 %	50 %	409191128
1005	NC_017293	C	6	6	83810	83815	0 %	0 %	0 %	100 %	409191128
1006	NC_017293	TGC	2	6	83846	83851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191128
1007	NC_017293	CAC	2	6	83923	83928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191129
1008	NC_017293	TGC	2	6	84094	84099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191129
1009	NC_017293	CTGC	2	8	84136	84143	0 %	25 %	25 %	50 %	409191129
1010	NC_017293	GCGA	2	8	84209	84216	25 %	0 %	50 %	25 %	409191129
1011	NC_017293	GCA	2	6	84531	84536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191130
1012	NC_017293	GCC	2	6	84549	84554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191130
1013	NC_017293	GC	3	6	84579	84584	0 %	0 %	50 %	50 %	409191130
1014	NC_017293	CCTCTC	2	12	84592	84603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191130
1015	NC_017293	ACT	2	6	84605	84610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191130
1016	NC_017293	GC	3	6	84663	84668	0 %	0 %	50 %	50 %	409191131
1017	NC_017293	ACGC	2	8	84765	84772	25 %	0 %	25 %	50 %	409191131
1018	NC_017293	TGC	2	6	84782	84787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191131
1019	NC_017293	TC	3	6	84826	84831	0 %	50 %	0 %	50 %	409191131
1020	NC_017293	AGG	2	6	85102	85107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191131
1021	NC_017293	ATA	2	6	85128	85133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409191131
1022	NC_017293	GCCA	2	8	85179	85186	25 %	0 %	25 %	50 %	409191131
1023	NC_017293	ACT	2	6	85218	85223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191132
1024	NC_017293	TGA	2	6	85225	85230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191132
1025	NC_017293	CT	3	6	85247	85252	0 %	50 %	0 %	50 %	409191132
1026	NC_017293	TAC	2	6	85373	85378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191132
1027	NC_017293	TGCA	2	8	85385	85392	25 %	25 %	25 %	25 %	409191132
1028	NC_017293	CCT	3	9	85469	85477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191132
1029	NC_017293	CGA	2	6	85531	85536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191132
1030	NC_017293	AGC	2	6	85538	85543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191132
1031	NC_017293	TGCC	2	8	85546	85553	0 %	25 %	25 %	50 %	409191132
1032	NC_017293	TGC	2	6	85626	85631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191133
1033	NC_017293	ACG	2	6	85730	85735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191133
1034	NC_017293	GTT	2	6	85739	85744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191133
1035	NC_017293	GC	3	6	86056	86061	0 %	0 %	50 %	50 %	409191134
1036	NC_017293	GGT	2	6	86064	86069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191134
1037	NC_017293	C	7	7	86076	86082	0 %	0 %	0 %	100 %	409191134
1038	NC_017293	TAT	2	6	86092	86097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409191134
1039	NC_017293	CCG	2	6	86213	86218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191134
1040	NC_017293	TG	3	6	86232	86237	0 %	50 %	50 %	0 %	409191134
1041	NC_017293	GC	3	6	86243	86248	0 %	0 %	50 %	50 %	409191134
1042	NC_017293	CGA	2	6	86266	86271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191134
1043	NC_017293	TAGA	2	8	86286	86293	50 %	25 %	25 %	0 %	409191134
1044	NC_017293	TCCT	2	8	86366	86373	0 %	50 %	0 %	50 %	409191134
1045	NC_017293	GCC	2	6	86429	86434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191135
1046	NC_017293	AGC	2	6	86444	86449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191135
1047	NC_017293	GCA	3	9	86634	86642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191135
1048	NC_017293	TGC	2	6	86645	86650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191135
1049	NC_017293	GC	3	6	86649	86654	0 %	0 %	50 %	50 %	409191135
1050	NC_017293	CCT	2	6	86678	86683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191135
1051	NC_017293	ACG	2	6	86697	86702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191135
1052	NC_017293	ATC	2	6	86744	86749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191135
1053	NC_017293	CCTGC	2	10	86822	86831	0 %	20 %	20 %	60 %	409191135
1054	NC_017293	TCT	2	6	86920	86925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191135
1055	NC_017293	CAA	2	6	86929	86934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191135
1056	NC_017293	CCT	2	6	86936	86941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191135
1057	NC_017293	CAT	2	6	86945	86950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191135
1058	NC_017293	TTA	2	6	87102	87107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409191136
1059	NC_017293	CG	3	6	87124	87129	0 %	0 %	50 %	50 %	409191136
1060	NC_017293	GCA	2	6	87234	87239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191136
1061	NC_017293	GCC	2	6	87257	87262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191136
1062	NC_017293	TACTG	2	10	87385	87394	20 %	40 %	20 %	20 %	409191136
1063	NC_017293	TTG	2	6	87476	87481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191137
1064	NC_017293	CCTT	2	8	87677	87684	0 %	50 %	0 %	50 %	409191137
