MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Tremblaya princeps PCVAL chromosome

Total Repeats: 1750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017293	CGC	2	6	43033	43038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191086
502	NC_017293	GAA	2	6	43060	43065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191086
503	NC_017293	GCT	2	6	43115	43120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191086
504	NC_017293	GCA	2	6	43141	43146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191086
505	NC_017293	ATGGC	2	10	43181	43190	20 %	20 %	40 %	20 %	409191086
506	NC_017293	CTA	2	6	43230	43235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191086
507	NC_017293	CCA	2	6	43275	43280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191086
508	NC_017293	GGC	2	6	43306	43311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191087
509	NC_017293	AGC	2	6	43323	43328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191087
510	NC_017293	CCT	2	6	43364	43369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191087
511	NC_017293	CAG	2	6	43475	43480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191087
512	NC_017293	GCTGT	2	10	43490	43499	0 %	40 %	40 %	20 %	409191087
513	NC_017293	CCT	2	6	43558	43563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191088
514	NC_017293	GC	3	6	43650	43655	0 %	0 %	50 %	50 %	409191088
515	NC_017293	GATG	2	8	43675	43682	25 %	25 %	50 %	0 %	409191088
516	NC_017293	GCACC	2	10	43717	43726	20 %	0 %	20 %	60 %	409191088
517	NC_017293	ACC	2	6	43795	43800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191088
518	NC_017293	GTA	2	6	43882	43887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191088
519	NC_017293	TCGCA	2	10	46010	46019	20 %	20 %	20 %	40 %	409191089
520	NC_017293	TGT	2	6	46025	46030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191089
521	NC_017293	AAC	2	6	46032	46037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191089
522	NC_017293	CGC	2	6	46094	46099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191089
523	NC_017293	GGAG	2	8	46145	46152	25 %	0 %	75 %	0 %	409191089
524	NC_017293	GCATG	2	10	46198	46207	20 %	20 %	40 %	20 %	409191089
525	NC_017293	CAC	2	6	46278	46283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191089
526	NC_017293	TTA	2	6	46430	46435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409191089
527	NC_017293	GT	3	6	46521	46526	0 %	50 %	50 %	0 %	409191089
528	NC_017293	AAC	2	6	46584	46589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409191089
529	NC_017293	AGCG	2	8	46592	46599	25 %	0 %	50 %	25 %	409191089
530	NC_017293	CTG	2	6	46671	46676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191089
531	NC_017293	AGTG	2	8	46797	46804	25 %	25 %	50 %	0 %	409191089
532	NC_017293	GCA	2	6	46991	46996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191089
533	NC_017293	ACGCT	2	10	47191	47200	20 %	20 %	20 %	40 %	409191089
534	NC_017293	ACC	2	6	47224	47229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191089
535	NC_017293	ACT	2	6	47233	47238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191089
536	NC_017293	GTTGT	2	10	47329	47338	0 %	60 %	40 %	0 %	409191089
537	NC_017293	GTC	2	6	47413	47418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191089
538	NC_017293	CTA	2	6	47447	47452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191089
539	NC_017293	CAG	2	6	47483	47488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191089
540	NC_017293	CTGT	2	8	47522	47529	0 %	50 %	25 %	25 %	409191089
541	NC_017293	GCA	2	6	49285	49290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191090
542	NC_017293	GCA	2	6	49306	49311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191090
543	NC_017293	CGG	2	6	49318	49323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191090
544	NC_017293	ATGCC	2	10	49327	49336	20 %	20 %	20 %	40 %	409191090
545	NC_017293	CG	3	6	49340	49345	0 %	0 %	50 %	50 %	409191090
546	NC_017293	CA	3	6	49613	49618	50 %	0 %	0 %	50 %	409191091
547	NC_017293	GC	3	6	49621	49626	0 %	0 %	50 %	50 %	409191091
548	NC_017293	CCT	2	6	49713	49718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191091
549	NC_017293	CTG	2	6	49721	49726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191091
550	NC_017293	TGC	2	6	49775	49780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191091
551	NC_017293	GCT	2	6	49816	49821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191092
552	NC_017293	TCC	2	6	49853	49858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191092
553	NC_017293	CTC	2	6	49859	49864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191092
554	NC_017293	AC	3	6	50014	50019	50 %	0 %	0 %	50 %	409191092
555	NC_017293	TGC	2	6	50105	50110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191092
556	NC_017293	CATC	2	8	50142	50149	25 %	25 %	0 %	50 %	409191092
557	NC_017293	CCA	2	6	50187	50192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191092
558	NC_017293	GC	3	6	50216	50221	0 %	0 %	50 %	50 %	409191092
559	NC_017293	ATG	2	6	50291	50296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409191092
560	NC_017293	GGC	2	6	50836	50841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191093
561	NC_017293	TGCC	2	8	50866	50873	0 %	25 %	25 %	50 %	409191093
562	NC_017293	GCCC	2	8	50898	50905	0 %	0 %	25 %	75 %	409191093
563	NC_017293	GCG	2	6	50916	50921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191093
