MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 02DC15 chromosome

Total Repeats: 22139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017292	ATG	2	6	242074	242079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454257
4502	NC_017292	ATG	2	6	242106	242111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454257
4503	NC_017292	GCA	2	6	242136	242141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454257
4504	NC_017292	AAG	2	6	242158	242163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454257
4505	NC_017292	A	6	6	242181	242186	100 %	0 %	0 %	0 %	384454257
4506	NC_017292	TCA	2	6	242192	242197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454257
4507	NC_017292	GCTT	2	8	242251	242258	0 %	50 %	25 %	25 %	384454257
4508	NC_017292	AT	3	6	242332	242337	50 %	50 %	0 %	0 %	384454257
4509	NC_017292	TGA	2	6	242456	242461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454257
4510	NC_017292	GAA	2	6	242466	242471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454257
4511	NC_017292	ATT	2	6	242481	242486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454257
4512	NC_017292	TGA	2	6	242525	242530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454257
4513	NC_017292	GAA	2	6	242574	242579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454257
4514	NC_017292	TTA	2	6	242601	242606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454257
4515	NC_017292	TTTAG	2	10	242645	242654	20 %	60 %	20 %	0 %	384454257
4516	NC_017292	AG	3	6	242715	242720	50 %	0 %	50 %	0 %	384454258
4517	NC_017292	T	7	7	242746	242752	0 %	100 %	0 %	0 %	384454258
4518	NC_017292	GCA	2	6	242776	242781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454258
4519	NC_017292	TAAT	2	8	242843	242850	50 %	50 %	0 %	0 %	384454258
4520	NC_017292	ATG	2	6	242902	242907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454258
4521	NC_017292	ACT	2	6	242920	242925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454258
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4523	NC_017292	CGT	2	6	242986	242991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454258
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4525	NC_017292	TTTA	2	8	243119	243126	25 %	75 %	0 %	0 %	384454258
4526	NC_017292	ATCG	2	8	243166	243173	25 %	25 %	25 %	25 %	384454258
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4530	NC_017292	CTG	2	6	243381	243386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384454259
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4532	NC_017292	ATG	2	6	243408	243413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454259
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4534	NC_017292	GTTGT	2	10	243450	243459	0 %	60 %	40 %	0 %	384454259
4535	NC_017292	A	6	6	243482	243487	100 %	0 %	0 %	0 %	384454259
4536	NC_017292	GGTA	2	8	243515	243522	25 %	25 %	50 %	0 %	384454259
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4539	NC_017292	TTG	2	6	243663	243668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454259
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4543	NC_017292	AAAG	2	8	243986	243993	75 %	0 %	25 %	0 %	384454259
4544	NC_017292	TTA	2	6	244171	244176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384454260
4545	NC_017292	TTTA	2	8	244229	244236	25 %	75 %	0 %	0 %	384454260
4546	NC_017292	AAG	2	6	244283	244288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454260
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4549	NC_017292	GCA	2	6	244512	244517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454260
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4553	NC_017292	GTT	2	6	244683	244688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454260
4554	NC_017292	TCC	2	6	244752	244757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454260
4555	NC_017292	TTTCCT	2	12	244836	244847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454260
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4557	NC_017292	GA	3	6	244972	244977	50 %	0 %	50 %	0 %	384454260
4558	NC_017292	TTC	2	6	245038	245043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384454260
4559	NC_017292	GAC	3	9	245050	245058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454260
4560	NC_017292	TGA	2	6	245064	245069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454260
4561	NC_017292	AGCT	2	8	245174	245181	25 %	25 %	25 %	25 %	384454261
4562	NC_017292	T	8	8	245185	245192	0 %	100 %	0 %	0 %	384454261
4563	NC_017292	GTT	2	6	245221	245226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454261
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4565	NC_017292	TTTAGG	2	12	245444	245455	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384454261
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4569	NC_017292	ATG	2	6	245726	245731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454261
4570	NC_017292	AGATA	2	10	245741	245750	60 %	20 %	20 %	0 %	384454261
4571	NC_017292	TTATC	2	10	245755	245764	20 %	60 %	0 %	20 %	384454261
4572	NC_017292	TTG	2	6	245808	245813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454262
4573	NC_017292	TAG	2	6	245819	245824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454262
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4581	NC_017292	CAT	2	6	246182	246187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454262
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4584	NC_017292	AGC	2	6	246282	246287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384454262
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4589	NC_017292	AGA	2	6	246650	246655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454263
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4591	NC_017292	G	6	6	246816	246821	0 %	0 %	100 %	0 %	384454263
4592	NC_017292	TGA	2	6	246825	246830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454263
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4595	NC_017292	ATC	2	6	246917	246922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454263
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4597	NC_017292	TCA	2	6	247089	247094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384454263
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4599	NC_017292	GAATC	2	10	247120	247129	40 %	20 %	20 %	20 %	384454263
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4601	NC_017292	GTTT	2	8	247241	247248	0 %	75 %	25 %	0 %	384454263
4602	NC_017292	GTA	2	6	247271	247276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454263
4603	NC_017292	TCC	2	6	247301	247306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384454263
4604	NC_017292	T	6	6	247348	247353	0 %	100 %	0 %	0 %	384454263
4605	NC_017292	TAG	2	6	247444	247449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454263
4606	NC_017292	ATAA	2	8	247453	247460	75 %	25 %	0 %	0 %	384454263
4607	NC_017292	GGA	2	6	247466	247471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384454263
4608	NC_017292	GTA	2	6	247472	247477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384454263
4609	NC_017292	ACA	2	6	247479	247484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384454263
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4614	NC_017292	T	6	6	247719	247724	0 %	100 %	0 %	0 %	384454264
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4619	NC_017292	GAA	2	6	248058	248063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454265
4620	NC_017292	TTGAG	2	10	248104	248113	20 %	40 %	40 %	0 %	384454265
4621	NC_017292	GTT	2	6	248170	248175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384454265
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4993	NC_017292	AAG	2	6	267287	267292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384454283
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