1065	NC_017293	CGT	2	6	87707	87712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191138
1066	NC_017293	CCCT	2	8	87727	87734	0 %	25 %	0 %	75 %	409191138
1067	NC_017293	TGC	2	6	87764	87769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191138
1068	NC_017293	TGCC	2	8	87788	87795	0 %	25 %	25 %	50 %	409191138
1069	NC_017293	TGT	2	6	87799	87804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191138
1070	NC_017293	CGC	2	6	87852	87857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191138
1071	NC_017293	CGC	2	6	87873	87878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191138
1072	NC_017293	AGC	2	6	87954	87959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191138
1073	NC_017293	CTG	2	6	88133	88138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191138
1074	NC_017293	CCT	2	6	88213	88218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191138
1075	NC_017293	GCCT	2	8	88287	88294	0 %	25 %	25 %	50 %	409191138
1076	NC_017293	CCT	2	6	88411	88416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191138
1077	NC_017293	CCT	2	6	88458	88463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191139
1078	NC_017293	CGA	2	6	88522	88527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191139
1079	NC_017293	GC	3	6	88588	88593	0 %	0 %	50 %	50 %	409191139
1080	NC_017293	GC	3	6	88658	88663	0 %	0 %	50 %	50 %	409191139
1081	NC_017293	AGC	2	6	88666	88671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191139
1082	NC_017293	AGTG	2	8	88686	88693	25 %	25 %	50 %	0 %	409191140
1083	NC_017293	GCC	2	6	88713	88718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191140
1084	NC_017293	TTA	2	6	88726	88731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409191140
1085	NC_017293	CGC	2	6	88911	88916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191140
1086	NC_017293	TGC	2	6	88944	88949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191140
1087	NC_017293	GCG	2	6	89019	89024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191140
1088	NC_017293	CTC	2	6	89148	89153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191140
1089	NC_017293	CGA	2	6	89258	89263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191140
1090	NC_017293	CGC	2	6	89495	89500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191141
1091	NC_017293	TGC	2	6	89596	89601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191141
1092	NC_017293	GCCAT	2	10	89602	89611	20 %	20 %	20 %	40 %	409191141
1093	NC_017293	CTG	2	6	89701	89706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191141
1094	NC_017293	GAC	2	6	89715	89720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191141
1095	NC_017293	CGT	2	6	89754	89759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191141
1096	NC_017293	ATG	2	6	89845	89850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191141
1097	NC_017293	CCGG	2	8	89893	89900	0 %	0 %	50 %	50 %	409191142
1098	NC_017293	CTG	2	6	89924	89929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191142
1099	NC_017293	AGG	2	6	90022	90027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409191142
1100	NC_017293	GCG	2	6	90036	90041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191142
1101	NC_017293	GCT	3	9	90082	90090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191142
1102	NC_017293	GC	3	6	90096	90101	0 %	0 %	50 %	50 %	409191142
1103	NC_017293	GCT	2	6	90109	90114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191142
1104	NC_017293	TCCT	2	8	90239	90246	0 %	50 %	0 %	50 %	409191143
1105	NC_017293	TGC	2	6	90331	90336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191143
1106	NC_017293	GAA	2	6	90383	90388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191143
1107	NC_017293	GT	3	6	90391	90396	0 %	50 %	50 %	0 %	409191143
1108	NC_017293	GCC	2	6	90401	90406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191143
1109	NC_017293	GCG	2	6	90435	90440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191143
1110	NC_017293	AC	3	6	90587	90592	50 %	0 %	0 %	50 %	409191143
1111	NC_017293	ACC	2	6	90618	90623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191143
1112	NC_017293	TTA	2	6	90847	90852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409191143
1113	NC_017293	AGC	2	6	90888	90893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191143
1114	NC_017293	TCC	2	6	90933	90938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191143
1115	NC_017293	TTA	2	6	90951	90956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409191143
1116	NC_017293	GAT	2	6	90965	90970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191143
1117	NC_017293	CTGCG	2	10	91067	91076	0 %	20 %	40 %	40 %	409191143
1118	NC_017293	TTC	2	6	91089	91094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191143
1119	NC_017293	TG	3	6	91159	91164	0 %	50 %	50 %	0 %	409191143
1120	NC_017293	GCTC	2	8	91188	91195	0 %	25 %	25 %	50 %	409191143
1121	NC_017293	TGC	2	6	91265	91270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191143
