MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 22139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017292	TCT	2	6	78086	78091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454099
1502	NC_017292	TCT	2	6	78095	78100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454099
1503	NC_017292	AAAGA	2	10	78176	78185	80 %	0 %	20 %	0 %	384454099
1504	NC_017292	AAAG	2	8	78247	78254	75 %	0 %	25 %	0 %	384454099
1505	NC_017292	CACCTC	2	12	78330	78341	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384454099
1506	NC_017292	CTT	2	6	78348	78353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454099
1507	NC_017292	AAC	2	6	78364	78369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454099
1508	NC_017292	GCT	2	6	78422	78427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454099
1509	NC_017292	AGT	2	6	78434	78439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454099
1510	NC_017292	CTC	2	6	78462	78467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454099
1511	NC_017292	CAG	2	6	78474	78479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454099
1512	NC_017292	ACC	2	6	78484	78489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454099
1513	NC_017292	GAA	2	6	78572	78577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454099
1514	NC_017292	CAC	2	6	78623	78628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454099
1515	NC_017292	ACAG	2	8	78730	78737	50 %	0 %	25 %	25 %	384454099
1516	NC_017292	CAA	2	6	78773	78778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454099
1517	NC_017292	GA	3	6	78861	78866	50 %	0 %	50 %	0 %	384454099
1518	NC_017292	CTT	2	6	78896	78901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454099
1519	NC_017292	GTT	2	6	78904	78909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454099
1520	NC_017292	AGTTC	2	10	79181	79190	20 %	40 %	20 %	20 %	384454099
1521	NC_017292	AG	3	6	79195	79200	50 %	0 %	50 %	0 %	384454099
1522	NC_017292	ATG	2	6	79281	79286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454099
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1524	NC_017292	GGT	2	6	79341	79346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384454100
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1527	NC_017292	AAG	2	6	79555	79560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454100
1528	NC_017292	T	6	6	79563	79568	0 %	100 %	0 %	0 %	384454100
1529	NC_017292	GAA	2	6	79701	79706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454100
1530	NC_017292	AAG	2	6	79714	79719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454100
1531	NC_017292	A	7	7	79814	79820	100 %	0 %	0 %	0 %	384454100
1532	NC_017292	TCT	2	6	79930	79935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454100
1533	NC_017292	GTC	2	6	80021	80026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454100
1534	NC_017292	GCTGAT	2	12	80157	80168	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384454100
1535	NC_017292	AC	3	6	80176	80181	50 %	0 %	0 %	50 %	384454100
1536	NC_017292	GAA	2	6	80232	80237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454100
1537	NC_017292	TTCT	2	8	80257	80264	0 %	75 %	0 %	25 %	384454100
1538	NC_017292	AC	3	6	80330	80335	50 %	0 %	0 %	50 %	384454100
1539	NC_017292	TTG	2	6	80380	80385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454100
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1541	NC_017292	AGA	2	6	80405	80410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454100
1542	NC_017292	T	6	6	80468	80473	0 %	100 %	0 %	0 %	384454100
1543	NC_017292	CAAA	2	8	80484	80491	75 %	0 %	0 %	25 %	384454100
1544	NC_017292	ATG	2	6	80647	80652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454101
1545	NC_017292	TAT	2	6	80677	80682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454101
1546	NC_017292	TGA	2	6	80709	80714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454101
1547	NC_017292	TAA	2	6	80733	80738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454101
1548	NC_017292	A	6	6	80737	80742	100 %	0 %	0 %	0 %	384454101
1549	NC_017292	TTC	2	6	80781	80786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454101
1550	NC_017292	T	6	6	80834	80839	0 %	100 %	0 %	0 %	384454101
1551	NC_017292	CTT	2	6	80875	80880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454101
1552	NC_017292	TAT	2	6	80883	80888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454101
1553	NC_017292	GAAA	2	8	80959	80966	75 %	0 %	25 %	0 %	384454101
1554	NC_017292	TAAA	2	8	81032	81039	75 %	25 %	0 %	0 %	384454101
1555	NC_017292	TTC	2	6	81087	81092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454101
1556	NC_017292	ATG	2	6	81110	81115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454101
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1558	NC_017292	AG	3	6	81219	81224	50 %	0 %	50 %	0 %	384454101
1559	NC_017292	GCT	2	6	81283	81288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454101
1560	NC_017292	AGAA	2	8	81306	81313	75 %	0 %	25 %	0 %	384454101
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1562	NC_017292	CT	3	6	81399	81404	0 %	50 %	0 %	50 %	384454101
1563	NC_017292	TAT	2	6	81440	81445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454101
1564	NC_017292	GAAG	2	8	81504	81511	50 %	0 %	50 %	0 %	384454101
1565	NC_017292	GCT	2	6	81517	81522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454101
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1567	NC_017292	CGTAT	2	10	81550	81559	20 %	40 %	20 %	20 %	384454101
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1570	NC_017292	ATG	2	6	81664	81669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454101
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1585	NC_017292	T	6	6	84002	84007	0 %	100 %	0 %	0 %	384454102
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1588	NC_017292	GTA	2	6	84074	84079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454102
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1590	NC_017292	ATA	2	6	84213	84218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454102
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1593	NC_017292	GTT	2	6	84322	84327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454102
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1595	NC_017292	CTT	2	6	84433	84438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454102
1596	NC_017292	GGA	2	6	84483	84488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454102
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1598	NC_017292	GAG	2	6	84517	84522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454102
1599	NC_017292	TAA	2	6	84553	84558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454102
1600	NC_017292	TGCA	2	8	84677	84684	25 %	25 %	25 %	25 %	384454102
1601	NC_017292	T	6	6	84921	84926	0 %	100 %	0 %	0 %	384454103
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1604	NC_017292	TTTA	2	8	85095	85102	25 %	75 %	0 %	0 %	384454103
1605	NC_017292	AT	3	6	85164	85169	50 %	50 %	0 %	0 %	384454103
1606	NC_017292	AT	3	6	85267	85272	50 %	50 %	0 %	0 %	384454103
1607	NC_017292	T	6	6	85406	85411	0 %	100 %	0 %	0 %	384454104
1608	NC_017292	AAG	2	6	85497	85502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454104
1609	NC_017292	GAT	2	6	85555	85560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454104
1610	NC_017292	CTT	2	6	85581	85586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454104
1611	NC_017292	GAT	2	6	85600	85605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454104
1612	NC_017292	CTTTT	2	10	85648	85657	0 %	80 %	0 %	20 %	384454104
1613	NC_017292	GTT	2	6	85671	85676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454104
1614	NC_017292	AGA	2	6	85747	85752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454105
1615	NC_017292	ATA	2	6	85757	85762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384454105
1616	NC_017292	TGA	2	6	85860	85865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454105
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1618	NC_017292	T	7	7	85910	85916	0 %	100 %	0 %	0 %	384454105
1619	NC_017292	TGTC	2	8	85950	85957	0 %	50 %	25 %	25 %	384454105
1620	NC_017292	AGCG	2	8	86104	86111	25 %	0 %	50 %	25 %	384454105
1621	NC_017292	GA	3	6	86135	86140	50 %	0 %	50 %	0 %	384454105
1622	NC_017292	AG	3	6	86184	86189	50 %	0 %	50 %	0 %	384454105
1623	NC_017292	AG	3	6	86222	86227	50 %	0 %	50 %	0 %	384454105
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