MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 22139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017292	TAC	2	6	213296	213301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454234
4002	NC_017292	GGT	2	6	213350	213355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454234
4003	NC_017292	ATA	2	6	213426	213431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454234
4004	NC_017292	TCT	2	6	213474	213479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454234
4005	NC_017292	CATA	2	8	213547	213554	50 %	25 %	0 %	25 %	384454234
4006	NC_017292	CCT	2	6	213606	213611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454234
4007	NC_017292	ATGT	2	8	213663	213670	25 %	50 %	25 %	0 %	384454234
4008	NC_017292	ACA	2	6	213675	213680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454234
4009	NC_017292	GCC	2	6	213705	213710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384454234
4010	NC_017292	AAG	2	6	213715	213720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454234
4011	NC_017292	A	7	7	213749	213755	100 %	0 %	0 %	0 %	384454234
4012	NC_017292	T	7	7	213773	213779	0 %	100 %	0 %	0 %	384454235
4013	NC_017292	TTG	2	6	213810	213815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454235
4014	NC_017292	GTT	2	6	213830	213835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454235
4015	NC_017292	ATG	2	6	213880	213885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454235
4016	NC_017292	GTT	2	6	213951	213956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454235
4017	NC_017292	AGAT	2	8	214057	214064	50 %	25 %	25 %	0 %	384454235
4018	NC_017292	AGAA	2	8	214180	214187	75 %	0 %	25 %	0 %	384454235
4019	NC_017292	GAAAA	2	10	214209	214218	80 %	0 %	20 %	0 %	384454235
4020	NC_017292	TGC	2	6	214232	214237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454235
4021	NC_017292	T	7	7	214264	214270	0 %	100 %	0 %	0 %	384454235
4022	NC_017292	GTA	2	6	214301	214306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454235
4023	NC_017292	AAC	2	6	214322	214327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454235
4024	NC_017292	GTT	2	6	214340	214345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454235
4025	NC_017292	C	6	6	214348	214353	0 %	0 %	0 %	100 %	384454235
4026	NC_017292	CAA	2	6	214374	214379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454235
4027	NC_017292	GTT	2	6	214492	214497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454236
4028	NC_017292	ATT	2	6	214512	214517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454236
4029	NC_017292	TTC	2	6	214527	214532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454236
4030	NC_017292	TAGCA	2	10	214575	214584	40 %	20 %	20 %	20 %	384454236
4031	NC_017292	AGC	2	6	214650	214655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454236
4032	NC_017292	ACA	2	6	214660	214665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454236
4033	NC_017292	ACG	2	6	214702	214707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454236
4034	NC_017292	GCT	2	6	214772	214777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454236
4035	NC_017292	AGC	2	6	214779	214784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454236
4036	NC_017292	AG	3	6	214886	214891	50 %	0 %	50 %	0 %	384454236
4037	NC_017292	T	6	6	215005	215010	0 %	100 %	0 %	0 %	384454236
4038	NC_017292	T	7	7	215038	215044	0 %	100 %	0 %	0 %	384454236
4039	NC_017292	T	6	6	215099	215104	0 %	100 %	0 %	0 %	384454236
4040	NC_017292	TTC	2	6	215238	215243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454236
4041	NC_017292	AAGAA	2	10	215273	215282	80 %	0 %	20 %	0 %	384454236
4042	NC_017292	AAG	2	6	215289	215294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454236
4043	NC_017292	GAA	2	6	215907	215912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454237
4044	NC_017292	TCA	2	6	215932	215937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454237
4045	NC_017292	AG	3	6	216042	216047	50 %	0 %	50 %	0 %	384454237
4046	NC_017292	GT	3	6	216126	216131	0 %	50 %	50 %	0 %	384454237
4047	NC_017292	GACA	2	8	216163	216170	50 %	0 %	25 %	25 %	384454237
4048	NC_017292	AG	3	6	216192	216197	50 %	0 %	50 %	0 %	384454237
4049	NC_017292	CTC	2	6	216249	216254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454237
4050	NC_017292	ATT	2	6	216277	216282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454237
4051	NC_017292	TTG	2	6	216385	216390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454237
4052	NC_017292	GGT	2	6	216396	216401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454237
4053	NC_017292	AGC	2	6	216452	216457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454237
4054	NC_017292	TTG	2	6	216517	216522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454237
4055	NC_017292	AAG	2	6	216552	216557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454238
4056	NC_017292	GAAAG	2	10	216573	216582	60 %	0 %	40 %	0 %	384454238
4057	NC_017292	TAT	2	6	216661	216666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454238
4058	NC_017292	AGA	2	6	216688	216693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454238
4059	NC_017292	ATTT	2	8	216744	216751	25 %	75 %	0 %	0 %	384454238
4060	NC_017292	TCA	2	6	216856	216861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454238
4061	NC_017292	GTG	2	6	216939	216944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454238
4062	NC_017292	ACTC	2	8	216953	216960	25 %	25 %	0 %	50 %	384454238
4063	NC_017292	TTA	2	6	217047	217052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454238
4064	NC_017292	TGT	2	6	217105	217110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454238
4065	NC_017292	TG	3	6	217209	217214	0 %	50 %	50 %	0 %	384454238
4066	NC_017292	TAG	2	6	217294	217299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454238
4067	NC_017292	TAC	2	6	217310	217315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454238