564	NC_017293	GCC	2	6	51000	51005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191093
565	NC_017293	AAG	2	6	51019	51024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191093
566	NC_017293	CAT	2	6	51111	51116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191093
567	NC_017293	CAG	2	6	51167	51172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191093
568	NC_017293	TGC	2	6	51220	51225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191093
569	NC_017293	GCA	2	6	51247	51252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191093
570	NC_017293	CG	4	8	51319	51326	0 %	0 %	50 %	50 %	409191093
571	NC_017293	CCAGG	2	10	51375	51384	20 %	0 %	40 %	40 %	409191093
572	NC_017293	C	8	8	51445	51452	0 %	0 %	0 %	100 %	409191093
573	NC_017293	GC	3	6	51578	51583	0 %	0 %	50 %	50 %	409191093
574	NC_017293	ATC	2	6	51627	51632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191093
575	NC_017293	TGGT	2	8	53126	53133	0 %	50 %	50 %	0 %	409191094
576	NC_017293	GCTA	2	8	53168	53175	25 %	25 %	25 %	25 %	409191094
577	NC_017293	GTC	2	6	53201	53206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191094
578	NC_017293	CCA	2	6	53263	53268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191094
579	NC_017293	CGA	2	6	53313	53318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191094
580	NC_017293	AGTT	2	8	53398	53405	25 %	50 %	25 %	0 %	409191094
581	NC_017293	GCC	2	6	53411	53416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191094
582	NC_017293	CAC	2	6	53507	53512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191094
583	NC_017293	AGC	2	6	53546	53551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191094
584	NC_017293	ATGCC	2	10	53694	53703	20 %	20 %	20 %	40 %	409191094
585	NC_017293	GA	3	6	53953	53958	50 %	0 %	50 %	0 %	409191095
586	NC_017293	GCTCT	2	10	53962	53971	0 %	40 %	20 %	40 %	409191095
587	NC_017293	TCC	2	6	54000	54005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191095
588	NC_017293	AGGC	2	8	54031	54038	25 %	0 %	50 %	25 %	409191095
589	NC_017293	GGTG	2	8	54066	54073	0 %	25 %	75 %	0 %	409191095
590	NC_017293	GTG	2	6	54141	54146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191095
591	NC_017293	GCC	2	6	54169	54174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409191095
592	NC_017293	TAC	2	6	54198	54203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191095
593	NC_017293	CCT	2	6	54221	54226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191095
594	NC_017293	GCA	2	6	54258	54263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191095
595	NC_017293	TCAT	2	8	54278	54285	25 %	50 %	0 %	25 %	409191095
596	NC_017293	TGG	2	6	54318	54323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191095
597	NC_017293	CTA	2	6	54333	54338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409191095
598	NC_017293	GCG	2	6	54381	54386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191095
599	NC_017293	GGC	2	6	54395	54400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191095
600	NC_017293	GCT	2	6	54444	54449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191095
601	NC_017293	TTG	2	6	54486	54491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191095
602	NC_017293	AGGG	2	8	54551	54558	25 %	0 %	75 %	0 %	409191095
603	NC_017293	GCA	2	6	54576	54581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191095
604	NC_017293	ACC	2	6	54583	54588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191095
605	NC_017293	TGT	3	9	54595	54603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409191095
606	NC_017293	GCAG	2	8	55141	55148	25 %	0 %	50 %	25 %	409191096
607	NC_017293	ACAGC	2	10	55167	55176	40 %	0 %	20 %	40 %	409191096
608	NC_017293	CT	3	6	55185	55190	0 %	50 %	0 %	50 %	409191096
609	NC_017293	GCG	2	6	55238	55243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191096
610	NC_017293	TGC	2	6	55261	55266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191096
611	NC_017293	GCGTA	2	10	55278	55287	20 %	20 %	40 %	20 %	409191096
612	NC_017293	ACG	2	6	55315	55320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191096
613	NC_017293	CTG	3	9	55347	55355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191096
614	NC_017293	GCA	3	9	55395	55403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191096
615	NC_017293	GCT	2	6	55416	55421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409191096
616	NC_017293	CG	3	6	55431	55436	0 %	0 %	50 %	50 %	409191096
617	NC_017293	AGC	2	6	55455	55460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409191096
618	NC_017293	CAC	2	6	55471	55476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409191096
619	NC_017293	C	6	6	55509	55514	0 %	0 %	0 %	100 %	409191096
620	NC_017293	GC	3	6	55518	55523	0 %	0 %	50 %	50 %	409191096
621	NC_017293	CCT	2	6	55544	55549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409191096
622	NC_017293	TGG	2	6	55561	55566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409191096
623	NC_017293	GAA	2	6	55604	55609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409191096
624	NC_017293	CTGCG	2	10	55675	55684	0 %	20 %	40 %	40 %	409191096
625	NC_017293	CG	3	6	55776	55781	0 %	0 %	50 %	50 %	409191096
626	NC_017293	AC	3	6	55808	55813	50 %	0 %	0 %	50 %	409191096
627	NC_017293	GGC	2	6	55865	55870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409191096
628	NC_017293	TTA	2	6	56002	56007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409191096
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