1122	NC_017293	TTC	2	6	91329	91334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191143
1123	NC_017293	AGGGGT	2	12	91365	91376	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	409191144
1124	NC_017293	GCT	2	6	91388	91393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191144
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1126	NC_017293	TAG	2	6	91501	91506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191144
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1250	NC_017293	CCA	2	6	98361	98366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191148
1251	NC_017293	GCT	2	6	98371	98376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191148
1252	NC_017293	CGA	2	6	98384	98389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191148
1253	NC_017293	CTG	2	6	98406	98411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191148
1254	NC_017293	TTG	2	6	98418	98423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191148
1255	NC_017293	GTA	2	6	98447	98452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191148
1256	NC_017293	CGT	2	6	98500	98505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191148
1257	NC_017293	TGC	2	6	98561	98566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191148
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1261	NC_017293	TGCA	2	8	98671	98678	25 %	25 %	25 %	25 %	409191148
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1279	NC_017293	CTGC	2	8	99733	99740	0 %	25 %	25 %	50 %	409191148
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1281	NC_017293	CG	3	6	99919	99924	0 %	0 %	50 %	50 %	409191148
1282	NC_017293	AGC	2	6	99937	99942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191148
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1352	NC_017293	CGGA	2	8	109719	109726	25 %	0 %	50 %	25 %	409191153
1353	NC_017293	GA	3	6	109725	109730	50 %	0 %	50 %	0 %	409191153
1354	NC_017293	CA	3	6	109779	109784	50 %	0 %	0 %	50 %	409191153
1355	NC_017293	CAG	2	6	109804	109809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191153
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1357	NC_017293	TCT	2	6	109986	109991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191153
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1359	NC_017293	CCA	2	6	110125	110130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191153
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1361	NC_017293	GCCC	2	8	112058	112065	0 %	0 %	25 %	75 %	409191154
1362	NC_017293	TTACGC	2	12	112133	112144	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409191154
1363	NC_017293	GTC	2	6	112224	112229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191155
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1365	NC_017293	TCT	2	6	112442	112447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409191155
1366	NC_017293	TATCC	2	10	112512	112521	20 %	40 %	0 %	40 %	409191155
1367	NC_017293	GGC	2	6	112565	112570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191155
1368	NC_017293	TGCA	2	8	112643	112650	25 %	25 %	25 %	25 %	409191155
1369	NC_017293	CGC	2	6	112682	112687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191155
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1371	NC_017293	GCC	2	6	112710	112715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191155
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1376	NC_017293	TGGC	2	8	112908	112915	0 %	25 %	50 %	25 %	409191155
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1480	NC_017293	CT	4	8	122175	122182	0 %	50 %	0 %	50 %	409191161
1481	NC_017293	ATG	2	6	122252	122257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191161
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1484	NC_017293	GC	3	6	122326	122331	0 %	0 %	50 %	50 %	409191161
1485	NC_017293	GC	3	6	122339	122344	0 %	0 %	50 %	50 %	409191161
1486	NC_017293	TGC	2	6	122351	122356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191161
1487	NC_017293	CACC	2	8	122359	122366	25 %	0 %	0 %	75 %	409191161
1488	NC_017293	AAG	2	6	122367	122372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191161
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1491	NC_017293	ATGC	2	8	122478	122485	25 %	25 %	25 %	25 %	409191161
1492	NC_017293	GCA	2	6	122588	122593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191161
1493	NC_017293	GC	3	6	122617	122622	0 %	0 %	50 %	50 %	409191161
1494	NC_017293	CT	3	6	122645	122650	0 %	50 %	0 %	50 %	409191161
1495	NC_017293	AGCA	2	8	122788	122795	50 %	0 %	25 %	25 %	409191161
1496	NC_017293	CTGCGC	2	12	122850	122861	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409191161
1497	NC_017293	GCA	2	6	122934	122939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191161
1498	NC_017293	GCC	2	6	123111	123116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191162
1499	NC_017293	GCA	2	6	123134	123139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191162
1500	NC_017293	AGC	2	6	123178	123183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191162

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