4068	NC_017292	AT	3	6	217545	217550	50 %	50 %	0 %	0 %	384454239
4069	NC_017292	AGAA	2	8	217850	217857	75 %	0 %	25 %	0 %	384454239
4070	NC_017292	TTG	2	6	217862	217867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454239
4071	NC_017292	CAAC	2	8	217917	217924	50 %	0 %	0 %	50 %	384454239
4072	NC_017292	TTC	2	6	218256	218261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454239
4073	NC_017292	AGC	2	6	218316	218321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454239
4074	NC_017292	ATC	2	6	218322	218327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454239
4075	NC_017292	TGT	2	6	218348	218353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454239
4076	NC_017292	GA	3	6	218379	218384	50 %	0 %	50 %	0 %	384454239
4077	NC_017292	AGT	2	6	218417	218422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454239
4078	NC_017292	GCG	2	6	218445	218450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384454239
4079	NC_017292	CTC	2	6	218454	218459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454239
4080	NC_017292	AT	3	6	218521	218526	50 %	50 %	0 %	0 %	384454239
4081	NC_017292	GTTAG	2	10	218557	218566	20 %	40 %	40 %	0 %	384454239
4082	NC_017292	CTA	2	6	218581	218586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454239
4083	NC_017292	TAAG	2	8	218625	218632	50 %	25 %	25 %	0 %	384454239
4084	NC_017292	TGGAT	2	10	218709	218718	20 %	40 %	40 %	0 %	384454239
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4087	NC_017292	TCT	2	6	218827	218832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454239
4088	NC_017292	GTT	2	6	218862	218867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454239
4089	NC_017292	T	6	6	218989	218994	0 %	100 %	0 %	0 %	384454239
4090	NC_017292	AAT	2	6	219070	219075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454239
4091	NC_017292	TTA	2	6	219118	219123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454239
4092	NC_017292	AGA	2	6	219150	219155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454239
4093	NC_017292	CAT	2	6	219179	219184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454239
4094	NC_017292	GATT	2	8	219196	219203	25 %	50 %	25 %	0 %	384454239
4095	NC_017292	TGC	2	6	219204	219209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454239
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4097	NC_017292	TGT	2	6	219268	219273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454239
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4099	NC_017292	TTCC	2	8	219353	219360	0 %	50 %	0 %	50 %	384454239
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4103	NC_017292	T	6	6	219475	219480	0 %	100 %	0 %	0 %	384454239
4104	NC_017292	CAC	2	6	219572	219577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454239
4105	NC_017292	GTTG	2	8	219726	219733	0 %	50 %	50 %	0 %	384454239
4106	NC_017292	CCA	2	6	219748	219753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454239
4107	NC_017292	TTC	2	6	219804	219809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454239
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4111	NC_017292	ATC	2	6	220056	220061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454239
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4113	NC_017292	TAG	2	6	220181	220186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454239
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4115	NC_017292	TAT	2	6	220289	220294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454239
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4118	NC_017292	GA	3	6	220403	220408	50 %	0 %	50 %	0 %	384454239
4119	NC_017292	CAC	2	6	220436	220441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454239
4120	NC_017292	T	6	6	220456	220461	0 %	100 %	0 %	0 %	384454239
4121	NC_017292	CAG	2	6	220508	220513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454239
4122	NC_017292	TGC	2	6	220518	220523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454239
4123	NC_017292	GCA	2	6	220531	220536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454239
4124	NC_017292	ACT	2	6	220537	220542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454239
4125	NC_017292	GATT	2	8	220602	220609	25 %	50 %	25 %	0 %	384454239
4126	NC_017292	GTTA	2	8	220614	220621	25 %	50 %	25 %	0 %	384454239
4127	NC_017292	CCA	2	6	220648	220653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454239
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4144	NC_017292	TGG	2	6	221363	221368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454239
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4232	NC_017292	TTC	2	6	226073	226078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454241
4233	NC_017292	TGTT	2	8	226136	226143	0 %	75 %	25 %	0 %	384454241
4234	NC_017292	T	7	7	226193	226199	0 %	100 %	0 %	0 %	384454241
4235	NC_017292	TTTC	2	8	226226	226233	0 %	75 %	0 %	25 %	384454241
4236	NC_017292	CAC	2	6	226243	226248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454241
4237	NC_017292	GCCAAC	2	12	226312	226323	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384454241
4238	NC_017292	T	6	6	226392	226397	0 %	100 %	0 %	0 %	384454242
4239	NC_017292	CTC	2	6	226442	226447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454242
4240	NC_017292	TGA	2	6	226487	226492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454242
4241	NC_017292	TTG	2	6	226519	226524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454242
4242	NC_017292	AACC	2	8	226534	226541	50 %	0 %	0 %	50 %	384454242
4243	NC_017292	TCG	2	6	226601	226606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454242
4244	NC_017292	AAT	2	6	226710	226715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454242
4245	NC_017292	GGA	2	6	226951	226956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454243
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