MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 22139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017292	TGC	2	6	323205	323210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454313
6002	NC_017292	C	14	14	323231	323244	0 %	0 %	0 %	100 %	384454313
6003	NC_017292	TTAG	2	8	323269	323276	25 %	50 %	25 %	0 %	384454313
6004	NC_017292	AAC	2	6	323331	323336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454313
6005	NC_017292	CTG	2	6	323345	323350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454313
6006	NC_017292	TG	3	6	323353	323358	0 %	50 %	50 %	0 %	384454313
6007	NC_017292	GTT	2	6	323423	323428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454313
6008	NC_017292	AGT	3	9	323511	323519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454313
6009	NC_017292	GTC	2	6	323526	323531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454313
6010	NC_017292	TTTA	2	8	323535	323542	25 %	75 %	0 %	0 %	384454313
6011	NC_017292	CCT	2	6	323560	323565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454313
6012	NC_017292	CTT	2	6	323603	323608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454313
6013	NC_017292	CAG	2	6	323633	323638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454313
6014	NC_017292	TAT	2	6	323685	323690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454313
6015	NC_017292	CAAA	2	8	323757	323764	75 %	0 %	0 %	25 %	384454313
6016	NC_017292	AGG	2	6	323873	323878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454313
6017	NC_017292	ATT	2	6	323904	323909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454313
6018	NC_017292	AAGAC	2	10	323989	323998	60 %	0 %	20 %	20 %	384454313
6019	NC_017292	CTA	2	6	324121	324126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454313
6020	NC_017292	AGT	2	6	324156	324161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454313
6021	NC_017292	GAAA	2	8	324198	324205	75 %	0 %	25 %	0 %	384454313
6022	NC_017292	AGT	2	6	324213	324218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454313
6023	NC_017292	T	8	8	324233	324240	0 %	100 %	0 %	0 %	384454313
6024	NC_017292	AC	3	6	324270	324275	50 %	0 %	0 %	50 %	384454313
6025	NC_017292	TA	3	6	324290	324295	50 %	50 %	0 %	0 %	384454313
6026	NC_017292	GTT	2	6	324373	324378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454313
6027	NC_017292	CTT	2	6	324383	324388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454313
6028	NC_017292	GAA	2	6	324630	324635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454314
6029	NC_017292	TGT	2	6	324673	324678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454314
6030	NC_017292	AGT	2	6	324691	324696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454314
6031	NC_017292	AG	3	6	324777	324782	50 %	0 %	50 %	0 %	384454314
6032	NC_017292	CTT	2	6	324801	324806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454314
6033	NC_017292	GA	3	6	324859	324864	50 %	0 %	50 %	0 %	384454314
6034	NC_017292	TC	3	6	324866	324871	0 %	50 %	0 %	50 %	384454314
6035	NC_017292	AG	3	6	324893	324898	50 %	0 %	50 %	0 %	384454314
6036	NC_017292	TGC	2	6	324910	324915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454314
6037	NC_017292	TGCA	2	8	324968	324975	25 %	25 %	25 %	25 %	384454314
6038	NC_017292	AGA	2	6	325019	325024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454314
6039	NC_017292	TGTT	2	8	325135	325142	0 %	75 %	25 %	0 %	384454314
6040	NC_017292	GTA	2	6	325219	325224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454314
6041	NC_017292	AG	3	6	325264	325269	50 %	0 %	50 %	0 %	384454314
6042	NC_017292	GTCTTT	2	12	325310	325321	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384454314
6043	NC_017292	AAG	2	6	325446	325451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454314
6044	NC_017292	GT	3	6	325633	325638	0 %	50 %	50 %	0 %	384454314
6045	NC_017292	CCT	2	6	325641	325646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454314
6046	NC_017292	G	6	6	325695	325700	0 %	0 %	100 %	0 %	384454314
6047	NC_017292	TTG	2	6	325708	325713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454314
6048	NC_017292	CTA	2	6	325756	325761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454314
6049	NC_017292	GCA	2	6	325782	325787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454314
6050	NC_017292	TGTGA	2	10	325866	325875	20 %	40 %	40 %	0 %	384454314
6051	NC_017292	C	14	14	325891	325904	0 %	0 %	0 %	100 %	384454314
6052	NC_017292	TTAG	2	8	325929	325936	25 %	50 %	25 %	0 %	384454314
6053	NC_017292	ACA	2	6	325992	325997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454314
6054	NC_017292	CTG	2	6	326002	326007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454314
6055	NC_017292	TG	3	6	326010	326015	0 %	50 %	50 %	0 %	384454314
6056	NC_017292	AGAACC	2	12	326057	326068	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384454314
6057	NC_017292	T	6	6	326116	326121	0 %	100 %	0 %	0 %	384454314
6058	NC_017292	TCA	2	6	326124	326129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454314
6059	NC_017292	AGA	2	6	326146	326151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454314
6060	NC_017292	AGT	2	6	326168	326173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454314
6061	NC_017292	TTTA	2	8	326186	326193	25 %	75 %	0 %	0 %	384454314
6062	NC_017292	AGA	2	6	326239	326244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454314
6063	NC_017292	CTT	2	6	326257	326262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454314
6064	NC_017292	CCA	2	6	326286	326291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384454314
6065	NC_017292	CTA	2	6	326334	326339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454314
6066	NC_017292	TGA	2	6	326344	326349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454314
6067	NC_017292	CTG	2	6	326403	326408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454314
6068	NC_017292	ATC	2	6	326411	326416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454314
6069	NC_017292	CAAA	2	8	326417	326424	75 %	0 %	0 %	25 %	384454314
6070	NC_017292	TTA	2	6	326463	326468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454314
6071	NC_017292	CAG	2	6	326488	326493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454314
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6073	NC_017292	T	6	6	326528	326533	0 %	100 %	0 %	0 %	384454314
6074	NC_017292	GAA	2	6	326538	326543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454314
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6079	NC_017292	AAAG	2	8	326859	326866	75 %	0 %	25 %	0 %	384454314
6080	NC_017292	AGCAA	2	10	326882	326891	60 %	0 %	20 %	20 %	384454314
6081	NC_017292	CTA	2	6	326892	326897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454314
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6083	NC_017292	AC	3	6	326946	326951	50 %	0 %	0 %	50 %	384454314
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6094	NC_017292	TC	3	6	327540	327545	0 %	50 %	0 %	50 %	384454315
6095	NC_017292	TGC	2	6	327584	327589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454315
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6097	NC_017292	AACTC	2	10	327727	327736	40 %	20 %	0 %	40 %	384454315
6098	NC_017292	AT	3	6	327793	327798	50 %	50 %	0 %	0 %	384454315
6099	NC_017292	TG	3	6	327809	327814	0 %	50 %	50 %	0 %	384454315
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6108	NC_017292	AG	3	6	328464	328469	50 %	0 %	50 %	0 %	384454315
6109	NC_017292	T	6	6	328530	328535	0 %	100 %	0 %	0 %	384454315
6110	NC_017292	CTGT	2	8	328537	328544	0 %	50 %	25 %	25 %	384454315
6111	NC_017292	TGC	2	6	328548	328553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454315
6112	NC_017292	C	15	15	328577	328591	0 %	0 %	0 %	100 %	384454315
6113	NC_017292	TTAG	2	8	328616	328623	25 %	50 %	25 %	0 %	384454315
6114	NC_017292	GAGG	2	8	328643	328650	25 %	0 %	75 %	0 %	384454315
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6118	NC_017292	GTT	2	6	328767	328772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454315
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